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诸氏鲻虾虎鱼转录组序列中微卫星标记的初步筛选及特征分析 被引量:16
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作者 蔡磊 余露军 +3 位作者 陈小曲 陈琳 李建军 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期146-151,共6页
旨在为大规模开发诸氏鲻虾虎鱼微卫星标记,采用高通量测序技术,对诸氏鲻虾虎鱼肝脏转录组进行了测序。结果共获得47 979条Unigenes,利用微卫星查找程序在47 979条Unigenes中共获得6 225个微卫星位点(12.97%),平均每7.02 kb就出现1个微... 旨在为大规模开发诸氏鲻虾虎鱼微卫星标记,采用高通量测序技术,对诸氏鲻虾虎鱼肝脏转录组进行了测序。结果共获得47 979条Unigenes,利用微卫星查找程序在47 979条Unigenes中共获得6 225个微卫星位点(12.97%),平均每7.02 kb就出现1个微卫星位点。6 225个微卫星位点由226种重复基序组成,主要分布在三、四和五碱基重复类型中。在数量上,单碱基重复类型微卫星位点最多,占42.49%,二碱基和三碱基重复类型所占比例相似,分别为25.22%和26.27%,四、五、六重复类型较少,合计占6.03%。单碱基重复序列中最多的类型为A/T,二碱基重复序列中以AG/CT重复单元为主,三碱基重复序列中以AGC/TCG为优势类型。挑选部分二、三和四单元重复类型微卫星序列,共设计76对引物,可稳定扩增出目的条带的有55对,其中32对具有多态性。结果表明,利用诸氏鲻虾虎鱼转录组数据可快速大量开发微卫星标记。 展开更多
关键词 诸氏鲻虾虎鱼 转录组序列 微卫星 筛选 分布特征
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不同发育期诸氏鲻虾虎鱼对钻井液的敏感性比较 被引量:8
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作者 李建军 吴美慧 +1 位作者 黄韧 《中国比较医学杂志》 CAS 2013年第4期48-51,共4页
目的筛选试验鱼适宜急性毒性试验的发育期。方法将诸氏鲻虾虎鱼早期仔鱼、中期仔鱼、晚期仔鱼、稚鱼、幼鱼及成鱼暴露于一定浓度的钻井液中,比较钻井液对不同发育期诸氏鲻虾虎鱼的急性毒性。结果早期仔鱼48 h LC50为157 mg/L,中期仔鱼48... 目的筛选试验鱼适宜急性毒性试验的发育期。方法将诸氏鲻虾虎鱼早期仔鱼、中期仔鱼、晚期仔鱼、稚鱼、幼鱼及成鱼暴露于一定浓度的钻井液中,比较钻井液对不同发育期诸氏鲻虾虎鱼的急性毒性。结果早期仔鱼48 h LC50为157 mg/L,中期仔鱼48 h LC50大于500 mg/L;中期仔鱼96 h LC50为79 mg/L,晚期仔鱼96h LC50为625 mg/L,稚鱼、幼鱼、成鱼96 h LC50显著大于500 mg/L;卤虫无节幼体96 h LC50为105 mg/L;不同发育期诸氏鲻虾虎鱼对钻井液的敏感性顺序为:早期仔鱼>中期仔鱼>晚期仔鱼>稚、幼、成鱼。结论诸氏鲻虾虎鱼的早期仔鱼适用于海洋污染物急性毒性评价。 展开更多
关键词 诸氏鲻虾虎鱼 钻井液 急性毒性 毒性评价
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诸氏鲻虾虎鱼致病性创伤弧菌的分离与鉴定 被引量:7
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作者 余露军 蔡磊 +2 位作者 陈小曲 李建军 《动物医学进展》 北大核心 2015年第9期51-54,共4页
从患病的诸氏鲻虾虎鱼分离病原,研究其致病性。通过形态学观察、生理生化特性、HSP60序列扩增及系统发育树分析等方法系统鉴定,并进行了人工感染和毒力基因检测。结果表明,从患病的诸氏鲻虾虎鱼肝脏组织分离到1株革兰阴性杆菌,编号PYMc1... 从患病的诸氏鲻虾虎鱼分离病原,研究其致病性。通过形态学观察、生理生化特性、HSP60序列扩增及系统发育树分析等方法系统鉴定,并进行了人工感染和毒力基因检测。结果表明,从患病的诸氏鲻虾虎鱼肝脏组织分离到1株革兰阴性杆菌,编号PYMc14-2,回归感染试验证实该菌株为诸氏鲻虾虎鱼的病原菌,毒力基因hemo检测结果阳性。生化特性结果与创伤弧菌类似,PCR扩增获得的486bp的HSP60基因序列与创伤弧菌(登录号AF230955.1)同源性达94%;系统进化树分析表明,PYMc14-2与创伤弧菌(登录号AF230955.1)聚为一簇,初步鉴定该菌为创伤弧菌。 展开更多
关键词 诸氏鲻虾虎鱼 病原菌 创伤弧菌 HSP60基因
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不同饲料对诸氏鲻虾虎鱼生长和利用效果的影响 被引量:4
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作者 魏远征 林忠婷 +1 位作者 李建军 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第1期29-36,共8页
目的初步探讨过渡期诸氏鲻虾虎鱼的营养需求,为专用配合饲料的开发及相关标准的制定提供数据参考。方法分别采用卤虫无节幼体(Arternia nauplii,CK)和7种商业化配合饲料(P30L8,P35L8,P50L8,P55L8;P50L12,P53L12,P55L12)饲喂过渡期... 目的初步探讨过渡期诸氏鲻虾虎鱼的营养需求,为专用配合饲料的开发及相关标准的制定提供数据参考。方法分别采用卤虫无节幼体(Arternia nauplii,CK)和7种商业化配合饲料(P30L8,P35L8,P50L8,P55L8;P50L12,P53L12,P55L12)饲喂过渡期虾虎鱼幼鱼,8周生长实验以测定存活率(survival rate,SR)、增重率(weight gain,WG)、特定生长率(specific growth rate,SGR)和摄食率(feeding rate,FR)、饲料系数(feed conversion ratio,FCR)等生长指标,并测定不同营养水平下虾虎鱼全鱼(除去内脏)的基本组份。结果 SR饲料组SR(51.78±8.98~68.22±4.95)较对照组CK(58.22±6.51)均无显著差异(P〉0.05);WG除P30L8(130.76±23.67)、P50L12组(220.86±16.9)外,各实验组均优于对照组CK(206±41.91,P〈0.05),且饲料粗脂肪含量相同(8%,12%;能量值相差不大)时,WG随饲料粗蛋白含量的升高而上升;SGR在粗脂肪含量相同时SGR也随饲料粗蛋白含量的升高而上升;FR,FCR P50L8,P55L8;P50L12,P53L12,P55L12组均优于对照组CK(1.74±0.36),且饲料粗脂肪含量8%时随粗蛋白含量上升而下降。此外虾虎鱼鱼体基本组份均与饲料中粗蛋白、粗脂肪含量关系不大(P〈0.05)。结论配合饲料饲替代生物饵料是可行的,且能取得较好的生长效果;饲料粗蛋白、粗脂肪含量对虾虎鱼鱼体基本组份影响不显著(P〈0.05);饲料粗蛋白50%,粗脂肪8%时,饲料利用率最好且过渡期虾虎鱼可获得较好的生长效果。 展开更多
关键词 诸氏鲻虾虎鱼 配合饵料 过渡期生长 饲料利用 鱼体基本组份
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三种海洋微藻光密度计数法的建立与应用
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作者 余露军 +2 位作者 魏远征 苗宗余 蔡磊 《海洋与渔业》 2021年第2期120-121,共2页
海水小球藻( Chlorella sp. )、亚心形扁藻( Platymonas subcordiformis )和牟氏角毛藻( Chaetoceros muelleri)是海洋绿藻和硅藻中典型种类,因具有营养价值高、生长速度快、易于大规模培养等优点,已经成为鱼、虾、贝等水产动物重要的... 海水小球藻( Chlorella sp. )、亚心形扁藻( Platymonas subcordiformis )和牟氏角毛藻( Chaetoceros muelleri)是海洋绿藻和硅藻中典型种类,因具有营养价值高、生长速度快、易于大规模培养等优点,已经成为鱼、虾、贝等水产动物重要的开口饵料,建立其快速、准确计数方法,对提高藻类利用水平、促进水产苗种工业高质量发展具有重要价值。 展开更多
关键词 海水小球藻 光密度计 水产苗种 亚心形扁藻 水产动物 开口饵料 牟氏角毛藻 准确计数
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