20个物种同义密码子偏性的比较分析 被引量：35

1

作者 刘庆坡 冯英 董辉 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2004年第7期67-71,共5页

　对6种双子叶植物、4种单子叶植物、7种多细胞真核动物、2种单细胞真核生物及1种原核生物(大肠杆菌)的编码序列(CodingDNASequence,CDS)进行了比较研究。结果发现,各供试物种密码子的用法存在明显的位置依赖,编码区域不同区段对密码子... 　对6种双子叶植物、4种单子叶植物、7种多细胞真核动物、2种单细胞真核生物及1种原核生物(大肠杆菌)的编码序列(CodingDNASequence,CDS)进行了比较研究。结果发现,各供试物种密码子的用法存在明显的位置依赖,编码区域不同区段对密码子选择使用的程度差异很大,表明基因的同义密码子偏性与其编码区不同区域的碱基环境密切相关;基因组差异是造成密码子使用偏性的首要因素。对"翻译起始区"和"翻译终止区"的特征分析发现,大部分供试物种编码序列中的"翻译起始区"碱基偏置强烈,"翻译终止区"相对较弱,暗示"翻译起始区"的密码子使用对提高蛋白翻译的效率和精确性更为重要。不同物种中G+C含量对其同义密码子偏性的贡献率差异很大,但并非是影响同义密码子使用偏性的唯一因素。可以认为,基因编码区域密码子偏性的研究能为搜寻物种进化的分子机理提供线索。 展开更多

关键词 密码子使用偏性 位置依赖 G+C含量

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籼稻品种93-11同义密码子的使用偏性 被引量：36

2

作者 刘庆坡 谭军 薛庆中 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第4期335-340,共6页

利用籼稻品种 93 11的全基因组序列及相应的EST数据 ,对影响同义密码子用法的若干因子进行了详细分析。指出 93 11基因的表达水平 (mRNA丰度 )与 3个同义密码子偏性指标CAI、CPP和ENC相关极显著 (r =0 2 2 7 ,0 14 5 和 - 0 14 7 ... 利用籼稻品种 93 11的全基因组序列及相应的EST数据 ,对影响同义密码子用法的若干因子进行了详细分析。指出 93 11基因的表达水平 (mRNA丰度 )与 3个同义密码子偏性指标CAI、CPP和ENC相关极显著 (r =0 2 2 7 ,0 14 5 和 - 0 14 7 ) ,表明高表达的基因其同义密码子非随机使用的程度越大 ;基因长度与CAI和CPP极显著负相关 (r=- 0 4 13 和 - 0 4 80 ) ,与ENC极显著正相关 (r=0 2 10 ) ,暗示较短的基因具有更高的转录活性 ;编码区G +C含量对其同义密码子偏性的贡献率远高于mRNA丰度和基因长度 ,G +C含量与CAI、CPP和ENC相关系数分别高达 0 877 ,0 832 和 - 0 74 0 ;起始编码区内A、T、C、G 4种碱基呈明显的 3周期振荡 ,尤以ATG下游第一个密码子所在的 3个位点 (+4、+5和 +6 )偏置最强烈 ,由此认为在这 3个特殊位点有较高的自然选择压存在 ;93 11中 2 5个最优密码子的首次确定将对水稻转基因具有指导意义。 展开更多

关键词 水稻 同义密码子使用偏性 基因表达水平 基因长度 编码区G+C含量 起始编码区 最优密码子

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粳稻叶绿体基因组的密码子用法 被引量：32

3

作者 刘庆坡 薛庆中 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1220-1224,共5页

基因组密码子使用受多种因素的影响 ,本试验通过对应分析探讨了若干重要因子对粳稻品种“日本晴”叶绿体全基因组序列密码子用法的效应。结果指出 ,在影响最大的第一条向量轴上 ,基因的位置坐标与该基因的表达水平(CAI)和GC3s极显著相关... 基因组密码子使用受多种因素的影响 ,本试验通过对应分析探讨了若干重要因子对粳稻品种“日本晴”叶绿体全基因组序列密码子用法的效应。结果指出 ,在影响最大的第一条向量轴上 ,基因的位置坐标与该基因的表达水平(CAI)和GC3s极显著相关 (r =0 785 和 - 0 80 4 ) ,而CAI与GC3s高度负相关 (r =- 0 917 ) ;说明基因表达水平的高低是影响密码子使用的主要因素 ,并且高表达的基因强烈偏好使用以T或A结尾的密码子。基因编码区碱基组成的影响力远不及基因的表达水平 ,G +C含量与ENC、CAI以及第一条向量轴上基因位置坐标的相关系数分别为0 344 、- 0 4 2 2 和 - 0 4 2 1 ;相关性测验和方差分析均表明基因长度对密码子的使用影响不大 ,估计与那些编码未知功能的ORFs的存在有关 ;复制转录对密码子的使用没有明显的选择。将高表达优越密码子分析法和高频密码子分析法相结合 ,确定了TGT和GAA等 12个密码子为叶绿体基因组的主要偏爱密码子。 展开更多

关键词 水稻 叶绿体基因组 密码子使用 对应分析 基因表达水平 G+C含量

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水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶基因的电子克隆 被引量：12

4

作者 刘庆坡 冯英 董辉 《生物信息学》 2005年第1期5-9,共5页

采用基于EST的电子克隆方法得到了一段长 16 11bp的cDNA序列 ,以此为信息探针搜索HTGs数据库 ,找到一个与之高度匹配的基因组DNA序列———OSJNBa0 0 5 7G0 7克隆。用FGENESH分析该克隆中的联配区域得到一个包含 14个外显子和 13个内含... 采用基于EST的电子克隆方法得到了一段长 16 11bp的cDNA序列 ,以此为信息探针搜索HTGs数据库 ,找到一个与之高度匹配的基因组DNA序列———OSJNBa0 0 5 7G0 7克隆。用FGENESH分析该克隆中的联配区域得到一个包含 14个外显子和 13个内含子的基因。该基因位于水稻第 3染色体物理图谱的 136 .0～ 137.6cM区域。推导的ORF编码 4 98个氨基酸 ,经BLASTP搜索SWISS -PROT数据库和蛋白序列的亚细胞定位显示 ,该基因编码水稻的线粒体丝氨酸羟甲基转移酶 (mSHMT)。该基因受到EST序列的完全支持 ,其中不乏来自盐胁迫、稻瘟病菌侵染等逆境处理的EST序列 ,推测该基因与水稻对逆境的应答反应有关。 展开更多

关键词 水稻 线粒体 丝氨酸羟甲基转移酶 基因克隆 电子克隆 EST 逆境

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水稻与拟南芥PHDfinger蛋白的系统分析 被引量：11

5

作者 冯英 刘庆坡 薛庆中 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第11期1284-1293,共10页

PHD finger (planthomeodomainfinger)是具Cys4 His Cys3 特征结构的锌指蛋白结构域 ,它广泛存在于植物或动物转录调节蛋白中。此类蛋白在植物或动物蛋白质组中具有多个功能各异的家族成员 ,并在发育中扮演重要的角色。鉴定了水稻 4 4... PHD finger (planthomeodomainfinger)是具Cys4 His Cys3 特征结构的锌指蛋白结构域 ,它广泛存在于植物或动物转录调节蛋白中。此类蛋白在植物或动物蛋白质组中具有多个功能各异的家族成员 ,并在发育中扮演重要的角色。鉴定了水稻 4 4个推定的非冗余PHD finger蛋白 ,并与拟南芥蛋白质组中 4 5个该家族成员进行了比较 ;所构建的 2棵进化树涵盖了这 89个蛋白质 ,暗示水稻、拟南芥与人的PHD 展开更多

关键词 PHD-finger 锌指蛋白 基因家族 水稻 拟南芥

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遗传密码子及其应用 被引量：13

6

作者 刘庆坡 薛庆中 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期851-855,共5页

作为生命信息的基本遗传单位,基因组遗传密码的破译对于人们加深对生命本质的认识具有重要的理论价值和现实意义.目前,遗传密码子的研究重心已由遗传密码子的破译及反常密码子的发现转入到遗传密码子的起源与进化及扩张等研究.遗传密码... 作为生命信息的基本遗传单位,基因组遗传密码的破译对于人们加深对生命本质的认识具有重要的理论价值和现实意义.目前,遗传密码子的研究重心已由遗传密码子的破译及反常密码子的发现转入到遗传密码子的起源与进化及扩张等研究.遗传密码子的起源与进化是当今基因组学研究的热点命题之一,相关的学说、假设层出不穷,但尚未取得实质性突破.另一方面,无义密码子的再定义及遗传密码的扩张等研究却极大的丰富和发展了遗传密码子的科学内涵,推动了生命科学研究的发展.文章综述了遗传密码子的多态性、起源与进化、无义密码子的再定义及遗传密码的扩张等方面的研究进展,并就其应用价值作了评述,期待为其在基因组学、医学等相关领域的应用研究提供参考. 展开更多

关键词 遗传密码 起源 进化 扩张

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拟南芥丝氨酸羧肽酶类蛋白家族的基因组学分析 被引量：12

7

作者 冯英 刘庆坡 +1 位作者 贾佳 薛庆中 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第8期864-873,共10页

基于隐马可夫模型,利用已知丝氨酸羧肽酶(SerineCarboxypeptidases,SCP)氨基酸序列作为训练集,搜索拟南芥全蛋白质组数据库,鉴定了54个推定的SCPL(丝氨酸羧肽酶类,SerineCarboxypeptidaseLike)基因,详细分析了各基因的结构特征、染色体... 基于隐马可夫模型,利用已知丝氨酸羧肽酶(SerineCarboxypeptidases,SCP)氨基酸序列作为训练集,搜索拟南芥全蛋白质组数据库,鉴定了54个推定的SCPL(丝氨酸羧肽酶类,SerineCarboxypeptidaseLike)基因,详细分析了各基因的结构特征、染色体定位与编码的蛋白质序列,发现7个可能最近发生复制事件的基因簇聚区,并且其SCPL基因广泛存在交替剪接方式。系统进化分析表明,88.9%基因编码的蛋白质属于双链羧肽酶Ⅰ或Ⅱ亚族,仅11.1%蛋白质属于单链羧肽酶Ⅲ亚族,暗示SCP蛋白不仅具有独特拓扑结构的催化中心与高度保守的“α/β水解酶折叠”三级结构,其DNA或蛋白质序列特征也可以作为系统进化研究依据。 展开更多

关键词 丝氨酸羧肽酶 基因家族 拟南芥 系统发生 进化

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不同彩色稻品种(系)农艺性状和品质性状的比较分析 被引量：10

8

作者 谢玲娟 陈昊钦 +3 位作者 袁自成 戴玲君 刘欣星 刘庆坡 《河南农业科学》 北大核心 2019年第6期36-45,共10页

以15个彩色稻品种(系)为试材,对其株高、穗数、穗粒数、结实率、千粒质量、糙米率、精米率、胶稠度以及直链淀粉、可溶性蛋白、维生素C、花青素含量等性状进行比较分析,以期筛选出综合性状比较优良的彩色稻材料。结果表明,参试彩色稻的... 以15个彩色稻品种(系)为试材,对其株高、穗数、穗粒数、结实率、千粒质量、糙米率、精米率、胶稠度以及直链淀粉、可溶性蛋白、维生素C、花青素含量等性状进行比较分析,以期筛选出综合性状比较优良的彩色稻材料。结果表明,参试彩色稻的株高介于92.3~150.0cm,其中,浙大紫的株高最高,翠玉最矮;穗长介于14.0~30.6cm,紫香521最长;穗粒数和穗数分别为48.33~178.64粒和5.0~14.6穗,分别以紫香521和绿香米最多;结实率介于45.35%~84.18%,紫香521最高;千粒质量介于15.59~28.01g,紫红色最高;糙米率和精米率分别为74.02%~83.05%和62.42%~78.60%,黄香米的糙米率和精米率均比较高;垩白度介于0.30%~55.80%,浙大黄的垩白度最小,紫红色最大;碱消值介于2.2~4.8,浙大银最大;胶稠度为72.87~174.93mm,秦稻2号最大;直链淀粉含量为14.61%~25.73%,其中,翠玉的最高,而黄香米最低;可溶性蛋白含量介于1.43%~1.81%,绿香米最高;维生素C含量介于0.054~0.125mg/kg,浙大黄最高;花青素含量介于0.030~0.258mg/g,浙大紫糯最高。利用线性比例变换法对农艺性状和品质性状指标数据进行标准化处理,然后利用加权分析得出不同彩色稻品种(系)的综合排名:浙大紫糯>紫香521>浙大黄>秦稻2号>浙大紫>翠玉>紫金稻>洋黑3号>红香米>紫金黄叶>浙大粉彩禾>绿香米>黄香米>浙大银>紫红色。 展开更多

关键词 彩色稻 农艺性状 品质性状 可溶性蛋白 维生素C 花青素

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小型农田水利工程建设与管理中存在问题及优化措施 被引量：9

9

作者 刘庆坡 《中国新技术新产品》 2017年第17期100-101,共2页

对小型农田水利工程建设与管理的研究,要抓住现存的问题,采取有效措施,对小型水利设施建设的重要性要充分认识,实施科学的管理;探索投资筹资的新途径;广泛推广节水灌溉新技术;切实提高农田水利的灌溉效益;提高管理人员素质,加强基层水... 对小型农田水利工程建设与管理的研究,要抓住现存的问题,采取有效措施,对小型水利设施建设的重要性要充分认识,实施科学的管理;探索投资筹资的新途径;广泛推广节水灌溉新技术;切实提高农田水利的灌溉效益;提高管理人员素质,加强基层水利工程管理;做好农田水利工程的维护和保养。 展开更多

关键词 农田水利 工程建设 存在问题 解决措施

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水稻基因组测序及基因功能的鉴定(英文) 被引量：7

10

作者 刘庆坡 薛庆中 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第8期669-677,共9页

水稻是重要的粮食作物。作为单子叶模式植物,水稻基因组的大规模测序具有巨大的理论价值和现实意义。目前已获得了籼稻“93-11”和粳稻“日本晴”高质量的基因组数据,这为在基因组水平上深入研究其生长、发育、抗病和高产等的遗传机理... 水稻是重要的粮食作物。作为单子叶模式植物,水稻基因组的大规模测序具有巨大的理论价值和现实意义。目前已获得了籼稻“93-11”和粳稻“日本晴”高质量的基因组数据,这为在基因组水平上深入研究其生长、发育、抗病和高产等的遗传机理提供了便利,从而为进一步解决世界粮食危机提供了新的突破口和契机。随着水稻基因组计划的顺利结束,其研究重心也已由建立高分辨率的遗传、物理和转录图谱为主的结构基因组学转向基因功能的研究。结构基因组学研究获得的大量序列数据为揭示和开发功能基因开辟了广阔的前景。目前,利用图位克隆和电子克隆等方法已成功分离了多个水稻抗病、抗虫、抗逆境、抗倒伏、高产、优质等重要农艺性状相关的基因,对培育水稻新品种,促进农业的可持续发展意义重大。据估计,水稻至少拥有3.7万个非转座因子相关的蛋白编码基因。因此,完成全基因组序列测定后,重要基因功能的鉴定已成为当前基因组学研究的主要目标。反向遗传学、大规模基因功能表达谱分析和蛋白质组研究等策略已在研究水稻重要基因的功能方面发挥了重要作用。文章综述了水稻基因组测序及基因功能研究的现状,并就新基因发掘和基因功能注释的方法作了评述,期待为水稻遗传工程和育种实践提供参考。 展开更多

关键词 水稻 基因组 测序 功能基因组学

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治理现代化视域下地方农林高校研究生教育质量提升路径探析 被引量：2

11

作者 刘庆坡 《高教学刊》 2023年第10期44-47,共4页

研究生教育是国家高等教育质量水平的重要体现,需要政府、高校、社会和师生等多元主体共同、合作治理。近年来,我国研究生教育规模取得长足发展,但仍然存在教育质量保障机制不健全、治理的原始创新能力不足等问题。对标研究生教育治理... 研究生教育是国家高等教育质量水平的重要体现,需要政府、高校、社会和师生等多元主体共同、合作治理。近年来,我国研究生教育规模取得长足发展,但仍然存在教育质量保障机制不健全、治理的原始创新能力不足等问题。对标研究生教育治理现代化新要求,结合浙江农林大学的创新性实践,论述提升研究生教育质量的路径、举措,为涉农高校研究生教育提供参考。 展开更多

关键词 研究生教育 治理现代化 质量提升 路径探讨 地方农林高校

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“一体化、两协同、四融合”新农科复合应用型人才培养体系的构建与实践——以浙江农林大学为例

12

作者 刘庆坡 邱飞 《中国农业教育》 2024年第2期14-20,60,共8页

乡村振兴战略背景下,培养新农科复合应用型人才,是适应时代变革趋势、深化新农科建设和打破人才培养藩篱的迫切需要。针对当前存在的教学资源整合创新力不够、人才培养和社会需求离散度高、专业人才内涵发展力不强等现实问题,浙江农林... 乡村振兴战略背景下,培养新农科复合应用型人才,是适应时代变革趋势、深化新农科建设和打破人才培养藩篱的迫切需要。针对当前存在的教学资源整合创新力不够、人才培养和社会需求离散度高、专业人才内涵发展力不强等现实问题,浙江农林大学探索构建了“一体化、两协同、四融合”新农科复合应用型人才培养体系,通过推动学科专业一体化发展,激活校地、校企联合办学活力,深化跨学科专业交叉融合、专业教育与双创教育融合、教学与科研相长融合、专业教育与课程思政、劳动教育融合发展等,打造知农爱农复合应用型卓越农科新才,为新时代农林人才培养改革提供参考。 展开更多

关键词 新农科 复合应用型 培养体系

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表油菜素内酯在缓解水稻砷毒害中的作用 被引量：5

13

作者 练旺民 徐薇 +5 位作者 孟卓玲 陶之欢 金珂 郑晶 张佳艺 刘庆坡 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期1267-1275,共9页

以砷耐受性中等的籼稻品种93-11为材料,通过营养液水培,生理指标测定和基因表达分析等方法,研究了表油菜素内酯在缓解水稻亚砷酸盐毒害中的作用。结果表明,外施表油菜素内酯能有效促进受砷毒害水稻幼苗的生长,降低水稻根系的砷积累量,... 以砷耐受性中等的籼稻品种93-11为材料,通过营养液水培,生理指标测定和基因表达分析等方法,研究了表油菜素内酯在缓解水稻亚砷酸盐毒害中的作用。结果表明,外施表油菜素内酯能有效促进受砷毒害水稻幼苗的生长,降低水稻根系的砷积累量,减少砷胁迫对根系细胞膜透性的影响,降低脯氨酸和非蛋白巯基化合物含量以及叶片中H_2O_2和O_2^(·-)等活性氧自由基的含量。通过定量表达分析发现,外施表油菜素内酯可降低水稻根系中亚砷酸盐和砷酸盐吸收相关基因的表达,但显著提高了砷酸还原酶基因的表达。说明外施表油菜素内酯可在一定程度上缓解砷对水稻的毒害作用。 展开更多

关键词 水稻 砷 表油菜素内酯 基因表达

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水稻花粉育性相关基因研究进展 被引量：4

14

作者 马龙 徐薇 +6 位作者 窦玲玲 柯笑楠 刘明月 耿艳飞 黄霞 贾玉芳 刘庆坡 《江苏农业科学》 2019年第10期42-47,共6页

花粉发育为水稻生殖发育不可或缺的过程之一,其育性高低对水稻育种以及经济产量具有重要意义。大量研究发现,水稻花粉发育是严格受基因表达调控的生物学过程。基于此,本文综述与水稻花粉育性相关的蛋白编码基因和调控性miRNA的研究现状... 花粉发育为水稻生殖发育不可或缺的过程之一,其育性高低对水稻育种以及经济产量具有重要意义。大量研究发现,水稻花粉发育是严格受基因表达调控的生物学过程。基于此,本文综述与水稻花粉育性相关的蛋白编码基因和调控性miRNA的研究现状,总结有关基因在调控水稻花粉育性方面的生物学功能及作用机制,并对该领域未来的发展趋势作出分析与展望,从而为水稻分子设计育种提供理论参考。 展开更多

关键词 水稻 花粉发育 生殖发育 相关基因 MIRNA 育种利用

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人类基因组计划及其伦理学问题 被引量：1

15

作者 刘庆坡 薛庆中 《中国科学基金》 CSCD 北大核心 2002年第3期165-168,共4页

本文概述了国际HGP和中国HGP的研究现状,并讨论了由此带来的ELSI问题。

关键词 人类基因组计划 伦理学 研究现状 ELSI 社会问题 法律问题 基因犯罪

原文传递

基于“一流专业”建设提升人才培养能力——以浙江农林大学农学专业为例 被引量：3

16

作者 刘庆坡 《高教学刊》 2020年第11期121-124,共4页

一流本科教育的重要标志是培养出一流人才。一流专业是培养一流人才的基本单元。提高一流专业的人才培养能力不仅需要一流的教师队伍、一流的教学活动、先进的育人理念、人才培养模式和专业文化等,更需要学生的全程深度参与。论述了一... 一流本科教育的重要标志是培养出一流人才。一流专业是培养一流人才的基本单元。提高一流专业的人才培养能力不仅需要一流的教师队伍、一流的教学活动、先进的育人理念、人才培养模式和专业文化等,更需要学生的全程深度参与。论述了一流专业建设的基本内涵及其在人才培养中的重要性,对标一流专业建设要求分析了浙江农林大学农学专业的发展现状、存在问题及发展思考,为涉农高校创建一流专业教育提供一定参考。 展开更多

关键词 一流专业 人才培养 实践路径 本科教育 农学专业

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小RNA调节植物免疫应答反应研究进展 被引量：2

17

作者 张子杰 肖文斐 +4 位作者 裘劼人 忻雅 刘庆坡 柴伟国 阮松林 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期539-548,共10页

植物小RNA不仅参与调控植物生长发育,而且在调节植物免疫应答方面具有重要作用。根据其起源和前体结构的不同,可以分为微小RNA(mi RNA)、小干扰RNA(si RNA)等,其在植物体内合成方式与作用机制方面存在差异。病原物侵染会引起内源性小RN... 植物小RNA不仅参与调控植物生长发育,而且在调节植物免疫应答方面具有重要作用。根据其起源和前体结构的不同,可以分为微小RNA(mi RNA)、小干扰RNA(si RNA)等,其在植物体内合成方式与作用机制方面存在差异。病原物侵染会引起内源性小RNA或病原物来源的小RNA表达变化,进而引发植物免疫应答反应并激活相应的RNA干扰路径。本文重点介绍了小RNA类型以及合成方式,植物对病原物的免疫应答过程中的小RNA和RNA干扰途径,以及RNA干扰技术在植物抗病虫害过程中的应用等方面,同时对在植物免疫应答中的小RNA和RNA干扰作用机制进行展望。 展开更多

关键词 植物小RNA RNA干扰 免疫应答 病原物侵染

原文传递

起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响 被引量：1

18

作者 刘庆坡 谭军 薛庆中 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期625-629,共5页

对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20～+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平。结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、... 对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20～+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平。结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、8个(-19、-18、-14、-9、-6、-4、-1和+5)和7个(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6),其中只有-4和+5位点与CAI和CPP的值正相关,表明上述位点在转录水平上处于有利进化的自然选择压。对高表达的变应原蛋白基因7个特殊位点(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6)的碱基作定点突变分子模拟,其表达量分别降低63.3%和72.5%,显示了这些位点对基因表达的重要性。AUG侧翼序列适应指数(AUGCAI)与侧翼区的G+C含量呈高度正相关(r=0.625),表明在AUG侧翼富集G+C对翻译起始更有效。紧邻起译密码子AUG侧翼序列8个位点(-6～-1和+4～+6,除-4外)对G或C强烈偏好,暗示这是调节翻译起始效率以及同义密码子偏性的重要因素之一,尤其是在高表达基因中。 展开更多

关键词 水稻 起译密码子 AUG侧翼序列 基因表达 同义密码子偏性 定点突变模拟

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地方农林院校“生物化学”课程教学改革与实践初探 被引量：1

19

作者 赵光武 刘庆坡 +3 位作者 臧运祥 何勇 李南羿 杨静 《教育教学论坛》 2017年第21期144-146,共3页

本文分析了浙江农林大学农林类专业基础课"生物化学"教学中存在的主要问题,从课程制度、教学内容、教学方法、课程考核等方面进行改革,提高了学生学习的主动性和实践动手能力,教学效果初见成效。

关键词 生物化学 教学改革 实践

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一个水稻铜锌SOD酶基因在应答亚砷酸盐胁迫中的作用 被引量：1

20

作者 窦玲玲 胡海超 +6 位作者 马龙 柯笑楠 刘明月 练旺民 金珂 谢玲娟 刘庆坡 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期437-444,共8页

【目的】水稻Os08g44770.1基因编码一个铜锌SOD酶,但其在响应亚砷酸盐[As(Ⅲ)]胁迫中的生物学功能未知。本研究旨在深入揭示由该基因调控水稻砷耐性改变的分子机理并为水稻抗逆育种提供理论参考。【方法】以野生型日本晴(WT)和2个Os08g4... 【目的】水稻Os08g44770.1基因编码一个铜锌SOD酶,但其在响应亚砷酸盐[As(Ⅲ)]胁迫中的生物学功能未知。本研究旨在深入揭示由该基因调控水稻砷耐性改变的分子机理并为水稻抗逆育种提供理论参考。【方法】以野生型日本晴(WT)和2个Os08g44770.1过表达转基因株系为试材,通过胁迫处理、生理指标测定和基因表达分析等,系统探究了转基因植株对As(Ⅲ)的耐受性表现,并初步揭示了其调控水稻砷耐性的生理和分子机理。【结果】与WT相比,过表达转基因株系对As(Ⅲ)更加敏感;转基因植株在砷胁迫下的根系相对伸长量、生物量(干质量)、叶绿素含量、根系细胞质膜完整性、叶片抗氧化程度等均显著低于WT;Os08g44770.1在砷处理后的WT和转基因植株叶片中的表达模式略有不同,但均表现为处理24 h时被显著诱导表达。【结论】过度表达Os08g44770.1基因可导致水稻的砷耐受性极显著下降。 展开更多

关键词 水稻 铜锌SOD 亚砷酸盐 转基因 生理机理 基因表达

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