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拟南芥ATGs在发育和非生物胁迫中的表达特征和功能分析
被引量：
2
1
作者
张鸿哲
朱璐
+2 位作者
左
泽
远
刘文浩
许杰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期2671-2682,共12页
植物细胞自噬(Autophagy)是依赖于液泡来降解体内异常蛋白的重要途径,其中ATGs (Autophagyrelated genes)蛋白对该途径中的核心组分自噬体的形成至关重要。目前在模式植物拟南芥中已经鉴定到35个ATGs,它们对细胞自噬的发生和调节起到关...
植物细胞自噬(Autophagy)是依赖于液泡来降解体内异常蛋白的重要途径,其中ATGs (Autophagyrelated genes)蛋白对该途径中的核心组分自噬体的形成至关重要。目前在模式植物拟南芥中已经鉴定到35个ATGs,它们对细胞自噬的发生和调节起到关键作用,然而全面地认知植物ATGs在生长发育和逆境中的转录表达变化尚有不足。本研究通过收集公共数据库中的转录组数据,利用生物信息学方法挖掘了拟南芥ATGs的表达信息,展示了其在47个不同发育时期或组织部位的表达聚类情况,对比分析了ATGs在植物非生物胁迫情况下的地上部分(茎)和地下部分(根)的表达差异,同时结合ATGs的启动子组分分析,阐明ATGs表达的时空变化可能的调控分子机制。本研究将为进一步探索ATGs在生长发育和非生物胁迫中的功能提供基础数据和相关依据。
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关键词
自噬相关基因(ATGs)
表达模式
生长发育
非生物胁迫
原文传递
拟南芥花药绒毡层细胞中具有基因簇特征的基因进化和功能分析
被引量：
2
2
作者
左
泽
远
刘琬琳
许杰
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期147-162,共16页
在植物基因组中,除了同源基因成簇现象外,近年来还发现一些具有共表达特性的异源基因也能够以基因簇形式存在,但这些异源基因簇的进化和生物学功能尚不清楚。花药发育和花粉形成是植物进化出的特有的生殖生物学过程,同时产生了一些在花...
在植物基因组中,除了同源基因成簇现象外,近年来还发现一些具有共表达特性的异源基因也能够以基因簇形式存在,但这些异源基因簇的进化和生物学功能尚不清楚。花药发育和花粉形成是植物进化出的特有的生殖生物学过程,同时产生了一些在花药绒毡层中特异表达和特定功能的基因簇基因。该研究通过筛选和分析花药绒毡层中基因簇基因的分子特性、表达调控、基因年龄和基因重复进化等信息,探讨花药基因簇基因与植物开花功能进化之间的关系。结果表明,在拟南芥(Arabidopsisthaliana)中共筛选到84个(13个基因簇)花药绒毡层特异高表达的基因簇基因,它们主要产生于串联重复事件,76%的基因出现在开花植物分化后的阶段,主要参与生殖发育、花粉鞘组成和脂代谢等生物学过程。研究初步解析了拟南芥花药绒毡层中基因簇基因的基本特征、生物学功能和基因进化机制,为深入揭示植物基因簇基因的遗传学功能奠定了基础。
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关键词
拟南芥
基因簇
花药绒毡层
基因重复
进化
原文传递
题名
拟南芥ATGs在发育和非生物胁迫中的表达特征和功能分析
被引量：
2
1
作者
张鸿哲
朱璐
左
泽
远
刘文浩
许杰
机构
上海交通大学
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期2671-2682,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31570312,31370026和31500297)资助。
文摘
植物细胞自噬(Autophagy)是依赖于液泡来降解体内异常蛋白的重要途径,其中ATGs (Autophagyrelated genes)蛋白对该途径中的核心组分自噬体的形成至关重要。目前在模式植物拟南芥中已经鉴定到35个ATGs,它们对细胞自噬的发生和调节起到关键作用,然而全面地认知植物ATGs在生长发育和逆境中的转录表达变化尚有不足。本研究通过收集公共数据库中的转录组数据,利用生物信息学方法挖掘了拟南芥ATGs的表达信息,展示了其在47个不同发育时期或组织部位的表达聚类情况,对比分析了ATGs在植物非生物胁迫情况下的地上部分(茎)和地下部分(根)的表达差异,同时结合ATGs的启动子组分分析,阐明ATGs表达的时空变化可能的调控分子机制。本研究将为进一步探索ATGs在生长发育和非生物胁迫中的功能提供基础数据和相关依据。
关键词
自噬相关基因(ATGs)
表达模式
生长发育
非生物胁迫
Keywords
Autophagy-related genes(ATGs)
Expression profile
Growth and development
Abiotic stress
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
Q945.78
原文传递
题名
拟南芥花药绒毡层细胞中具有基因簇特征的基因进化和功能分析
被引量：
2
2
作者
左
泽
远
刘琬琳
许杰
机构
上海交通大学生命科学技术学院
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期147-162,共16页
基金
国家自然科学基金(No.31570312,No.31370026)。
文摘
在植物基因组中,除了同源基因成簇现象外,近年来还发现一些具有共表达特性的异源基因也能够以基因簇形式存在,但这些异源基因簇的进化和生物学功能尚不清楚。花药发育和花粉形成是植物进化出的特有的生殖生物学过程,同时产生了一些在花药绒毡层中特异表达和特定功能的基因簇基因。该研究通过筛选和分析花药绒毡层中基因簇基因的分子特性、表达调控、基因年龄和基因重复进化等信息,探讨花药基因簇基因与植物开花功能进化之间的关系。结果表明,在拟南芥(Arabidopsisthaliana)中共筛选到84个(13个基因簇)花药绒毡层特异高表达的基因簇基因,它们主要产生于串联重复事件,76%的基因出现在开花植物分化后的阶段,主要参与生殖发育、花粉鞘组成和脂代谢等生物学过程。研究初步解析了拟南芥花药绒毡层中基因簇基因的基本特征、生物学功能和基因进化机制,为深入揭示植物基因簇基因的遗传学功能奠定了基础。
关键词
拟南芥
基因簇
花药绒毡层
基因重复
进化
Keywords
Arabidopsis thaliana
gene cluster
anther tapetum
gene duplication
evolution
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
拟南芥ATGs在发育和非生物胁迫中的表达特征和功能分析
张鸿哲
朱璐
左
泽
远
刘文浩
许杰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
原文传递
2
拟南芥花药绒毡层细胞中具有基因簇特征的基因进化和功能分析
左
泽
远
刘琬琳
许杰
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
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