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资阳香橙砧木CjSPL基因家族鉴定及表达模式分析
被引量：
1
1
作者
彭
洪
娴
邱洁雅
+7 位作者
惠秋玲
徐媛媛
淳长品
凌丽俐
曹立
何义仲
彭
良志
付行政
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期625-639,共15页
鳞片启动子结合类蛋白(squamosa promoter binding protein-like,SPL)家族是一类参与调控植物生长发育以及响应环境胁迫的重要转录因子,但在柑橘等多年生果树中的研究较少。本研究以柑橘一种重要的砧木——资阳香橙(Citrus junos Sieb.e...
鳞片启动子结合类蛋白(squamosa promoter binding protein-like,SPL)家族是一类参与调控植物生长发育以及响应环境胁迫的重要转录因子,但在柑橘等多年生果树中的研究较少。本研究以柑橘一种重要的砧木——资阳香橙(Citrus junos Sieb.ex Tanaka)为材料,基于plantTFDB转录因子数据库和甜橙基因组数据库鉴定并克隆出资阳香橙15个SPL家族基因,命名为CjSPL1–CjSPL15。序列分析表明,CjSPLs的开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为393–2865 bp,编码130–954个氨基酸;系统进化树将15个CjSPLs分为9个亚家族;基因结构和保守结构域分析预测出20个不同的保守motif和SBP基本结构域;启动子顺式作用元件分析预测出20种启动子元件,其中包含植物生长发育、非生物胁迫及次生代谢物相关元件。通过实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)分析了CjSPLs在干旱、盐和低温胁迫下的表达模式,较多CjSPLs在胁迫处理后显著上调表达。本研究为后续深入研究柑橘及其他果树SPL家族转录因子功能提供参考。
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关键词
资阳香橙
SPL基因家族
非生物胁迫
表达模式
原文传递
马铃薯块茎淀粉组分高效检测体系的建立及应用
被引量：
5
2
作者
宋玉浩
史伟玲
+10 位作者
张娇
丁振宇
彭
洪
娴
蒋春燕
马秋芹
李芝静
赵勇
唐道彬
张凯
王季春
刘勋
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期600-608,共9页
马铃薯块茎淀粉组分(直链/支链淀粉比AM/AP)影响淀粉特性以及决定其在食品和其他工业上的应用。AM/AP的测定对其合理利用以及选育特异淀粉组分的专用品种等具有重要意义。采用96孔板双波长法对马铃薯不同AM/AP比率标准样品进行测试,发...
马铃薯块茎淀粉组分(直链/支链淀粉比AM/AP)影响淀粉特性以及决定其在食品和其他工业上的应用。AM/AP的测定对其合理利用以及选育特异淀粉组分的专用品种等具有重要意义。采用96孔板双波长法对马铃薯不同AM/AP比率标准样品进行测试,发现当测试样品AM/AP比率超过制作标准曲线的AM/AP比率(33.3%)时,测试结果明显高估直链淀粉含量。基于96孔板的碘染分析,建立了马铃薯AM/AP比率和最大吸收峰下波长的标准曲线:y=601.88x0.0215,R2=0.9999。该方法进一步提高了测试准确度和应用范围。利用该方法测试了198个马铃薯品种(系)以及高直链淀粉组分的转基因块茎,明确了收集的马铃薯品种(系)的直链淀粉组成范围为17.4%~33.3%。新建立的马铃薯淀粉组分测试方法为高效准确筛选遗传育种材料以及改良淀粉组分株系提供了方便。
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关键词
马铃薯
淀粉组分
检测体系
直链淀粉
支链淀粉
原文传递
题名
资阳香橙砧木CjSPL基因家族鉴定及表达模式分析
被引量：
1
1
作者
彭
洪
娴
邱洁雅
惠秋玲
徐媛媛
淳长品
凌丽俐
曹立
何义仲
彭
良志
付行政
机构
西南大学柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期625-639,共15页
基金
国家自然科学基金(32072550)
国家重点研发计划(2018YFD1000300)
国家现代农业(柑橘)产业技术体系建设专项(CARS-26)。
文摘
鳞片启动子结合类蛋白(squamosa promoter binding protein-like,SPL)家族是一类参与调控植物生长发育以及响应环境胁迫的重要转录因子,但在柑橘等多年生果树中的研究较少。本研究以柑橘一种重要的砧木——资阳香橙(Citrus junos Sieb.ex Tanaka)为材料,基于plantTFDB转录因子数据库和甜橙基因组数据库鉴定并克隆出资阳香橙15个SPL家族基因,命名为CjSPL1–CjSPL15。序列分析表明,CjSPLs的开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为393–2865 bp,编码130–954个氨基酸;系统进化树将15个CjSPLs分为9个亚家族;基因结构和保守结构域分析预测出20个不同的保守motif和SBP基本结构域;启动子顺式作用元件分析预测出20种启动子元件,其中包含植物生长发育、非生物胁迫及次生代谢物相关元件。通过实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)分析了CjSPLs在干旱、盐和低温胁迫下的表达模式,较多CjSPLs在胁迫处理后显著上调表达。本研究为后续深入研究柑橘及其他果树SPL家族转录因子功能提供参考。
关键词
资阳香橙
SPL基因家族
非生物胁迫
表达模式
Keywords
Ziyang Xiangcheng
SPL gene family
abiotic stress
expression pattern
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S666.4 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
马铃薯块茎淀粉组分高效检测体系的建立及应用
被引量：
5
2
作者
宋玉浩
史伟玲
张娇
丁振宇
彭
洪
娴
蒋春燕
马秋芹
李芝静
赵勇
唐道彬
张凯
王季春
刘勋
机构
西南大学农学与生物科技学院
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期600-608,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31571728)
重庆市技术创新与应用发展专项(cstc2019jscx-gksbX0157)
+1 种基金
西南大学基本科研业务费专项资金项目(XDJK2019D023)
国家重点研发计划项目(2018YFE0127900)。
文摘
马铃薯块茎淀粉组分(直链/支链淀粉比AM/AP)影响淀粉特性以及决定其在食品和其他工业上的应用。AM/AP的测定对其合理利用以及选育特异淀粉组分的专用品种等具有重要意义。采用96孔板双波长法对马铃薯不同AM/AP比率标准样品进行测试,发现当测试样品AM/AP比率超过制作标准曲线的AM/AP比率(33.3%)时,测试结果明显高估直链淀粉含量。基于96孔板的碘染分析,建立了马铃薯AM/AP比率和最大吸收峰下波长的标准曲线:y=601.88x0.0215,R2=0.9999。该方法进一步提高了测试准确度和应用范围。利用该方法测试了198个马铃薯品种(系)以及高直链淀粉组分的转基因块茎,明确了收集的马铃薯品种(系)的直链淀粉组成范围为17.4%~33.3%。新建立的马铃薯淀粉组分测试方法为高效准确筛选遗传育种材料以及改良淀粉组分株系提供了方便。
关键词
马铃薯
淀粉组分
检测体系
直链淀粉
支链淀粉
Keywords
potato
starch component
detection system
amylose
amylopectin
分类号
S532 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
资阳香橙砧木CjSPL基因家族鉴定及表达模式分析
彭
洪
娴
邱洁雅
惠秋玲
徐媛媛
淳长品
凌丽俐
曹立
何义仲
彭
良志
付行政
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
原文传递
2
马铃薯块茎淀粉组分高效检测体系的建立及应用
宋玉浩
史伟玲
张娇
丁振宇
彭
洪
娴
蒋春燕
马秋芹
李芝静
赵勇
唐道彬
张凯
王季春
刘勋
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
原文传递
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