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深圳地区结核分枝杆菌耐药分离株分子特征与表型特征相关性研究
被引量:
7
1
作者
桂静
王峰
+2 位作者
李金莉
罗道泉
姚立
泰
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期466-471,共6页
目的 研究深圳地区2007-2008年分离的结核分枝杆菌耐药株分子特征与表型特征的相关性.方法 参照WHO/IUATLD标准,使用L-J药敏培养基,1%比例法药敏试验筛选针对异烟肼、利福平、链霉素、氧氟沙星、卡那霉素5种药物耐药或敏感的临床分离株...
目的 研究深圳地区2007-2008年分离的结核分枝杆菌耐药株分子特征与表型特征的相关性.方法 参照WHO/IUATLD标准,使用L-J药敏培养基,1%比例法药敏试验筛选针对异烟肼、利福平、链霉素、氧氟沙星、卡那霉素5种药物耐药或敏感的临床分离株,通过PCR扩增经筛选菌株的rpoB、katG、rpsL、rrs1、gyrAB、rrs2基因的相关序列,运用DNAStar和BLASTN进行序列分析,应用二倍稀释法测定其表型最低抑菌浓度(MIC)值.结果 筛得实验菌株123株,其中耐药株73株,全敏感株50株.异烟肼耐药株katG基因突变率为84.6%,突变位点全部为S315T或S315N.利福平耐药株rpoB基因突变率为93.6%,突变位点主要集中在S531L(30/44,68.2%)和H526D(9/44,20.5%)或H526R(1/44,2.3%).链霉素耐药株以rpsl基因突变为主,突变位点为K43R(19/27,70.4%)和K88Q(6/27,22.2%);rrs1基因突变较少见,仅491C→T(2/27,7.4%)及513A→C(1/27,3.7%);2个基因突变率合计为65.9%.氧氟沙星耐药株突变率为100%,以gyrA基因突变为主,突变位点包括D94A(2/11,18.2%)、S91P(4/11,36.4%)和A90V(3/11,27.3%),3个突变位点总突变率为81.8%(9/11);S95T存在于所有氧氟沙星耐药株及部分全敏感株gyrA基因中;gyrB未发现突变.卡那霉索耐药株rrs2基因突变率为61.1%;突变位点为1400 A→C(9/11,81.8%)和1483 G→T(2/11,18.2%).其他突变位点在全敏感株中未发现.临床耐药株同一耐药组别所包含耐药类型不同,相关耐药基因的突变位点相同,其MIC值基本一致;相关耐药基因突变位点不同,其MIC值存在明显差异.结论 结核分枝杆菌耐药基因突变存在一定的地域特性,表型特征因耐药基因突变位点不同存在耐药程度差异.
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关键词
结核分枝杆菌
耐药
聚合酶链反应
基因
分子特征
原文传递
题名
深圳地区结核分枝杆菌耐药分离株分子特征与表型特征相关性研究
被引量:
7
1
作者
桂静
王峰
李金莉
罗道泉
姚立
泰
机构
深圳市慢性病防治中心病原检验科
出处
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期466-471,共6页
基金
国家科技重大专项课题资助项目(2008ZX10003-004)
文摘
目的 研究深圳地区2007-2008年分离的结核分枝杆菌耐药株分子特征与表型特征的相关性.方法 参照WHO/IUATLD标准,使用L-J药敏培养基,1%比例法药敏试验筛选针对异烟肼、利福平、链霉素、氧氟沙星、卡那霉素5种药物耐药或敏感的临床分离株,通过PCR扩增经筛选菌株的rpoB、katG、rpsL、rrs1、gyrAB、rrs2基因的相关序列,运用DNAStar和BLASTN进行序列分析,应用二倍稀释法测定其表型最低抑菌浓度(MIC)值.结果 筛得实验菌株123株,其中耐药株73株,全敏感株50株.异烟肼耐药株katG基因突变率为84.6%,突变位点全部为S315T或S315N.利福平耐药株rpoB基因突变率为93.6%,突变位点主要集中在S531L(30/44,68.2%)和H526D(9/44,20.5%)或H526R(1/44,2.3%).链霉素耐药株以rpsl基因突变为主,突变位点为K43R(19/27,70.4%)和K88Q(6/27,22.2%);rrs1基因突变较少见,仅491C→T(2/27,7.4%)及513A→C(1/27,3.7%);2个基因突变率合计为65.9%.氧氟沙星耐药株突变率为100%,以gyrA基因突变为主,突变位点包括D94A(2/11,18.2%)、S91P(4/11,36.4%)和A90V(3/11,27.3%),3个突变位点总突变率为81.8%(9/11);S95T存在于所有氧氟沙星耐药株及部分全敏感株gyrA基因中;gyrB未发现突变.卡那霉索耐药株rrs2基因突变率为61.1%;突变位点为1400 A→C(9/11,81.8%)和1483 G→T(2/11,18.2%).其他突变位点在全敏感株中未发现.临床耐药株同一耐药组别所包含耐药类型不同,相关耐药基因的突变位点相同,其MIC值基本一致;相关耐药基因突变位点不同,其MIC值存在明显差异.结论 结核分枝杆菌耐药基因突变存在一定的地域特性,表型特征因耐药基因突变位点不同存在耐药程度差异.
关键词
结核分枝杆菌
耐药
聚合酶链反应
基因
分子特征
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
Drug resistant
PCR
Gene
Molecular characterization
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
深圳地区结核分枝杆菌耐药分离株分子特征与表型特征相关性研究
桂静
王峰
李金莉
罗道泉
姚立
泰
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
7
原文传递
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