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胰腺癌预后相关铁死亡基因筛选及预后预测模型构建
1
作者
何冲
周
姝
睿
+4 位作者
李雅晴
陈少杰
练国达
陈尚祥
黄开红
《岭南现代临床外科》
2022年第1期14-23,共10页
目的探讨铁死亡相关基因对胰腺癌患者预后预测的价值,并进一步探索其分子机制。方法从公共数据库中下载胰腺癌患者的基因表达及相应的临床病理数据,采用R软件"limma"包筛选胰腺癌组织中差异表达基因,使用单因素COX回归分析筛...
目的探讨铁死亡相关基因对胰腺癌患者预后预测的价值,并进一步探索其分子机制。方法从公共数据库中下载胰腺癌患者的基因表达及相应的临床病理数据,采用R软件"limma"包筛选胰腺癌组织中差异表达基因,使用单因素COX回归分析筛选预后相关的铁死亡相关基因,利用LASSO COX回归分析构建预后模型。通过Kaplan-Meier生存分析检验该模型在预测胰腺癌预后中的意义,用ROC曲线评估模型预测胰腺癌预后的准确性。在ICGC验证队列中通过Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线评估该模型在外部队列中的预测价值。依照风险值中位数,将TCGA训练队列分为两组,比较其基因表达差异、差异基因富集通路差异,评估免疫细胞浸润丰度。结果通过单因素COX回归分析,37个铁死亡相关基因被鉴定为预后基因(P<0.05)。利用LASSO COX回归分析,构建了一个基于15个铁死亡相关基因的预后预测模型。根据模型计算将队列中所有患者分为高风险组和低风险组,Kaplan-Meier生存分析表明高风险组的胰腺癌患者较低风险组生存时间短(HR=2.16,P<0.05)。ROC曲线分析证明了预测模型在胰腺癌预后预测中的准确性:ROC曲线下面积值分别为0.74(1年)、0.82(3年)、0.88(5年)。对高低风险组差异表达基因进行功能富集分析,发现两组胰腺癌患者免疫微环境之间存在差异,高风险组中幼稚B细胞、浆细胞、CD8^(+)T细胞浸润程度较低风险组低,但M0和M1巨噬细胞的浸润程度高(P<0.05)。此外,在PD-1和CTLA4在TCGA-PAAD队列低危组和高危组中的表达中,TCGA-PAAD队列低风险组患者中PD-1和CTLA4的表达水平较高风险组患者更高(P<0.05)。结论本研究构建了胰腺癌中铁死亡相关基因预后预测模型,具有预测胰腺癌患者预后的作用,并发现TCGA队列中高低风险组免疫微环境存在差异,可为免疫治疗提供参考。
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关键词
胰腺癌
铁死亡
预后
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职称材料
乡村振兴中“新乡贤+三治融合”模式的理论与实践
2
作者
周
姝
睿
蔡宝刚
+4 位作者
李斯明
韩坤龙
林佳婷
张迪
王婷
《农业工程技术》
2022年第18期84-86,99,共4页
以江苏省扬州市沿湖村为例,探索更有效的乡村治理模式——“新乡贤+三治融合”乡村基层治理模式,旨在探寻一条具有中国特色、区域特点的美丽乡村建设之路,形成对中国乡村建设更深刻的认识与思考,从而为促进国家最美乡村建设提供有益的...
以江苏省扬州市沿湖村为例,探索更有效的乡村治理模式——“新乡贤+三治融合”乡村基层治理模式,旨在探寻一条具有中国特色、区域特点的美丽乡村建设之路,形成对中国乡村建设更深刻的认识与思考,从而为促进国家最美乡村建设提供有益的学术支持。
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关键词
乡村振兴
新乡贤
融合发展
治理模式
基层建设
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职称材料
指尖上的精彩
3
作者
周
姝
睿
《小学生作文辅导(今天写什么习作素材版)》
2013年第10期11-11,共1页
我们看似平常的手指,却也有着无数奇妙的精彩。
关键词
小学生
作文
语文学习
课外阅读
原文传递
题名
胰腺癌预后相关铁死亡基因筛选及预后预测模型构建
1
作者
何冲
周
姝
睿
李雅晴
陈少杰
练国达
陈尚祥
黄开红
机构
中山大学孙逸仙纪念医院消化内科
出处
《岭南现代临床外科》
2022年第1期14-23,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(81874057)
国家自然科学基金青年项目(82103142)
+8 种基金
国家自然科学基金青年项目(82003175)
国家自然科学基金青年项目(82002505)
中国博士后科学基金第70批面上项目(2021M703701)
广东省医学科学技术研究基金(A2016210)
广东省医学科学技术研究基金(A2019447)
广东省医学科学技术研究基金(A2021158)
广东省自然区域联合基金-青年基金项目(2020A1515110841)
广州市科技计划项目(202102020082)
广州市科技计划项目(202102020161)。
文摘
目的探讨铁死亡相关基因对胰腺癌患者预后预测的价值,并进一步探索其分子机制。方法从公共数据库中下载胰腺癌患者的基因表达及相应的临床病理数据,采用R软件"limma"包筛选胰腺癌组织中差异表达基因,使用单因素COX回归分析筛选预后相关的铁死亡相关基因,利用LASSO COX回归分析构建预后模型。通过Kaplan-Meier生存分析检验该模型在预测胰腺癌预后中的意义,用ROC曲线评估模型预测胰腺癌预后的准确性。在ICGC验证队列中通过Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线评估该模型在外部队列中的预测价值。依照风险值中位数,将TCGA训练队列分为两组,比较其基因表达差异、差异基因富集通路差异,评估免疫细胞浸润丰度。结果通过单因素COX回归分析,37个铁死亡相关基因被鉴定为预后基因(P<0.05)。利用LASSO COX回归分析,构建了一个基于15个铁死亡相关基因的预后预测模型。根据模型计算将队列中所有患者分为高风险组和低风险组,Kaplan-Meier生存分析表明高风险组的胰腺癌患者较低风险组生存时间短(HR=2.16,P<0.05)。ROC曲线分析证明了预测模型在胰腺癌预后预测中的准确性:ROC曲线下面积值分别为0.74(1年)、0.82(3年)、0.88(5年)。对高低风险组差异表达基因进行功能富集分析,发现两组胰腺癌患者免疫微环境之间存在差异,高风险组中幼稚B细胞、浆细胞、CD8^(+)T细胞浸润程度较低风险组低,但M0和M1巨噬细胞的浸润程度高(P<0.05)。此外,在PD-1和CTLA4在TCGA-PAAD队列低危组和高危组中的表达中,TCGA-PAAD队列低风险组患者中PD-1和CTLA4的表达水平较高风险组患者更高(P<0.05)。结论本研究构建了胰腺癌中铁死亡相关基因预后预测模型,具有预测胰腺癌患者预后的作用,并发现TCGA队列中高低风险组免疫微环境存在差异,可为免疫治疗提供参考。
关键词
胰腺癌
铁死亡
预后
Keywords
pancreatic cancer
ferroptosis
prognosis
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
乡村振兴中“新乡贤+三治融合”模式的理论与实践
2
作者
周
姝
睿
蔡宝刚
李斯明
韩坤龙
林佳婷
张迪
王婷
机构
扬州大学法学院
出处
《农业工程技术》
2022年第18期84-86,99,共4页
文摘
以江苏省扬州市沿湖村为例,探索更有效的乡村治理模式——“新乡贤+三治融合”乡村基层治理模式,旨在探寻一条具有中国特色、区域特点的美丽乡村建设之路,形成对中国乡村建设更深刻的认识与思考,从而为促进国家最美乡村建设提供有益的学术支持。
关键词
乡村振兴
新乡贤
融合发展
治理模式
基层建设
分类号
F32 [经济管理—产业经济]
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职称材料
题名
指尖上的精彩
3
作者
周
姝
睿
机构
江苏省南通师范第二附属小学六(A)班
出处
《小学生作文辅导(今天写什么习作素材版)》
2013年第10期11-11,共1页
文摘
我们看似平常的手指,却也有着无数奇妙的精彩。
关键词
小学生
作文
语文学习
课外阅读
分类号
G633.34 [文化科学—教育学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胰腺癌预后相关铁死亡基因筛选及预后预测模型构建
何冲
周
姝
睿
李雅晴
陈少杰
练国达
陈尚祥
黄开红
《岭南现代临床外科》
2022
0
下载PDF
职称材料
2
乡村振兴中“新乡贤+三治融合”模式的理论与实践
周
姝
睿
蔡宝刚
李斯明
韩坤龙
林佳婷
张迪
王婷
《农业工程技术》
2022
0
下载PDF
职称材料
3
指尖上的精彩
周
姝
睿
《小学生作文辅导(今天写什么习作素材版)》
2013
0
原文传递
已选择
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