广西甘薯病毒病的病原病毒种类检测 被引量：15

1

作者 黄利利 Pham Binhdan +4 位作者 何芳练 刘奕君 刘义明 陈保善 廖咏梅 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1213-1218,共6页

甘薯病毒病是广西甘薯的主要病害之一。为明确为害广西甘薯的病毒种类,到广西南宁、玉林、崇左、北海、宜州和桂林等市的甘薯种植区采集疑似甘薯病毒病样品,共采集到127个甘薯样品,用为害甘薯的12种病毒的引物,通过RT-PCR或PCR技术检测... 甘薯病毒病是广西甘薯的主要病害之一。为明确为害广西甘薯的病毒种类,到广西南宁、玉林、崇左、北海、宜州和桂林等市的甘薯种植区采集疑似甘薯病毒病样品,共采集到127个甘薯样品,用为害甘薯的12种病毒的引物,通过RT-PCR或PCR技术检测,并对扩增产物进行测序和所获序列的Blast分析。结果表明:为害广西甘薯的病毒种类有11种,包括10种RNA病毒:甘薯羽状斑驳病毒(sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)、甘薯G病毒(sweet potato virus G,SPVG)、甘薯褪绿矮化病毒(sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)、甘薯轻型斑点病毒(sweet potato mild speckling virus,SPMSV)、甘薯C病毒(sweet potato virus C,SPVC)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)、甘薯褪绿斑病毒(sweet potato chlorotic fleck virus,SPCFV)、甘薯脉花叶病毒(sweet potato vein mosaic virus,SPVMV)、甘薯潜隐病毒(sweet potato latent virus,SPLV)、甘薯轻型斑驳病毒(sweet potato mild mottle virus,SPMMV),1种DNA病毒:甘薯卷叶病毒(sweet potato leaf curl virus,SPLCV)。在127份甘薯样品中,有48个样品检测到SPFMV,占37.79%;31个样品检测到SPVG,占24.40%;29个样本检测到SPLCV,占22.83%;27个样本检测到SPCSV,占21.30%,其他被检测到的甘薯病毒占20.00%之下。检测到病毒的88个样品中,有40个样品仅检测到一种病毒,即SPFMV、SPVG、SPCSV、SPMSV、CMV、SPLCV单独侵染。48个样品为2种或2种以上的病毒复合侵染。病毒复合侵染时,甘薯症状表现复杂,有矮化、花叶、皱缩、叶脉突起等症状。其中,检测到SPCSV的甘薯植株,表现出严重的矮化症状。 展开更多

关键词 甘薯 病毒病 病毒种类 检测

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荸荠组培苗在间歇浸没式生物反应器(TIBs)中的高效增殖技术 被引量：8

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作者 高美萍 林志城 +7 位作者 张驰 江文 董伟清 欧昆鹏 桂杰 闭志强 何芳练 陈丽娟 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1653-1657,共5页

【目的】探讨间歇浸没式生物反应器(TIBs)对荸荠(Eleocharis dulcis)组培苗快速繁殖的效果,为提高荸荠组培苗繁殖效率及其工厂化生产提供技术支撑。【方法】以初代诱导培养获得的桂蹄2号荸荠组培苗为外植体,利用TIBs系统进行组培快繁,... 【目的】探讨间歇浸没式生物反应器(TIBs)对荸荠(Eleocharis dulcis)组培苗快速繁殖的效果,为提高荸荠组培苗繁殖效率及其工厂化生产提供技术支撑。【方法】以初代诱导培养获得的桂蹄2号荸荠组培苗为外植体,利用TIBs系统进行组培快繁,研究荸荠组培苗不同继代代数、接种密度、激素组合及反应器间歇浸没频率等因子对荸荠组培增殖的影响。【结果】经初代诱导培养的第4、5、6代继代材料增殖倍数较高,其中第6代继代苗增殖倍数最高,达31.1倍,到第7代后随继代代数的增加增殖倍数逐渐降低。当接种密度大于15丛/瓶时,外植体污染率达16.0%;当接种密度低于10丛/瓶时,外植体的污染率为0。低于10 min/6 h的间歇浸没频率有利于降低污染率,在6 h内低于15 min的浸没时间有利于降低玻璃化苗率;当激素组合为3.0 mg/L 6-BA+0.01 mg/L NAA时,组培苗增殖倍数达38.5倍,且组培苗生长正常。【结论】在TIBs系统中,采用经初代诱导培养的第5代荸荠继代组培苗,增殖培养基为MS+3.0 mg/L 6-BA+0.01 mg/L NAA+30.0 g/L蔗糖,pH 6.0,接种密度10丛/瓶,反应器间歇浸没频率为10min/6 h,可获得较好的培养效果。 展开更多

关键词 荸荠 组培苗 TIBs 高效增殖

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晚熟荔浦芋新品种桂芋2号的选育 被引量：8

3

作者 董伟清 闭志强 +8 位作者 江文 韦绍龙 唐军 何芳练 覃柳燕 高美萍 颜梅新 陈丽娟 蔡炳华 《长江蔬菜》 2016年第24期32-33,共2页

桂芋2号是从桂芋1号大田组培苗后代中筛选的优良芽变单株,经离体快繁、种植观察、筛选培育而成的槟榔芋新品种。全生育期240~260 d,晚熟,株高130~170 cm,叶片互生、阔大,长45~65 cm,宽35~50 cm;母芋表皮有灰褐色鳞片,上部略尖下部钝圆... 桂芋2号是从桂芋1号大田组培苗后代中筛选的优良芽变单株,经离体快繁、种植观察、筛选培育而成的槟榔芋新品种。全生育期240~260 d,晚熟,株高130~170 cm,叶片互生、阔大,长45~65 cm,宽35~50 cm;母芋表皮有灰褐色鳞片,上部略尖下部钝圆如卵形或椭圆形,切面有明显的槟榔紫色花纹,单芋质量1.2~2.5 kg,营养丰富,淀粉含量高,易煮熟,口感细腻,香味浓郁,菜粮兼宜;对芋疫病和软腐病的抗性强于桂芋1号,每667 m^2产量3 200 kg左右,适于广西境内芋头产区特别是桂林市、南宁市、贺州市等地区种植。 展开更多

关键词 荔浦芋 芋疫病 软腐病 离体快繁 培苗 芽变 修仁镇 金陵镇 广西农业科学院 荔浦县

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荸荠品种桂蹄2号对秆枯病和枯萎病的田间抗性比较试验 被引量：8

4

作者 江文 陈丽娟 +10 位作者 蔡炳华 何芳练 高美萍 董伟清 欧昆鹏 桂杰 韦绍龙 闭志强 李建存 何小兰 张驰 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1029-1033,共5页

【目的】探讨桂蹄2号对荸荠秆枯病和枯萎病的田间抗性,为荸荠生产提供科学指导。【方法】以广西荸荠主产区平乐县、荔浦县、贺州市平桂区为试验点,各试验点分别选择土壤肥力程度高、中、低3种类型田块,每种类型田块分别种植桂蹄2号和当... 【目的】探讨桂蹄2号对荸荠秆枯病和枯萎病的田间抗性,为荸荠生产提供科学指导。【方法】以广西荸荠主产区平乐县、荔浦县、贺州市平桂区为试验点,各试验点分别选择土壤肥力程度高、中、低3种类型田块,每种类型田块分别种植桂蹄2号和当地农家品种,在荸荠封行期和膨大期进行荸荠秆枯病和枯萎病病害调查,并计算病情指数。【结果】在荸荠封行期,3个试验点桂蹄2号均未发生秆枯病,对照病情指数为7.57-16.87;枯萎病桂蹄2号病情指数为0-7.50,对照病情指数为3.58-14.23。在荸荠膨大期,3个试验点桂蹄2号秆枯病病情指数为8.42-22.58,枯萎病病情指数为5.16-20.26;差异显著性分析显示,荸荠秆枯病和枯萎病病情指数在平乐县试验点和荔浦县试验点与对照达极显著差异水平（P〈0.01）,在贺州市平桂区试验点与对照达显著差异水平（P〈0.05）。桂蹄2号在不同土壤肥力的抗病性表现为：高土壤肥力〉中等土壤肥力〉低土壤肥力。【结论】桂蹄2号较当地农家品种抗荸荠秆枯病和枯萎病,可在广西各地推广种植。 展开更多

关键词 荸荠 荸荠秆枯病 荸荠枯萎病 病情指数

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芋淀粉分支酶(SBE)基因的鉴定、生物信息学及表达分析 被引量：5

5

作者 董伟清 刘莉莉 +2 位作者 蒋慧萍 邱祖杨 何芳练 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第7期1373-1382,共10页

淀粉分支酶(starch branching enzyme,SBE)在支链淀粉生物合成中发挥关键作用,直接影响淀粉的含量和结构。芋(Colocasia esculenta)是一种主要的块茎类作物,在世界上热带和亚热带地区广泛栽培。目前,SBE在芋中的研究很少,对SBE基因在芋... 淀粉分支酶(starch branching enzyme,SBE)在支链淀粉生物合成中发挥关键作用,直接影响淀粉的含量和结构。芋(Colocasia esculenta)是一种主要的块茎类作物,在世界上热带和亚热带地区广泛栽培。目前,SBE在芋中的研究很少,对SBE基因在芋中的数量、分子结构特征和表达模式还不清楚。本研究首次对芋SBE基因进行了全面分析,鉴定了3个SBE基因(CeSBE1、CeSBE2和CeSBE3)。CeSBE1、CeSBE2和CeSBE3蛋白氨基酸数量分别为828、845和598,分子质量分别为92956.71、95625.13、69169.16 Da,等电点分别为5.22、5.41和7.36。系统进化分析显示3个CeSBE蛋白分别在3个不同的亚群。基因结构分析显示,CeSBE1、CeSBE2和CeSBE3外显子数量分别为16、22、10;保守结构域分析表明,CeSBE1和CeSBE2均具有alpha-amylase_C和alpha-amylase结构域及7个motif,而CeSBE3具有alpha-amylase和CBM_48结构域及3个motif。CeSBE基因启动子区域顺式作用元件分析表明,共预测到55个顺式作用元件,其中29个具有功能注释,涉及光响应、激素响应、植物生长发育及环境压力等相关元件。在不同组织中,3个CeSBE基因均能在所有组织中表达,其中CeSBE2在球茎和叶片显著表达(P<0.05);在球茎不同发育阶段中,CeSBE2在所有的发育阶段均有较高的表达量,呈现先升高后降低的表达趋势,在球茎发育120 d的表达量达到峰值。球茎不同发育阶段总淀粉和支链淀粉含量增加与CeSBE2表达量趋势一致,说明CeSBE2可能是芋支链淀粉生物合成的关键基因。本研究结果可为芋的产量、品质和营养性状的遗传改良提供基础。 展开更多

关键词 芋 淀粉分支酶 生物信息学分析 表达分析

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芋全长转录组测序分析及淀粉生物合成相关基因挖掘 被引量：6

6

作者 何芳练 刘莉莉 +3 位作者 蒋慧萍 韦绍龙 邱祖杨 董伟清 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第6期1252-1260,共9页

【目的】获取芋(Colocasia esculenta)全长转录本序列和结构信息,并挖掘淀粉生物合成相关基因和转录本的结构信息,为后续阐明芋淀粉生物合成的分子机制及深入利用芋基因资源提供科学依据。【方法】以荔浦芋1号为试材,采集其3月龄植株的... 【目的】获取芋(Colocasia esculenta)全长转录本序列和结构信息,并挖掘淀粉生物合成相关基因和转录本的结构信息,为后续阐明芋淀粉生物合成的分子机制及深入利用芋基因资源提供科学依据。【方法】以荔浦芋1号为试材,采集其3月龄植株的不同组织(叶片、叶柄、球茎、匍匐茎和根)开展混合样三代全长转录组测序,对获得的转录本进行功能注释,通过生物信息学方法分析转录本可变剪接(AS)、可变多聚腺苷酸化(APA)、长链非编码RNA(lncRNA)、转录因子(TF)和简单重复序列(SSR)等的结构信息,通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)注释获得芋淀粉生物合成相关的基因和转录本,并对其进行AS和APA分析。【结果】通过对芋叶片、叶柄、球茎、匍匐茎和根混合样开展三代全长转录组测序,共获得全长转录本序列38043条;通过与参考基因组进行比对,鉴定出新转录本31058条,其中28785条获得功能注释;通过对转录本结构分析,共鉴定出9360个AS事件、6436个基因存在poly(A)位点、25081个SSR位点、304个lncRNA、1911个融合转录本和1608个TF。通过KEGG注释获得芋淀粉生物合成相关基因14个和转录本60条;对获得的转录本进行AS和APA分析发现,6个基因发生了AS事件,包括内含子保留(IR)、5′端可变剪接(A5SS)、3′端可变剪接(A3SS)、外显子跳跃(ES)和互斥可变外显子(MEE)5种类型,有10个基因存在poly(A)位点,其中7个基因存在2个及2个以上poly(A)位点。【结论】通过三代全长转录组测序分析获得芋全长转录本序列和结构信息,挖掘到芋淀粉生物合成相关基因14个,转录本60条,可作为后续阐明芋淀粉生物合成分子机制及深入利用芋基因资源的科学依据。 展开更多

关键词 芋 全长转录组 功能注释 结构分析 淀粉生物合成

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广西莲藕产业发展现状及发展趋势 被引量：6

7

作者 张尚文 吴龙墩 +5 位作者 蒋慧萍 颜梅新 高美萍 何芳练 董伟清 江文 《长江蔬菜》 2017年第18期174-177,共4页

从地理、气候、土壤等自然条件分析广西种植莲藕的优势及不足,通过广西不同产区莲藕产业规模化、产业化、品牌化、生产模式及效益现状进行深入调查,分析影响产业发展的主要问题,展望产业发展未来。

关键词 莲藕产业 现状 发展趋势

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桂东南地区芋疫霉的交配型研究 被引量：6

8

作者 陆叶 陆志翔 +3 位作者 何芳练 袁高庆 陈保善 廖咏梅 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期285-290,共6页

芋疫病是广西芋头上的重要病害。本研究从桂东南地区部分乡镇的芋头产区采集并分离获得12个芋疫霉菌株,通过与辣椒疫霉A1交配型HD-3菌株和A2交配型S-5菌株对峙培养来测定其交配型,并以ITS1/ITS4通用引物对基因组DNA进行PCR扩增,得到各... 芋疫病是广西芋头上的重要病害。本研究从桂东南地区部分乡镇的芋头产区采集并分离获得12个芋疫霉菌株,通过与辣椒疫霉A1交配型HD-3菌株和A2交配型S-5菌株对峙培养来测定其交配型,并以ITS1/ITS4通用引物对基因组DNA进行PCR扩增,得到各菌株的ITS序列。结果表明,通过对ITS序列的Blast比对,发现所有菌株的ITS序列与GenBank中登录的芋疫霉（Phytophthora coloc asiae）不同分离物序列同源性达97%~100%,证明所采样本均为芋疫霉。从桂东南地区采集到的12个芋疫霉菌株均为A2交配型,未发现其它交配型菌株。 展开更多

关键词 桂东南 芋疫霉 交配型

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干旱胁迫对芋球茎淀粉和蔗糖代谢通路相关基因表达的影响

9

作者 董伟清 刘莉莉 +1 位作者 邱祖杨 何芳练 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期738-747,共10页

[目的]探究芋球茎响应干旱胁迫的分子机制,特别是干旱胁迫对淀粉和蔗糖代谢通路相关基因表达的影响,为耐旱品种选育提供依据。[方法]以荔浦芋1号为试验材料,对干旱胁迫下的芋球茎进行转录组测序,对获得的差异表达基因进行GO和KEGG富集分... [目的]探究芋球茎响应干旱胁迫的分子机制,特别是干旱胁迫对淀粉和蔗糖代谢通路相关基因表达的影响,为耐旱品种选育提供依据。[方法]以荔浦芋1号为试验材料,对干旱胁迫下的芋球茎进行转录组测序,对获得的差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,进一步筛选与淀粉和蔗糖代谢通路相关的酶基因,并分析这些酶基因在干旱胁迫下的表达模式。[结果]芋球茎在干旱胁迫下筛选到差异表达基因1983个,其中上调表达基因373个,下调表达基因1610个。GO富集分析显示,差异表达基因在生物过程富集最多的是细胞过程和代谢过程,在细胞组分富集最多的是细胞解剖实体,在分子功能富集最多的催化活性和结合。KEGG富集分析显示,富集最多的通路分别是代谢通路、氮素代谢通路、抗坏血酸和醛酸代谢通路。对淀粉和蔗糖代谢通路的差异表达基因进行统计,共筛选到26个差异表达基因,涉及11种酶,其中上调表达基因5个,下调表达基因21个。在干旱胁迫下,淀粉合成酶、己糖激酶、果糖激酶、UTP-葡萄糖-1-磷酸盐尿苷酸转移酶、α-淀粉酶、内切葡聚糖酶、β-葡萄糖苷酶和β-呋喃果糖苷酶的基因下调表达;UDP-葡萄糖磷酸水解酶和海藻-6-磷酸合成/磷酸酶的基因上调表达;蔗糖合成酶和β-呋喃果糖苷酶的基因既有上调表达,也有下调表达。[结论]淀粉和蔗糖代谢通路相关基因的表达受到干旱胁迫的影响。调控淀粉代谢和海藻糖生物合成相关基因下调表达,而调控蔗糖代谢相关基因既有上调表达,也有下调表达。 展开更多

关键词 芋 干旱胁迫 表达分析 淀粉 蔗糖

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贺州香芋发展现状与思考 被引量：6

10

作者 何青石 赖松新 +2 位作者 董伟清 江文 何芳练 《长江蔬菜》 2019年第16期80-82,共3页

主要分析了贺州香芋产业的发展现状、存在问题,并根据地方特色提出建立香芋新品种种苗推广体系、加强科技培训、以政府为引导建立线上线下销售体系、加强贺州香芋品牌建设等发展对策。

关键词 贺州香芋 现状 品牌 思考

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广西槟榔芋水田轻简化高效栽培技术 被引量：7

11

作者 董伟清 何芳练 +4 位作者 韦绍龙 蒋慧萍 邱祖杨 何青石 赖松新 《中国蔬菜》 北大核心 2019年第4期103-104,共2页

广西槟榔芋产区综合应用全田配方施肥和高畦覆膜免培土技术,减少了后期除草、追肥和培土3个环节,较常规栽培每667 m^2节约人工成本500元,增产10%以上,且槟榔芋品质优异,已成为广西槟榔芋的主要栽培模式。槟榔芋属天南星科芋属魁芋类,芋... 广西槟榔芋产区综合应用全田配方施肥和高畦覆膜免培土技术,减少了后期除草、追肥和培土3个环节,较常规栽培每667 m^2节约人工成本500元,增产10%以上,且槟榔芋品质优异,已成为广西槟榔芋的主要栽培模式。槟榔芋属天南星科芋属魁芋类,芋肉具有紫色槟榔花纹,富含淀粉、维生素和氨基酸等。广西是槟榔芋的主产区之一,以盛产“荔浦芋”而闻名,槟榔芋常年种植面积6 667 hm2(10万亩),其中仅荔浦市种植面积就达3 333 hm2(5万亩),年产量8.3万t。槟榔芋常规栽培中需进行多次培土、追肥、除草等农事操作,劳动力投入大. 展开更多

关键词 槟榔芋 高效栽培技术 轻简化

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广西芋头产业现状与发展对策 被引量：3

12

作者 何芳练 刘莉莉 +4 位作者 邱祖杨 邓金花 蒋生发 王霏峰 董伟清 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2023年第9期151-156,共6页

广西是我国芋头的主产区之一。介绍了广西芋头种植面积扩大、新品种推广迅速、种苗种芋实现规模化繁育、栽培技术逐渐完善、产业链逐渐形成、品牌意识增强、政府重视程度提高、芋头科研取得较大进展等发展现状,指出了存在的科技投入不... 广西是我国芋头的主产区之一。介绍了广西芋头种植面积扩大、新品种推广迅速、种苗种芋实现规模化繁育、栽培技术逐渐完善、产业链逐渐形成、品牌意识增强、政府重视程度提高、芋头科研取得较大进展等发展现状,指出了存在的科技投入不足、病虫害防治滞后、产业机械化程度低、缺乏精深加工产品等问题。同时从增加芋头产业的科技投入、健全和完善科技服务体系、加快芋头产业机械化研究、加强芋头精深加工产品研发等方面提出了对策和建议,可为更好地开发和利用广西芋头资源以及芋头产业的可持续发展提供参考。 展开更多

关键词 芋头 广西 产业现状 问题 对策建议

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荸荠淀粉合成酶AGPase的基因克隆及表达分析 被引量：5

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作者 董伟清 江文 +6 位作者 何芳练 邱祖杨 蒋慧萍 黄诗宇 刘莉莉 何春红 杨干德 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期956-963,共8页

【目的】克隆荸荠ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因EdAPS1的cDNA序列,并分析其序列特征及其在荸荠不同组织和球茎发育过程中的表达情况,为研究荸荠淀粉生物合成机制提供理论依据。【方法】通过RT-PCR技术从荸荠球茎中克隆EdAPS1... 【目的】克隆荸荠ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因EdAPS1的cDNA序列,并分析其序列特征及其在荸荠不同组织和球茎发育过程中的表达情况,为研究荸荠淀粉生物合成机制提供理论依据。【方法】通过RT-PCR技术从荸荠球茎中克隆EdAPS1基因的cDNA序列,采用生物信息学方法对其序列和所编码的蛋白进行预测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测EdAPS1基因在荸荠不同组织和球茎发育过程中的表达情况。【结果】克隆获得的EdAPS1基因cDNA序列全长1716 bp,包含1个1521 bp开放阅读框(ORF),编码506个氨基酸。EdAPS1蛋白分子式为C_(2469)H_(3896)N_(672)O_(746)S_(23),相对分子量为55.67 kD,等电点为5.98,具有NTPtransferase和PbH1结构域。同源性和系统进化树分析结果表明,EdAPS1蛋白与不同植物相应蛋白的同源性在68.80%~86.91%,其中与油莎草相应蛋白(ALL29329.1)的亲缘关系最近。荧光定量PCR分析结果表明,EdAPS1基因在荸荠不同组织中均有表达,其中在球茎的表达量最高,与在其他组织的表达量差异显著(P<0.05,下同),尤其在球茎发育后期的表达量更高,且显著高于球茎其他发育时期。【结论】从荸荠中成功克隆了EdAPS1基因,可为后续阐明荸荠淀粉生物合成机制及培育高淀粉荸荠品种提供参考依据。 展开更多

关键词 荸荠 淀粉合成酶 基因克隆 表达分析

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芋淀粉合成酶基因家族的鉴定、生物信息学及表达分析

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作者 何芳练 刘莉莉 +1 位作者 邱祖杨 董伟清 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期1-13,共13页

【目的】鉴定芋淀粉合成酶(CeSS)基因家族,并对其生物信息学及表达模式进行分析,为芋产量、品质和营养性状的遗传改良提供参考。【方法】使用HMMER 3.12b软件以SS基因家族典型保守结构域Glyco_transf_5为模型,鉴定芋基因组中SS基因家族... 【目的】鉴定芋淀粉合成酶(CeSS)基因家族,并对其生物信息学及表达模式进行分析,为芋产量、品质和营养性状的遗传改良提供参考。【方法】使用HMMER 3.12b软件以SS基因家族典型保守结构域Glyco_transf_5为模型,鉴定芋基因组中SS基因家族信息,利用生物信息学软件分析其分子结构特征、系统发育关系及顺式作用元件,采用转录组和实时荧光定量PCR技术检测其在正常生长发育条件和干旱胁迫下的转录表达。【结果】在芋基因组中鉴定了6个SS基因(CeSS1、CeSS2、CeSS3⁃1、CeSS3⁃2、CeSS4和CeGBSS1)。6个预测的芋SS基因长度为4980~61347 bp,对应的CDS长度为1275~2895 bp,编码蛋白的氨基酸残基数量为424~964个,分子质量为48067.43~109391.75 Da,理论等电点为5.18~6.11。系统进化分析显示6个芋SS蛋白分布在5个亚家族。基因结构分析显示,6个CeSS基因外显子数量为7~15个。在6个CeSS蛋白中鉴定出10个保守motif,其中7个获得注释。在保守结构域上,CeSS1、CeSS2、CeSS4和CeGBSS1蛋白均含有淀粉合成酶催化结构域(motif 2和motif 5)和糖基转移酶群组1(motif 1和motif 3),而CeSS3⁃1蛋白含有motif 1、motif 3和motif 5,CeSS3⁃2蛋白只含有motif 2。基因启动子区域顺式作用元件分析表明,共预测到73个顺式作用元件,其中36个具有功能注释,除了具有核心元件TATA⁃box和CAAT⁃box外,还涉及大量与光响应、激素响应、胁迫响应及生长发育等相关元件。在正常生长发育条件下,6个CeSS基因在叶片和球茎的整体表达量均高于叶柄和根,其中CeGBSS1基因的表达量远高于其他基因,且在叶片和球茎的相对表达量极显著高于叶柄和根(P<0.01,下同);在球茎不同发育阶段,CeGBSS1基因在所有的发育阶段均有较高表达量,且在30~90 d发育过程中呈上升趋势,其余基因的表达量较低。在干旱胁迫下,6个CeSS基因在叶片的相对表达量较对照组显著(P<0.05)或极显著下� 展开更多

关键词 芋 淀粉合成酶 生物信息学分析 表达分析

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芋ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)基因家族的克隆、生物信息学及表达分析 被引量：5

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作者 何芳练 刘莉莉 +3 位作者 蒋慧萍 邱祖杨 黄诗宇 董伟清 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2022年第8期1554-1564,共11页

芋(Colocasia esculenta)为天南星科芋属成员,在世界范围内广泛种植,其球茎主要贮藏物质为淀粉。ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)是淀粉合成的第一个关键酶和限速酶,在植物淀粉合成中发挥关键作用,但目前关于芋AGPase基因家族的分子结构... 芋(Colocasia esculenta)为天南星科芋属成员,在世界范围内广泛种植,其球茎主要贮藏物质为淀粉。ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)是淀粉合成的第一个关键酶和限速酶,在植物淀粉合成中发挥关键作用,但目前关于芋AGPase基因家族的分子结构特征和表达模式还不清楚。本研究以芋新品种‘荔浦芋1号’为试材,从全长转录组注释信息中筛选到6个AGPase基因家族成员,利用RT-PCR技术克隆了6个基因的编码区,利用生物信息学对其理化性质、进化关系和保守motif进行分析;同时利用转录组学和荧光定量RT-PCR技术对6个基因在不同组织和球茎不同发育阶段的表达模式进行分析。结果表明:克隆获得6个芋AGPase基因编码区的cDNA序列,序列长度为1398~2028bp,编码的蛋白大小为350~543 aa,其中4个基因(CeAGPL1~CeAGPL4)编码AGPase的大亚基,2个基因(CeAGPS1,CeAGPS2)编码AGPase的小亚基。系统进化分析显示,所有的AGPase分成了大亚基和小亚基2个群组,4个大亚基分在了大亚基组,2个小亚基分在了小亚基组。CeAGP家族蛋白分子质量范围为38753.22~59743.05kDa,等电点范围为5.64~8.82,亚细胞定位为叶绿体、淀粉体和细胞质等。蛋白的保守motif分析发现,CeAGP家族蛋白共预测到11个保守motif,6个motif功能注释为NTP_transferase,除CeAGPS2外,另外5个CeAGP蛋白均包含11个motif。在不同组织中,6个CeAGP基因均能在所有组织中表达,其中CeAGPL3和CeAGPS1基因在叶片和叶柄中高表达,CeAGPL1和CeAGPS1基因在球茎中高表达,6个CeAGP基因在根的表达量均较低。在球茎不同发育阶段中,CeAGPL1和CeAGPS1高表达且均表现先升高后降低的趋势,2个基因分别在4月龄和5月龄阶段的表达量最高。该研究结果为后续阐明芋淀粉合成的分子机制提供依据。 展开更多

关键词 芋 AGPASE 基因克隆 表达分析

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广西南宁市木薯褐斑病的发生调查及其病原鉴定 被引量：4

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作者 卢云妙 覃宇臻 +4 位作者 廖士顺 刘丁广 何芳练 廖咏梅 陈保善 《广西植保》 2010年第3期5-8,共4页

经2009年7-11月对南宁市武鸣县太平镇、宁武镇等地的木薯褐斑病进行调查,发现木薯褐斑病在南宁市各木薯种植区普遍发生,9、10、11月病害发生较重,最高病叶率达50.7%,病情指数为14.1;通过柯赫氏法则验证、病原菌的形态特征观察及其rDNA-... 经2009年7-11月对南宁市武鸣县太平镇、宁武镇等地的木薯褐斑病进行调查,发现木薯褐斑病在南宁市各木薯种植区普遍发生,9、10、11月病害发生较重,最高病叶率达50.7%,病情指数为14.1;通过柯赫氏法则验证、病原菌的形态特征观察及其rDNA-ITS序列测定,鉴定出引起木薯褐斑病的病原菌为木薯钉孢[Passalora henningsii （Allesch.） R.F.Castaneda ＆ U. Braun]。 展开更多

关键词 木薯褐斑病 调查 病原鉴定

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不同淀粉型荸荠品种比较试验 被引量：4

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作者 唐和良 何芳练 +4 位作者 廖春勇 莫登启 高美萍 陈丽娟 江文 《长江蔬菜》 2016年第16期22-23,共2页

为了解决广西钟山县粉蹄单产不高问题,引进广西农科院生物技术研究所培育的桂粉蹄1号新品种、平乐主栽地方品种,与本地主栽品种进行比较试验,对其生育特性、适应性和产量等进行研究。试验结果表明,桂粉蹄1号植株生长粗壮、抗倒伏、产量... 为了解决广西钟山县粉蹄单产不高问题,引进广西农科院生物技术研究所培育的桂粉蹄1号新品种、平乐主栽地方品种,与本地主栽品种进行比较试验,对其生育特性、适应性和产量等进行研究。试验结果表明,桂粉蹄1号植株生长粗壮、抗倒伏、产量高、单果质量较大,在钟山种植适应性强,是适合本地种植的粉马蹄新品种。 展开更多

关键词 淀粉型 品种比较试验 桂粉 生育特性 广西农科院 广西钟山 生物技术研究所 钟山县 单果质量 平乐

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晚熟芋头新品种桂芋2号栽培技术 被引量：4

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作者 闭志强 董伟清 +10 位作者 唐军 江文 陈丽娟 何芳练 高美萍 韦绍龙 欧昆鹏 蔡炳华 苏宾 桂杰 覃柳燕 《长江蔬菜》 2015年第22期129-131,共3页

桂芋2号是在桂芋1号体细胞突变产生的组培变异株中筛选出的优变异单株,通过茎尖组织培养扩繁、多年大田栽培观察、反复优选、组培提纯复壮培育而成。在水田和旱地（有灌溉设施）种植表现优良,水田产量2 500-3 800 kg/667 m^2、旱地产量2... 桂芋2号是在桂芋1号体细胞突变产生的组培变异株中筛选出的优变异单株,通过茎尖组织培养扩繁、多年大田栽培观察、反复优选、组培提纯复壮培育而成。在水田和旱地（有灌溉设施）种植表现优良,水田产量2 500-3 800 kg/667 m^2、旱地产量2 200-3 000 kg/667 m^2,其中母芋占产量的80%左右。 展开更多

关键词 大田栽培 体细胞突变 异株 种芋 试验结果 茎尖组织培养 提纯复壮 单株 阿维菌素 水肥一体化

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桂芋2号荔浦芋新品种主要病虫害综合防控技术 被引量：4

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作者 何芳练 邱祖杨 +3 位作者 蒋慧萍 江文 李小泉 董伟清 《长江蔬菜》 2018年第12期75-77,共3页

荔浦芋是最优秀的槟榔芋品种之一,因产于荔浦而得名,至今已有340多a的历史。基于独特的自然条件和土壤优势,以及荔浦农人数百年的智慧结晶形成的整套独特栽培管理方法,荔浦产出的荔浦芋因具有香、酥、粉、糯、甜、软、鲜的特殊风味而久... 荔浦芋是最优秀的槟榔芋品种之一,因产于荔浦而得名,至今已有340多a的历史。基于独特的自然条件和土壤优势,以及荔浦农人数百年的智慧结晶形成的整套独特栽培管理方法,荔浦产出的荔浦芋因具有香、酥、粉、糯、甜、软、鲜的特殊风味而久负盛名,在历史上一度成为皇室贡品,荔浦县因此被冠以＂荔浦芋之乡＂美称,先后获得广西首个产地证明商标、农业部地理标志、中国百强农产品区域公用品牌及入选2017全国名特优新农产品目录等荣誉。 展开更多

关键词 荔浦芋 综合防控技术 新品种 病虫害 栽培管理 特殊风味 地理标志 产品目录

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芋不同组织淀粉生物合成和代谢相关基因的差异表达分析

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作者 何芳练 刘莉莉 +1 位作者 邱祖杨 董伟清 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2978-2988,共11页

【目的】开展芋(Colocasia esculenta)不同组织的转录组试验,为芋基因功能和代谢调控网络的分子机制研究提供基因资源。【方法】采集播种90 d的荔浦芋1号芋球茎、叶片、叶柄和根进行生理检测和转录组测序,对不同组织的差异表达基因(DEGs... 【目的】开展芋(Colocasia esculenta)不同组织的转录组试验,为芋基因功能和代谢调控网络的分子机制研究提供基因资源。【方法】采集播种90 d的荔浦芋1号芋球茎、叶片、叶柄和根进行生理检测和转录组测序,对不同组织的差异表达基因(DEGs)进行GO和KEGG功能富集分析,并对淀粉生物合成和代谢相关基因进行发掘和表达模式分析。【结果】芋球茎的淀粉和可溶性糖含量分别为134.85和23.92 mg/g,在4种组织中含量最高。转录组测序共获得85.41 Gb Clean data,与参考基因组比对效率为90.30%~92.56%,共33828个基因获得功能注释。不同组织间DEGs数量为5625~10562个。球茎与根、叶片和叶柄的比较组中,在生物过程中分别富集到与淀粉生物合成和代谢相关的GO功能2、5和5个;KEGG富集分析显示,在淀粉和蔗糖代谢途径分别富集到146、161和126个DEGs。通过富集分析发掘涉及淀粉生物合成和代谢相关DEGs共82个,其在4种组织中呈不同表达模式,其中ADP-葡萄糖焦磷酸化酶基因(AGPase基因)(Taro_004018和Taro_026553),颗粒结合淀粉合成酶基因(GBSS基因)(Taro_033806),以及淀粉分支酶基因(SBE基因)(Taro_009230)等基因在球茎的表达显著高于其他组织(P<0.05)。【结论】GO和KEGG功能富集分析显示芋4种组织在代谢功能方面有差异,球茎在淀粉含量及淀粉生物合成关键酶基因的表达高于其他组织,是淀粉的储藏器官。 展开更多

关键词 芋 转录组 淀粉生物合成 代谢 表达模式

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