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蛋白质组学结合生物信息学分析干眼的蛋白标志物
1
作者 杨延婷 师雅君 +5 位作者 杨光 纪海洋 刘婕 洪珏 张丹 马晓芃 《国际眼科杂志》 CAS 2025年第1期104-111,共8页
目的:通过生物信息学方法分析与干眼(DE)发病机制相关的差异蛋白质,以期揭示其潜在的分子机制。方法:通过检索从建库至2023-08-31发表在PubMed和EMBASE数据库中的采用蛋白质组学方法检测干眼临床样本中蛋白质表达的文章,挑选出差异蛋白... 目的:通过生物信息学方法分析与干眼(DE)发病机制相关的差异蛋白质,以期揭示其潜在的分子机制。方法:通过检索从建库至2023-08-31发表在PubMed和EMBASE数据库中的采用蛋白质组学方法检测干眼临床样本中蛋白质表达的文章,挑选出差异蛋白,并通过STRING数据库和Cytoscape软件进行枢纽基因筛选和模块分析,进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析、基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:最终纳入21篇文献,确定74个差异表达的蛋白质。频率最高的差异蛋白为钙粒蛋白A(calgranulin A,SA1008)、脂质运载蛋白1(LCN1)、溶菌酶(LYZ)、乳腺珠蛋白-B(SCGB2A1)、富脯氨酸蛋白4(PRR4)、转铁蛋白(TF)和钙粒蛋白B(S100A9)。前10个枢纽基因为血清白蛋白(ALB)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素6(IL6)、IL1β、IL8、基质金属蛋白酶9(MMP9)、α-抗胰蛋白酶(SERPINA1)、IL10、补体C3(C3)和乳铁蛋白(LTF)。模块分析推测种子基因为MMP9和PRR4。KEGG分析显示差异表达的蛋白主要富集在IL17信号通路(61.9%)。结论:研究结果揭示了DE的潜在分子靶点和途径,并证实了DE的发病机制与炎症之间的关联。然而,还需要进一步深入研究以证实这些生物标志物在临床实践中的意义。 展开更多
关键词 干眼 蛋白质组学 质谱分析 生物标志物
电针对干眼大鼠角膜自噬相关蛋白调节作用的研究
2
作者 杨延婷 莫晓芬 +8 位作者 马睿琦 杨光 师雅君 赵越 纪海洋 张丹 郭浩东 刘婕 马晓芃 《上海针灸杂志》 CSCD 2024年第6期675-683,共9页
目的观察电针对干眼大鼠角膜自噬的调节作用。方法将雄性Sprague-Dawley(SD)大鼠随机分为正常组、模型组、电针组和假针组。除正常组外,其余3组均采用皮下注射东莨菪碱溶液配合吹风制备大鼠干眼模型。电针组和假针组造模后分别予电针及... 目的观察电针对干眼大鼠角膜自噬的调节作用。方法将雄性Sprague-Dawley(SD)大鼠随机分为正常组、模型组、电针组和假针组。除正常组外,其余3组均采用皮下注射东莨菪碱溶液配合吹风制备大鼠干眼模型。电针组和假针组造模后分别予电针及假针刺干预。检测大鼠干预前后泪膜破裂时间和泪液分泌量,并评估角膜荧光素染色的分值;应用透射电镜观察大鼠角膜组织的超微结构;采用蛋白免疫印迹(Western blotting)技术检测大鼠角膜微管相关蛋白轻链3(microtubule-associatedprotein 1 light chain 3,LC3)、P62和Beclin-1的表达,应用实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)技术检测角膜LC3 mRNA的表达。结果与正常组比较,模型组大鼠泪液分泌量降低,泪膜破裂时间缩短,角膜荧光素染色评分升高,差异均具有统计学意义(P<0.05);角膜上皮细胞肿胀,线粒体明显损伤;角膜LC3Ⅱ和Beclin-1蛋白表达减少,P62蛋白表达增多,LC3 mRNA表达减少,差异均具有统计学意义(P<0.05)。与模型组比较,电针组大鼠泪液分泌量升高,泪膜破裂时间延长,角膜荧光素染色评分降低,差异均具有统计学意义(P<0.05);角膜上皮细胞轻微肿胀,有自噬小体形成;角膜LC3Ⅱ和Beclin-1蛋白表达增多,P62蛋白表达降低,LC3 mRNA表达增多,差异均具有统计学意义(P<0.05)。与模型组比较,假针组细胞器肿胀明显,线粒体损伤明显;其余指标差异均无统计学意义(P>0.05)。结论电针可以促进干眼大鼠角膜组织中自噬的发生,促进自噬可能是电针治疗干眼的潜在机制。 展开更多
关键词 针刺疗法 电针 干眼 角膜 自噬 大鼠
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基于数据挖掘技术分析针灸治疗颈椎病的临床应用规律
3
作者 师雅君 黄琴峰 +5 位作者 杨光 谢晨 黄馨云 孔谐和 金悠悠 马晓芃 《上海针灸杂志》 CSCD 2024年第11期1196-1203,共8页
目的收集整理针灸治疗颈椎病(cervical spondylosis,CS)的临床随机对照试验文献,总结针灸治疗CS的临床应用规律。方法检索中国知网、中国生物医学文献数据库、万方数据库以及维普数据库中2015年1月1日至2023年12月31日发表的临床随机对... 目的收集整理针灸治疗颈椎病(cervical spondylosis,CS)的临床随机对照试验文献,总结针灸治疗CS的临床应用规律。方法检索中国知网、中国生物医学文献数据库、万方数据库以及维普数据库中2015年1月1日至2023年12月31日发表的临床随机对照试验文献,用Microsoft Excel 2019进行计量分析,用SPSS 25.0软件进行穴位系统聚类分析。结果共纳入文献2219篇,提取针灸处方4108条,涉及穴位212个。颈夹脊、风池、大椎、天柱、合谷、肩井、百会、后溪、外关和曲池是常用穴位,有效聚类为颈夹脊-风池、大椎-天柱。根据CS分型不同选穴略有差异,除均多取头颈部穴位外,神经根型、颈型、脊髓型选用上肢穴位较多,椎动脉型、交感型选用下肢穴位较多。总使用频次最高的经脉是足少阳胆经,神经根型CS和脊髓型CS使用频次最高的是手阳明大肠经,椎动脉型CS使用频次最高的是督脉,颈型CS和交感型CS使用频次最高的是足少阳胆经。特定穴中多选取五输穴。此外,神经根型、颈型和脊髓型CS应用最多的八脉交会穴是后溪和外关,而椎动脉型和交感型CS应用最多的是后溪和内关。常用治疗方法依次为针刺、灸法、电针。结论颈夹脊、风池、大椎、天柱、合谷、肩井、百会、后溪、外关和曲池是针灸治疗CS的常用穴位,不同分型选穴和常用经脉略有差异,治疗方法以针刺、灸法和电针为主。 展开更多
关键词 颈椎病 针灸疗法 针刺疗法 灸法 电针 选穴 计量分析
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