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三疣梭子蟹IAG基因结构及不同剪切体时空表达
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作者 兰伟康 李光 +2 位作者 高保全 刘萍 吕建建 《广东海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期26-34,共9页
【目的】分析三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)IAG(PtIAG)基因的结构及不同剪切体的时空表达模式,揭示其在性别分化中的功能及作用机制。【方法】基于NCBI数据库的甲壳动物IAG基因序列构建ML系统进化树。利用生物信息学软件对PtIA... 【目的】分析三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)IAG(PtIAG)基因的结构及不同剪切体的时空表达模式,揭示其在性别分化中的功能及作用机制。【方法】基于NCBI数据库的甲壳动物IAG基因序列构建ML系统进化树。利用生物信息学软件对PtIAG基因的DNA结构及启动子区域进行分析。利用PCR技术对PtIAG基因进行可变剪切分析。利用qPCR技术对PtIAG基因进行时空表达分析。【结果】ML系统进化树显示,PtIAG基因与其他蟹类IAG基因的进化关系更近。PtIAG基因包含4个外显子和3个内含子,全长2615 bp。核心启动子位于起始密码子(ATG)上游2834 bp,启动子区域包括SOX-5、SOX-9、DSX等转录因子识别位点。PtIAG基因存在2种不同的转录本,其中PtIAG2为内含子保留型可变剪切转录本。qPCR结果显示,在幼体发育时期,PtIAG基因主要在溞状幼体Ⅰ期的雄蟹中表达;在成体组织中,PtIAG基因主要在促雄性腺中表达。【结论】PtIAG基因在三疣梭子蟹雄性分化及维持中具重要功能。 展开更多
关键词 三疣梭子蟹 PtIAG基因 基因结构 可变剪切 时空表达
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