利用c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA ends,RACE)克隆了大珠母贝CCT-eta c DNA全长。利用多种生物信息学软件对大珠母贝CCT-eta c DNA和预测的氨基酸序列进行了分析,并采用实时荧光定量PCR对其组织表达谱和冷应激...利用c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA ends,RACE)克隆了大珠母贝CCT-eta c DNA全长。利用多种生物信息学软件对大珠母贝CCT-eta c DNA和预测的氨基酸序列进行了分析,并采用实时荧光定量PCR对其组织表达谱和冷应激下的表达模式进行了分析。结果显示,大珠母贝CCT-eta c DNA全长为1895bp,其中开放阅读框(ORF)为1632bp,编码543个氨基酸残基,含有CCT家族的3个签名序列:37RTTLGPRGMDKLI49、58ISNDGATILKTLDIVHP74、86QDAEVGDGT94,具有3个保守的功能结构域:赤道结构域、顶端结构域和中间结构域。氨基酸同源序列比对结果显示,大珠母贝CCT-eta与其他物种的同源性较高,与长牡蛎(Crassostrea gigas)、斑马鱼(Danio rerio)、人(Homo sapiens)的同源性分别为83.2%、80.1%、79.3%。CCT-eta基因在大珠母贝各组织中均有表达,但在闭壳肌中表达水平最高,而在心脏和肝胰腺中表达很低;冷应激后,大珠母贝各组织中CCT-eta表达显著上调,但不同组织的冷应激响应模式不同,闭壳肌响应速度较慢,而心脏和肝胰腺响应速度较快,提示冷应激时CCT-eta对保护大珠母贝肝胰腺和心脏等内脏组织具有重要作用。展开更多
文摘利用c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA ends,RACE)克隆了大珠母贝CCT-eta c DNA全长。利用多种生物信息学软件对大珠母贝CCT-eta c DNA和预测的氨基酸序列进行了分析,并采用实时荧光定量PCR对其组织表达谱和冷应激下的表达模式进行了分析。结果显示,大珠母贝CCT-eta c DNA全长为1895bp,其中开放阅读框(ORF)为1632bp,编码543个氨基酸残基,含有CCT家族的3个签名序列:37RTTLGPRGMDKLI49、58ISNDGATILKTLDIVHP74、86QDAEVGDGT94,具有3个保守的功能结构域:赤道结构域、顶端结构域和中间结构域。氨基酸同源序列比对结果显示,大珠母贝CCT-eta与其他物种的同源性较高,与长牡蛎(Crassostrea gigas)、斑马鱼(Danio rerio)、人(Homo sapiens)的同源性分别为83.2%、80.1%、79.3%。CCT-eta基因在大珠母贝各组织中均有表达,但在闭壳肌中表达水平最高,而在心脏和肝胰腺中表达很低;冷应激后,大珠母贝各组织中CCT-eta表达显著上调,但不同组织的冷应激响应模式不同,闭壳肌响应速度较慢,而心脏和肝胰腺响应速度较快,提示冷应激时CCT-eta对保护大珠母贝肝胰腺和心脏等内脏组织具有重要作用。
