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大顶苦瓜种质资源的遗传多样性分析与指纹图谱构建
1
作者
杨天文
王静
+5 位作者
李炯
徐
彬
其
程蛟文
洪宇
曹毅
崔竣杰
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期103-114,共12页
为实现对大顶苦瓜种质的快速精准鉴定,以包含主栽品种在内的26份大顶苦瓜种质为材料,通过筛选高多态性简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)核心标记,对其进行聚类分析和指纹图谱构建。结果表明:在苦瓜基因组6种SSR基序单元类型中...
为实现对大顶苦瓜种质的快速精准鉴定,以包含主栽品种在内的26份大顶苦瓜种质为材料,通过筛选高多态性简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)核心标记,对其进行聚类分析和指纹图谱构建。结果表明:在苦瓜基因组6种SSR基序单元类型中,二核苷酸SSR标记的多态性最好,适用于进一步从中筛选苦瓜SSR核心标记。在遗传相似系数0.80处,40个SSR标记将26份大顶苦瓜种质分为3个类群,第一类群包含18份种质,果形以短圆锥形为主;第二类群包含5份种质,果形以长圆锥形为主;第三类群包含3份种质,其果形与大顶苦瓜相似,但含有非大顶苦瓜种质背景。利用MC05_69594、MC04_50530、MC06_87314和MC10_146038这4个SSR核心标记可对26份大顶苦瓜种质进行有效鉴定,并为每份大顶苦瓜种质建立独特的QR编码指纹图谱,其中,1号大顶和3号大顶疑为相似材料。构建的大顶苦瓜指纹图谱可以为大顶苦瓜种质鉴定与育种利用提供科学依据。
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关键词
大顶苦瓜
简单重复序列标记
遗传多样性
种质鉴定
指纹图谱
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职称材料
题名
大顶苦瓜种质资源的遗传多样性分析与指纹图谱构建
1
作者
杨天文
王静
李炯
徐
彬
其
程蛟文
洪宇
曹毅
崔竣杰
机构
佛山科学技术学院园艺系
华南农业大学园艺学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期103-114,共12页
基金
广东省自然科学基金(2019A1515011939)
佛山市植物种质资源工程技术研究中心项目(BKS208024)。
文摘
为实现对大顶苦瓜种质的快速精准鉴定,以包含主栽品种在内的26份大顶苦瓜种质为材料,通过筛选高多态性简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)核心标记,对其进行聚类分析和指纹图谱构建。结果表明:在苦瓜基因组6种SSR基序单元类型中,二核苷酸SSR标记的多态性最好,适用于进一步从中筛选苦瓜SSR核心标记。在遗传相似系数0.80处,40个SSR标记将26份大顶苦瓜种质分为3个类群,第一类群包含18份种质,果形以短圆锥形为主;第二类群包含5份种质,果形以长圆锥形为主;第三类群包含3份种质,其果形与大顶苦瓜相似,但含有非大顶苦瓜种质背景。利用MC05_69594、MC04_50530、MC06_87314和MC10_146038这4个SSR核心标记可对26份大顶苦瓜种质进行有效鉴定,并为每份大顶苦瓜种质建立独特的QR编码指纹图谱,其中,1号大顶和3号大顶疑为相似材料。构建的大顶苦瓜指纹图谱可以为大顶苦瓜种质鉴定与育种利用提供科学依据。
关键词
大顶苦瓜
简单重复序列标记
遗传多样性
种质鉴定
指纹图谱
Keywords
dading bitter gourd
simple sequence repeat marker
genetic diversity
germplasm identification
fin-gerprinting
分类号
S642.5 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大顶苦瓜种质资源的遗传多样性分析与指纹图谱构建
杨天文
王静
李炯
徐
彬
其
程蛟文
洪宇
曹毅
崔竣杰
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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