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海棠‘比利时垂枝’McRGL1a基因的克隆与分析
被引量:
3
1
作者
卢艳
芬
卜
芋
芬
+2 位作者
郝素晓
胡博
姚允聪
《北京农学院学报》
2016年第3期1-5,共5页
【目的】DELLA蛋白是赤霉素信号转导通路一类重要的调节因子,具有抑制植物生长的生理功能。本研究从海棠品种‘比利时垂枝’中分离得到一个海棠DELLA蛋白家族基因McRGL1a,并对其基因进行生物信息学分析,为进一步研究McRGL1a在调控植物...
【目的】DELLA蛋白是赤霉素信号转导通路一类重要的调节因子,具有抑制植物生长的生理功能。本研究从海棠品种‘比利时垂枝’中分离得到一个海棠DELLA蛋白家族基因McRGL1a,并对其基因进行生物信息学分析,为进一步研究McRGL1a在调控植物株高的生物学功能奠定基础。【方法】通过RT-PCR技术获得McRGL1a基因的cDNA。应用多种生物学工具分析其序列特征。【结果】序列分析表明,McRGL1a的cDNA长度为1 920bp,编码639个氨基酸;McRGL1a蛋白具有亲水性,主要定位于细胞质;海棠McRGL1a与苹果DELLA蛋白同源性极高,都具有DELLA、TVHYNP等典型结构;系统进化分析结果表明McRGL1a可能在植物株高调控过程中发挥重要功能。
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关键词
海棠
DELLA蛋白
基因克隆
序列分析
McRGL1a
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职称材料
5种苹果属植物GAI基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
卢艳
芬
卜
芋
芬
+2 位作者
郝素晓
汪天宇
姚允聪
《北京农学院学报》
2017年第1期1-7,共6页
【目的】研究DELLA家族的成员GAI在调控植物株型形成方面的生物学功能。【方法】从5种苹果属植物(‘国光’、‘武乡海棠’、‘SH6’、‘比利时垂枝’、‘比利时直立’)中分离得到GAI基因,应用多种生物学工具分析其序列特征。【结果】序...
【目的】研究DELLA家族的成员GAI在调控植物株型形成方面的生物学功能。【方法】从5种苹果属植物(‘国光’、‘武乡海棠’、‘SH6’、‘比利时垂枝’、‘比利时直立’)中分离得到GAI基因,应用多种生物学工具分析其序列特征。【结果】序列分析表明,GAI的CDS序列长度为1 875bp,编码624个氨基酸;GAI的基因组序列长度与其对应CDS序列长度相同;GAI蛋白具有亲水性,主要定位于细胞质;5种苹果属植物的GAI序列相似性极高,都具有DELLA家族和GRAS家族特有的典型结构。【结论】试验结果暗示这5种苹果属GAI基因可能在苹果株型形成方面发挥重要功能。
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关键词
苹果属植物
GAI
植物株型
DELLA蛋白
基因克隆
序列分析
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职称材料
苹果砧木‘SH6’中RGLs基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
3
作者
麻楠
刘静
+4 位作者
陈琦
郝素晓
卜
芋
芬
卢艳
芬
姚允聪
《北京农学院学报》
2018年第2期1-6,共6页
【目的】从苹果砧木‘SH6’中分离出三个DELLA家族基因RGL1b,RGL2a,RGL2b,为探究苹果DELLA蛋白家族对植株生长发育的调控机理,对这三个基因进行了生物信息学分析。【方法】通过克隆技术从苹果砧木‘SH6’中分离得到RGL1b,RGL2a,RGL2b的...
【目的】从苹果砧木‘SH6’中分离出三个DELLA家族基因RGL1b,RGL2a,RGL2b,为探究苹果DELLA蛋白家族对植株生长发育的调控机理,对这三个基因进行了生物信息学分析。【方法】通过克隆技术从苹果砧木‘SH6’中分离得到RGL1b,RGL2a,RGL2b的编码序列,利用生物学工具分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR方法分析其基因表达水平。【结果】序列分析表明,苹果砧木‘SH6’的3种RGLs序列具有较高相似性,均存在DELLA蛋白和GRAS家族的结构特征。但序列也存在部分差异,预测其编码的蛋白都具有亲水性能,RGL1b,RGL2a蛋白大部分定位在细胞质,而RGL2b主要分布在细胞核。用实时荧光定量PCR方法,检测了‘SH6’及其亲本‘国光’中这3种RGLs基因的相对表达水平,结果显示,RGL1b,RGL2a,RGL2b在‘SH6’中的表达量均明显高于‘国光’中的表达。【结论】苹果砧木‘SH6’中RGL1b,RGL2a,RGL2b基因可能在果树矮化中发挥重要作用。
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关键词
SH6
DELLA蛋白
RGL1b
RGL2a
RGL2b
株高
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职称材料
五种杨树MYB基因的克隆及其在叶片发育中的表达分析
4
作者
潘成
卜
芋
芬
荆艳萍
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期4090-4098,共9页
本研究以84K杨(Populus alba×Populus glandulosa)为研究材料,从中克隆到PagMYB10、PagMYB57、PagMYB134、PagMYB156及PagMYB182共5种MYB基因,其编码区序列长度分别为810 bp、957 bp、888 bp、804 bp和738 bp,分别编码269个、318个...
本研究以84K杨(Populus alba×Populus glandulosa)为研究材料,从中克隆到PagMYB10、PagMYB57、PagMYB134、PagMYB156及PagMYB182共5种MYB基因,其编码区序列长度分别为810 bp、957 bp、888 bp、804 bp和738 bp,分别编码269个、318个、295个、267个和245个氨基酸。它们都具有R2和R3保守结构域,属于R2R3-MYB转录因子。氨基酸序列同源性分析和进化分析表明PagMYB10和PagMYB134属于转录激活因子,而PagMYB57、Pag MYB156及Pag MYB182属于转录抑制因子。运用荧光定量PCR对叶片发育中这五种MYB的表达情况进行检测,结果表明PagMYB10和PagMYB134在第二片叶中表达量最高,两者在叶片发育过程中的表达量呈现相似的变化趋势;而PagMYB57、PagMYB156及PagMYB182则在第3片叶中的表达量最高,三者在叶片发育过程中的表达趋势相似,提示这两类MYB对于转录存在协同调控。该研究结果为进一步开展杨树MYB基因的功能特性研究提供了基础。
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关键词
杨树
MYB
基因克隆
叶片发育
表达分析
原文传递
细胞骨架参与调控细胞壁形成的研究进展
被引量:
4
5
作者
张越
满奕
+3 位作者
卜
芋
芬
孙娜
李瑞丽
荆艳萍
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2020年第2期176-186,共11页
植物细胞壁是地球上最丰富的可再生资源,也是植物细胞区别于动物细胞的特殊结构之一,它与细胞质膜及细胞骨架共同构成了植物细胞表面的细胞壁-质膜-细胞骨架连续体.细胞壁为植物细胞提供外部支撑结构,细胞骨架则在细胞内构成内部网络支...
植物细胞壁是地球上最丰富的可再生资源,也是植物细胞区别于动物细胞的特殊结构之一,它与细胞质膜及细胞骨架共同构成了植物细胞表面的细胞壁-质膜-细胞骨架连续体.细胞壁为植物细胞提供外部支撑结构,细胞骨架则在细胞内构成内部网络支架结构.近年来,有关植物细胞骨架调控细胞壁形成的研究有了很大进展,本文从细胞骨架参与细胞壁物质膜泡运输、细胞骨架调控纤维素微纤丝沉积、细胞骨架调控次生细胞壁加厚以及细胞骨架参与细胞壁形成信号的调控等方面进行了阐述和总结,并对今后的研究方向进行了展望.
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关键词
细胞壁
细胞骨架
次生壁加厚
细胞壁信号
原文传递
题名
海棠‘比利时垂枝’McRGL1a基因的克隆与分析
被引量:
3
1
作者
卢艳
芬
卜
芋
芬
郝素晓
胡博
姚允聪
机构
北京农学院植物科学技术学院/北京林果业生态环境功能提升协同创新中心
出处
《北京农学院学报》
2016年第3期1-5,共5页
基金
北京市农委科技项目(20150121)
北京市大学生科研训练计划深化项目
2016农业应用新技术北京市重点实验室开放课题(kf2016024)
文摘
【目的】DELLA蛋白是赤霉素信号转导通路一类重要的调节因子,具有抑制植物生长的生理功能。本研究从海棠品种‘比利时垂枝’中分离得到一个海棠DELLA蛋白家族基因McRGL1a,并对其基因进行生物信息学分析,为进一步研究McRGL1a在调控植物株高的生物学功能奠定基础。【方法】通过RT-PCR技术获得McRGL1a基因的cDNA。应用多种生物学工具分析其序列特征。【结果】序列分析表明,McRGL1a的cDNA长度为1 920bp,编码639个氨基酸;McRGL1a蛋白具有亲水性,主要定位于细胞质;海棠McRGL1a与苹果DELLA蛋白同源性极高,都具有DELLA、TVHYNP等典型结构;系统进化分析结果表明McRGL1a可能在植物株高调控过程中发挥重要功能。
关键词
海棠
DELLA蛋白
基因克隆
序列分析
McRGL1a
Keywords
Malus sp
DELLA proteins
plant height
gene clone
sequence analysis
McRGLla
分类号
S661.4 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
5种苹果属植物GAI基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
卢艳
芬
卜
芋
芬
郝素晓
汪天宇
姚允聪
机构
北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京市重点实验室/北京林果业生态环境功能提升协同创新中心
出处
《北京农学院学报》
2017年第1期1-7,共6页
基金
北京市农委农业科技项目(20150121)
北京市大学生科研训练计划深化项目
2016农业应用新技术北京市重点实验室开放课题(kf2016024)
文摘
【目的】研究DELLA家族的成员GAI在调控植物株型形成方面的生物学功能。【方法】从5种苹果属植物(‘国光’、‘武乡海棠’、‘SH6’、‘比利时垂枝’、‘比利时直立’)中分离得到GAI基因,应用多种生物学工具分析其序列特征。【结果】序列分析表明,GAI的CDS序列长度为1 875bp,编码624个氨基酸;GAI的基因组序列长度与其对应CDS序列长度相同;GAI蛋白具有亲水性,主要定位于细胞质;5种苹果属植物的GAI序列相似性极高,都具有DELLA家族和GRAS家族特有的典型结构。【结论】试验结果暗示这5种苹果属GAI基因可能在苹果株型形成方面发挥重要功能。
关键词
苹果属植物
GAI
植物株型
DELLA蛋白
基因克隆
序列分析
Keywords
Malus plant
GAI
plant architecture
DELLA
gene cloning
sequence analysis
分类号
S5 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
苹果砧木‘SH6’中RGLs基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
3
作者
麻楠
刘静
陈琦
郝素晓
卜
芋
芬
卢艳
芬
姚允聪
机构
北京农学院植物科学技术学院/北京林果业生态环境功能提升协同创新中心
出处
《北京农学院学报》
2018年第2期1-6,共6页
基金
农业应用新技术北京市重点实验室开放课题(kf2016024)
文摘
【目的】从苹果砧木‘SH6’中分离出三个DELLA家族基因RGL1b,RGL2a,RGL2b,为探究苹果DELLA蛋白家族对植株生长发育的调控机理,对这三个基因进行了生物信息学分析。【方法】通过克隆技术从苹果砧木‘SH6’中分离得到RGL1b,RGL2a,RGL2b的编码序列,利用生物学工具分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR方法分析其基因表达水平。【结果】序列分析表明,苹果砧木‘SH6’的3种RGLs序列具有较高相似性,均存在DELLA蛋白和GRAS家族的结构特征。但序列也存在部分差异,预测其编码的蛋白都具有亲水性能,RGL1b,RGL2a蛋白大部分定位在细胞质,而RGL2b主要分布在细胞核。用实时荧光定量PCR方法,检测了‘SH6’及其亲本‘国光’中这3种RGLs基因的相对表达水平,结果显示,RGL1b,RGL2a,RGL2b在‘SH6’中的表达量均明显高于‘国光’中的表达。【结论】苹果砧木‘SH6’中RGL1b,RGL2a,RGL2b基因可能在果树矮化中发挥重要作用。
关键词
SH6
DELLA蛋白
RGL1b
RGL2a
RGL2b
株高
Keywords
SH6
DELLA protein
RGL1b
RGL2a
RGL2b
height
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
五种杨树MYB基因的克隆及其在叶片发育中的表达分析
4
作者
潘成
卜
芋
芬
荆艳萍
机构
北京林业大学生物科学与技术学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期4090-4098,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0600201)资助
文摘
本研究以84K杨(Populus alba×Populus glandulosa)为研究材料,从中克隆到PagMYB10、PagMYB57、PagMYB134、PagMYB156及PagMYB182共5种MYB基因,其编码区序列长度分别为810 bp、957 bp、888 bp、804 bp和738 bp,分别编码269个、318个、295个、267个和245个氨基酸。它们都具有R2和R3保守结构域,属于R2R3-MYB转录因子。氨基酸序列同源性分析和进化分析表明PagMYB10和PagMYB134属于转录激活因子,而PagMYB57、Pag MYB156及Pag MYB182属于转录抑制因子。运用荧光定量PCR对叶片发育中这五种MYB的表达情况进行检测,结果表明PagMYB10和PagMYB134在第二片叶中表达量最高,两者在叶片发育过程中的表达量呈现相似的变化趋势;而PagMYB57、PagMYB156及PagMYB182则在第3片叶中的表达量最高,三者在叶片发育过程中的表达趋势相似,提示这两类MYB对于转录存在协同调控。该研究结果为进一步开展杨树MYB基因的功能特性研究提供了基础。
关键词
杨树
MYB
基因克隆
叶片发育
表达分析
Keywords
Poplar
MYB
Gene cloning
Leaf development
Expression analysis
分类号
S792.11 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
细胞骨架参与调控细胞壁形成的研究进展
被引量:
4
5
作者
张越
满奕
卜
芋
芬
孙娜
李瑞丽
荆艳萍
机构
北京林业大学
北京林业大学生物科学与技术学院
出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2020年第2期176-186,共11页
基金
国家重点研发计划项目(批准号:2017YFD0600201)
国家自然科学基金(批准号:31761133009)资助.
文摘
植物细胞壁是地球上最丰富的可再生资源,也是植物细胞区别于动物细胞的特殊结构之一,它与细胞质膜及细胞骨架共同构成了植物细胞表面的细胞壁-质膜-细胞骨架连续体.细胞壁为植物细胞提供外部支撑结构,细胞骨架则在细胞内构成内部网络支架结构.近年来,有关植物细胞骨架调控细胞壁形成的研究有了很大进展,本文从细胞骨架参与细胞壁物质膜泡运输、细胞骨架调控纤维素微纤丝沉积、细胞骨架调控次生细胞壁加厚以及细胞骨架参与细胞壁形成信号的调控等方面进行了阐述和总结,并对今后的研究方向进行了展望.
关键词
细胞壁
细胞骨架
次生壁加厚
细胞壁信号
Keywords
cell wall
cytoskeleton
secondary cell wall thickening
cell wall signaling
分类号
Q942 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海棠‘比利时垂枝’McRGL1a基因的克隆与分析
卢艳
芬
卜
芋
芬
郝素晓
胡博
姚允聪
《北京农学院学报》
2016
3
下载PDF
职称材料
2
5种苹果属植物GAI基因的克隆及生物信息学分析
卢艳
芬
卜
芋
芬
郝素晓
汪天宇
姚允聪
《北京农学院学报》
2017
3
下载PDF
职称材料
3
苹果砧木‘SH6’中RGLs基因的克隆及生物信息学分析
麻楠
刘静
陈琦
郝素晓
卜
芋
芬
卢艳
芬
姚允聪
《北京农学院学报》
2018
2
下载PDF
职称材料
4
五种杨树MYB基因的克隆及其在叶片发育中的表达分析
潘成
卜
芋
芬
荆艳萍
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
5
细胞骨架参与调控细胞壁形成的研究进展
张越
满奕
卜
芋
芬
孙娜
李瑞丽
荆艳萍
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2020
4
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