生物信息学工具BLAST的使用简介 被引量：15

1

作者 吕军 张颖 +1 位作者 冯立芹 李宏 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期179-191,共13页

从网上在线服务、电子邮件服务和本地运行三个方面介绍BLAST的使用方法,目的是使大家尽快掌握它,使其成为理论生物学研究的有力工具.

关键词 BLAST 数据库 搜索

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基因组中开阅读框架长度的分布模型与基因组进化 被引量：5

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作者 冯立芹 李宏 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期375-381,共7页

分析了5种真核、15种细菌和10种古菌基因组中开阅读框架(openreadingframe,ORF)的数目随长度的分布,发现不同生物的分布相似且有明显的规律性。用各种分布模型进行拟合比较,结果显示每种生物的这类分布均符合Г(α,β)分布,由此提出生... 分析了5种真核、15种细菌和10种古菌基因组中开阅读框架(openreadingframe,ORF)的数目随长度的分布,发现不同生物的分布相似且有明显的规律性。用各种分布模型进行拟合比较,结果显示每种生物的这类分布均符合Г(α,β)分布,由此提出生物基因组中ORF的数目随长度的分布是Г(α,β)分布的假设。分析各生物基因组的拟合参数,发现α和β值与基因组进化存在明显的相关性;讨论了α和β值的生物进化意义,并给出了真核生物偏好使用长基因的结论;依照Г(α, β)分布估计了酵母基因组中ORF数目的上限为5870个。该方法对于研究生物基因组进化以及评估理论预测基因的可靠性具有建设性意义。 展开更多

关键词 基因组 ORF Г(α β)分布 基因组进化

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热力学统计物理课程教学改革探讨 被引量：4

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作者 冯立芹 《中国西部科技》 2014年第5期90-91,71,共3页

结合《热力学·统计物理》的课程特点和教学中存在的问题,笔者进行了教学内容、教学方法、教学手段、考核方式等方面的改革和实践,并起到较好的效果。

关键词 热力学统计物理 教学改革 教学实践

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熊胆的真伪鉴别 被引量：5

4

作者 冯立芹 《首都医药》 2014年第8期55-56,共2页

目的阐述熊胆的真伪品鉴别方法及鉴别要点,为临床应用熊胆提供保障,使传统中药材能更好地发挥临床治疗效果,服务百姓健康。方法通过阐述正品熊胆的特征和各种检验方法的参考结果,同时与常见伪品的特征及理化鉴别结果进行对比,并总结鉴... 目的阐述熊胆的真伪品鉴别方法及鉴别要点,为临床应用熊胆提供保障,使传统中药材能更好地发挥临床治疗效果,服务百姓健康。方法通过阐述正品熊胆的特征和各种检验方法的参考结果,同时与常见伪品的特征及理化鉴别结果进行对比,并总结鉴别的要点为临床鉴别熊胆提供参考依据。结果熊胆属贵细中药材,具有确切的临床疗效,但因其资源稀缺而出现大量的伪品或是掺伪品,进而影响临床应用效果。因此,临床工作者应正确掌握熊胆的真伪鉴别方法及要点,以便使熊胆发挥真正地临床治疗效果,更好地为百姓健康服务。结论熊胆是重要的贵细中药之一,药理作用广泛而明确,具有深入的研究价值。但目前药品市场有伪品出现,因此需要熟练掌握鉴别方法,正确区分真伪,使其发挥临床治疗作用。 展开更多

关键词 熊胆 鉴别 药理作用

原文传递

利用机械能守恒求解非惯性系单摆的振动周期 被引量：1

5

作者 冯立芹 《物理与工程》 2014年第5期40-42,44,共4页

由于不同的非惯性系具有不同的加速度,导致单摆在不同的非惯性系中具有不同的振动周期,所以有必要掌握非惯性系下单摆振动周期的计算.基本的计算方法是利用非惯性系动力学方程,结合受力分析求解,但这种方法既要考虑惯性力,又需要进行力... 由于不同的非惯性系具有不同的加速度,导致单摆在不同的非惯性系中具有不同的振动周期,所以有必要掌握非惯性系下单摆振动周期的计算.基本的计算方法是利用非惯性系动力学方程,结合受力分析求解,但这种方法既要考虑惯性力,又需要进行力的分解,比较麻烦.本文通过引入惯性力势能,给出非惯性系机械能守恒定律,并利用机械能守恒定律对处于特定非惯性系中的单摆周期进行分析计算,得出非惯性系中单摆的振动周期不仅与单摆自身属性有关,而且与非惯性系的运动加速度或角速度有关的结论. 展开更多

关键词 单摆 振动周期 惯性力势能 非惯性系 机械能守恒

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真核模式生物蛋白质数据库统计规律研究 被引量：1

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作者 冯立芹 李宏 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2014年第6期5318-5321,5332,共5页

目的：根据NCBI Refseq基因集的蛋白质序列数据,构建包含11种真核模式生物在内的基因、蛋白质信息数据库（EPD）,探讨各种模式生物的蛋白质序列长度频率分布,并以此来探讨在生物进化过程中,蛋白质序列长度的变化趋势。方法：通过计算机... 目的：根据NCBI Refseq基因集的蛋白质序列数据,构建包含11种真核模式生物在内的基因、蛋白质信息数据库（EPD）,探讨各种模式生物的蛋白质序列长度频率分布,并以此来探讨在生物进化过程中,蛋白质序列长度的变化趋势。方法：通过计算机编程软件提取不同种类生物基因总数、有实验数据支撑的蛋白质序列（标记为NP_的序列）数、理论预测的蛋白质序列（标记为XP_的序列）数等相关信息进行统计。结果：对该数据库数据统计规律的研究表明：数据库共有347042个基因,469887个蛋白质,平均每个基因可翻译有1.35个蛋白质;蛋白质序列长度为300-350个氨基酸的最多;长度小于100个氨基酸和大于2500个氨基酸的蛋白质序列很少。结论：模式生物蛋白质序列长度频率分布具有一定规律性;人和爪蛙的蛋白质长度频率分布曲线形状最相似;从蛋白质长度频率分布曲线的靠近程度上看,人与小鼠更接近;生物偏好使用中等长度的蛋白质序列。 展开更多

关键词 真核生物 数据库 频率分布

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人类基因组中蛋白质编码序列数目随其长度的分布研究 被引量：1

7

作者 冯立芹 李宏 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2009年第1期58-64,共7页

分析了人类24条染色体基因组中蛋白质编码序列的数目随长度的分布,发现分布规律有明显的相似性;用Г(α,β)分布对实际分布进行拟合,其特征参数α均小于1,即蛋白质编码序列是呈随长度减少而其数目一直增加的分布.而研究的其它生物(15种... 分析了人类24条染色体基因组中蛋白质编码序列的数目随长度的分布,发现分布规律有明显的相似性;用Г(α,β)分布对实际分布进行拟合,其特征参数α均小于1,即蛋白质编码序列是呈随长度减少而其数目一直增加的分布.而研究的其它生物(15种真细菌,10种古核菌和5种真核生物)均是α>1的Г(α,β)分布.经过分析比较,推测人类蛋白质编码序列的分布也应该是α>1的Г(α,β)分布.在对短序列补充了推测数据后,重新对数据拟合,效果很好,α值在1.19～1.85之间.生物基因所遵从的Г(α,β)分布规律对研究基因组进化及评估理论预测的基因准确性具有积极意义. 展开更多

关键词 人类基因组 蛋白质编码序列 Г(α β)分布 染色体进化速率

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薄膜干涉中附加光程差及干涉条纹公式分析

8

作者 冯立芹 李春芝 《物理与工程》 2022年第6期46-48,共3页

现行许多教材对薄膜干涉中附加光程差和干涉条纹公式的表达书写不够统一,使得学生在学习过程中,对半波损失引起的附加光程差的表达及干涉级次的理解存在一定的困惑。针对此种情况,本文就薄膜干涉中半波损失相关的干涉级次问题,结合干涉... 现行许多教材对薄膜干涉中附加光程差和干涉条纹公式的表达书写不够统一,使得学生在学习过程中,对半波损失引起的附加光程差的表达及干涉级次的理解存在一定的困惑。针对此种情况,本文就薄膜干涉中半波损失相关的干涉级次问题,结合干涉级次取值特点及物理意义,详细地分析了薄膜干涉中存在半波损失时附加光程差的不同表达式,给出了不同附加光程差表示下干涉条纹公式的具体形式,对学生理解具有半波损失的干涉有一定的指导作用。 展开更多

关键词 薄膜干涉 半波损失 附加光程差 干涉条件

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量纲分析法求解复摆和扭摆的振动周期 被引量：1

9

作者 冯立芹 王耘涛 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2007年第5期495-498,共4页

通过对量纲概念及量纲分析基本理论的分析讨论,用实例解释了在求解振动周期中的量纲分析应用.用量纲法分析振动的周期,只要选择主定参量,而对物理过程几乎不需再作分析.

关键词 量纲式 量纲分析 Π定理 复摆 扭摆 周期

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预测酵母基因组中基因数目的一种方法

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作者 冯立芹 李宏 王耘涛 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2005年第6期625-628,共4页

分析了酵母(Saccharomyces cerevisiae,Scer)、大肠杆菌(Escherichia,Ecoli)和枯草杆菌(Bacillus sub- tilis,Bsub)基因组中基因和开阅读框架(open reading frame,ORF)的数目随长度的分布,发现不同生物的分布相似且有明显的规律性,并依... 分析了酵母(Saccharomyces cerevisiae,Scer)、大肠杆菌(Escherichia,Ecoli)和枯草杆菌(Bacillus sub- tilis,Bsub)基因组中基因和开阅读框架(open reading frame,ORF)的数目随长度的分布,发现不同生物的分布相似且有明显的规律性,并依照此规律估计了酵母基因组中基因数目约为5752个．本文的方法对于评估理论预测基因的可靠性具有建设性意义． 展开更多

关键词 基因组 基因 开阅读框架(ORF)

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蛋白质规则二级结构中亲疏水氨基酸的次邻关联、次次邻关联

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作者 胡秀珍 冯立芹 《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》 2002年第3期165-169,共5页

规则二级结构中亲-疏水氨基酸的紧邻关联特性对不同类蛋白质有不同的规律,但在同类蛋白质同类规则二级结构不同长度的片断中有相同的规律,并且亲-疏水氨基酸的关联特征是可以定位的,那么次邻关联、次次邻关联是否也有此规律呢?本文对此... 规则二级结构中亲-疏水氨基酸的紧邻关联特性对不同类蛋白质有不同的规律,但在同类蛋白质同类规则二级结构不同长度的片断中有相同的规律,并且亲-疏水氨基酸的关联特征是可以定位的,那么次邻关联、次次邻关联是否也有此规律呢?本文对此进行了讨论. 展开更多

关键词 蛋白质 亲-疏水氨基酸 冷邻关联 次次邻关联

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关于电势零点问题的几点体会

12

作者 冯立芹 韩元春 《海洋世界》 2002年第2期-,共2页

电势是描述电场中各点性质的物理量 ,某点的电势的确切意义是该点与电势零点的电势差 ,能否正确地得出电势 ,关键在于电势零点的选取。本文仅以无限大带电体为例 ,说明电势零点的选取不能一概而论 ,需具体情况具体分析 。

关键词 电势 电势零点 无限大带电体

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几种模式生物基因数目与长度的关系研究

13

作者 冯立芹 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2011年第1期55-57,共3页

分析了大肠杆菌、枯草杆菌、酵母、拟南芥基因组中基因数目随长度的分布,发现有明显的规律性,根据分布的特点用各种分布模型进行拟合比较,提出这类分布是Г(α,β)分布的假设.

关键词 模式生物 基因组 基因 Г(α β)分布

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热力学恒等式证明的方法与技巧

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作者 冯立芹 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2013年第5期506-508,共3页

在热力学中,涉及热力学函数偏导数的恒等式证明有很多,但学生对这类问题往往不知如何分析.本文对这类问题进行了适当的归纳总结,并通过具体实例给出了不同情况下这类证明题的分析方法.

关键词 热力学函数 恒等式 麦克斯韦关系 特性函数

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酵母基因组中ORF数目与长度的关系

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作者 冯立芹 《生物信息学》 2011年第1期32-34,共3页

根据NCBI数据库中基因注释序列及相关注释文件,统计了酿酒酵母基因组中不同长度的开阅读框架(Open ReadingFrame,ORF)的数目,分析了开阅读框架的数目随长度的分布关系,结果发现有明显的规律性。根据分布的特点用各种分布模型进行拟合比... 根据NCBI数据库中基因注释序列及相关注释文件,统计了酿酒酵母基因组中不同长度的开阅读框架(Open ReadingFrame,ORF)的数目,分析了开阅读框架的数目随长度的分布关系,结果发现有明显的规律性。根据分布的特点用各种分布模型进行拟合比较,提出这类分布是Г(α,β)分布的假设。进一步根据Г(α,β)分布估算了酵母基因组蛋白质编码序列的数目为5870个。该结果对于基因注释具有一定的参考价值。 展开更多

关键词 基因组 开阅读框架(ORF) Г(α β)分布

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关于电势零点问题的几点体会

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作者 冯立芹 韩元春 《内蒙古科技与经济》 2002年第8期117-118,共2页

电势是描述电场中各点性质的物理量 ,某点的电势的确切意义是该点与电势零点的电势差 ,能否正确地得出电势 ,关键在于电势零点的选取。本文仅以无限大带电体为例 ,说明电势零点的选取不能一概而论 ,需具体情况具体分析 。

关键词 电势 电势零点 无限大带电体

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非惯性系弹簧谐振子振动周期的计算

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作者 王耘涛 冯立芹 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2013年第1期11-13,共3页

通过引入等效势能,给出了非惯性系机械能守恒定律.分三种情况,利用机械能守恒对处于匀加速运动参考系中的弹簧谐振子周期进行了分析计算,并给出了正确的结果.

关键词 等效势能 非惯性系 机械能守恒 弹簧谐振子

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酵母基因组数据库的比较研究

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作者 冯立芹 李宏 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期641-647,共7页

通过对三个不同版本酵母基因组数据库的比较,给出了近几年酵母基因组中开阅读框架(ORF)和基因的变化情况;发现短的ORF变化不稳定,并给出造成这种不稳定的可能原因是序列的随机性;给出了TY*类ORF和以其它方式命名的ORF(*类ORF)的特点,对... 通过对三个不同版本酵母基因组数据库的比较,给出了近几年酵母基因组中开阅读框架(ORF)和基因的变化情况;发现短的ORF变化不稳定,并给出造成这种不稳定的可能原因是序列的随机性;给出了TY*类ORF和以其它方式命名的ORF(*类ORF)的特点,对所有*类ORF在2001年和2002年的数据库中不复存在提出质疑. 展开更多

关键词 酵母基因组 开阅读框架 ITY＊类ORF ＊类ORF

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西红花的药理作用及与常见伪品的鉴别 被引量：1

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作者 冯立芹 《首都医药》 2014年第6期48-49,共2页

目的对西红花的药理作用进行总结并对其伪品进行介绍,从而进一步明确西红花的临床应用以及鉴别西红花的方法。方法通过对西红花的药理作用及正伪品西红花的鉴别等方面对西红花进行阐述。结果与结论西红花不但在临床上得到广泛使用,还大... 目的对西红花的药理作用进行总结并对其伪品进行介绍,从而进一步明确西红花的临床应用以及鉴别西红花的方法。方法通过对西红花的药理作用及正伪品西红花的鉴别等方面对西红花进行阐述。结果与结论西红花不但在临床上得到广泛使用,还大量用于日用化工、食品等工业,是化妆品和香料的宝贵原料,因而是一种贵细中药。而不法分子为牟取暴利,采用掺伪及造假等手段充斥药材市场。这些赝品不但无效,个别品种还会危害健康。因此,药品监督部门应该严格控制西红花药材的流通渠道,避免伪品在市场上销售。而作为医药工作者要掌握西红花的鉴别方法,仔细辨认,全面考察,确定真伪,以保证西红花饮片的质量,发挥其在中医临床治疗中的功用。 展开更多

关键词 西红花 药理作用 伪品 鉴 别 临床作用

原文传递

中药不良反应的因素与安全合理用药 被引量：1

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作者 冯立芹 《首都医药》 2014年第4期49-50,共2页

目的分析中药不良反应产生的因素,提出解决办法,指导临床安全用药。方法根据临床经验,总结中药产生不良反应的诸多因素,对中药的合理使用进行探讨。结果多种因素共同决定了中药的不良反应。结论根据因素和不同种类中药药性的区别,采取... 目的分析中药不良反应产生的因素,提出解决办法,指导临床安全用药。方法根据临床经验,总结中药产生不良反应的诸多因素,对中药的合理使用进行探讨。结果多种因素共同决定了中药的不良反应。结论根据因素和不同种类中药药性的区别,采取相应措施,保证临床安全有效用药。 展开更多

关键词 中药 不良反应 因素 安全用药

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