陆地棉CRK基因家族的鉴定及其表达分析 被引量：8

1

作者 张中起 王娇 +4 位作者 靳炜 葛冬冬 刘康 吕芬妮 孙敬 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第13期2442-2461,共20页

【目的】富含半胱氨酸类受体激酶(CRK)是植物中最大的类受体激酶家族之一,在植物生长发育、激素信号传导和抗逆境胁迫中发挥重要作用。从全基因组水平鉴定陆地棉CRK基因家族并进行生物信息学和表达模式分析,为研究和利用陆地棉CRK基因... 【目的】富含半胱氨酸类受体激酶(CRK)是植物中最大的类受体激酶家族之一,在植物生长发育、激素信号传导和抗逆境胁迫中发挥重要作用。从全基因组水平鉴定陆地棉CRK基因家族并进行生物信息学和表达模式分析,为研究和利用陆地棉CRK基因家族奠定基础。【方法】从Pfam数据库下载stress-antifung结构域氨基酸序列,应用BLASTp程序搜索棉花基因组数据库,鉴定棉花CRK基因家族;利用Compute p I/Mw tool、Signal P、TMHMM Server V2.0、Wo LF POSRT等在线工具预测陆地棉CRK家族蛋白的分子量、信号肽、跨膜结构域和亚细胞定位等;用Clustal X1.8软件对棉花和拟南芥CRK蛋白质进行氨基酸序列比对,MEGA5.0分析棉花和拟南芥CRK蛋白的系统进化关系;使用TBtools制作陆地棉CRK基因家族的染色体定位、基因结构和蛋白质结构域示意图;应用植物顺式调控元件数据库Plant CARE分析棉花启动子序列;通过植物磷酸化位点数据库Plant Phos预测陆地棉CRK家族蛋白的磷酸化位点;从NCBI数据库下载RNA-Seq数据,利用转录组定量工具Kallisto计算TPM值,通过在线工具Morpheus绘制陆地棉CRK家族基因表达热图。【结果】陆地棉基因组中有70个CRK基因,分布于14条染色体,其中52个基因(74.3%)集中串联成簇分布于A6/D6、A9/D9、A10/D10染色体,且在A/D染色体组之间呈现高度共线性关系。编码302—901个氨基酸,58个蛋白质(82.9%)具有跨膜结构域,主要定位于叶绿体、质膜和胞外。磷酸化位点预测结果表明,陆地棉和拟南芥CRK有5个相同的磷酸化位点基序,包括3种丝氨酸磷酸化位点基序和2种苏氨酸磷酸化位点基序。65个陆地棉CRK基因的启动子区(92.9%)至少含有一种逆境激素响应元件,69个基因启动子区(98.6%)至少含有一种生物或非生物胁迫响应元件。根据RNA-Seq数据分析结果,陆地棉CRK基因可分为3种不同的组织表达特征类型;盐、干旱、冷、� 展开更多

关键词 陆地棉 富含半胱氨酸蛋白激酶 基因家族 抗逆性 GH CRK25

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玉米TRV-VIGS的优化与顶腐病抗病基因的鉴定 被引量：6

2

作者 李聪聪 安晓晖 +2 位作者 张中起 刘康 孙敬 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2111-2118,共8页

烟草脆裂病毒(TRV)介导的基因沉默方法简便易行,但在常规试验条件下按照报道的方法操作沉默玉米基因的效率较低,难以实际应用。为了优化TRV-VIGS体系,并鉴定顶腐病抗病基因,本研究以玉米八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因为靶基因,构建沉默载... 烟草脆裂病毒(TRV)介导的基因沉默方法简便易行,但在常规试验条件下按照报道的方法操作沉默玉米基因的效率较低,难以实际应用。为了优化TRV-VIGS体系,并鉴定顶腐病抗病基因,本研究以玉米八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因为靶基因,构建沉默载体pTRV2-ZmPDS,从浸种处理、农杆菌菌株、真空辅助渗入和共培养时间4个试验因素优化玉米TRV-VIGS体系,提高基因沉默效率。结果表明,无菌水浸泡种子24 h,剥去种皮后用LB4404农杆菌菌株真空渗入处理60 min,再共培养10 h时,全株白化苗占出苗植株总数的25. 1%~29. 3%,较优化前沉默比率(3. 0%)提高了8~10倍。半定量RTPCR分析表明,与对照和未白化植株相比,白化植株的ZmPDS基因转录水平显著降低。应用优化的TRV-VIGS体系沉默ZmMAC3基因,高抗顶腐病的玉米杂交种先玉335在接种亚粘团镰孢菌后表现出典型的顶腐病病症,表明,与双子叶植物相似,MAC3蛋白是玉米内生免疫和抗病所必需的关键调控因子。综上所述,优化后的TRV-VIGS体系可以应用于玉米基因功能的鉴定。 展开更多

关键词 玉米 TRV-VIGS PDS MAC3 真空辅助农杆菌渗入

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高产优质大豆新品种菏豆37的选育与应用

3

作者 梁邦平 王俊涛 +5 位作者 李素娟 张中起 高保民 何迪 王秋玲 刘艳 《贵州农业科学》 CAS 2024年第9期1-6,共6页

【目的】选育高产高蛋白大豆新品种,为满足市场对高蛋白、高蛋脂双高大豆品种的需求。【方法】菏泽市农业科学院2003年以中黄13(白花)作母本、以菏豆12作父本组配杂交组合,经系谱法选育高蛋白大豆新品种。【结果】育成的高蛋白大豆新品... 【目的】选育高产高蛋白大豆新品种,为满足市场对高蛋白、高蛋脂双高大豆品种的需求。【方法】菏泽市农业科学院2003年以中黄13(白花)作母本、以菏豆12作父本组配杂交组合,经系谱法选育高蛋白大豆新品种。【结果】育成的高蛋白大豆新品在2020—2021年国家黄淮海南片区域试验中平均产量分别为2886.0 kg/hm^(2)和3046.7 kg/hm^(2),比对照(中黄13)分别增产4.5%和9.8%。2022年参加国家黄淮海南片生产试验,平均产量3254.8 kg/hm^(2),比对照(中黄13)增产8.4%。2023年通过国家农作物品种审定委员会审定,审定编号:国审豆20231043,命名为菏豆37。【结论】菏豆37丰产性和稳产性较好,籽粒较大,蛋白质含量45.01%,脂肪含量20.47%,蛋脂总和达65.48%,属于高蛋白和蛋脂双高品种。 展开更多

关键词 大豆 菏豆37 高产 高蛋白 蛋脂双高

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大豆新品种菏豆36号的亲本系谱、丰产性、稳产性及适应性分析

4

作者 张中起 王俊涛 +4 位作者 刘艳 梁邦平 高保民 何迪 王秋玲 《黑龙江农业科学》 2024年第4期54-59,共6页

为促进大豆新品种菏豆36号在黄淮地区的推广应用,利用菏豆36号参加2018-2019年黄淮海夏大豆品种试验的数据,采用亲本分析、方差分析、比较分析法、高稳系数法和适应性参数法等分析方法,对该品种的亲本系谱、丰产稳产性和适应性等进行分... 为促进大豆新品种菏豆36号在黄淮地区的推广应用,利用菏豆36号参加2018-2019年黄淮海夏大豆品种试验的数据,采用亲本分析、方差分析、比较分析法、高稳系数法和适应性参数法等分析方法,对该品种的亲本系谱、丰产稳产性和适应性等进行分析和综合评价。结果表明,在区域试验和生产试验中,菏豆36号较对照品种中黄13增产极显著,稳产性和适应性均优于对照品种。该品种适宜在山东南部,河南南部,江苏和安徽两省淮河以北地区夏播种植。 展开更多

关键词 菏豆36号 亲本系谱 丰产性 稳产性 适应性

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菏泽市大豆产业和种业发展现状、问题及对策

5

作者 张中起 梁邦平 +3 位作者 王俊涛 高保民 刘艳 王秋玲 《黑龙江农业科学》 2023年第6期79-84,共6页

为了促进山东省菏泽市大豆产业和种业发展,利用中国种业大数据平台、国家统计局网站、山东省统计局网站、菏泽市统计局网站等获得菏泽市大豆育成品种信息、种植面积总产量和单产等数据,并分析菏泽市大豆产业和种业发展现状及存在的问题... 为了促进山东省菏泽市大豆产业和种业发展,利用中国种业大数据平台、国家统计局网站、山东省统计局网站、菏泽市统计局网站等获得菏泽市大豆育成品种信息、种植面积总产量和单产等数据,并分析菏泽市大豆产业和种业发展现状及存在的问题。深入分析发现,大豆种植面积整体呈下降趋势、单产水平稳步提升、大豆育种企事业单位数量较少、商业化育种体系不健全、创新能力不足、种质资源保护与利用不足、耐盐碱大豆品种选育空白等;针对存在的问题提出积极推广大豆-玉米带状复合种植、加强种质资源鉴定与创新利用、建立生物育种技术平台、扩大育种目标等建议,以期进一步推动菏泽市大豆产业发展和种业振兴。 展开更多

关键词 菏泽市 大豆 产业发展 种业振兴

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夏大豆新品种菏豆41的高效栽培管理技术

6

作者 梁邦平 刘艳 +3 位作者 张中起 高保民 王俊涛 王秋玲 《中国种业》 2023年第7期123-125,共3页

菏豆41为菏泽市农业科学院选育的高产夏大豆新品种,2022年通过山东省品种审定委员会审定,审定编号:鲁审豆20220002。该品种高产、优质、商品性好,适合在山东省进行夏播种植。

关键词 夏大豆 菏豆41 高产

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棉花E3泛素连接酶基因GhRING1-like的克隆及功能分析 被引量：4

7

作者 夏朝阳 安晓晖 +2 位作者 张中起 葛冬冬 刘康 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期39-50,共12页

[目的]RING(really interesting new gene) finger E3泛素连接酶在植物生长发育和抵御环境胁迫中具有重要作用。克隆棉花RING finger E3泛素连接酶基因GhRING1-like并分析其表达特征和功能,为该基因分子作用机制研究和育种应用奠定基础... [目的]RING(really interesting new gene) finger E3泛素连接酶在植物生长发育和抵御环境胁迫中具有重要作用。克隆棉花RING finger E3泛素连接酶基因GhRING1-like并分析其表达特征和功能,为该基因分子作用机制研究和育种应用奠定基础。[方法]根据棉花表达谱分析,选取并克隆干旱胁迫处理上调表达基因GhRING1-like,qRT-PCR分析GhRING1-like的组织表达特性及其对不同非生物胁迫和激素处理的响应模式;采用瞬时表达对GhRING1-like-GFP融合蛋白进行亚细胞定位分析;通过获得病毒介导的基因沉默(VIGS)棉花和过表达拟南芥植株,分析沉默或过表达GhRING1-like对植株生长发育及其抗旱性的影响。[结果]GhRING1-like基因序列全长996 bp,编码332个氨基酸,其C端含有RING-H_2(C3H_2C3)结构域。GhRING1-like定位于内质网上。GhRING1-like在叶片中优势表达; 200 g·L^(-1)PEG6000诱导处理1 h后瞬时显著上调表达12倍; GhRING1-like对Na Cl、ABA和SA的响应时间都在处理后3 h,上调表达均在5倍左右。干旱胁迫处理后,VIGS沉默GhRING1-like棉花叶片相对含水量和叶绿素荧光参数Fv/Fm分别较未沉默对照降低17.1%和30.6%,而电解质渗透率和丙二醛含量分别较对照提高70.8%和100%。过表达GhRING1-like显著提高了拟南芥种子萌发和幼苗期对于甘露醇引起的渗透胁迫的耐受性;可使营养生长中后期阶段的拟南芥在水分亏缺处理下的存活率提高2.4倍;转基因拟南芥叶片气孔开度降低51.2%,失水率明显降低。干旱胁迫下,过表达GhRING1-like使依赖于ABA诱导表达的At AREB1、At ERD15、AtRD29A上调表达,而对不依赖ABA的干旱胁迫诱导基因At DREB和脯氨酸合成基因At PLD没有影响。[结论]棉花GhRING1-like参与了植物非生物胁迫抗性的调控,主要通过依赖于ABA通路正向调控植物的抗旱反应。 展开更多

关键词 E3泛素连接酶 干旱胁迫 实时荧光定量PCR 病毒介导的基因沉默(VIGS) 转基因拟南芥

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大豆VLN基因家族的全基因组鉴定及组织表达分析

8

作者 张中起 梁邦平 +3 位作者 王俊涛 高保民 刘艳 王秋玲 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第3期35-45,共11页

绒毛蛋白(villin,VLN)是最重要的肌动蛋白结合蛋白(actin-binding proteins,简称ABPs)之一,参与肌动蛋白丝的解聚和组装,具有成核、成帽、切割和捆绑等重要的功能。分析大豆VLN基因家族成员的数量、序列特征、系统进化和表达模式,为阐... 绒毛蛋白(villin,VLN)是最重要的肌动蛋白结合蛋白(actin-binding proteins,简称ABPs)之一,参与肌动蛋白丝的解聚和组装,具有成核、成帽、切割和捆绑等重要的功能。分析大豆VLN基因家族成员的数量、序列特征、系统进化和表达模式,为阐明大豆VLNs基因的生物学功能奠定基础。通过HMM方法检索大豆中黄13的参考基因组,鉴定大豆VLN基因家族成员;利用在线网站NCBI-CDD、SMART、PDB、ExPASy和Plant-mPLoc分析大豆VLNs蛋白的理化性质;利用MG2C、GSDS、MEME和PlantCARE分析大豆VLNs基因的序列特征;通过转录组测序数据分析大豆VLNs基因表达模式;利用在线网站STRING 11.5构建大豆VLNs蛋白互作网络。从大豆中共鉴定出8个VLNs基因,它们分布于8条染色体,亚细胞定位均位于细胞质。大豆VLN家族基因的外显子/内含子数量较多且基因序列较长,启动子区有大量与生长发育、植物激素、生物胁迫和非生物胁迫等相关的响应元件,成员间蛋白序列有一定的保守性和相似性,大豆VLN家族蛋白在系统进化上分为3组。部分大豆VLNs基因在根、茎、花、荚和种子中特异性表达,蛋白互作网络显示成员间存在潜在的相互作用。大豆VLN基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析结果,为进一步解析大豆VLNs基因功能提供了重要的理论基础。大豆共有8个VLNs基因,它们均定位于细胞质,具有响应生长发育、激素和胁迫的调控元件,GmVLN3、GmVLN5和GmVLN6在根、茎、荚中特异性优势表达。 展开更多

关键词 大豆 VLN基因家族 鉴定 表达分析

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国审夏大豆菏豆28号的丰产性、稳产性及适应性分析 被引量：2

9

作者 张中起 刘艳 +3 位作者 梁邦平 王俊涛 高保民 王秋玲 《种子》 北大核心 2022年第8期110-115,F0003,共7页

根据2016-2018年国家黄淮海夏大豆品种试验报告的数据,利用方差分析、变异系数、高稳系数、增产点比例和适应度等方法,对菏豆28号的丰产性、稳产性和适应性进行分析和综合评价。结果表明,菏豆28号比对照品种中黄13增产,差异极显著,具有... 根据2016-2018年国家黄淮海夏大豆品种试验报告的数据,利用方差分析、变异系数、高稳系数、增产点比例和适应度等方法,对菏豆28号的丰产性、稳产性和适应性进行分析和综合评价。结果表明,菏豆28号比对照品种中黄13增产,差异极显著,具有良好的丰产性;变异系数(CV)和高稳系数(HSC)分析结果表明,菏豆28号具有良好的稳产性;增产点比例和适应度分析结果显示,菏豆28号在不同生态区具有广泛的适应性。研究表明,菏豆28号是一个综合性状好、丰产性高、稳产性高和适应性广的优质夏大豆新品种,适宜在山东省南部、河南省南部、江苏和安徽两省淮河以北地区夏播种植。 展开更多

关键词 夏大豆 菏豆28号 丰产性 稳产性 适应性

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高蛋白夏大豆新品种菏豆38 被引量：1

10

作者 张中起 刘艳 +3 位作者 梁邦平 王俊涛 高保民 王秋玲 《中国种业》 2022年第1期127-128,共2页

菏豆38是山东省菏泽市农业科学院以黄沙豆为母本、菏豆12号为父本通过有性杂交经系谱法选择培育而成的大豆新品种,2021年通过山东省农作物品种审定委员会审定。菏豆38为高蛋白大豆品种,蛋白质(干基)含量45.02%,粗脂肪(干基)含量19.08%,... 菏豆38是山东省菏泽市农业科学院以黄沙豆为母本、菏豆12号为父本通过有性杂交经系谱法选择培育而成的大豆新品种,2021年通过山东省农作物品种审定委员会审定。菏豆38为高蛋白大豆品种,蛋白质(干基)含量45.02%,粗脂肪(干基)含量19.08%,蛋白质、脂肪含量合计64.10%。菏豆38株型紧凑、分枝中等,适宜种植密度为1.0万~1.3万株/667m^(2)。为促进高蛋白大豆新品种菏豆38在生产上的推广应用,对其系谱来源、特征特性和栽培技术进行了总结。 展开更多

关键词 夏大豆 菏豆38 特征特性 栽培技术

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压铸模的预热及冷却

11

作者 张中起 《发动机燃料系统》 2000年第4期27-28,共2页

关键词 压铸模 预热处理 冷却处理

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高产大豆新品种菏豆39及其栽培技术

12

作者 梁邦平 刘艳 +3 位作者 张中起 高保民 王俊涛 王秋玲 《中国种业》 2021年第11期121-122,共2页

菏豆39是由山东省菏泽市农业科学院以菏豆17号作母本、中黄13作父本进行有性杂交选育的高产夏大豆新品种,2017-2018年参加山东省大豆区域试验,平均产量221.0kg/667m^(2),较对照品种菏豆12号平均增产5.5%;2019年参加山东省大豆生产试验,... 菏豆39是由山东省菏泽市农业科学院以菏豆17号作母本、中黄13作父本进行有性杂交选育的高产夏大豆新品种,2017-2018年参加山东省大豆区域试验,平均产量221.0kg/667m^(2),较对照品种菏豆12号平均增产5.5%;2019年参加山东省大豆生产试验,平均产量222.9kg/667m^(2),较对照菏豆12号增产6.1%;经接种鉴定,对大豆花叶病毒SC-3和SC-7株系均表现为中感。该品种高产、优质、商品性好,于2021年通过山东省农作物品种审定委员会审定,对其品种特征特性、产量表现及其高效栽培管理技术进行介绍。 展开更多

关键词 夏大豆 菏豆39 高产 栽培技术

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