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韭菜根际真菌和内生真菌种群多样性分析 被引量:5
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作者 付静 +1 位作者 梅眉 黄永红 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2018年第A01期246-252,共7页
在前期研究发现,韭菜处理可以减轻香蕉枯萎病和根结线虫病害的发生,推测韭菜中含有能抑制病原菌及致死根结线虫的生防菌。对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌的种群结构及多样性进行比较分析,以期为分离鉴定韭菜中抑菌和杀根结线虫... 在前期研究发现,韭菜处理可以减轻香蕉枯萎病和根结线虫病害的发生,推测韭菜中含有能抑制病原菌及致死根结线虫的生防菌。对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌的种群结构及多样性进行比较分析,以期为分离鉴定韭菜中抑菌和杀根结线虫的生防真菌提供理论依据。通过Illumina平台对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌样品中的18S rRNA序列进行测序,并进行生物信息学分析。结果表明:从韭菜根际土壤、根系、叶片中获得348 484高质量序列和123个操作分类单元(OTU)。根际真菌的Chao、ACE、Shannon指数显著高于内生真菌(叶片和根系),而Simpson指数则显著小于内生真菌。根际真菌群落主要由子囊菌门(Ascomycota)(67. 20%)和担子菌门(Basidiomycota)(24.44%) 2个菌门组成;而内生真菌主要由子囊菌门组成,在叶片和根系中含量分别为91. 39%和96. 60%。在检测到的5个菌门中,内生真菌中子囊菌门显著高于根际土壤,其他菌门则显著低于根际土壤。叶片和根系中内生真菌稍有不同,但是差异并不显著。该研究表明,韭菜根际真菌和内生真菌的种群结构存在显著差异,根际真菌的多样性及丰富性显著高于内生真菌。该研究为分离鉴定韭菜中抑制植物病原菌及致死根结线虫的生防真菌提供参考。 展开更多
关键词 韭菜 真菌多样性 Illumina测序 内生菌 根际土壤
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两类抗生素药剂对‘纽荷尔’脐橙黄龙病菌的抑制作用及根际细菌群落结构的影响 被引量:4
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作者 黄洋 关巍 +6 位作者 王铁霖 晏建红 田二渊 杨玉文 赵廷昌 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期83-92,共10页
为探究磺胺二甲氧嘧啶钠盐(sulfadimethoxine sodium salt,SDM)和氨苄青霉素(ampicillin,AMP)对柑橘黄龙病(citrus Huanglongbing,HLB)的防效以及对柑橘根际细菌群落结构的影响,本试验以‘纽荷尔’脐橙为研究对象,采用0.5 g/L SDM和1 g/... 为探究磺胺二甲氧嘧啶钠盐(sulfadimethoxine sodium salt,SDM)和氨苄青霉素(ampicillin,AMP)对柑橘黄龙病(citrus Huanglongbing,HLB)的防效以及对柑橘根际细菌群落结构的影响,本试验以‘纽荷尔’脐橙为研究对象,采用0.5 g/L SDM和1 g/L AMP进行灌根,使用Taq Man qPCR技术监测病树叶内黄龙病菌菌量的动态变化,并利用宏基因组技术分析根际细菌群落结构的变化。结果显示,AMP连续处理后病树叶片内黄龙病菌菌含量在一定程度上受到抑制,初步判断AMP对黄龙病有一定的抑制效果,SDM处理对黄龙病菌菌含量抑制效果较差;2类抗生素处理组中根际主要优势类群结构和相对丰度在门、属分类水平上均发生改变,解磷细菌中慢生根瘤菌属Bradyrhizobium细菌的相对丰度在处理后有明显变化,pstA、pstC等部分磷循环功能基因相对丰度发生改变,表明2类抗生素药剂均影响了‘纽荷尔’脐橙病树根际细菌群落结构。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病 根际细菌 宏基因组 抗生素 抑制作用
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西瓜噬酸菌调控因子aryR的基因功能分析 被引量:2
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作者 田二渊 关巍 +5 位作者 王铁霖 黄洋 杨玉文 赵廷昌 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2020年第2期8-16,共9页
瓜类细菌性果斑病是危害葫芦科作物的世界性病害,其病原菌为西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli)。以西瓜噬酸菌野生型菌株Aac-5为研究对象,构建了转录调控因子aryR的全基因缺失突变株,并构建了互补菌株。测定了野生型、突变株和互补菌株... 瓜类细菌性果斑病是危害葫芦科作物的世界性病害,其病原菌为西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli)。以西瓜噬酸菌野生型菌株Aac-5为研究对象,构建了转录调控因子aryR的全基因缺失突变株,并构建了互补菌株。测定了野生型、突变株和互补菌株的致病性、致敏性、生物膜形成能力和运动能力等生物学特性。同时,使用qRT-PCR定量检测了鞭毛基因fliR和fliC以及III型分泌系统功能基因hrpE和hrcN的表达水平。结果显示,aryR的缺失降低了Aac-5对西瓜的致病力和运动能力,增强了生物膜形成能力,对非寄主烟草仍具有致敏性。hrpE、hrcN、fliR、fliC基因在突变株中的表达量下调,表明aryR对hrpE、hrcN、fliR、fliC基因均为正调控。综上所述,基因aryR在Aac-5致病过程、运动能力和其他表型中起着重要的调控作用。 展开更多
关键词 西瓜噬酸菌 转录调控因子 aryR 致病性 运动能力
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西瓜噬酸菌铜代谢相关基因copZ功能分析 被引量:1
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作者 关巍 +4 位作者 王铁霖 李展鸿 杨玉文 慧芹 赵廷昌 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期377-387,共11页
瓜类细菌性果斑病(Bacterial fruit blotch,BFB)病原菌为西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli,Ac),主要为害西瓜、甜瓜等葫芦科作物,是瓜类生产上主要细菌性病害。目前生产上对该病害的防治手段主要以化学防治为主,其中铜制剂的防治效果较... 瓜类细菌性果斑病(Bacterial fruit blotch,BFB)病原菌为西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli,Ac),主要为害西瓜、甜瓜等葫芦科作物,是瓜类生产上主要细菌性病害。目前生产上对该病害的防治手段主要以化学防治为主,其中铜制剂的防治效果较为显著。本研究以西瓜噬酸菌野生型菌株Aac-5中铜代谢相关基因copZ为对象,探究copZ基因缺失对西瓜噬酸菌抗铜性、生长能力等表型的影响;采用RT-qPCR技术测定在不添加和添加外源铜离子条件下,基因copZ缺失后对其他铜代谢相关基因表达量的影响。成功构建了西瓜噬酸菌copZ基因缺失突变菌株ΔcopZ和互补菌株ΔcopZ-comp。结果表明,野生型菌株Aac-5与ΔcopZ-comp菌株在添加1.25 mmol·L^(-1)CuSO_(4)的生长能力与不添加CuSO_(4)相似,而ΔcopZ菌株的生长能力减弱;当添加CuSO_(4)至2.50 mmol·L^(-1)时,野生型菌株Aac-5、ΔcopZ菌株和ΔcopZ-comp菌株的生长能力均减弱。基因copZ缺失在不含铜和含铜条件下均能使西瓜噬酸菌生物膜形成能力减弱;在不含铜条件下基因copZ不影响西瓜噬酸菌的运动能力,在含有1.25 mmol·L^(-1)CuSO_(4)的运动性培养基中各菌株运动能力丧失。ΔcopZ菌株在西瓜子叶内的生长能力相较于野生型菌株Aac-5显著增强,但在西瓜幼苗上的致病力差异不显著,仍具有引起烟草过敏性反应的能力。在不同铜浓度处理后,铜代谢相关基因cueR、copA表达量在野生型菌株中的变化趋势与ΔcopZ菌株存在差异;基因cusA、hylD在野生型菌株中表达量变化趋势与ΔcopZ菌株一致。这表明基因copZ在西瓜噬酸菌铜代谢过程中具有重要作用。 展开更多
关键词 抗铜 西瓜噬酸菌 copZ 基因功能分析
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