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新型冠状病毒实时荧光RT-PCR检测的性能验证 被引量：8
1
作者 何吕芬 李沙 +7 位作者 利振坤 李欢 王立程 符晓莹 黎元莉 陈海 陈少金 朱雄 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第7期848-851,共4页
目的对实时荧光聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸进行方法学评价.方法依据ISO15189和CNAS-GL039性能评价文件及厂家声明,对本法精密度、准确度、检测下限、特异性和抗干扰能力进行验证.结果RT-PCR试剂检测SARS... 目的对实时荧光聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸进行方法学评价.方法依据ISO15189和CNAS-GL039性能评价文件及厂家声明,对本法精密度、准确度、检测下限、特异性和抗干扰能力进行验证.结果RT-PCR试剂检测SARS-CoV-2核酸结果的精密度均小于允许变异度,准确性和重复性的符合率均为100%,检测下限为1.0×103 copies/mL,内源性抗干扰能力CV<5%,与感染部位相同或感染症状相似的其他病原体等无交叉反应.结论RT-PCR检测方法灵敏度高,重复性好,抗干扰力强,检测下限和特异性均符合要求,可用于临床检测. 展开更多
关键词 新型冠状病毒 性能验证 实时荧光聚合酶链反应
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慢加急性肝衰竭并发侵袭性真菌感染患者临床特点及其影响因素分析 被引量：4
2
作者 利振坤 何吕芬 +3 位作者 李欢 符晓莹 王身华 吴智明 《实用肝脏病杂志》 CAS 2021年第4期520-523,共4页
目的分析慢加急性乙型肝炎肝衰竭(HBV-ACLF)并发侵袭性真菌感染患者的临床特点及其影响因素。方法2017年1月~2020年1月我院收治的HBV-ACLF患者130例,使用迪尔鉴定仪鉴定真菌种类,采用多因素Logistic回归分析影响ACLF患者并发侵袭性真菌... 目的分析慢加急性乙型肝炎肝衰竭(HBV-ACLF)并发侵袭性真菌感染患者的临床特点及其影响因素。方法2017年1月~2020年1月我院收治的HBV-ACLF患者130例,使用迪尔鉴定仪鉴定真菌种类,采用多因素Logistic回归分析影响ACLF患者并发侵袭性真菌感染的危险因素。结果在本组130例HBV-ACLF患者中,并发侵袭性真菌感染50例(38.5%),其中,上呼吸道和肺部感染24例(48.0%),肠道感染14例(28.0%),泌尿道感染7例(14.0%),血流感染4例(8.0%),腹腔感染1例(2.0%);白色念珠菌26株(52.0%),另有热带念珠菌8株(16.0%),近平滑念珠菌6株(12.0%),季也蒙念珠菌5株(10.0%),黄曲霉菌3株(6.0%)和毛霉菌2株(4.0%);并发侵袭性真菌感染患者年龄≥40岁和长时间应用抗生素占比显著多于未并发真菌感染患者(P<0.05),血清总胆红素和凝血酶原时间显著高于或长于未并发患者,而血清白蛋白水平显著低于未并发真菌感染组(P<0.05);多因素Logistic回归分析显示,年龄≥40岁(OR=3.332)、血清总胆红素水平过高(OR=4.525)和长时间应用抗生素(OR=1.576)为ACLF患者并发侵袭性真菌感染的危险因素(P<0.05)。结论HBV-ACLF患者存在容易并发侵袭性真菌感染的危险因素,了解感染的常见部位和常见菌株有助于临床早期预防,及时处理,提高生存率。 展开更多
关键词 慢加急性肝衰竭 侵袭性真菌感染 临床特征 影响因素
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海南省三亚地区珠蛋白生成障碍性贫血的基因分型研究 被引量：4
3
作者 利振坤 李强 麦珍 《检验医学与临床》 CAS 2016年第1期46-47,50,共3页
目的初步对三亚地区人群珠蛋白生成障碍性贫血(简称地贫)进行基因分型以了解该地区地贫患病率及其高发的基因类型。方法收集1 164例外周血,用跨跃断裂点聚合酶链反应及反向斑点膜条杂交技术进行地贫基因分型检测。结果 1 164例外周血中... 目的初步对三亚地区人群珠蛋白生成障碍性贫血(简称地贫)进行基因分型以了解该地区地贫患病率及其高发的基因类型。方法收集1 164例外周血,用跨跃断裂点聚合酶链反应及反向斑点膜条杂交技术进行地贫基因分型检测。结果 1 164例外周血中。地贫344例(29.55%),β地贫92例(7.90%),αβ复合型地贫10例(0.86%)。地贫阳性率为38.3%。α地贫前4位的基因型及基因构成比分别是:-α^(3.7)/αα(128例)37.20%、-α^(4.2)/αα(82例)23.84%、——^(SEA)/αα(50例)14.53%、-α^(3.7)/-α^(4.2)(38例)11.05%;β地贫前4位的突变位点名称分别是:CD41-42(66例)、IVS-Ⅱ-654(12例)、-28(6例)、-29(4例)。结论三亚地区地贫以α地贫为主,具有区域性的特点,且发生率较高,加强对育龄人群的地贫全面筛查及基因诊断。 展开更多
关键词 α珠蛋白生成障碍性贫血 Β珠蛋白生成障碍性贫血 基因检测
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三亚市9743例女性HPV感染状况及亚型分布特征 被引量：4
4
作者 何吕芬 唐嘉敏 +3 位作者 李欢 李沙 朱雄 利振坤 《肿瘤预防与治疗》 2021年第6期520-526,共7页
目的:分析三亚市女性人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染状况及亚型分布特征,为预防HPV感染和宫颈癌提供依据。方法:收集2017年1月至2019年12月在三亚市人民医院进行HPV基因分型检测的女性患者标本9743例,采用PCR反向点杂交法... 目的:分析三亚市女性人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染状况及亚型分布特征,为预防HPV感染和宫颈癌提供依据。方法:收集2017年1月至2019年12月在三亚市人民医院进行HPV基因分型检测的女性患者标本9743例,采用PCR反向点杂交法共检测37种型别。结果:2017~2019年感染HPV患者2192例,总感染率为22.50%。不同年度受检女性HPV感染率差异有统计学意义(x^(2)=8.752,P=0.013),2017年感染率最高,高达24.79%。所有感染HPV的基因型中,低危型638例,高危型2084例,疑似高危型274例。HPV单一感染率16.90%,二重HPV感染率4.04%,多重HPV感染率1.52%。HPV高危型感染率前5位的分别是HPV52、58,16,51,39亚型,其感染占比分别是13.45%,10.41%,9.75%,7.18%,6.48%。患者年龄分析表明,感染率最高的是≥61岁年龄组(37.09%),其次是≤20岁年龄组(31.83%),各年龄组女性HPV感染率差异有统计学意义(x^(2)=98.762,P=0.001)。结论:三亚市2017~2019年度女性HPV感染率有差异,主要以单一感染,高危型别为主,且与年龄关系密切,20岁以下及61岁以上的女性感染率明显较高。应加强对年轻女性及61岁以上女性HPV感染的监测力度。本研究为三亚市宫颈癌的流行病学调查及防治提供参考依据,并为研发更多HPV基因型的疫苗提供数据支持。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 感染 基因型 宫颈癌
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HBV阿德福韦酯耐药位点基因突变检测方法的建立
5
作者 利振坤 何吕芬 +2 位作者 李欢 李沙 王身华 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第20期3041-3046,共6页
目的探究并评价Taqman锁核酸(Locked nucleic acid,LNA)探针实时荧光聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)在检测乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染患者阿德福韦酯(Adefovir dipivoxil,ADV)耐药位点基因突变中的应用... 目的探究并评价Taqman锁核酸(Locked nucleic acid,LNA)探针实时荧光聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)在检测乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染患者阿德福韦酯(Adefovir dipivoxil,ADV)耐药位点基因突变中的应用价值。方法通过基因测序筛选阳性样本,进而构建ADV重组质粒标准品、标准曲线等,以构建的重组质粒为标准品建立实时荧光定量PCR反应体系,评价其线性范围、扩增效率、灵敏度及重复性等指标。结果rtA181V、rtN236T位点野生型和突变型重组质粒被成功构建;Taqman-LNA荧光PCR检测的线性范围为1×10^9/μl^1×10^2/μl;rtA181V、rtN236T位点野生型及突变型质粒标准品的扩增效率均高于75;rtA181V位点可稳定准确检测到最低为0.04%的突变比例,rtN236T位点可稳定准确检测出最低为0.05%的突变比例,则Taqman-LNA荧光PCR检测rtA181V和rtN236T位点临床标本的灵敏度分别为0.04%和0.05%;rtA181V、rtN236T位点野生型及突变型质粒标准品在高、中浓度中的变异系数均<5%。结论Taqman-LNA荧光PCR检测法线性范围广、扩增效率高、灵敏度高、重复性好,是一种快速、简便、灵敏的基因突变检测方法,在检测HBV感染患者ADV耐药位点基因突变中具有较高的应用价值和临床意义。 展开更多
关键词 Taqman-LNA荧光PCR 乙型肝炎病毒感染 阿德福韦酯 基因突变
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不同靶基因检测新型冠状病毒结果分析
6
作者 符晓莹 李欢 +7 位作者 何吕芬 李沙 王立程 利振坤 黎元莉 陈少金 陈海 朱雄 《中国热带医学》 CAS 2020年第10期939-943,共5页
目的比较三种不同靶基因检测2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的检测结果,分析其一致性,初步评估各试剂的应用情况。方法收集43份本院患者和定点治疗医院送来的咽拭子标本,根据临床诊断分为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)组31份和对照组12份,... 目的比较三种不同靶基因检测2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的检测结果,分析其一致性,初步评估各试剂的应用情况。方法收集43份本院患者和定点治疗医院送来的咽拭子标本,根据临床诊断分为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)组31份和对照组12份,用三种SARS-CoV-2核酸检测试剂同时进行实时荧光逆转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)检测,检测结果的阳性率差异和一致性分别用Fisher精确概率检验和Kendall′s协调系数W检验。结果在COVID-19组中试剂B的阳性检出率最高为90.32%,且不存在需复检结果;试剂A和试剂C的阳性检出率分别为77.42%和74.19%,且试剂C出现的需复检结果较多;在对照组中试剂A和试剂C未检测出阳性,但试剂B出现一例阳性结果。COVID-19组中各试剂的阳性检出率差异不具有统计学意义(P>0.05);一致性方面差异具有统计学意义,渐进显著性Sig=0.00,Kendall′sW系数值为0.852,说明三种试剂检测结果的一致性程度很高。结论三种试剂对COVID-19核酸检测的结果一致性很好,灵敏度方面试剂B较有优势,特异性方面试剂A和试剂C较稳定。试剂B最适合疫情期间的严格排查,但应注意假阳性结果的出现;试剂A和试剂C针对假阴性和需复检结果需要提高检测样本的质量,且试剂C的结果判读方式在处理大批量阳性标本数据时体验欠佳。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 实时荧光逆转录聚合酶链式反应 核酸检测
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