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花不同发育时期的凉粉草转录组分析及黄酮类合成基因挖掘
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作者 尤健开 曾丽珊 +4 位作者 王仲冬 夏艺萌 林颖 詹若挺 张桂芳 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1772-1780,共9页
目的探究凉粉草黄酮类化合物代谢途径的关键基因并比较花不同发育时期(现蕾期、开花期、凋谢期)叶片中的相关基因变化。方法以凉粉草两种栽培品系平远草和台湾草现蕾期、开花期、凋谢期3个时期的叶片为供试材料,运用Illumina NovaSeq 6... 目的探究凉粉草黄酮类化合物代谢途径的关键基因并比较花不同发育时期(现蕾期、开花期、凋谢期)叶片中的相关基因变化。方法以凉粉草两种栽培品系平远草和台湾草现蕾期、开花期、凋谢期3个时期的叶片为供试材料,运用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行转录组测序和生物信息学分析。结果转录数据组装并去冗余得到99945条unigene,其中有56362条unigene成功注释。30116条unigene在KOG数据库中比对获得注释,一般功能预测是最多的一个类群;44461条unigene在GO数据库中比对获得注释,根据功能分为生物进程、细胞组分、分子功能3个GO类别57个小组。筛选得到7466条差异基因,经过KEGG富集分析,差异基因主要富集在植物-病原体相互作用、植物激素信号转导、MAPK信号通路-植物、苯丙烷类生物合成等通路上。51条差异基因与黄酮类生物合成相关,借助基因表达规律的分析,发现两栽培品系基因在同一时期的表达基本一致,现蕾期、开花期与凋谢期3个时期的表达差异显著。随机选取5个差异基因进行RTqPCR验证,结果表明其基因表达与转录组基本一致。结论该研究探知了两种栽培品系中黄酮类化合物代谢途径的关键基因及其在花各发育时期叶片中的表达模式,为探索凉粉草黄酮类生物合成提供了理论基础。 展开更多
关键词 凉粉草 转录组学 差异表达基因 黄酮类化合物 生物合成途径
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基于UPLC-Q-TOF-MS的凉粉草不同栽培品系代谢物分析 被引量：2
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作者 曾丽珊 尤健开 +4 位作者 王艳鸽 夏艺萌 林颖 詹若挺 张桂芳 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1592-1599,共8页
目的基于代谢组学方法探究凉粉草不同栽培品系(台湾草、平远草和增城草)的差异代谢物,筛选品系鉴别的主要代谢物。方法运用超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)非靶向代谢组学技术分析不同品系凉粉草的化学成分,数据经主... 目的基于代谢组学方法探究凉粉草不同栽培品系(台湾草、平远草和增城草)的差异代谢物,筛选品系鉴别的主要代谢物。方法运用超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)非靶向代谢组学技术分析不同品系凉粉草的化学成分,数据经主成分分析、正交偏最小二乘判别分析和方差分析处理,筛选不同品系鉴别的代谢物。结果共筛选得到186种差异代谢物,台湾草、平远草与增城草之间的差异代谢物主要显著富集于黄酮类生物合成通路。3个品系均有芸香苷、山奈酚3-O-葡萄糖苷、槲皮素等黄酮类代谢物;结合差异倍数和文献报道,槲皮素、山奈酚3-O-葡萄糖苷可作为3个凉粉草品系区分的差异代谢物。结论UPLC-Q-TOF-MS代谢组学技术可阐明不同品系凉粉草化学成分差异,为其品系鉴别和资源开发提供参考。 展开更多
关键词 凉粉草 品系 超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱 代谢组学 差异代谢物 黄酮类
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