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一株产纤维素酶细菌的筛选、鉴定及产酶条件优化 被引量:13
1
作者 静琳 黄爱玲 +2 位作者 郑蓉 李殿殿 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期26-29,共4页
目的:筛选1株产纤维素酶的细菌。方法:通过对从腐烂朽木及其附近土壤中得到的样品进行富集培养、分离纯化得到16株纤维素分解菌,经刚果红染色鉴定和液体发酵培养后对其进行了菌种初步鉴定及产酶条件的初步优化。结果:获得1株纤维素酶分... 目的:筛选1株产纤维素酶的细菌。方法:通过对从腐烂朽木及其附近土壤中得到的样品进行富集培养、分离纯化得到16株纤维素分解菌,经刚果红染色鉴定和液体发酵培养后对其进行了菌种初步鉴定及产酶条件的初步优化。结果:获得1株纤维素酶分泌量较高的细菌LT3。结论:LT3为革兰氏阳性菌,菌体成杆状,经发酵优化培养后,较适产酶条件为甘蔗渣20g/L,pH7.0、30℃培养120h,CMC酶活为71.17U/mL,滤纸酶活为33.37U/mL。通过克隆其16S rDNA序列,对其进行系统进化分析,鉴定为蜡状芽孢杆菌。 展开更多
关键词 碱性纤维素酶 16S RDNA 细菌
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毒素DON单链抗体的同源建模及与DON结合的分子模拟研究 被引量:6
2
作者 郑蓉 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第23期2882-2888,共7页
通过同源模建及分子力学构建并优化了呕吐毒素DON单链抗体的三维结构,结合Procheck和verify_3D方法评估得到合理的抗体模型.利用分子对接方法研究了单链抗体与其抗原DON的识别及相互作用.结果表明,毒素结合到抗体轻链上,通过轻重链的交... 通过同源模建及分子力学构建并优化了呕吐毒素DON单链抗体的三维结构,结合Procheck和verify_3D方法评估得到合理的抗体模型.利用分子对接方法研究了单链抗体与其抗原DON的识别及相互作用.结果表明,毒素结合到抗体轻链上,通过轻重链的交界区残基与重链结合,与残基Pro107之间存在氢键作用.采用分子动力学模拟和MM/GBSA方法计算了毒素DON与抗体之间的结合自由能,计算结果与实验值相吻合,体系疏水相互作用是维持复合物稳定结构的主要驱动力.动力学模拟氢键分析和能量分解结果共同表明,残基Pro107参与稳定氢键的形成并贡献很强的范德华作用,是毒素结合抗体最关键的残基.本研究为该毒素抗体的结构设计提供了重要的线索和理论依据,对毒素类分子新型抗体的研究和开发具有理论指导价值. 展开更多
关键词 DON 抗体设计 结合自由能 同源建模 分子对接
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猪圆环病毒衣壳蛋白在枯草芽孢杆菌中的表达研究 被引量:6
3
作者 陈灵艳 陈先进 +1 位作者 蒋烨 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期140-145,共6页
研究猪圆病毒衣壳蛋白在枯草芽孢杆菌中的表达情况。以3个不同的质粒为基础,构建不同类型的猪圆环病毒衣壳蛋白基因(PCV2-ORF2)重组表达载体,并分别转化进入枯草芽孢杆菌168和WB800中。利用SDS-PAGE和Western blot检测目的蛋白的表达,... 研究猪圆病毒衣壳蛋白在枯草芽孢杆菌中的表达情况。以3个不同的质粒为基础,构建不同类型的猪圆环病毒衣壳蛋白基因(PCV2-ORF2)重组表达载体,并分别转化进入枯草芽孢杆菌168和WB800中。利用SDS-PAGE和Western blot检测目的蛋白的表达,并通过实时荧光定量PCR检测目的基因的转录水平上的表达情况。结果显示,ORF2基因原序列在枯草芽孢杆菌中难以表达,经过密码子优化后,构建的截短ORF2基因表达载体在枯草芽孢杆菌内表达系统中成功表达目的蛋白。密码子优化促进了目的基因的表达。 展开更多
关键词 猪圆环病毒衣壳蛋白 枯草芽孢杆菌 实时定量PCR 密码子优化
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水稻金属硫蛋白ricMT的一级结构特征分析 被引量:1
4
作者 刘进元 《清华大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2000年第6期29-32,共4页
为了获得水稻金属硫蛋白 ric MT的一级结构特征 ,通过等电点和蛋白稳定性预测 ,初步判断 ric MT蛋白是一个不稳定的酸性蛋白 ;并用 ric MT氨基酸序列对 EMBL 蛋白数据库进行检索 ,得到 5 0余个同源性较高的来自动植物的 MT蛋白 ,用二重... 为了获得水稻金属硫蛋白 ric MT的一级结构特征 ,通过等电点和蛋白稳定性预测 ,初步判断 ric MT蛋白是一个不稳定的酸性蛋白 ;并用 ric MT氨基酸序列对 EMBL 蛋白数据库进行检索 ,得到 5 0余个同源性较高的来自动植物的 MT蛋白 ,用二重序列对排分析和氨基酸组成模式分析与已知的蛋白进行比较 ,将 ric MT归属于植物类金属硫蛋白类型。采用多重序列比较法总结出植物类金属硫蛋白的一级结构的三点特征 :相对分子量比动物 MT大 ,平均为 71个氨基酸残基 ;与哺乳动物 MT不同的独特氨基酸组成模式 ;一级结构典型的三段式分布 ,间隔区多数达 3 0~ 展开更多
关键词 金属硫蛋白 ricMT 一级结构 水稻 等电点
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猕猴桃金属硫蛋白的结构建模 被引量:1
5
作者 朱春明 +2 位作者 张日清 赵南明 刘进元 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2000年第6期602-607,共6页
应用距离几何算法对金属硫蛋白的半胱氨酸富含区进行了结构预测,并结合同源模块法成功地完成了对猕猴桃金属硫蛋白三级结构的建模.结果表明,植物金属硫蛋白也像哺乳动物金属硫蛋白一样具有独立形成两个金属硫络合簇的结构基础,本方... 应用距离几何算法对金属硫蛋白的半胱氨酸富含区进行了结构预测,并结合同源模块法成功地完成了对猕猴桃金属硫蛋白三级结构的建模.结果表明,植物金属硫蛋白也像哺乳动物金属硫蛋白一样具有独立形成两个金属硫络合簇的结构基础,本方法可应用于其他同类蛋白的三级结构建模. 展开更多
关键词 金属硫蛋白 猕猴桃 三级结构 建模 结构预测
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有关阿尔茨海默病抗Aβ蛋白的药物研究进展 被引量:3
6
作者 林旭 黄爱玲 +1 位作者 洪安辉 《海峡药学》 2008年第10期1-5,共5页
阿尔茨海默病(AD)的病因和发病机制尚不清楚。目前"淀粉样蛋白假说"引起广泛关注和重视。本文概述了基于"Aβ假说"的药物研究进展。
关键词 阿尔茨海默病 药物治疗
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犬细小病毒VP2基因在枯草芽孢杆菌中的表达及鉴定 被引量:3
7
作者 李爽 黄文斌 +1 位作者 黄爱玲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期171-174,共4页
从犬细小病毒/犬瘟热二联苗中提取CPV基因组,根据GenBank发表的CPV-VP2基因序列设计一对引物,对VP2基因进行PCR扩增,并克隆至TA Cloning Kit Dual Promoter(pCRⅡ),获得克隆载体pCR-VP2。将重组质粒亚克隆到枯草芽孢杆菌表达载体pHT43上... 从犬细小病毒/犬瘟热二联苗中提取CPV基因组,根据GenBank发表的CPV-VP2基因序列设计一对引物,对VP2基因进行PCR扩增,并克隆至TA Cloning Kit Dual Promoter(pCRⅡ),获得克隆载体pCR-VP2。将重组质粒亚克隆到枯草芽孢杆菌表达载体pHT43上,获得重组表达载体pHT43-VP2。经双酶切鉴定及序列比对分析后,将pHT43-VP2载体转化入枯草芽孢杆菌WB600中进行诱导表达,产物使用PAGE胶蛋白回收法纯化。结果表明,在69 kD处存在目的蛋白,ELISA检测发现,纯化后的目的蛋白与阳性血清存在特异性反应。 展开更多
关键词 犬细小病毒 VP2蛋白 枯草芽孢杆菌
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Modeling the Cysteine Rich Domain of Plant Metallothionein-like Protein 被引量:2
8
作者 何红珍 朱春明 +3 位作者 张日清 赵南明 刘进元 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第10期1155-1159,共5页
With the progress of plant genome research, more than 50 plant metallothionein_like (MT_L) genes have been found, but only several MT_L proteins have been detected and no experimental structural information for MT_L p... With the progress of plant genome research, more than 50 plant metallothionein_like (MT_L) genes have been found, but only several MT_L proteins have been detected and no experimental structural information for MT_L proteins has been reported so far. Since detailed knowledge of the protein tertiary structure is required to understand its biological function, a method is needed to determine the structure of these proteins. In this study, the structural data of known mammal MT was used to determine the interatomic distance constraints of the CXC and CXXC motifs and the metal_sulfur chelating cluster. Then several possible MT conformations were predicted using a distance geometry algorithm. The statistical analysis was used to select those with much lower target function values and lower conformation energies as the predicted tertiary structural models of the cysteine_rich (CR) domains of these proteins. A suitable prediction method for modeling the CR domain of the plant MT_L protein was constructed. The accurately predicted result for the known structure of an MT protein from blue crab suggests that this method is practicable. The tertiary structures of CR domains of rape MT_L protein LSC54 was then modeled with this method. 展开更多
关键词 plant metallothionein-like protein cysteine rich domain tertiary structure prediction distance geometry algorithm
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西藏墨脱石锅饮食应用价值研究 被引量:2
9
作者 黄爱玲 《福州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期613-616,共4页
为了研究西藏墨脱石锅的烹调特性,对墨脱石锅的化学组成,烹调时锅中所释放的金属元素种类以及食物中氨基酸变化进行研究.实验结果显示,墨脱石锅与普通传统砂锅的化学成分基本一样,但是各个成分的比例差异较大.Cr、Cl、Ni、S、P元素是墨... 为了研究西藏墨脱石锅的烹调特性,对墨脱石锅的化学组成,烹调时锅中所释放的金属元素种类以及食物中氨基酸变化进行研究.实验结果显示,墨脱石锅与普通传统砂锅的化学成分基本一样,但是各个成分的比例差异较大.Cr、Cl、Ni、S、P元素是墨脱石锅独有的.石锅烹饪过程中释放到汤中的人体所需金属元素浓度比砂锅高.墨脱石锅在烹调过程中能促进食物中的蛋白质水解成氨基酸,从而提高汤中氨基酸的浓度,特别是人体所需氨基酸的浓度.研究表明,西藏墨脱石锅优良的材质,独特的烹调特性,将其加工成日常炊具将具有一定的市场前景. 展开更多
关键词 墨脱石锅 西藏 烹调特性 金属元素 游离氨基酸
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Classification and Nomenclature of Plant Metallothionein-like Proteins Based on Their Cysteine Arrangement Patterns 被引量:1
10
作者 刘进元 赵南明 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第6期649-652,共4页
随着植物基因组研究的进展 ,在基因文库和蛋白文库登录的植物类金属硫蛋白基因已超过 5 0个 ,接近金属硫蛋白总数的 1/ 3,而且有不断上升的趋势。鉴于目前植物类金属硫蛋白命名与分类随意性太大 ,很有必要建立一个统一合理的命名与分类... 随着植物基因组研究的进展 ,在基因文库和蛋白文库登录的植物类金属硫蛋白基因已超过 5 0个 ,接近金属硫蛋白总数的 1/ 3,而且有不断上升的趋势。鉴于目前植物类金属硫蛋白命名与分类随意性太大 ,很有必要建立一个统一合理的命名与分类法。对植物类金属硫蛋白一级结构进行详细分析后 ,发现该蛋白两端富含半胱氨酸的区域内半胱氨酸的排列方式颇具规律性 ,进而提出了以半胱氨酸排列方式为基础的分类及命名法 ,并阐述了采用这种方法的理由及其可行性。 展开更多
关键词 plant metallothionein_like protein cysteine arrangement patterns CLASSIFICATION
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天然兔源噬菌体单链抗体库的构建与鉴定 被引量:2
11
作者 黄爱玲 冯荣虎 +1 位作者 李森 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期31-34,共4页
目的:构建天然兔源噬菌体单链抗体库。方法:采用RT-PCR法从未免疫的兔子脾脏中克隆得到抗体重链可变区(VH)与轻链可变区(VL)基因,重叠PCR将VH和VL拼接成scFv片段,将scFv连接到噬菌粒pComb3XSS上,电转入XL1-Blue菌中,得到单链抗体库,并... 目的:构建天然兔源噬菌体单链抗体库。方法:采用RT-PCR法从未免疫的兔子脾脏中克隆得到抗体重链可变区(VH)与轻链可变区(VL)基因,重叠PCR将VH和VL拼接成scFv片段,将scFv连接到噬菌粒pComb3XSS上,电转入XL1-Blue菌中,得到单链抗体库,并用此抗体库筛选抗肌酸激酶抗体。结果:构建了容量为4×108,基因重组率95%的单链抗体库,DNA指纹图谱显示抗体库多样性良好。以肌酸激酶为抗原,从该库中筛到3株抗肌酸激酶的抗体。结论:分析表明构建的天然兔源单链抗体库质量良好,可用于快速筛选、制备多种单链抗体。 展开更多
关键词 噬菌体展示 单链抗体 兔源抗体库
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不同佐剂对猪圆环病毒衣壳蛋白免疫原性的影响 被引量:1
12
作者 王立波 吴润生 +1 位作者 闫超 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第11期3037-3046,共10页
试验旨在研究猪圆环病毒不同佐剂疫苗的制备及其对免疫原性的影响。将去除信号肽的PCV2(porcine circovirus type 2,PCV2)Cap蛋白基因连接在pET-28a载体上,进行诱导表达,用脱氧胆酸钠(DOC)和低浓度尿素对表达产物进行溶解,制备氢氧化铝... 试验旨在研究猪圆环病毒不同佐剂疫苗的制备及其对免疫原性的影响。将去除信号肽的PCV2(porcine circovirus type 2,PCV2)Cap蛋白基因连接在pET-28a载体上,进行诱导表达,用脱氧胆酸钠(DOC)和低浓度尿素对表达产物进行溶解,制备氢氧化铝胶体佐剂、脂质体佐剂、弗氏佐剂、白油佐剂、蜂胶佐剂,并与纯化的PCV2-Cap蛋白混合制成亚单位疫苗,以商品化的灭活疫苗作为阳性对照,免疫小鼠,并使用ELISA方法检测动物血清中抗体及细胞因子含量的变化,评估其免疫保护效果。结果显示,表达产物以包涵体的形式存在,使用DOC溶解包涵体可省略蛋白复性步骤,且纯化方法简单,获得纯度较高的衣壳蛋白;ELISA检测结果表明PCV2-Cap蛋白能诱导产生特异性较高的抗体;水系佐剂制备的亚单位疫苗具有较高的免疫活性,为亚单位疫苗的商品化提供重要的数据支持。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 包涵体 佐剂 亚单位疫苗
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蛋白质网络的特征研究 被引量:1
13
作者 林锦贤 胡尊胜 《福州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期486-490,共5页
基于复杂网络理论研究蛋白质网络的特征.构建了蛋白质网络,当截断距离R为0.7 nm时,单体蛋白网络表现出明显的小世界性质.分析了蛋白质网络的分层结构,当截断距离增大时,分层指数b值减小,截断距离R为2.4 nm时,分层指数b与网络规模正相关... 基于复杂网络理论研究蛋白质网络的特征.构建了蛋白质网络,当截断距离R为0.7 nm时,单体蛋白网络表现出明显的小世界性质.分析了蛋白质网络的分层结构,当截断距离增大时,分层指数b值减小,截断距离R为2.4 nm时,分层指数b与网络规模正相关.研究结果表明,单体蛋白质网络及其对应复合物中肽链网络中接近中心度和介数中心度较高的残基均是非极性、疏水性氨基酸. 展开更多
关键词 复杂网络 蛋白质网络 截断距离 拓扑特征
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蛋白质界面网络中模体和模块的探测 被引量:1
14
作者 胡尊胜 林锦贤 《华侨大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2014年第1期61-66,共6页
基于复杂网络研究蛋白质界面网络中的模体和模块,发现蛋白质界面网络与蛋白质肽链网络的拓扑性质有差异.蛋白质界面网络中的模体类型和数量受截断距离R影响较大,R值不同,网络中的模体类型和数量都有较大差别.蛋白质界面网络中存在模块结... 基于复杂网络研究蛋白质界面网络中的模体和模块,发现蛋白质界面网络与蛋白质肽链网络的拓扑性质有差异.蛋白质界面网络中的模体类型和数量受截断距离R影响较大,R值不同,网络中的模体类型和数量都有较大差别.蛋白质界面网络中存在模块结构,分析R为0.5,0.7,1.2,2.4nm时网络中存在的3-派系-模块,发现当R为0.7nm时的蛋白质界面网络模块划分比较符合实际.最后,分析蛋白质界面网络中的模块与其拓扑性质的关系,发现界面网络中的节点数与3-派系-模块数呈线性关系. 展开更多
关键词 蛋白质 肽链网络 界面网络 模体 模块 拓扑性质
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植物炭疽病真菌金属硫蛋白的三级结构预测
15
作者 何红珍 +2 位作者 赵南明 张日清 刘进元 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第2期293-296,共4页
根据实验测定的Ⅰ类金属硫蛋白 (metallothionein ,MT)三级结构的实验数据 ,给出该类蛋白质的两种特征结构 (CXC、CXXC一级结构 ,半胱氨酸 金属络合簇三级结构 )的原子间距离约束条件 ,然后运用距离几何算法计算出一系列可能的构象 .... 根据实验测定的Ⅰ类金属硫蛋白 (metallothionein ,MT)三级结构的实验数据 ,给出该类蛋白质的两种特征结构 (CXC、CXXC一级结构 ,半胱氨酸 金属络合簇三级结构 )的原子间距离约束条件 ,然后运用距离几何算法计算出一系列可能的构象 .从这些构象中经统计分析筛选出目标函数值显著较小的结构作为所预测蛋白质的三级结构模型 .用已知结构的蓝蟹MT对方法进行检验证实其可行性后 ,对植物炭疽病真菌金属硫蛋白CAP3进行了三级结构预测 . 展开更多
关键词 植物 炭疽病 金属硫蛋白 三级结构 预测 距离几何算法
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Analysis of Salicylic Acid Induced Proteins in Rice
16
作者 时松海 潘明祥 +3 位作者 陈浩明 朱梅 刘进元 《Tsinghua Science and Technology》 SCIE EI CAS 1999年第3期1519-1523,共5页
An analysis using SDS\|PAGE of acidic and basic protein fractions extracted from rice seedling treated with salicylic acid (SA) yielded several new proteins, some of which are similar in relative molecular mass to PR... An analysis using SDS\|PAGE of acidic and basic protein fractions extracted from rice seedling treated with salicylic acid (SA) yielded several new proteins, some of which are similar in relative molecular mass to PR\|1a,c, PR\|2, 2e and PR\|3d, 3e of tobacco. Direct assays for peroxidases and β\|1,3\|glucanases demonstrated that the activities of the two enzymes in the rice seedlings increased rapidly with time after SA treatment, reaching a maximum 6 days after treatment.Disease resistance tests showed that SA treated rice seedlings stunted the development of blight lesions and displayed higher resistance to rice blight pathogen ( Xanthomonas oryzea pv. oryzea ). The data suggest that the treatment with SA, even for plants with high endogenous SA levels such as rice, may induce the appearance of new proteins and the formation of disease resistance. The results contribute to the analysis of the SA role in rice systemic acquired resistance. 展开更多
关键词 RICE salicylic acid (SA) induced protein systemic acquired resistance (SAR)
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LU分解和Laplace算法在GPU上的实现 被引量:9
17
作者 陈颖 林锦贤 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2011年第3期851-855,共5页
随着图形处理器(GPU)性能的大幅度提升以及可编程性的发展,已经有许多算法成功地移植到GPU上。LU分解和Laplace算法是科学计算的核心,但计算量往往很大,由此提出了一种在GPU上加速计算的方法。使用Nvidia公司的统一计算设备架构(CUDA)... 随着图形处理器(GPU)性能的大幅度提升以及可编程性的发展,已经有许多算法成功地移植到GPU上。LU分解和Laplace算法是科学计算的核心,但计算量往往很大,由此提出了一种在GPU上加速计算的方法。使用Nvidia公司的统一计算设备架构(CUDA)编程模型实现这两个算法,通过对CPU与GPU进行任务划分,同时利用GPU上的共享存储器提高数据访问速度,对GPU程序进行分支消除,并且对矩阵分段计算以达到加速计算的目的。实验结果表明,随着矩阵规模的增大,基于GPU的算法相对于基于CPU的算法具有良好的加速效果。 展开更多
关键词 图形处理器 LU分解 Laplace算法 统一计算设备架构 共享存储器
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多核CPU和GPU加速分子动力学模拟 被引量:6
18
作者 林江宏 林锦贤 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2011年第3期843-847,共5页
在多核中央处理器(CPU)—图形处理器(GPU)异构并行体系结构上,采用OpenMP和计算统一设备架构(CUDA)编程实现了基于AMBER力场的蛋白质分子动力学模拟程序。通过合理地将程序划分为CPU单线程、CPU多线程和GPU多线程执行部分,高效地利用了... 在多核中央处理器(CPU)—图形处理器(GPU)异构并行体系结构上,采用OpenMP和计算统一设备架构(CUDA)编程实现了基于AMBER力场的蛋白质分子动力学模拟程序。通过合理地将程序划分为CPU单线程、CPU多线程和GPU多线程执行部分,高效地利用了计算机的处理能力。性能测试结果表明,相对于优化后的CPU串行计算,多核CPU-GPU异构并行计算模型有强大的性能优势,特别是将占整个程序执行时间90%的作用力的计算移植到GPU上执行,获得了最高可达12倍的计算加速比。 展开更多
关键词 分子动力学 图形处理器 多核中央处理器 AMBER力场 计算统一设备架构 OPENMP
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一种采用新的相似性度量方法的共调控基因动态模糊聚类算法 被引量:1
19
作者 李小梅 郭红 《福州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期198-205,共8页
针对基因间共调控关系的特点和现有共调控基因聚类分析方法的不足,提出一种基于广义信息论中二次互信息的广义相似性度量标准QMISM,并利用免疫遗传算法将高维样本映射到二维空间,进而实现动态模糊聚类和聚类结果可视化.对人工合成数据... 针对基因间共调控关系的特点和现有共调控基因聚类分析方法的不足,提出一种基于广义信息论中二次互信息的广义相似性度量标准QMISM,并利用免疫遗传算法将高维样本映射到二维空间,进而实现动态模糊聚类和聚类结果可视化.对人工合成数据和真实的基因表达数据的实验结果表明,该算法能得到更好的聚类结果. 展开更多
关键词 共调控基因 相似性度量 免疫遗传算法 动态模糊聚类
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构建时延基因调控网络的多数据源融合算法 被引量:1
20
作者 徐赛娟 郭红 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2013年第2期375-379,共5页
为了进一步提高基因调控网络构建的精确度,提出一种基于多数据源融合的时延基因调控网络构建算法.该算法基于递归模糊神经网络模型,使用时序互信息估计基因间的转录时延,并限制每个基因的潜在调控基因,从而有效提高建网的效率.在网络结... 为了进一步提高基因调控网络构建的精确度,提出一种基于多数据源融合的时延基因调控网络构建算法.该算法基于递归模糊神经网络模型,使用时序互信息估计基因间的转录时延,并限制每个基因的潜在调控基因,从而有效提高建网的效率.在网络结构学习阶段,使用离散多目标粒子群优化(discrete multi-objective particle swarm optimization,dMOPSO)算法实现从时序基因表达数据和CHIP-chip数据共同构建基因调控网络.人工模拟数据和酵母菌细胞周期表达数据的实验结果表明该算法能正确选出潜在的调控基因,从而更加精确地构建基因调控网络. 展开更多
关键词 基因调控网络 递归模糊神经网络 多数据源融合 时延 时序互信息
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