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河北省PEDV流行毒株的分离鉴定及遗传演化分析
被引量:
5
1
作者
辛树阳
严世杰
+8 位作者
宋涛
郝建香
付琦媛
李文傲
王春芳
回卫荣
唐
梦
虎
马增军
芮萍
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期1265-1271,共7页
为掌握河北省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行和变异情况,2017—2018年本研究在河北地区(秦皇岛、唐山、承德、张家口、廊坊、保定和石家庄)共收集278份疑似猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED...
为掌握河北省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行和变异情况,2017—2018年本研究在河北地区(秦皇岛、唐山、承德、张家口、廊坊、保定和石家庄)共收集278份疑似猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)病死猪临床样品,采用RT-PCR技术进行PEDV筛查,共检测到53份阳性病料,阳性率为19.1%。通过Vero细胞传代培养,成功分离到1株PEDV毒株,将其命名为CH-HB1-2018,对其进行全基因组测序,结合GenBank中公布的PEDV毒株序列对其进行全基因序列同源性比对及系统进化树分析,结果显示所分离毒株与CV777,CH-S,SM98等早期经典毒株的核苷酸同源性在96.6%~97.6%之间,与2010年后分离的变异毒株JS-HZ2012,LC,JSX2014等的核苷酸同源性在98.9%~99.1%之间,进化树分析结果表明所分离毒株为变异毒株,与JS-HZ2012,JSX2014等变异毒株属于同一进化分支,与同源性分析结果一致。本研究为河北省PEDV的流行情况研究提供了理论依据。
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关键词
猪流行性腹泻
流行病学
遗传变异
原文传递
施马伦贝格病的检测及防控
2
作者
钟瑶
李枫
+1 位作者
唐
梦
虎
宋涛
《今日畜牧兽医》
2023年第6期28-30,共3页
施马伦贝格病毒(SBV)是2011年在德国首次发现的一种新型病毒,能够引起反刍动物腹泻、发热、流产、产奶量下降等症状。截至2014年6月,SBV已在德国、英国、意大利等27个欧洲国家广泛流行,并逐渐扩散到我国周边国家。SBV作为一种新发的动...
施马伦贝格病毒(SBV)是2011年在德国首次发现的一种新型病毒,能够引起反刍动物腹泻、发热、流产、产奶量下降等症状。截至2014年6月,SBV已在德国、英国、意大利等27个欧洲国家广泛流行,并逐渐扩散到我国周边国家。SBV作为一种新发的动物传染病病毒,若随入境商品或媒介传入我国并发生流行,将会对我国畜牧业生产和国民经济造成巨大影响,故预先开展SBV的调查研究工作具有重要意义。本文对SBV的病原学、流行病学、临床症状以及检测方法等进行梳理介绍,以期对我国SBV的预防和研究提供参考。
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关键词
施马伦贝格病毒
反刍动物新发病
预警与防范
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职称材料
柔嫩艾美耳球虫河北株SOSO7基因克隆与序列分析
被引量:
1
3
作者
闫艳娟
庞洪泽
+5 位作者
李蕴玉
张东林
李佩国
张香斋
张召兴
唐
梦
虎
《中国家禽》
北大核心
2018年第17期22-25,共4页
为分析柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)河北株SO7基因序列遗传变异性,试验根据GenBank发表的SO7序列设计引物,利用RT-PCR技术克隆出柔嫩艾美耳球虫河北株SO7基因,将SO7基因克隆入pMD18-T载体中,进行测序、序列分析及表达蛋白结构的预...
为分析柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)河北株SO7基因序列遗传变异性,试验根据GenBank发表的SO7序列设计引物,利用RT-PCR技术克隆出柔嫩艾美耳球虫河北株SO7基因,将SO7基因克隆入pMD18-T载体中,进行测序、序列分析及表达蛋白结构的预测。结果显示:柔嫩艾美耳球虫河北株SO7基因编码215个氨基酸,具有一个开放阅读框,大小为645 bp;与GenBank中发表的美国分离株(LS18)、扬州分离株(YZ)、海南分离株(HN)、广东分离株(GD)、北京分离株(BJ)SO7核苷酸序列的同源性分别为99.4%、99.5%、99.7%、99.5%、99.4%,所推导的氨基酸序列的同源性分别为98.6%、99.1%、99.1%、98.6%、98.1%。从进化关系来看,同种间SO7基因相比,柔嫩艾美耳球虫河北株与HN株同属一个分支,遗传关系较近;与GD株、BJ株的遗传关系相对较远。蛋白结构预测显示蛋白的相对分子质量为52.20 ku,理论等电点(PI)为5.08,不稳定系数为52.73,为不稳定蛋白;在1~20个氨基酸具有信号肽;有5个疏水位点;没有跨膜结构。综上所述,柔嫩艾美耳球虫河北株SO7基因序列遗传变异性不明显,可以作为构建核酸疫苗候选基因。
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关键词
柔嫩艾美耳球虫河北株
SO7基因
序列分析
蛋白结构预测
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职称材料
题名
河北省PEDV流行毒株的分离鉴定及遗传演化分析
被引量:
5
1
作者
辛树阳
严世杰
宋涛
郝建香
付琦媛
李文傲
王春芳
回卫荣
唐
梦
虎
马增军
芮萍
机构
河北科技师范学院河北省预防兽医学重点实验室
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期1265-1271,共7页
基金
河北省现代农业产业技术体系生猪疫病控制创新团队岗位项目(HBCT2018110207)
河北省高等学校科学技术研究项目青年基金(QN2019097)
秦皇岛市科技计划项目(201803B010)。
文摘
为掌握河北省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行和变异情况,2017—2018年本研究在河北地区(秦皇岛、唐山、承德、张家口、廊坊、保定和石家庄)共收集278份疑似猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)病死猪临床样品,采用RT-PCR技术进行PEDV筛查,共检测到53份阳性病料,阳性率为19.1%。通过Vero细胞传代培养,成功分离到1株PEDV毒株,将其命名为CH-HB1-2018,对其进行全基因组测序,结合GenBank中公布的PEDV毒株序列对其进行全基因序列同源性比对及系统进化树分析,结果显示所分离毒株与CV777,CH-S,SM98等早期经典毒株的核苷酸同源性在96.6%~97.6%之间,与2010年后分离的变异毒株JS-HZ2012,LC,JSX2014等的核苷酸同源性在98.9%~99.1%之间,进化树分析结果表明所分离毒株为变异毒株,与JS-HZ2012,JSX2014等变异毒株属于同一进化分支,与同源性分析结果一致。本研究为河北省PEDV的流行情况研究提供了理论依据。
关键词
猪流行性腹泻
流行病学
遗传变异
Keywords
porcine epidemic diarrhea
epidemiology
genetic variation
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
施马伦贝格病的检测及防控
2
作者
钟瑶
李枫
唐
梦
虎
宋涛
机构
泸州市江阳区农业农村局
荆门(中国农谷)农业科学研究院
河北科技师范学院河北省预防兽医学重点实验室
出处
《今日畜牧兽医》
2023年第6期28-30,共3页
基金
河北省重点研发计划项目(21324801D)
秦皇岛市科技计划项目(201903B009)。
文摘
施马伦贝格病毒(SBV)是2011年在德国首次发现的一种新型病毒,能够引起反刍动物腹泻、发热、流产、产奶量下降等症状。截至2014年6月,SBV已在德国、英国、意大利等27个欧洲国家广泛流行,并逐渐扩散到我国周边国家。SBV作为一种新发的动物传染病病毒,若随入境商品或媒介传入我国并发生流行,将会对我国畜牧业生产和国民经济造成巨大影响,故预先开展SBV的调查研究工作具有重要意义。本文对SBV的病原学、流行病学、临床症状以及检测方法等进行梳理介绍,以期对我国SBV的预防和研究提供参考。
关键词
施马伦贝格病毒
反刍动物新发病
预警与防范
分类号
S85 [农业科学—兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
柔嫩艾美耳球虫河北株SOSO7基因克隆与序列分析
被引量:
1
3
作者
闫艳娟
庞洪泽
李蕴玉
张东林
李佩国
张香斋
张召兴
唐
梦
虎
机构
河北科技师范学院河北省预防兽医学重点实验室
出处
《中国家禽》
北大核心
2018年第17期22-25,共4页
基金
河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡产业创新团队(HBCT2018150206)
2017年河北省硕士研究生创新资助项目(CXZZSS2017158)
文摘
为分析柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)河北株SO7基因序列遗传变异性,试验根据GenBank发表的SO7序列设计引物,利用RT-PCR技术克隆出柔嫩艾美耳球虫河北株SO7基因,将SO7基因克隆入pMD18-T载体中,进行测序、序列分析及表达蛋白结构的预测。结果显示:柔嫩艾美耳球虫河北株SO7基因编码215个氨基酸,具有一个开放阅读框,大小为645 bp;与GenBank中发表的美国分离株(LS18)、扬州分离株(YZ)、海南分离株(HN)、广东分离株(GD)、北京分离株(BJ)SO7核苷酸序列的同源性分别为99.4%、99.5%、99.7%、99.5%、99.4%,所推导的氨基酸序列的同源性分别为98.6%、99.1%、99.1%、98.6%、98.1%。从进化关系来看,同种间SO7基因相比,柔嫩艾美耳球虫河北株与HN株同属一个分支,遗传关系较近;与GD株、BJ株的遗传关系相对较远。蛋白结构预测显示蛋白的相对分子质量为52.20 ku,理论等电点(PI)为5.08,不稳定系数为52.73,为不稳定蛋白;在1~20个氨基酸具有信号肽;有5个疏水位点;没有跨膜结构。综上所述,柔嫩艾美耳球虫河北株SO7基因序列遗传变异性不明显,可以作为构建核酸疫苗候选基因。
关键词
柔嫩艾美耳球虫河北株
SO7基因
序列分析
蛋白结构预测
Keywords
E. tenella Hebei strain
SO7 gene
sequence analysis
protein structure prediction
分类号
S855.9 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
河北省PEDV流行毒株的分离鉴定及遗传演化分析
辛树阳
严世杰
宋涛
郝建香
付琦媛
李文傲
王春芳
回卫荣
唐
梦
虎
马增军
芮萍
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
原文传递
2
施马伦贝格病的检测及防控
钟瑶
李枫
唐
梦
虎
宋涛
《今日畜牧兽医》
2023
0
下载PDF
职称材料
3
柔嫩艾美耳球虫河北株SOSO7基因克隆与序列分析
闫艳娟
庞洪泽
李蕴玉
张东林
李佩国
张香斋
张召兴
唐
梦
虎
《中国家禽》
北大核心
2018
1
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职称材料
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