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基于PacBio平台的七叶一枝花全长转录组测序 被引量：6
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作者 宋发军 杨瑞霜 +3 位作者 吕昕芮 刘祖懿 王红莹 孟艳艳 《中南民族大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2022年第2期153-160,共8页
以根状茎、茎、叶、花、果荚及种子6个部位为样品,利用PacBio技术对七叶一枝花进行了全长转录组测序,并对测序数据进行了生物信息学分析.研究共获得52537个平均长度为2607 bp的高质量isoforms,其中40725条isoforms得到注释.GO注释中,459... 以根状茎、茎、叶、花、果荚及种子6个部位为样品,利用PacBio技术对七叶一枝花进行了全长转录组测序,并对测序数据进行了生物信息学分析.研究共获得52537个平均长度为2607 bp的高质量isoforms,其中40725条isoforms得到注释.GO注释中,4596个isoforms分为生物学过程、细胞组成和分子功能三大类的49个功能组;COG注释到了17848个isoforms,其中参与复制,重组和修复相关的isoforms最多,达5094个;此外,31934个isoforms被注释到KEGG数据库中的134个代谢通路,分布于碳水化合物代谢、翻译、折叠、分类和降解、脂质代谢等分类中.基因结构分析中,共得到39342个CDS,其平均长度达到759 bp.此外,SSR分析表明,52537个isoforms中的双核苷酸重复数最多,达到9925个.研究获得了七叶一枝花的全长转录组数据库,为该属植物的后续分子研究提供了数据支撑和基因资源. 展开更多
关键词 七叶一枝花 全长转录组 测序分析 功能注释
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脱落酸对葡萄幼苗镉积累的影响 被引量：2
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作者 韩佳希 范中菡 +6 位作者 董义霞 吕昕芮 李红春 陈庆华 李洪浩 林立金 胡容平 《中国农学通报》 2022年第34期46-51,共6页
为降低镉污染条件下葡萄对镉的积累,促进葡萄生长,采用盆栽试验研究镉污染(5 mg/kg)条件下喷施脱落酸对葡萄幼苗生长及镉积累的影响。结果表明,葡萄幼苗各部位的生物量和叶片的光合色素含量均随着脱落酸浓度的增加(0、1、5、10、20μmol... 为降低镉污染条件下葡萄对镉的积累,促进葡萄生长,采用盆栽试验研究镉污染(5 mg/kg)条件下喷施脱落酸对葡萄幼苗生长及镉积累的影响。结果表明,葡萄幼苗各部位的生物量和叶片的光合色素含量均随着脱落酸浓度的增加(0、1、5、10、20μmol/L)而先降低后增加。随着脱落酸浓度的增加,葡萄幼苗叶片的POD及CAT活性和土壤pH呈现先增加后降低的趋势,而SOD活性随着脱落酸浓度的增加而增加。另外,喷施脱落酸能使葡萄幼苗各部位镉含量显著低于对照,并随着脱落酸浓度的增加而减少,脱落酸浓度为20μmol/L时,葡萄幼苗的根系和地上部分分别较对照降低了36.54%和74.36%。综上,喷施脱落酸能够降低葡萄对镉的吸收,以20μmol/L脱落酸浓度最佳。 展开更多
关键词 葡萄 镉 脱落酸 光合生理 抗氧化生理
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七叶一枝花中两个尿苷二磷酸糖基转移酶基因的克隆和原核表达
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作者 宋发军 吕昕芮 +3 位作者 刘祖懿 杨瑞霜 王红莹 孟艳艳 《中南民族大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2022年第3期277-284,共8页
尿苷二磷酸糖基转移酶(uridine diphosphate glycosyltransferases,UGTs)是重楼皂苷生物合成途径下游的关键酶,通过催化薯蓣皂苷元或偏诺皂苷元的糖基化反应以形成多种重楼皂苷.因此,获取并表征与重楼皂苷合成相关的UGTs,对于解析重楼... 尿苷二磷酸糖基转移酶(uridine diphosphate glycosyltransferases,UGTs)是重楼皂苷生物合成途径下游的关键酶,通过催化薯蓣皂苷元或偏诺皂苷元的糖基化反应以形成多种重楼皂苷.因此,获取并表征与重楼皂苷合成相关的UGTs,对于解析重楼皂苷的生物合成途径具有重要的研究价值.为此,在获得2个UGTs基因(PpUGT01和PpUGT42)全长的基础上,分别构建了它们的原核表达载体,并将其在大肠杆菌中顺利表达,同时获得了可溶性蛋白表达产物.此外,还进一步利用体外酶促反应对PpUGT42的催化活性进行了分析.结果为获得催化重楼皂苷生成的关键UGTs奠定了基础,也可为人工合成重楼皂苷提供新的线索. 展开更多
关键词 七叶一枝花 尿苷二磷酸糖基转移酶 原核表达 体外酶促反应
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