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基于转录组和蛋白组数据联合分析浅光休眠烟草种子暗萌发的分子网络
1
作者 刘一灵 刘奇源 +3 位作者 董帅 张民 罗燕 李振华 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期237-243,共7页
【目的】旨在挖掘浅光休眠烟草Nicotiana tabacum种子在黑暗下的调控基因和分子网络。【方法】以浅光休眠烟草Y85种子为实验材料,通过整合转录组和蛋白组数据,挖掘其暗萌发的分子网络。【结果】胚根突出前后蛋白和(或)mRNA表达差异存在... 【目的】旨在挖掘浅光休眠烟草Nicotiana tabacum种子在黑暗下的调控基因和分子网络。【方法】以浅光休眠烟草Y85种子为实验材料,通过整合转录组和蛋白组数据,挖掘其暗萌发的分子网络。【结果】胚根突出前后蛋白和(或)mRNA表达差异存在5种差异类型,其中共同上调表达的蛋白(基因)有BoGH3B、MAN1、ERD3、MLP31、FAP1等,共同下调表达的蛋白(基因)有NEC1、MFT、ECP63、SOP1、LE25、SBP65等。上述差异蛋白(基因)富集的信号通路包括果糖和甘露糖代谢、甘露聚糖分解、内甘露聚糖-1,4-β-甘露糖苷酶活性;而发生功能的细胞成分包括线粒体、膜组成部分和叶绿体。【结论】通过整合转录组和蛋白组数据初步构建了浅光休眠烟草Y85种子的暗萌发调控网络。 展开更多
关键词 烟草 光休眠种子 暗萌发 转录组 蛋白组 联合分析
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基于表型组和转录组数据研究光对烟草早期幼苗发育的影响
2
作者 曹廷茂 罗贞宝 +5 位作者 刘奇源 张民 刘一灵 刘仁祥 李德仑 李振华 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2023年第5期45-54,共10页
为深入解析光对烟草早期幼苗发育的调控机理,以烤烟品种CV87为试材,设置12 h光周期和持续黑暗2个处理,采用表型组学研究了烟草种子培育第1~9天的形态变化,在此基础上采用转录组学研究了其发育第4天基因表达网络差异。结果表明,光下种子... 为深入解析光对烟草早期幼苗发育的调控机理,以烤烟品种CV87为试材,设置12 h光周期和持续黑暗2个处理,采用表型组学研究了烟草种子培育第1~9天的形态变化,在此基础上采用转录组学研究了其发育第4天基因表达网络差异。结果表明,光下种子发芽势和发芽率提高约30%,子叶开口长增加约2 cm,而下胚轴长度缩短约2 cm。在早期幼苗发育阶段有551个基因差异表达受光诱导,其中364个表达上调,187个表达下调。551个基因中有28个在蛋白水平存在互作关系,其中包括AMT1-3、PSAK、LHCB5等15个上调表达基因和OLEO1、LEA7和PDF2.3等13个下调表达基因。GO富集表明,这28个DEGs主要与光合作用、光系统、植物激素响应有关。综上所述,本研究解析了烟草早期幼苗发育过程中响应光信号的表型变化,并通过转录组分析挖掘到一些调控表型差异相关基因,这些结果为进一步研究光环境对烟草萌发和早期幼苗发育的影响提供了参考。 展开更多
关键词 种子萌发 早期幼苗发育 光信号 表型组 转录组 烟草
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引发回干处理和贮藏条件对酒用高粱种子萌发的影响 被引量：1
3
作者 董帅 陈丽娜 +3 位作者 张民 刘奇源 伍雨 李星月 《北方农业学报》 2022年第2期127-134,共8页
【目的】提升酒用高粱种子活力,解决制约贵州省酒用高粱种植及产业发展的瓶颈。【方法】以酒用高粱品种红缨子作为供试材料,以聚乙二醇(PEG)为引发剂,分析引发时间(12、24、36、48 h),回干程度(7%、10%、15%),贮藏时间(0、30、60、90 d... 【目的】提升酒用高粱种子活力,解决制约贵州省酒用高粱种植及产业发展的瓶颈。【方法】以酒用高粱品种红缨子作为供试材料,以聚乙二醇(PEG)为引发剂,分析引发时间(12、24、36、48 h),回干程度(7%、10%、15%),贮藏时间(0、30、60、90 d)及贮藏温度(25℃恒温和自然变温)处理下酒用高粱种子的萌发力。【结果】引发时间、回干程度和贮藏时间中任一因素均显著影响种子的萌发率(P<0.05),且引发时间×回干程度、引发时间×贮藏温度、引发时间×回干程度×贮藏温度存在互作。酒用高粱种子引发12 h回干程度7%、引发24 h回干程度10%、引发48 h回干程度7%较其他处理种子萌发率显著提高(P<0.05);在25℃恒温和自然变温条件下引发12 h回干程度7%、引发36 h回干程度15%处理的萌发整齐度较高。【结论】引发12 h回干程度7%、引发36 h回干程度15%为酒用高粱种子适宜的萌发条件;25℃恒温和自然变温条件下酒用高粱种子均较耐贮藏。 展开更多
关键词 酒用高粱 种子引发 种子回干 种子贮藏 聚乙二醇
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丸化种子成长史
4
作者 刘奇源 《生命世界》 2022年第5期10-15,共6页
如今,咱们在市面上发现了五颜六色的神秘种子有各种作物、各种品种原本熟悉的玉米粒突然变成了红色的,绿色的而且,有农民反映买到的生菜种子居然变成了六味地黄丸!笔珠一样小的种子比之前整整大了5倍甚至还带着黄色的光泽!难道我们是买... 如今,咱们在市面上发现了五颜六色的神秘种子有各种作物、各种品种原本熟悉的玉米粒突然变成了红色的,绿色的而且,有农民反映买到的生菜种子居然变成了六味地黄丸!笔珠一样小的种子比之前整整大了5倍甚至还带着黄色的光泽!难道我们是买到了假的种子吗? 展开更多
关键词 六味地黄丸 成长史 玉米粒 种子
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