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3个候选miRNA在不同光周期绵羊垂体中的表达及潜在功能预测
1
作者 刁婉莹 夏青 +3 位作者 刘秋月 贺小云 储明星 狄冉 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期129-138,共10页
季节性发情是限制肉羊生产效率的重要因素,然而,当前绵羊季节性发情的分子机制尚未解析。本研究旨在对季节性发情3个候选调控因子(oar-miR-127、oar-miR-200a和oar-miR-200b)进行表达水平及潜在功能分析,以探索其在绵羊季节性发情中的... 季节性发情是限制肉羊生产效率的重要因素,然而,当前绵羊季节性发情的分子机制尚未解析。本研究旨在对季节性发情3个候选调控因子(oar-miR-127、oar-miR-200a和oar-miR-200b)进行表达水平及潜在功能分析,以探索其在绵羊季节性发情中的调控作用。根据序列信息对3个miRNA进行了靶基因预测,构建了miRNA-mRNA互作网络,并对靶基因开展了功能富集分析;利用qRT-PCR技术检测了oar-miR-127、oar-miR-200a、oar-miR-200b和共同靶基因在长短光照周期转换过程的表达水平。结果表明,oar-miR-127、oar-miR-200a和oar-miR-200b可分别靶向2 890、534个和451个靶基因,三者与靶基因形成了复杂的互作网络;这些靶基因显著富集到基因表达的昼夜节律调节等生物过程及胰岛素、甲状腺激素和GnRH等繁殖相关信号通路;3个miRNA在光周期转换过程中均呈现下调的表达趋势(在SP21高表达,在LP21低表达),靶基因与3个miRNA呈相反的表达趋势,暗示其可能受到miRNA的负调控。以上结果说明oar-miR-127、oar-miR-200a和oar-miR-200b可作为潜在的季节性发情调控因子进行进一步验证。 展开更多
关键词 绵羊 季节性发情 垂体 光照周期 MIRNA
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绵羊SPP1和PLCB3基因多态性与产羔数的关联分析 被引量：3
2
作者 刁婉莹 狄冉 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2021年第1期8-12,共5页
试验旨在探究SPP1基因g.36651870T>C位点多态性、PLCB3基因g.41871219T>C位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,以期寻找绵羊产羔数性状相关的分子标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY誖SNP技术对多羔羊(小尾寒羊、湖羊... 试验旨在探究SPP1基因g.36651870T>C位点多态性、PLCB3基因g.41871219T>C位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,以期寻找绵羊产羔数性状相关的分子标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY誖SNP技术对多羔羊(小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊)和单羔羊(滩羊、苏尼特羊、萨福克羊和草原型藏羊)7个绵羊品种SPP1、PLCB3基因的2个位点进行多态性检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明:2个位点均存在TT、TC和CC三种基因型。SPP1基因g.36651870T>C位点的基因型频率和等位基因频率在两类绵羊品种间差异极显著(P<0.01);PLCB3基因g.41871219T>C位点基因型频率在两类绵羊品种间差异不显著(P>0.05),等位基因频率差异显著(P<0.05)。群体遗传学分析表明,SPP1基因g.36651870T>C位点在小尾寒羊、苏尼特羊、萨福克羊和湖羊中均表现为中度多态(0.25≤PIC<0.5),在滩羊、策勒黑羊和草原型藏羊中表现为低度多态(PIC<0.25);PLCB3基因g.41871219T>C位点在滩羊中表现为中度多态(0.25≤PIC<0.5),在其余6个绵羊品种中均表现为低度多态(PIC<0.25)。卡方适合性检验表明,SPP1基因g.36651870T>C位点在7个绵羊品种中均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05);PLCB3基因g.41871219T>C位点在小尾寒羊、滩羊、苏尼特羊、策勒黑羊、草原型藏羊5个品种中处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。关联分析表明,PLCB3基因g.41871219T>C位点多态性与小尾寒羊第1胎产羔数有显著关联(P<0.05),TT基因型个体产羔数显著高于CC基因型个体;SPP1基因g.36651870T>C位点多态性与小尾寒羊不同胎次产羔数之间无显著关联(P>0.05)。综上,PLCB3基因g.41871219T>C位点对小尾寒羊产羔数性状选育具有一定的参考意义,SPP1基因g.36651870T>C位点不适用于小尾寒羊产羔数性状选育。 展开更多
关键词 绵羊 SPP1基因 PLCB3基因 产羔数 SNP分型
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