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厚壳贻贝(Mytilus coruscus)金属硫蛋白MT-10:cDNA克隆、结构分析及铜离子胁迫下的表达
被引量:
7
1
作者
王昊盛
宋鑫金
+5 位作者
董文强
吴斌
陈永霞
卢
玮
筱
祁鹏志
郭宝英
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期864-869,共6页
近年来我国沿海海域重金属污染日趋严重,软体动物尤其是双壳贝类响应重金属污染胁迫的研究发展成为目前的研究热点。金属硫蛋白是一类广泛存在于生物体内富含半胱氨酸(Cys)的小分子蛋白,具有结合金属离子的能力,能有效调节生物体细胞内...
近年来我国沿海海域重金属污染日趋严重,软体动物尤其是双壳贝类响应重金属污染胁迫的研究发展成为目前的研究热点。金属硫蛋白是一类广泛存在于生物体内富含半胱氨酸(Cys)的小分子蛋白,具有结合金属离子的能力,能有效调节生物体细胞内的金属离子平衡,具有清除自由基,重金属解毒的功能,关于厚壳贻贝MT蛋白的研究尚未见报道。本文首次利用RT-PCR和c DNA末端快速扩增技术克隆了厚壳贻贝MT-10蛋白c DNA全长(Mc-MT-10),其包含101bp的5′UTR区,108bp的3′UTR区以及222bp的ORF区,编码73个氨基酸。经比对发现Mc-MT-10富含Cys,且具有9个软体动物中常见的CXC结构以及CKCXXXCXCX结构,系统进化树中同科或属中MT-10聚合成一个分支,显示出高度保守性。采用Q-PCR技术分析了MT-10 mRNA在Cu^(2+)胁迫下厚壳贻贝外套膜及消化腺中表达变化,结果表明Mc-MT-10 mRNA在Cu^(2+)胁迫下两种组织中的表达量急剧升高,说明Cu^(2+)能够诱导Mc-MT-10 mRNA的表达,并且表现出诱导具有阈值性特点。研究结果可为深入研究厚壳贻贝MT蛋白的功能奠定基础,为厚壳贻贝抗重金属污染新品种选育提供数据支持。
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关键词
厚壳贻贝
金属硫蛋白基因
荧光定量PCR
铜胁迫
下载PDF
职称材料
扁玉螺转录组SSR信息分析
被引量:
7
2
作者
卢
玮
筱
陈永霞
祁鹏志
《浙江海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第3期215-220,共6页
采用生物信息学方法分析扁玉螺转录组文库EST序列(SSR)位点,并且设计简单重复序列(SSR)引物,以期为扁玉螺分子标记辅助育种提供有力的工具。对扁玉螺进行转录组测序采用Illumina Hiseq^(TM)高通量测序平台,再利用Micro SAtellite(MISA)...
采用生物信息学方法分析扁玉螺转录组文库EST序列(SSR)位点,并且设计简单重复序列(SSR)引物,以期为扁玉螺分子标记辅助育种提供有力的工具。对扁玉螺进行转录组测序采用Illumina Hiseq^(TM)高通量测序平台,再利用Micro SAtellite(MISA)工具,分析扁玉螺转录组中SSR的重复基元及其分布频率。利用Primer 3软件设计引物,并且通过SSRFinder筛选出SSR引物。从233 853条Unigenes中找到202 337个符合条件的SSRs,发生频率为45.34%,SSR位点的出现频率为86.53%。SSR位点中单核苷酸重复是主要类型,占总SSRs的63.44%,其次为双核苷酸和三核苷酸,分别为24.12%和6.73%。SSR所包含的重复基元中,单核苷酸重复基元A/T最多,占总SSR的54.15%;其次为双核苷酸AC/GT多,为15.9%。扁玉螺转录组中SSR位点出现频率高,而且类型丰富;大量的SSR分子标记技术有助于扁玉螺分子育种与遗传多样性分析提供更多的依据。
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关键词
扁玉螺
SSR
MicroSAtellite软件
转录组
引物
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职称材料
题名
厚壳贻贝(Mytilus coruscus)金属硫蛋白MT-10:cDNA克隆、结构分析及铜离子胁迫下的表达
被引量:
7
1
作者
王昊盛
宋鑫金
董文强
吴斌
陈永霞
卢
玮
筱
祁鹏志
郭宝英
机构
浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期864-869,共6页
基金
浙江省公益项目
2017C32009号
+1 种基金
浙江海洋大学科研启动资金项目
21105013615号
文摘
近年来我国沿海海域重金属污染日趋严重,软体动物尤其是双壳贝类响应重金属污染胁迫的研究发展成为目前的研究热点。金属硫蛋白是一类广泛存在于生物体内富含半胱氨酸(Cys)的小分子蛋白,具有结合金属离子的能力,能有效调节生物体细胞内的金属离子平衡,具有清除自由基,重金属解毒的功能,关于厚壳贻贝MT蛋白的研究尚未见报道。本文首次利用RT-PCR和c DNA末端快速扩增技术克隆了厚壳贻贝MT-10蛋白c DNA全长(Mc-MT-10),其包含101bp的5′UTR区,108bp的3′UTR区以及222bp的ORF区,编码73个氨基酸。经比对发现Mc-MT-10富含Cys,且具有9个软体动物中常见的CXC结构以及CKCXXXCXCX结构,系统进化树中同科或属中MT-10聚合成一个分支,显示出高度保守性。采用Q-PCR技术分析了MT-10 mRNA在Cu^(2+)胁迫下厚壳贻贝外套膜及消化腺中表达变化,结果表明Mc-MT-10 mRNA在Cu^(2+)胁迫下两种组织中的表达量急剧升高,说明Cu^(2+)能够诱导Mc-MT-10 mRNA的表达,并且表现出诱导具有阈值性特点。研究结果可为深入研究厚壳贻贝MT蛋白的功能奠定基础,为厚壳贻贝抗重金属污染新品种选育提供数据支持。
关键词
厚壳贻贝
金属硫蛋白基因
荧光定量PCR
铜胁迫
Keywords
Mytilus coruscus
metallothionein
Real-time fluorescence quantitative PCR
Cu^2+ stress
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
Q955
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职称材料
题名
扁玉螺转录组SSR信息分析
被引量:
7
2
作者
卢
玮
筱
陈永霞
祁鹏志
机构
国家海洋设施养殖工程技术研究中心
出处
《浙江海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第3期215-220,共6页
基金
浙江省公益项目(2017C32009)
文摘
采用生物信息学方法分析扁玉螺转录组文库EST序列(SSR)位点,并且设计简单重复序列(SSR)引物,以期为扁玉螺分子标记辅助育种提供有力的工具。对扁玉螺进行转录组测序采用Illumina Hiseq^(TM)高通量测序平台,再利用Micro SAtellite(MISA)工具,分析扁玉螺转录组中SSR的重复基元及其分布频率。利用Primer 3软件设计引物,并且通过SSRFinder筛选出SSR引物。从233 853条Unigenes中找到202 337个符合条件的SSRs,发生频率为45.34%,SSR位点的出现频率为86.53%。SSR位点中单核苷酸重复是主要类型,占总SSRs的63.44%,其次为双核苷酸和三核苷酸,分别为24.12%和6.73%。SSR所包含的重复基元中,单核苷酸重复基元A/T最多,占总SSR的54.15%;其次为双核苷酸AC/GT多,为15.9%。扁玉螺转录组中SSR位点出现频率高,而且类型丰富;大量的SSR分子标记技术有助于扁玉螺分子育种与遗传多样性分析提供更多的依据。
关键词
扁玉螺
SSR
MicroSAtellite软件
转录组
引物
Keywords
Neverita didyma
SSR
MicroSAtellite
transcriptional group
primers
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
厚壳贻贝(Mytilus coruscus)金属硫蛋白MT-10:cDNA克隆、结构分析及铜离子胁迫下的表达
王昊盛
宋鑫金
董文强
吴斌
陈永霞
卢
玮
筱
祁鹏志
郭宝英
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2017
7
下载PDF
职称材料
2
扁玉螺转录组SSR信息分析
卢
玮
筱
陈永霞
祁鹏志
《浙江海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018
7
下载PDF
职称材料
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