通过SYBYL X 2.0软件包中Topomer CoMFA和Surflex-dock研究28种黄嘌呤结构的胞浆型磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶（cPEPCK）抑制剂的三维定量构效关系（3D-QSAR）和分子对接模式.所得优化的3D-QSAR模型q2和r^2分别为0.907和0.994（q^2〉0.5时...通过SYBYL X 2.0软件包中Topomer CoMFA和Surflex-dock研究28种黄嘌呤结构的胞浆型磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶（cPEPCK）抑制剂的三维定量构效关系（3D-QSAR）和分子对接模式.所得优化的3D-QSAR模型q2和r^2分别为0.907和0.994（q^2〉0.5时,建立的模型具有可靠的预测能力）,结果表明该模型具有较高预测能力.分子对接结果显示,此类分子与cPEPCK的Asn 533,Asn 292和Phe 530等活性功能残基具有氢键作用.Trp516可能是潜在的活性残基.基于以上研究讨论,为设计和开发具有较高活性的新型黄嘌呤类cPEPCK抑制剂提供有效信息.展开更多
计算机辅助药物设计(computer aided drug design CADD)是以计算机的数值计算、逻辑判断、图形处理和数据库技术与功能为载体,运用化学和生物信息学提供的信息资源,直接模建或间接虚拟靶点图像,根据分子匹配理论和计算化学方法,模拟和...计算机辅助药物设计(computer aided drug design CADD)是以计算机的数值计算、逻辑判断、图形处理和数据库技术与功能为载体,运用化学和生物信息学提供的信息资源,直接模建或间接虚拟靶点图像,根据分子匹配理论和计算化学方法,模拟和计算受体与配体的相互作用,并对药物研发的各个阶段进行辅助解释和预测,设计出有效的先导物,再对先导物进行优化与改造。计算机辅助药物设计既可用于先导物的衍生,也可以用于先导物的优化,是实现基于结构和基于性质的药物设计的技术手段。展开更多
文摘计算机辅助药物设计(computer aided drug design CADD)是以计算机的数值计算、逻辑判断、图形处理和数据库技术与功能为载体,运用化学和生物信息学提供的信息资源,直接模建或间接虚拟靶点图像,根据分子匹配理论和计算化学方法,模拟和计算受体与配体的相互作用,并对药物研发的各个阶段进行辅助解释和预测,设计出有效的先导物,再对先导物进行优化与改造。计算机辅助药物设计既可用于先导物的衍生,也可以用于先导物的优化,是实现基于结构和基于性质的药物设计的技术手段。
