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基于网络药理学探究丹参对血小板聚集的机制
被引量:
9
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作者
霍苏
崔鹤蓉
+8 位作者
顾昱昊
戴子琦
王亚欣
娄邵
岩
戚蕊
项嘉伟
王鹏龙
马涛
雷海民
《西北药学杂志》
2021年第4期586-595,共10页
目的运用网络药理学的方法预测丹参对血小板聚集的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在的作用机制,以期开发新的抗血小板药物。方法通过TCMSP数据库筛选丹参的有效成分;输入Pharm Mapper数据库获得相应基因;检索GeneCards数据库获...
目的运用网络药理学的方法预测丹参对血小板聚集的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在的作用机制,以期开发新的抗血小板药物。方法通过TCMSP数据库筛选丹参的有效成分;输入Pharm Mapper数据库获得相应基因;检索GeneCards数据库获得血小板聚集的靶点基因;利用R语言3.6.3截取交集网络获得候选靶点;借助Cytoscape 3.7.2将“药物-化合物-靶点-疾病”网络可视化处理;在String平台上构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库对候选靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释;潜在药效成分和关键靶点的分子对接由Autodock Vina 1.1.2实现。结果获得丹参中65个活性化合物、109个不重复的靶标信息、84个血小板聚集治疗靶点。GO功能富集得到GO条目1963个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1789个,细胞组分(CC)条目113个,分子功能(MF)条目61个;KEGG通路富集得到129条信号通路(P<0.05)。分子对接结果显示,丹参中的丹参酮ⅡA与G蛋白偶联受体(GPCRs)等靶点的亲和力强。结论丹参中的有效成分作用血小板聚集的机制与磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路的调控有关,丹参通过介导磷酸腺苷(ADP)诱导的C信号通路对血小板聚集具有较好的整合效应。
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关键词
网络药理学
丹参
血小板聚集
作用机制
分子对接
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题名
基于网络药理学探究丹参对血小板聚集的机制
被引量:
9
1
作者
霍苏
崔鹤蓉
顾昱昊
戴子琦
王亚欣
娄邵
岩
戚蕊
项嘉伟
王鹏龙
马涛
雷海民
机构
北京中医药大学中药学院
出处
《西北药学杂志》
2021年第4期586-595,共10页
基金
中央高校基金科研业务项目(编号:2019-JYB-TD005,BUCM-2019-JCRC002,2020-JYB-ZDGG-044)
中华中医药学会青年人才托举工程项目(编号:CACM-2018-QNRC2-B08)。
文摘
目的运用网络药理学的方法预测丹参对血小板聚集的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在的作用机制,以期开发新的抗血小板药物。方法通过TCMSP数据库筛选丹参的有效成分;输入Pharm Mapper数据库获得相应基因;检索GeneCards数据库获得血小板聚集的靶点基因;利用R语言3.6.3截取交集网络获得候选靶点;借助Cytoscape 3.7.2将“药物-化合物-靶点-疾病”网络可视化处理;在String平台上构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库对候选靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释;潜在药效成分和关键靶点的分子对接由Autodock Vina 1.1.2实现。结果获得丹参中65个活性化合物、109个不重复的靶标信息、84个血小板聚集治疗靶点。GO功能富集得到GO条目1963个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1789个,细胞组分(CC)条目113个,分子功能(MF)条目61个;KEGG通路富集得到129条信号通路(P<0.05)。分子对接结果显示,丹参中的丹参酮ⅡA与G蛋白偶联受体(GPCRs)等靶点的亲和力强。结论丹参中的有效成分作用血小板聚集的机制与磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路的调控有关,丹参通过介导磷酸腺苷(ADP)诱导的C信号通路对血小板聚集具有较好的整合效应。
关键词
网络药理学
丹参
血小板聚集
作用机制
分子对接
Keywords
network pharmacology
Salviae miltiorrhiza
platelet aggregation
mechanism of action
molecular docking
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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题名
作者
出处
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1
基于网络药理学探究丹参对血小板聚集的机制
霍苏
崔鹤蓉
顾昱昊
戴子琦
王亚欣
娄邵
岩
戚蕊
项嘉伟
王鹏龙
马涛
雷海民
《西北药学杂志》
2021
9
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