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中药高通量转录组研究进展
被引量：
14
1
作者
张召
宝
侯林
+4 位作者
潘晴
王绪敏
崔清华
田景振
马鲁豫
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1553-1558,共6页
中药是中华传统文化的瑰宝,是中华民族智慧的结晶。新方法技术的不断应用使得中药研究与时俱进。高通量转录组研究经过数年的发展,已经成为一项较为成熟的研究手段。该文对中药转录组研究概况进行了综述,比较了Roche公司的GS FLXTM平台...
中药是中华传统文化的瑰宝,是中华民族智慧的结晶。新方法技术的不断应用使得中药研究与时俱进。高通量转录组研究经过数年的发展,已经成为一项较为成熟的研究手段。该文对中药转录组研究概况进行了综述,比较了Roche公司的GS FLXTM平台和Illumina公司的HiSeqTM2000平台两大测序平台,介绍了中药转录组分析的流程,并以西洋参和金银花为例,阐述了中药转录组研究的特色。对传统中药进行高通量转录组研究,可以从整体水平上了解目标物种的功能基因概况,明确活性成分的代谢通路,为中药研究奠定分子生物学基础,为传统中医药理论提供现代生物学阐释。但是,目前的中药转录组研究仍面临着分子基础薄弱,测序投资成本高,分析人员紧缺等困难。未来,伴随测序技术的发展与完善,转录组与蛋白质组、代谢组等组学的联合应用,将为开创高通量筛选与高效率研发相结合的新型中药产业发展模式奠定坚实的基础。
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关键词
中药
转录组
西洋参
金银花
原文传递
中药三萜皂苷合成通路的生物信息学分析
被引量：
4
2
作者
张召
宝
侯林
+2 位作者
崔清华
潘晴
马鲁豫
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1255-1261,共7页
目的从系统进化学角度对中药三萜皂苷合成通路中关键酶进行生物信息学分析。方法从NCBI数据库下载已有17种中药中的鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质全长序列,通过生物信息学软件对其进行理化性质分析、保守域分析...
目的从系统进化学角度对中药三萜皂苷合成通路中关键酶进行生物信息学分析。方法从NCBI数据库下载已有17种中药中的鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质全长序列,通过生物信息学软件对其进行理化性质分析、保守域分析、蛋白质三维结构预测和系统进化树的构建。结果序列分析表明,鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质序列保守性均较高。其中鲨烯合成酶具有两个高度保守的区域——富含天冬氨酸的镁离子结合位点1和2——可作为认定鲨烯合成酶的依据;鲨烯环氧酶和2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白三维结构保守,无规则卷曲部分为高变区。结论上游合成在进化中趋于保守和稳定;三萜皂苷众多类型的形成可能与下游细胞色素P450、糖基转移酶、β-糖苷酶等的修饰有关。
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关键词
三萜皂苷
鲨烯合成酶
鲨烯环氧酶
2
3-氧化鲨烯环化酶
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职称材料
醒脑益智胶囊不同配比对阿尔茨海默病大鼠行为学的影响
被引量：
1
3
作者
张晓平
侯林
+3 位作者
张龙霏
聂克
张召
宝
田景振
《中国实验方剂学杂志》
CAS
北大核心
2013年第19期221-224,共4页
目的:观察醒脑益智胶囊各组成药物有效部位不同配比对阿尔茨海默病大鼠(AD)行为学的影响,寻找药物最佳配伍比例。方法:雄性Wistar大鼠随机分为假模型组、模型组、阳性药对照组(石杉碱甲0.05 mg·kg-1)、醒脑益智胶囊全方组及8种不...
目的:观察醒脑益智胶囊各组成药物有效部位不同配比对阿尔茨海默病大鼠(AD)行为学的影响,寻找药物最佳配伍比例。方法:雄性Wistar大鼠随机分为假模型组、模型组、阳性药对照组(石杉碱甲0.05 mg·kg-1)、醒脑益智胶囊全方组及8种不同配比药物组。大鼠常规饲养3 d后,Morris水迷宫训练7 d,进行1.25%D-半乳糖腹腔注射(4 mL·kg-1),连续6周,联合Aβ1-40海马内注射2μL(5 g·L-1)复合造模,造模1周后,连续ig给药30 d,采用Morris水迷宫实验观察不同配比药物改善学习记忆的作用。结果:与模型组比较,各给药组大鼠空间学习能力显著提高,定向航行试验中搜索平台潜伏期缩短,空间探索实验中跨台次数增加,与模型组比较均有显著性差异(P<0.05或P<0.01)。其中4组即冰片∶淫羊藿苷∶远志总皂苷∶三七总皂苷45∶6.8∶32.6∶0(mg·kg-1)影响较为明显。结论:醒脑益智胶囊各组成药物有效部位不同配比均具有改善大鼠空间学习记忆的能力,但作用效果存在差异。
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关键词
醒脑益智胶囊
阿尔茨海默病
行为学
Morris水迷宫试验
原文传递
题名
中药高通量转录组研究进展
被引量：
14
1
作者
张召
宝
侯林
潘晴
王绪敏
崔清华
田景振
马鲁豫
机构
山东中医药大学药学院
中国科学院北京基因组研究所基因组学与信息重点实验室
中国科学院北京基因组研究所中药道地基因联合实验室
山东省医学科学院
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1553-1558,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81273394)
文摘
中药是中华传统文化的瑰宝,是中华民族智慧的结晶。新方法技术的不断应用使得中药研究与时俱进。高通量转录组研究经过数年的发展,已经成为一项较为成熟的研究手段。该文对中药转录组研究概况进行了综述,比较了Roche公司的GS FLXTM平台和Illumina公司的HiSeqTM2000平台两大测序平台,介绍了中药转录组分析的流程,并以西洋参和金银花为例,阐述了中药转录组研究的特色。对传统中药进行高通量转录组研究,可以从整体水平上了解目标物种的功能基因概况,明确活性成分的代谢通路,为中药研究奠定分子生物学基础,为传统中医药理论提供现代生物学阐释。但是,目前的中药转录组研究仍面临着分子基础薄弱,测序投资成本高,分析人员紧缺等困难。未来,伴随测序技术的发展与完善,转录组与蛋白质组、代谢组等组学的联合应用,将为开创高通量筛选与高效率研发相结合的新型中药产业发展模式奠定坚实的基础。
关键词
中药
转录组
西洋参
金银花
Keywords
traditional Chinese medicine
transcriptome
Panax quinq
folius
Lonicera japonica
分类号
R341 [医药卫生—基础医学]
原文传递
题名
中药三萜皂苷合成通路的生物信息学分析
被引量：
4
2
作者
张召
宝
侯林
崔清华
潘晴
马鲁豫
机构
山东中医药大学药学院
山东省医学科学院
出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1255-1261,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81273394)
"十二五"重大新药创制国家科技重大专项(2013ZX09103002-005)
文摘
目的从系统进化学角度对中药三萜皂苷合成通路中关键酶进行生物信息学分析。方法从NCBI数据库下载已有17种中药中的鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质全长序列,通过生物信息学软件对其进行理化性质分析、保守域分析、蛋白质三维结构预测和系统进化树的构建。结果序列分析表明,鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质序列保守性均较高。其中鲨烯合成酶具有两个高度保守的区域——富含天冬氨酸的镁离子结合位点1和2——可作为认定鲨烯合成酶的依据;鲨烯环氧酶和2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白三维结构保守,无规则卷曲部分为高变区。结论上游合成在进化中趋于保守和稳定;三萜皂苷众多类型的形成可能与下游细胞色素P450、糖基转移酶、β-糖苷酶等的修饰有关。
关键词
三萜皂苷
鲨烯合成酶
鲨烯环氧酶
2
3-氧化鲨烯环化酶
Keywords
triterpenoid saponin
squalene synthase
squalene epoxidase
2,3-oxidosqualene cyclase
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
醒脑益智胶囊不同配比对阿尔茨海默病大鼠行为学的影响
被引量：
1
3
作者
张晓平
侯林
张龙霏
聂克
张召
宝
田景振
机构
山东中医药大学
出处
《中国实验方剂学杂志》
CAS
北大核心
2013年第19期221-224,共4页
基金
国家重大新药创制专项(2011ZX09102-003-06)
文摘
目的:观察醒脑益智胶囊各组成药物有效部位不同配比对阿尔茨海默病大鼠(AD)行为学的影响,寻找药物最佳配伍比例。方法:雄性Wistar大鼠随机分为假模型组、模型组、阳性药对照组(石杉碱甲0.05 mg·kg-1)、醒脑益智胶囊全方组及8种不同配比药物组。大鼠常规饲养3 d后,Morris水迷宫训练7 d,进行1.25%D-半乳糖腹腔注射(4 mL·kg-1),连续6周,联合Aβ1-40海马内注射2μL(5 g·L-1)复合造模,造模1周后,连续ig给药30 d,采用Morris水迷宫实验观察不同配比药物改善学习记忆的作用。结果:与模型组比较,各给药组大鼠空间学习能力显著提高,定向航行试验中搜索平台潜伏期缩短,空间探索实验中跨台次数增加,与模型组比较均有显著性差异(P<0.05或P<0.01)。其中4组即冰片∶淫羊藿苷∶远志总皂苷∶三七总皂苷45∶6.8∶32.6∶0(mg·kg-1)影响较为明显。结论:醒脑益智胶囊各组成药物有效部位不同配比均具有改善大鼠空间学习记忆的能力,但作用效果存在差异。
关键词
醒脑益智胶囊
阿尔茨海默病
行为学
Morris水迷宫试验
Keywords
Xingnao Yizhi capsule
Alzheimer＇s disease
ethology
Morris water maze test
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中药高通量转录组研究进展
张召
宝
侯林
潘晴
王绪敏
崔清华
田景振
马鲁豫
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
14
原文传递
2
中药三萜皂苷合成通路的生物信息学分析
张召
宝
侯林
崔清华
潘晴
马鲁豫
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
下载PDF
职称材料
3
醒脑益智胶囊不同配比对阿尔茨海默病大鼠行为学的影响
张晓平
侯林
张龙霏
聂克
张召
宝
田景振
《中国实验方剂学杂志》
CAS
北大核心
2013
1
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