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基于微流控芯片的流式线虫机器学习图像识别系统
被引量:
3
1
作者
杨光
何
玲
宇
+6 位作者
高林耿
何
希文
李栋基
韩超
王疏影
吴佳颖
陈翔
《功能材料与器件学报》
CAS
2019年第4期286-292,共7页
秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,以下简称线虫)作为一种体内模式生物被广泛应用于药物筛选、神经生物学等研究中。生理指标(体长等)是线虫研究的重要部分,利用图像识别进行线虫形态特征研究相比传统方法具有精度高的优点。近年来...
秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,以下简称线虫)作为一种体内模式生物被广泛应用于药物筛选、神经生物学等研究中。生理指标(体长等)是线虫研究的重要部分,利用图像识别进行线虫形态特征研究相比传统方法具有精度高的优点。近年来微流控芯片由于其特征尺度与线虫大小尺度匹配、易于自动化等优点,被越来越多地应用在细胞与微米尺度生物的研究中。文章介绍了一种基于微流控芯片的流式线虫图像识别系统,该系统利用设计的微流控芯片,实现单线虫快速流过检测通道,通过搭建的基于机器学习的机器视觉模块,在流动过程中对线虫形态特征进行快速分类,分类结果可作为后续分选操作的依据。
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关键词
微流控芯片
秀丽隐杆线虫
计算机视觉
自动化平台
原文传递
图像引导的微流控单细胞打印系统
被引量:
1
2
作者
陈
宇
赖文天
+2 位作者
何
玲
宇
赵飞
陈翔
《微纳电子技术》
CAS
北大核心
2021年第8期708-714,共7页
传统流式细胞分离方式需要较大的细胞起始浓度,采用机械臂的单细胞分离方式成本高昂,使单细胞技术推广受限。设计并制作了一种集成阀门和动态流阻捕获结构的微流控芯片,可以进行单细胞捕获、鉴定及释放的循环过程;搭建了集成流动控制模...
传统流式细胞分离方式需要较大的细胞起始浓度,采用机械臂的单细胞分离方式成本高昂,使单细胞技术推广受限。设计并制作了一种集成阀门和动态流阻捕获结构的微流控芯片,可以进行单细胞捕获、鉴定及释放的循环过程;搭建了集成流动控制模块、双光路荧光检测的光学模块和运动收集模块的外围控制系统;实现了图像引导的细胞捕获、特定细胞检测和释放的自动化过程,并通过荧光微球和svf细胞验证了系统可行性。其细胞打印速度为1个/s,细胞活性可达95%以上。该打印系统将有助于构建自动化、操作简便且集多种功能于一体的单细胞分析芯片。
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关键词
微流控
图像引导
单细胞捕获
单细胞打印
荧光检测
下载PDF
职称材料
基于微孔板的自动化三维细胞打印及加样系统
被引量:
1
3
作者
王疏影
张楚
+2 位作者
何
玲
宇
韩超
陈翔
《功能材料与器件学报》
CAS
2020年第6期400-406,共7页
细胞体外三维培养是药物筛选的重要环节,目前研究多采用微孔板作为细胞生长环境。而常规的兼容微孔板的开放式微流控体系使用实体模具生成三维结构并且手动移液,存在实验周期长、效率低的缺点。文章提出了一种基于微孔板的自动化三维细...
细胞体外三维培养是药物筛选的重要环节,目前研究多采用微孔板作为细胞生长环境。而常规的兼容微孔板的开放式微流控体系使用实体模具生成三维结构并且手动移液,存在实验周期长、效率低的缺点。文章提出了一种基于微孔板的自动化三维细胞打印及加样系统,该系统集成了数字光处理(Digital Light Processing,DLP)生物3D打印技术和全自动液体工作站。通过甲级丙烯酰化明胶(GelMA)载细胞打印,证明该系统精度可达100μm且单孔实验时间在15分钟之内,利用该系统构建了肿瘤团簇模型以及血管内皮细胞和肿瘤细胞的共培养模型。
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关键词
三维培养
微孔板
开放式微流控
水凝胶
原文传递
一种新型单细胞微流控捕获芯片的制作及系统搭建
被引量:
1
4
作者
何
玲
宇
王疏影
+2 位作者
赵飞
龙妍婷
陈翔
《功能材料与器件学报》
CAS
2020年第6期412-418,共7页
本文基于捕获检测释放的机制,采用集成片上阀门的三层微流控芯片工艺,设计并制作了一种用于捕获和释放单细胞的芯片。利用COMSOL仿真优化芯片结构来增大细胞被捕获率。比较了芯片阀门在不同聚二甲基硅氧烷(Polydimethylsiloxane,PDMS)...
本文基于捕获检测释放的机制,采用集成片上阀门的三层微流控芯片工艺,设计并制作了一种用于捕获和释放单细胞的芯片。利用COMSOL仿真优化芯片结构来增大细胞被捕获率。比较了芯片阀门在不同聚二甲基硅氧烷(Polydimethylsiloxane,PDMS)制作比例、不同进样压力时的状态以及长时间工作的性能,测试了芯片捕获与释放机制的有效性,能实现捕获、检测及释放过程。芯片的制作工艺简单,成品率可达95%以上,这种先捕获检测后再释放的方式为单细胞分离收集提供了新的技术途径。
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关键词
微流控
片上阀门
三层芯片
单细胞
原文传递
题名
基于微流控芯片的流式线虫机器学习图像识别系统
被引量:
3
1
作者
杨光
何
玲
宇
高林耿
何
希文
李栋基
韩超
王疏影
吴佳颖
陈翔
机构
上海交通大学微纳电子学系
上海交通大学医学院
出处
《功能材料与器件学报》
CAS
2019年第4期286-292,共7页
基金
上海市科委基础重大研发计划资助项目(17JC1401001).
文摘
秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,以下简称线虫)作为一种体内模式生物被广泛应用于药物筛选、神经生物学等研究中。生理指标(体长等)是线虫研究的重要部分,利用图像识别进行线虫形态特征研究相比传统方法具有精度高的优点。近年来微流控芯片由于其特征尺度与线虫大小尺度匹配、易于自动化等优点,被越来越多地应用在细胞与微米尺度生物的研究中。文章介绍了一种基于微流控芯片的流式线虫图像识别系统,该系统利用设计的微流控芯片,实现单线虫快速流过检测通道,通过搭建的基于机器学习的机器视觉模块,在流动过程中对线虫形态特征进行快速分类,分类结果可作为后续分选操作的依据。
关键词
微流控芯片
秀丽隐杆线虫
计算机视觉
自动化平台
Keywords
Microfluidic Chip
Caenorhabditis elegans
Computer vision
Automation platform
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
TN492 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
原文传递
题名
图像引导的微流控单细胞打印系统
被引量:
1
2
作者
陈
宇
赖文天
何
玲
宇
赵飞
陈翔
机构
湖北第二师范学院计算机学院
上海交通大学电子信息与电气工程学院微米/纳米加工技术国家级重点实验室
出处
《微纳电子技术》
CAS
北大核心
2021年第8期708-714,共7页
基金
湖北省自然科学基金资助项目(2016CFC724)
上海市科委基础重大研发计划资助项目(17JC1401001)。
文摘
传统流式细胞分离方式需要较大的细胞起始浓度,采用机械臂的单细胞分离方式成本高昂,使单细胞技术推广受限。设计并制作了一种集成阀门和动态流阻捕获结构的微流控芯片,可以进行单细胞捕获、鉴定及释放的循环过程;搭建了集成流动控制模块、双光路荧光检测的光学模块和运动收集模块的外围控制系统;实现了图像引导的细胞捕获、特定细胞检测和释放的自动化过程,并通过荧光微球和svf细胞验证了系统可行性。其细胞打印速度为1个/s,细胞活性可达95%以上。该打印系统将有助于构建自动化、操作简便且集多种功能于一体的单细胞分析芯片。
关键词
微流控
图像引导
单细胞捕获
单细胞打印
荧光检测
Keywords
microfluidics
image guide
single cell capture
single cell print
fluorescence detetion
分类号
O35 [理学—流体力学]
下载PDF
职称材料
题名
基于微孔板的自动化三维细胞打印及加样系统
被引量:
1
3
作者
王疏影
张楚
何
玲
宇
韩超
陈翔
机构
上海交通大学微纳电子学系
出处
《功能材料与器件学报》
CAS
2020年第6期400-406,共7页
基金
上海市科委基础重大研发计划资助项目(17JC1401001).
文摘
细胞体外三维培养是药物筛选的重要环节,目前研究多采用微孔板作为细胞生长环境。而常规的兼容微孔板的开放式微流控体系使用实体模具生成三维结构并且手动移液,存在实验周期长、效率低的缺点。文章提出了一种基于微孔板的自动化三维细胞打印及加样系统,该系统集成了数字光处理(Digital Light Processing,DLP)生物3D打印技术和全自动液体工作站。通过甲级丙烯酰化明胶(GelMA)载细胞打印,证明该系统精度可达100μm且单孔实验时间在15分钟之内,利用该系统构建了肿瘤团簇模型以及血管内皮细胞和肿瘤细胞的共培养模型。
关键词
三维培养
微孔板
开放式微流控
水凝胶
Keywords
Three-dimensional culture
Microwell plate
Open microfluidic
Hydrogel
分类号
Q813.11 [生物学—生物工程]
R318 [医药卫生—生物医学工程]
原文传递
题名
一种新型单细胞微流控捕获芯片的制作及系统搭建
被引量:
1
4
作者
何
玲
宇
王疏影
赵飞
龙妍婷
陈翔
机构
上海交通大学微纳电子学系微米/纳米加工技术国家级重点实验室
出处
《功能材料与器件学报》
CAS
2020年第6期412-418,共7页
基金
上海市科委基础重大研发计划资助项目(17JC1401001)
文摘
本文基于捕获检测释放的机制,采用集成片上阀门的三层微流控芯片工艺,设计并制作了一种用于捕获和释放单细胞的芯片。利用COMSOL仿真优化芯片结构来增大细胞被捕获率。比较了芯片阀门在不同聚二甲基硅氧烷(Polydimethylsiloxane,PDMS)制作比例、不同进样压力时的状态以及长时间工作的性能,测试了芯片捕获与释放机制的有效性,能实现捕获、检测及释放过程。芯片的制作工艺简单,成品率可达95%以上,这种先捕获检测后再释放的方式为单细胞分离收集提供了新的技术途径。
关键词
微流控
片上阀门
三层芯片
单细胞
Keywords
Microfluidic
On-board valve
Three layers of the chip
Single cell
分类号
Q2-33 [生物学—细胞生物学]
TN492 [电子电信—微电子学与固体电子学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于微流控芯片的流式线虫机器学习图像识别系统
杨光
何
玲
宇
高林耿
何
希文
李栋基
韩超
王疏影
吴佳颖
陈翔
《功能材料与器件学报》
CAS
2019
3
原文传递
2
图像引导的微流控单细胞打印系统
陈
宇
赖文天
何
玲
宇
赵飞
陈翔
《微纳电子技术》
CAS
北大核心
2021
1
下载PDF
职称材料
3
基于微孔板的自动化三维细胞打印及加样系统
王疏影
张楚
何
玲
宇
韩超
陈翔
《功能材料与器件学报》
CAS
2020
1
原文传递
4
一种新型单细胞微流控捕获芯片的制作及系统搭建
何
玲
宇
王疏影
赵飞
龙妍婷
陈翔
《功能材料与器件学报》
CAS
2020
1
原文传递
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