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罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)卵巢再发育规律及启动再次发育的关键基因和信号通路研究
1
作者
孔天赐
许珊华
+7 位作者
何
鉴
桥
吴慧玲
马笑凯
唐琼英
易少奎
夏正龙
蔡缪荧
杨国梁
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1510-1521,共12页
罗氏沼虾在温度适宜的条件下可常年产卵,生产上常利用其多次产卵的特性来进行育苗生产,以提高亲虾利用率,从而提高经济效益。为更深入地了解罗氏沼虾卵巢再次发育的动态变化规律及启动再次发育的关键基因和信号通路,对罗氏沼虾卵巢再发...
罗氏沼虾在温度适宜的条件下可常年产卵,生产上常利用其多次产卵的特性来进行育苗生产,以提高亲虾利用率,从而提高经济效益。为更深入地了解罗氏沼虾卵巢再次发育的动态变化规律及启动再次发育的关键基因和信号通路,对罗氏沼虾卵巢再发育过程中的卵巢外部形态、内部组织学及不同发育时期的转录组学进行研究。结果表明,罗氏沼虾卵巢再发育可分为卵原细胞积累期、卵母细胞生成期、卵子成熟期、再次排卵期及恢复期共5个时期;转录组测序共获得5个发育时期卵巢99.3 Gb质控后数据,成功注释到89614个Unigenes,识别了32288个差异表达基因,包括17009个上调和15279个下调基因;构建WGCNA共表达网络,发现MEgreen颜色模块下基因在Ⅰ期卵巢高表达,并随着卵巢成熟度的增高而降低,直至排卵完成后呈现上升趋势;蛋白质相互作用网络(PPI network)进一步分析该模块下基因间的互作关系,发现核糖体(Ribosome)和蛋白酶体(Proteasome)信号通路及通路中相关基因包括核糖体蛋白基因RPL24、RPS24、RPL10a、RPS3a等和蛋白酶体基因家族PSMC2、PSMC4、PSMC6、PSMD4等基因在启动卵巢再次发育中发挥着重要功能。KEGG富集分析也发现Ribosome和Proteasome通路显著富集(P.adjust<0.05)。该研究结果为揭示罗氏沼虾卵巢再次发育的组织形态学特征及相关基因的分子调控机制研究奠定了理论基础。
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关键词
罗氏沼虾
卵巢
再次发育
转录组学
组织学
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题名
罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)卵巢再发育规律及启动再次发育的关键基因和信号通路研究
1
作者
孔天赐
许珊华
何
鉴
桥
吴慧玲
马笑凯
唐琼英
易少奎
夏正龙
蔡缪荧
杨国梁
机构
湖州师范学院生命科学学院
江苏数丰水产种业有限公司
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1510-1521,共12页
基金
国家现代农业产业技术体系资助,CARS-48号
浙江省农业(水产)新品种选育重大科技专项,2021C02069-4-3号。
文摘
罗氏沼虾在温度适宜的条件下可常年产卵,生产上常利用其多次产卵的特性来进行育苗生产,以提高亲虾利用率,从而提高经济效益。为更深入地了解罗氏沼虾卵巢再次发育的动态变化规律及启动再次发育的关键基因和信号通路,对罗氏沼虾卵巢再发育过程中的卵巢外部形态、内部组织学及不同发育时期的转录组学进行研究。结果表明,罗氏沼虾卵巢再发育可分为卵原细胞积累期、卵母细胞生成期、卵子成熟期、再次排卵期及恢复期共5个时期;转录组测序共获得5个发育时期卵巢99.3 Gb质控后数据,成功注释到89614个Unigenes,识别了32288个差异表达基因,包括17009个上调和15279个下调基因;构建WGCNA共表达网络,发现MEgreen颜色模块下基因在Ⅰ期卵巢高表达,并随着卵巢成熟度的增高而降低,直至排卵完成后呈现上升趋势;蛋白质相互作用网络(PPI network)进一步分析该模块下基因间的互作关系,发现核糖体(Ribosome)和蛋白酶体(Proteasome)信号通路及通路中相关基因包括核糖体蛋白基因RPL24、RPS24、RPL10a、RPS3a等和蛋白酶体基因家族PSMC2、PSMC4、PSMC6、PSMD4等基因在启动卵巢再次发育中发挥着重要功能。KEGG富集分析也发现Ribosome和Proteasome通路显著富集(P.adjust<0.05)。该研究结果为揭示罗氏沼虾卵巢再次发育的组织形态学特征及相关基因的分子调控机制研究奠定了理论基础。
关键词
罗氏沼虾
卵巢
再次发育
转录组学
组织学
Keywords
Macrobrachium rosenbergii
ovary
re-development
transcriptomics
histology
分类号
Q523.8 [生物学—生物化学]
Q789 [农业科学—水产科学]
S917
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)卵巢再发育规律及启动再次发育的关键基因和信号通路研究
孔天赐
许珊华
何
鉴
桥
吴慧玲
马笑凯
唐琼英
易少奎
夏正龙
蔡缪荧
杨国梁
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
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参考文献
引证文献
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