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西瓜种子大小全基因组关联分析
被引量:
2
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作者
王学征
刘硕
+6 位作者
徐雅菲
高启帆
修
洪
超
李燕
李亚平
齐国安
刘识
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期26-34,共9页
试验调查分析62份不同西瓜种质资源种子大小性状,包括种子长度、种子宽度、种子厚度、种形指数、种子千粒重、单瓜种子数等。针对性状结果展开数据分析,以主成分分析、相关性分析、聚类分析等不同统计学方法分析不同品种特征近似程度。...
试验调查分析62份不同西瓜种质资源种子大小性状,包括种子长度、种子宽度、种子厚度、种形指数、种子千粒重、单瓜种子数等。针对性状结果展开数据分析,以主成分分析、相关性分析、聚类分析等不同统计学方法分析不同品种特征近似程度。种子大小遗传多样性分析结果表明,62份西瓜种质资源中,种子长度、种子宽度、种子厚度、种形指数、种子千粒重、单瓜种子数多样性指数均在4.20以上,呈较高多样性;通过全基因组关联分析发现,共检测到7个与西瓜种子长度相关的SNP位点和11个与西瓜种子宽度相关的SNP位点,其中4、7号染色体上2个与西瓜种子长度相关的SNP达显著水平,4个与西瓜种子宽度关联的SNP位点达显著水平,分别位于1、4、7、10号染色体。
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关键词
西瓜
种子大小
多样性
全基因组关联分析
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职称材料
题名
西瓜种子大小全基因组关联分析
被引量:
2
1
作者
王学征
刘硕
徐雅菲
高启帆
修
洪
超
李燕
李亚平
齐国安
刘识
机构
农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
东北农业大学园艺园林学院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期26-34,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31772333)
国家西甜瓜产业技术体系项目(CARS-026-02)
文摘
试验调查分析62份不同西瓜种质资源种子大小性状,包括种子长度、种子宽度、种子厚度、种形指数、种子千粒重、单瓜种子数等。针对性状结果展开数据分析,以主成分分析、相关性分析、聚类分析等不同统计学方法分析不同品种特征近似程度。种子大小遗传多样性分析结果表明,62份西瓜种质资源中,种子长度、种子宽度、种子厚度、种形指数、种子千粒重、单瓜种子数多样性指数均在4.20以上,呈较高多样性;通过全基因组关联分析发现,共检测到7个与西瓜种子长度相关的SNP位点和11个与西瓜种子宽度相关的SNP位点,其中4、7号染色体上2个与西瓜种子长度相关的SNP达显著水平,4个与西瓜种子宽度关联的SNP位点达显著水平,分别位于1、4、7、10号染色体。
关键词
西瓜
种子大小
多样性
全基因组关联分析
Keywords
watermelon
seed size
genetic diversity
genome-wide association analysis
分类号
S651 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西瓜种子大小全基因组关联分析
王学征
刘硕
徐雅菲
高启帆
修
洪
超
李燕
李亚平
齐国安
刘识
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
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