目的比较食管癌放射抵抗细胞株与其亲本细胞microRNA表达谱的差异。方法应用Agilent human miRNA芯片检测人食管癌耐放射细胞株KYSE-150R与其亲本细胞KYSE-150的表达谱。GeneSpringGX10.0.2数据分析挑选差异表达基因。应用软件对筛选...目的比较食管癌放射抵抗细胞株与其亲本细胞microRNA表达谱的差异。方法应用Agilent human miRNA芯片检测人食管癌耐放射细胞株KYSE-150R与其亲本细胞KYSE-150的表达谱。GeneSpringGX10.0.2数据分析挑选差异表达基因。应用软件对筛选出的显著差异表达miRNA的潜在靶基因进行预测并验证。结果与亲本细胞相比,KYSE.150R中上调超过2倍的miRNA有10个,为hsa-miR-1539、hsa—miR-1237、hsa—miR-92b等;表达下调超过2倍的有miRNA有25个,为hsa—miR-185、hsa—miR-18b、hsa—miR-17等。软件预测发现其中18个miRNA有潜在的靶基因,10个miRNAs的靶基因多达200个。显著差异表达的miRNA(如hsa.1et-Ta、hsa—miR-185、hsa-miR-141、hsa—miR-92b、hsa—miR-22和hsa-miR-301a)与放射抵抗密切相关。结论筛选出的miRNAs可能通过调控其靶基因而参与食管癌放射抵抗,为临床上放射抵抗的逆转提供全新的靶标和策略。展开更多
文摘目的比较食管癌放射抵抗细胞株与其亲本细胞microRNA表达谱的差异。方法应用Agilent human miRNA芯片检测人食管癌耐放射细胞株KYSE-150R与其亲本细胞KYSE-150的表达谱。GeneSpringGX10.0.2数据分析挑选差异表达基因。应用软件对筛选出的显著差异表达miRNA的潜在靶基因进行预测并验证。结果与亲本细胞相比,KYSE.150R中上调超过2倍的miRNA有10个,为hsa-miR-1539、hsa—miR-1237、hsa—miR-92b等;表达下调超过2倍的有miRNA有25个,为hsa—miR-185、hsa—miR-18b、hsa—miR-17等。软件预测发现其中18个miRNA有潜在的靶基因,10个miRNAs的靶基因多达200个。显著差异表达的miRNA(如hsa.1et-Ta、hsa—miR-185、hsa-miR-141、hsa—miR-92b、hsa—miR-22和hsa-miR-301a)与放射抵抗密切相关。结论筛选出的miRNAs可能通过调控其靶基因而参与食管癌放射抵抗,为临床上放射抵抗的逆转提供全新的靶标和策略。