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题名模糊聚类法在动态设计组学数据趋势聚类中的应用
被引量:2
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作者
王璐
张涛
刘佳
刘盈君
公晓云
薛付忠
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机构
山东大学公共卫生学院生物统计学系
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出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2015年第1期2-5,9,共5页
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基金
国家自然科学基金资助(81302514)
山东省自然科学基金(ZR2013HQ056)
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文摘
目的探讨模糊C均值聚类方法(FCM)在动态设计组学数据不同动态趋势聚类中的应用。方法使用模糊C均值聚类方法,分别对模拟的动态数据和动态基因表达进行聚类,识别不同的变化模式。结果对模拟数据的分析显示,FCM可以准确地识别模拟设定的不同动态变化趋势,并将其聚为一类;同时,通过设定隶属度阈值我们可以避免对噪声变量的聚类。而对动态基因组表达数据的实例分析表明FCM可以有效地将具有相同表达模式的基因聚类,并且能给出类间关系。结论模糊C-均值聚类可以用于动态组学数据不同动态变化模式的聚类,帮助我们更有效地探索生物信息。
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关键词
动态组学数据
模糊C均值聚类
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Keywords
Dynamic Omics data
Fuzzy C-means cluster
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分类号
O212
[理学—概率论与数理统计]
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题名中国经济发展模式研究综述
被引量:2
- 2
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作者
王群峰
公晓云
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机构
北京师范大学经济与工商管理学院
山东省地税局
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出处
《山东社会科学》
CSSCI
北大核心
2012年第10期143-145,共3页
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文摘
中国经济发展模式一直是国内外学术界较为关心的话题,通过对中国经济发展模式进程、特点、面临的问题、改进优化等已有研究文献的爬梳,进行了有益的归纳与分析。中国的经济经过几十年的发展,取得了令世人瞩目的成就,然而发展中也逐渐暴露出很多缺陷和不足。但是,只要我们怀着实事求是的态度,不断深化各项改革,逐步化解矛盾、解决问题,中国的经济一定能够沿着正确的轨道继续前进。
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关键词
中国经济发展模式
研究文献
综述
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分类号
F120.3
[经济管理—世界经济]
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题名代谢组学数据正态性对疾病分类准确性的影响
被引量:1
- 3
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作者
公晓云
申小涛
徐静
张涛
朱正江
薛付忠
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机构
山东大学公共卫生学院生物统计学系
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心
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出处
《山东大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2016年第4期89-93,共5页
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基金
山东省博士后创新项目(201302032)
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文摘
目的探讨在代谢组学数据中服从正态分布的变量个数逐步增加时统计分类方法分类准确率的变化趋势。方法首先模拟产生11组代谢数据,且数据中服从正态分布的变量逐渐增加,然后用传统的非机器学习统计方法[Bayes判别、Fisher判别、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)]和机器学习方法[随机森林(RF)、支持向量机(SVM)]进行统计分析,比较分类准确率的变化;最后用两个实例分析对模拟结果的合理性进行评价。结果代谢组学数据正态性对Bayes判别、Fisher判别、PLS-DA的分析结果影响较大,随着数据中服从正态分布的变量个数增加,分类准确率增大,而对RF和SVM基本没有影响。结论传统的非机器学习方法在统计分析过程中对数据正态性有一定的要求,而机器学习类的方法对数据正态性基本没有要求,且分类准确率一直保持较高的稳定状态。
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关键词
数据正态性
分类准确率
Bayes判别
FISHER判别
偏最小二乘判别分析
随机森林
支持向量机
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Keywords
Data Normality
Classification Accuracy
Bayes Discrimination
Fisher Discrimination
Partial Least Squares Discrimination Analysis
Random Forest
Support Vector M achine
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分类号
R195.1
[医药卫生—卫生统计学]
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