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基于ITS的贵州省30个树种的DNA条形码研究
被引量:
3
1
作者
成宇
蔡莎莎
+5 位作者
舒剑锋
袁昊
伍颖
凃
翠
杨鹏
赵财
《山地农业生物学报》
2018年第6期31-35,共5页
本文对贵州省19科26属30种林木树种植物ITS序列进行PCR扩增及测序,用MEGA 5. 0软件对序列进行比对分析序列信息,用最近距离法计算种内及种间遗传距离,通过邻接法构建系统发育树。结果表明,供试树种的DNA总长度为506~684 bp,其中平均G+...
本文对贵州省19科26属30种林木树种植物ITS序列进行PCR扩增及测序,用MEGA 5. 0软件对序列进行比对分析序列信息,用最近距离法计算种内及种间遗传距离,通过邻接法构建系统发育树。结果表明,供试树种的DNA总长度为506~684 bp,其中平均G+C含量为64%,种内平均遗传距离为0. 013,种间平均遗传距离为0. 236;基于ITS序列构建的聚类树显示,对30种林木树种的鉴定成功率为83%,因此,推荐ITS序列作为林木树种DNA条形码的候选序列。
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关键词
林木树种
DNA条形码
ITS
鉴定
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职称材料
题名
基于ITS的贵州省30个树种的DNA条形码研究
被引量:
3
1
作者
成宇
蔡莎莎
舒剑锋
袁昊
伍颖
凃
翠
杨鹏
赵财
机构
贵州大学生命科学学院
出处
《山地农业生物学报》
2018年第6期31-35,共5页
基金
贵州大学博士基金(201354)
贵州省烟草专卖局项目(201401)
+3 种基金
贵州省科学技术基金(黔科合J字[2014]2064号)
大学生创新创业训练计划项目(贵大省创字[2015]004
贵大校创字[2015]024)
贵州省中药材现代产业技术体系建设(GZCYTX-02)
文摘
本文对贵州省19科26属30种林木树种植物ITS序列进行PCR扩增及测序,用MEGA 5. 0软件对序列进行比对分析序列信息,用最近距离法计算种内及种间遗传距离,通过邻接法构建系统发育树。结果表明,供试树种的DNA总长度为506~684 bp,其中平均G+C含量为64%,种内平均遗传距离为0. 013,种间平均遗传距离为0. 236;基于ITS序列构建的聚类树显示,对30种林木树种的鉴定成功率为83%,因此,推荐ITS序列作为林木树种DNA条形码的候选序列。
关键词
林木树种
DNA条形码
ITS
鉴定
Keywords
tree species
DNA barcoding
ITS
identification
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于ITS的贵州省30个树种的DNA条形码研究
成宇
蔡莎莎
舒剑锋
袁昊
伍颖
凃
翠
杨鹏
赵财
《山地农业生物学报》
2018
3
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引证文献
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