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罗非鱼优势耐冰温假单胞菌的分离鉴定及耐冰温基因
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作者 陈惠萍 梁桉婕 +5 位作者 吕冉晖 陈鸿 缪小兰 段杉 《广东海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期96-104,共9页
【目的】分析罗非鱼(Oreochromis mossambicus)中优势耐冰温假单胞菌(Pseudomonas)特有的基因特征和耐冰温基因。【方法】采用全长16S rDNA测序找出冰温贮藏罗非鱼中的优势假单胞菌,进行分离、鉴定;通过Illumina平台对其进行基因组从头... 【目的】分析罗非鱼(Oreochromis mossambicus)中优势耐冰温假单胞菌(Pseudomonas)特有的基因特征和耐冰温基因。【方法】采用全长16S rDNA测序找出冰温贮藏罗非鱼中的优势假单胞菌,进行分离、鉴定;通过Illumina平台对其进行基因组从头测序,并通过基因家族分析确定耐冰温假单胞菌的核心基因家族,再与不耐冰温的铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa PAO1)的基因组比较,筛选出耐冰温假单胞菌特有的核心基因家族;结合文献报道的假单胞菌的寒冷适应基因筛查出耐冰温假单胞菌潜在的耐冰温基因。【结果与结论】发现并分离出冰温贮藏罗非鱼中丰度最高的5株腐败菌,经鉴定均为布氏假单胞菌(Pseudomonas bubulae)和莓实假单胞菌(Pseudomonas fragi)。这5株假单胞菌的核心基因家族有3 692个,其中861个在不耐冰温的铜绿假单胞菌的基因组中不存在,此861个特有的核心基因家族在群体感应、类固醇的降解、某些氨基酸和肽的代谢、脂肪酸降解、抗坏血酸和醛糖酸代谢、柠檬烯和蒎烯降解、丁酸代谢、苯乙烯降解和香叶醇降解等途径中显著富集。进一步筛查发现上述5株耐冰温假单胞菌带有不耐冰温的铜绿假单胞菌没有的des、cbpM、ousA、treP、treR、trxC和grX等基因。 展开更多
关键词 罗非鱼 冰温贮藏 假单胞菌 鉴定 基因组测序 耐冰温基因
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内源化学反应及细菌活动对冰温贮藏罗非鱼片腐败变质的贡献研究 被引量:1
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作者 陈惠萍 刘易晓 +5 位作者 陈鸿 缪小兰 梁桉婕 段杉 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2023年第19期13-19,共7页
目的评估内源化学反应及细菌活动对冰温贮藏罗非鱼片腐败变质的贡献。方法研究经抑菌处理及未经抑菌处理的罗非鱼片在冰温贮藏期间的菌落总数、挥发性盐基氮(total volatile basic nitrogen,TVB-N)值、pH、硫代巴比妥酸(thiobarbituric ... 目的评估内源化学反应及细菌活动对冰温贮藏罗非鱼片腐败变质的贡献。方法研究经抑菌处理及未经抑菌处理的罗非鱼片在冰温贮藏期间的菌落总数、挥发性盐基氮(total volatile basic nitrogen,TVB-N)值、pH、硫代巴比妥酸(thiobarbituric acid,TBA)值及感官鲜度的变化,采用电子鼻监测挥发性成分的变化,并对未经抑菌处理罗非鱼片各指标与菌落总数间进行皮尔逊相关性分析。结果贮藏期间经抑菌处理的样品的菌落总数始终小于5.05 log CFU/g,TVB-N值小于3.00 mg/100 g,pH及电子鼻测定的各种挥发性成分基本未变,未发生感官腐败,虽然TBA值有所增加(P<0.05),但始终低于0.05 mg MDA/100 g。而未经抑菌处理的罗非鱼片,菌落总数在21 d时达到9.19 log CFU/g,TVB-N值增至40.69 mg/100 g,pH由6.65增至7.63,电子鼻测定的氮氧化合物、硫化物及有机硫化物骤增,TBA值增至0.072 mg MDA/100 g,显著高于抑菌处理的样品,感官腐败明显。结论冰温贮藏条件下内源化学反应仅导致一定程度的脂质氧化,罗非鱼片的腐败主要由细菌活动造成。 展开更多
关键词 罗非鱼片 冰温贮藏 内源化学反应 细菌活动 腐败
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