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构建MS2-RIP方法用于鉴定lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的相互作用分子 被引量：1
1
作者 巫孟师 熊敏敏 +2 位作者 彭丹 韩雪 钟小敏 《中山大学学报（医学科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期24-32,共9页
【目的】为了探讨lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的作用机制,本研究拟构建一种新的MS2-RIP方法用于鉴定DANCR的相互作用分子。【方法】利用MS2噬菌体衣壳蛋白可与噬菌体复制酶编码基因5’端一段由19个碱基组成的RNA茎环结构序列,即MS2结合位... 【目的】为了探讨lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的作用机制,本研究拟构建一种新的MS2-RIP方法用于鉴定DANCR的相互作用分子。【方法】利用MS2噬菌体衣壳蛋白可与噬菌体复制酶编码基因5’端一段由19个碱基组成的RNA茎环结构序列,即MS2结合位点(MS2 Binding Site,MS2 BS)高效结合的特点,构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒,通过MS2蛋白与MS2 BS的亲和作用,使DANCR得到富集,并且同步捕获与DANCR相互作用的分子,用于进一步分析鉴定。【结果】成功构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒用于MS2-RIP实验,该实验可显著富集DANCR以及作为阳性对照的DANCR结合蛋白EZH2。【结论】基于MS2蛋白与MS2结合位点的高效结合特性,我们针对lncRNA DANCR建立了MS2-RIP方法。该方法可有效富集DANCR以及与DANCR结合的生物活性分子,为研究DANCR的作用机制提供一种新的技术手段。 展开更多
关键词 MS2 RNA结合蛋白免疫沉淀 长链非编码RNA DANCR
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