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题名基于图神经网络的非同义单核苷酸多态性预测研究
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作者
侯孝平
张明
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机构
江苏科技大学计算机学院
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出处
《计算机技术与发展》
2024年第11期207-213,共7页
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基金
江苏省产学研合作项目(BY20231174)。
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文摘
在遗传与变异的研究中,非同义单核苷酸多态性(nsSNP)是一个重要的研究方向,目前已发现由非同义单核苷酸多态性引起的疾病有6 000多种,因此,准确预测非单核苷酸多态性对更好地了解其功能机制和疾病治疗具有重要意义。针对该问题,文中提出了一种名为SGNN的模型,旨在通过图神经网络与卷积神经网络的方法,实现高性能地完成nsSNP预测任务。在SGNN模型中,通过样本长度归一化处理,截取出适当长度的残基环境,以减少冗余信息,降低噪声干扰;随后,通过ProtTrans模型提取出样本残基环境的PT特征,并将属于同种蛋白质且具有相同突变位点的样本构成的集合使用图数据建模的方法转化为图结构数据;在模型训练的过程中,通过GraphSAGE算法更新图并使用节点分类的方法结合卷积神经网络完成样本致病性预测。实验中选择MMP数据集和PredictSNP数据集作为基准数据集,并与已有的最新的方法进行对比。其中,SGNN在MMP数据集上准确率(ACC)为85.2%,在PredictSNP数据集上ACC为83.3%,相较于最新的方法分别提升了3.2百分点和3.6百分点。实验结果表明,在nsSNP预测任务中,SGNN具有更好的预测性能。
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关键词
非同义单核苷酸多态性
ProtTrans
图神经网络
卷积神经网络
深度学习
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Keywords
non-synonymous single nucleotide polymorphism
ProtTrans
graph neural network
convolutional neural network
deeplearning
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分类号
TP183
[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
Q811.4
[自动化与计算机技术—控制科学与工程]
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题名二氢苯骈吡喃肟及肟酯衍生物的合成
被引量:1
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作者
侯孝平
黄文龙
彭司勋
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机构
中国药材大学药物化学研究室
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出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1995年第3期129-133,共5页
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基金
国家自然科学基金
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文摘
为了寻找活性高、毒副作用小的抗高血压药,根据二氢苯骈吡喃类化合物的一般构效关系,对二氢苯骈吡喃类钾通道启开剂进行进一步的结构修饰。以对氰基酚为原料经酯化、Fries重排、缩合、成肟、再酯化共五步反应,合成了15个苯骈吡喃类化合物(Ⅰa~c,Ⅱa~c,Ⅲa~i),其中12个化合物(Ⅱ,Ⅲ)未见文献报道,结构经元素分析、IR、1HNMR、MS确证。初步的体外缩血管活性试验表明,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类化合物对所试血管收缩剂引起的血管收缩反应无抑制作用。
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关键词
苯骈吡喃
钾通道启开剂
降压药
酯化
合成
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Keywords
Benzopyran
K ̄+ Channel openers
Antihypertensives
Oximation
Esterification
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分类号
TQ463.54
[化学工程—制药化工]
R972.4
[医药卫生—药品]
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题名二氢苯骈吡喃酮Mannich反应的副反应
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作者
侯孝平
黄文龙
彭司勋
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机构
中国药科大学药物化学研究室
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出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第2期71-73,共3页
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基金
国家自然科学基金
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文摘
以Mannich反应拟合成3-胺甲基-4-羟基取代的苯骈吡喃化合物(Ⅲ),得到DielsAlder缩合产物(Ⅳa)和(Ⅳb),初步探索了反应条件并确定了所得产物的结构。
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关键词
MANNICH反应
二氢苯骈吡喃酮
抗高血压药
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Keywords
Mannich reaction
Benzopyranones
Diels-Alder reaction
Aldol condensation
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分类号
R972.4
[医药卫生—药品]
R914.5
[医药卫生—药学]
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题名认真搞好保单清理 防范和化解经营风险
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作者
杨春风
刘国才
侯孝平
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机构
中保人寿保险公司牡丹江分公司
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出处
《内蒙古保险》
1999年第2期43-45,共3页
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文摘
中保人寿东宁县支公司于1985年开办简易人身保险业务,到1997年末共承保13,075人,255,644份,保费收入1206万元,占整个业务比重的973%,占普通寿险的3216%。全县205万人口,人均达到124份,简身险业务档案量非常大,...
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关键词
防范和化解
投保单
分业经营
被保险人
失效保单
保费收入
交费能力
寿险公司
金额不符
经营风险
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分类号
F
[经济管理]
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题名开发中的新抗溃疡药贲妥拉唑
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作者
侯孝平
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出处
《药学进展》
CAS
北大核心
1994年第3期163-164,共2页
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文摘
开发中的新抗溃疡药贲妥拉唑最近,尽管以杀灭幽门螺旋菌(H.pylori)而治疗消化道溃疡引起广泛关注。但是,由于缺乏可以普遍应用的有效药物。因此,新的胃酸分泌抑制剂的发展仍然较快即使研究出一个有效药物。抗分泌药物对迅速缓解症状(如溃疡疼痛)以及某些特...
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关键词
溃疡病用药
贲妥拉唑
新药
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分类号
R975.6
[医药卫生—药品]
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