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基于网络药理学探究苍术抗血管性痴呆的作用机制
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作者 苏文欣 刘瑶 +2 位作者 袁宪宇 向勤 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2024年第3期0101-0105,共5页
基于网络药理学研究苍术抗血管性痴呆的作用机制。方法 通过TCMSP数据库和Uniprot数据库筛选苍术的活性成分及作用靶点,通过OMIM数据库和Gene cards数据库筛选VaD作用靶点,用jvenn工具软件获取苍术和VaD的交集靶点,利用STRING构建中药-... 基于网络药理学研究苍术抗血管性痴呆的作用机制。方法 通过TCMSP数据库和Uniprot数据库筛选苍术的活性成分及作用靶点,通过OMIM数据库和Gene cards数据库筛选VaD作用靶点,用jvenn工具软件获取苍术和VaD的交集靶点,利用STRING构建中药-疾病靶点蛋白相互作用网络与筛选核心基因;结合两者的数据用Cytoscape 3.9.1建立与血管性痴呆相关的苍术对活性成分—潜在靶点网络,利用DAVID平台对网络进行GO富集分析、KEGG通路注释分析,研究苍术抗血管性痴呆的作用机制。经过研究,苍术中发现了9种有效的化学成分,而且这些成分对血管性痴呆的治疗有着重要的作用,共计发现了49个潜在靶点,其中包括AKT1、TNF、IL6、CASP3和TP53等核心基因。经GO功能富集分析,共收录了419个条目,包括314个生物过程、40个分子功能和65个细胞成分。经KEGG通路注释分析,共检索到44条通道,包括有癌症信号通路、糖尿病并发症的AGE-RAGEA信号通路等。结论 初步验证和预测苍术主要通过抑制炎症的途径抗血管性痴呆,为研发治疗血管性痴呆的药物提供一定的理论数据和开发方向。 展开更多
关键词 网络药理学 苍术抗血 管性痴呆
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MFSD8结构与功能的预测分析研究 被引量:1
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作者 刘宇琦 +2 位作者 苏文欣 龚厚武 向勤 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2022年第11期4-6,共3页
预测和分析Major Facilitator Superfamily Domaincontaining 8(MFSD8)的结构与功能,为其功能的进一步研究提供新的思路和参考。方法 从NCBI获得MFSD8的基因序列和蛋白氨基酸序列。利用Expasy在线分析工具对MFSD8蛋白理化性质进行分析,S... 预测和分析Major Facilitator Superfamily Domaincontaining 8(MFSD8)的结构与功能,为其功能的进一步研究提供新的思路和参考。方法 从NCBI获得MFSD8的基因序列和蛋白氨基酸序列。利用Expasy在线分析工具对MFSD8蛋白理化性质进行分析,Swiss-Mode预测其三级结构,STRING预测其互作蛋白,并对互作蛋白进行GO注释和KEGG分析。结果 人MFSD8蛋白分子式为C2664H4114N660O717S23,分子量为57627.58 Da,理论等电点为6.41,半衰期为30 h,不稳定系数为40.9,脂肪族氨基酸系数为114.42,亲水性平均值为0.45,为酸性蛋白分子;结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主;预测互作蛋白主要为CLN6、CLN3、CLN5、TPP1、MFSD11、PPT1,互作蛋白主要涉及溶酶体组织等多个生物过程,涉及膜筏等多个细胞组分,参与溶血磷脂酸结合剂分子功能,并显著参与溶酶体信号通路。结论 该研究结果具有较高的价值,可为进一步研究MFSD8的功能提供新的思路和理论依据。 展开更多
关键词 MFSD8 结构 功能 生物信息学
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