目的:运用网络药理学方法分析荜茇调控铁死亡治疗肺癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、Genecards数据库获得荜茇活...目的:运用网络药理学方法分析荜茇调控铁死亡治疗肺癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、Genecards数据库获得荜茇活性成分及相关靶点、肺癌相关疾病靶点并取交集靶点。通过Cytoscape 3.8.0构建“药物-成分-疾病-靶点”网络,分析其作用机制。通过String数据库构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),筛选荜茇治疗肺癌的核心靶点,通过R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。通过FerrDb数据库检索调控铁死亡的基因,最终分析荜茇活性成分、肺癌和铁死亡三者之间关系。通过肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析基因差异表达情况。结果:从TCMSP中获取荜茇有效活性成分15种,靶点158个;从GeneCards数据库获取肺癌相关基因23469个;获得荜茇治疗肺癌的关键靶点68个;从FerrDb数据库获得259个与铁死亡相关的基因;预测得到以IL-6、NOX1、NOX3、PTGS2和G6PD 5个荜茇调控铁死亡治疗肺癌的可能作用靶标,通过分析以上基因在正常与肿瘤组织表达中存在显著差异。结论:荜茇可能通过IL-6、NOX1、NOX3、PTGS2、G6PD 5个基因起到调控铁死亡治疗肺癌的作用。展开更多
文摘目的:运用网络药理学方法分析荜茇调控铁死亡治疗肺癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、Genecards数据库获得荜茇活性成分及相关靶点、肺癌相关疾病靶点并取交集靶点。通过Cytoscape 3.8.0构建“药物-成分-疾病-靶点”网络,分析其作用机制。通过String数据库构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),筛选荜茇治疗肺癌的核心靶点,通过R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。通过FerrDb数据库检索调控铁死亡的基因,最终分析荜茇活性成分、肺癌和铁死亡三者之间关系。通过肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析基因差异表达情况。结果:从TCMSP中获取荜茇有效活性成分15种,靶点158个;从GeneCards数据库获取肺癌相关基因23469个;获得荜茇治疗肺癌的关键靶点68个;从FerrDb数据库获得259个与铁死亡相关的基因;预测得到以IL-6、NOX1、NOX3、PTGS2和G6PD 5个荜茇调控铁死亡治疗肺癌的可能作用靶标,通过分析以上基因在正常与肿瘤组织表达中存在显著差异。结论:荜茇可能通过IL-6、NOX1、NOX3、PTGS2、G6PD 5个基因起到调控铁死亡治疗肺癌的作用。
