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复方银杏通脉口服液治疗糖尿病周围神经病变潜在作用机制的网络药理学与分子对接研究
1
作者 龙文明 伍敏瑞 +6 位作者 申超赞 黄昊嫦 陈亮 罗满云 王贻兵 俞星源 谢江 《中医药通报》 2024年第8期48-54,共7页
目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨复方银杏通脉口服液治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的作用机制。方法:使用TCMSP、Pubchem数据库检索及文献查阅主要药物活性成分及结构,在Swiss Target Prediction数据库预测活性成分作用的人类靶点... 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨复方银杏通脉口服液治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的作用机制。方法:使用TCMSP、Pubchem数据库检索及文献查阅主要药物活性成分及结构,在Swiss Target Prediction数据库预测活性成分作用的人类靶点;利用GeneCards、OMIM、DisGenet数据库获取DPN相关靶点;对药物与疾病的共同靶点使用DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,并对结果进行可视化呈现;使用Autodock Vina软件预测关键活性成分与靶点的结合能,使用PyMOL软件对结果进行可视化处理。结果:筛选出复方银杏通脉口服液与DPN的共同靶点469个;网络分析结果提示丁香树脂醇、槲皮素、丁香素等为复方银杏通脉口服液的关键活性成分;PPI分析结果提示SRC、PIK3CA、PIK3CB等为关键靶点;KEGG富集分析结果提示主要涉及脂质和动脉粥样硬化、细胞凋亡、PI3K-Akt信号通路等DPN相关通路;分子对接结果显示关键活性成分与关键靶点均有较强的结合力。结论:复方银杏通脉口服液中,多成分作用于多靶点、参与多途径而发挥治疗DPN作用。 展开更多
关键词 复方银杏通脉口服液 糖尿病周围神经病变 网络药理学 分子对接 PI3K-AKT
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梓木草防治COVID-19潜在作用机制的网络药理学研究
2
作者 龙文明 向春红 +4 位作者 罗满云 申超赞 黄昊嫦 伍敏瑞 杨娜 《中国中医药现代远程教育》 2024年第22期170-173,共4页
目的 运用网络药理学方法探讨梓木草治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的潜在作用机制。方法 文献检索梓木草的有效成分,通过DisGeNET数据库、GeneCards数据库获取COVID-19靶点;利用韦恩图获取药物-疾病交集靶点并将其导入蛋白互作网络分... 目的 运用网络药理学方法探讨梓木草治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的潜在作用机制。方法 文献检索梓木草的有效成分,通过DisGeNET数据库、GeneCards数据库获取COVID-19靶点;利用韦恩图获取药物-疾病交集靶点并将其导入蛋白互作网络分析数据库(STRING数据库)获取核心靶点,在注释、可视化和综合发现数据库(DAVID数据库)对交集靶点进行基因本体论(GO)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,最后利用AutoDock Vina及PyMOL 2.5软件进行分子对接,使用Cytoscape 3.10.0软件进行可视化呈现。结果 梓木草中的β-谷甾醇、柯伊利素、木犀草素等成分通过肿瘤坏死因子(TNF)、表皮生长因子受体(EGFR)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)等关键靶点调控缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、Janus激酶(JAK)-信号转导和转录激活因子(STAT)信号等通路,从而发挥防治COVID-19的作用。结论梓木草可能通过多成分、多途径发挥抗COVID-19的作用。 展开更多
关键词 梓木草 COVID-19 网络药理学 分子对接
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柯伊利素抗胰腺癌作用机制的网络药理学研究
3
作者 邱敏 唐娜萍 +6 位作者 龙文明 伍敏瑞 陈琳 杨勇 申超赞 罗满云 杨娜 《齐齐哈尔医学院学报》 2024年第16期1509-1514,共6页
目的运用网络药理学探讨柯伊利素抗胰腺癌作用机制。方法在GeneCard、DisGeNET数据库获取胰腺癌的作用靶点,在Swiss Target Prediction数据库获取柯伊利素的人类靶点,利用韦恩图获取药物—疾病共同靶点,利用DAVID数据库进行富集分析,将... 目的运用网络药理学探讨柯伊利素抗胰腺癌作用机制。方法在GeneCard、DisGeNET数据库获取胰腺癌的作用靶点,在Swiss Target Prediction数据库获取柯伊利素的人类靶点,利用韦恩图获取药物—疾病共同靶点,利用DAVID数据库进行富集分析,将共同靶点导入Cytoscape 3.10.2软件STRING APP获取关键靶点,并构建柯伊利素—胰腺癌网络图,利用AutoDock vina 1.1.2做关键靶点与柯伊利素分子对接,利用Kaplan-Meier Plotter在线数据库绘制关键靶点KM曲线。结果最终获取柯伊利素—胰腺癌共同靶点62个,其中PTGS2、EGFR等10个靶点为关键活性靶点,富集分析结果富集了包括RAS信号通路、PI3K-Akt信号通路、内分泌抵抗等,药物靶点分子对接热能良好,关键靶点PTGS2、EGFR低表达对胰腺癌生存具有获益。结论柯伊利素具有潜在抗胰腺癌作用,其机制可能通过多靶点、多途径发挥抗胰腺癌作用。 展开更多
关键词 柯伊利素 胰腺癌 网络药理学 分子对接 生存分析
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基于网络药理学和分子对接探讨梓木草抗炎作用机制
4
作者 龙文明 陈亮 +4 位作者 伍敏瑞 邱敏 谢江 罗满云 屈健 《安徽医药》 CAS 2024年第12期2354-2358,I0003,I0004,共7页
目的基于网络药理学和分子对接探讨梓木草抗炎的作用机制。方法2023年1—3月,首先利用网络药理学研究方法在文献中检索梓木草成分,并通过TCMSP数据库、PubChem数据库获取成分结构式及3D结构,同时将成分结构导入Swiss Target Prediction... 目的基于网络药理学和分子对接探讨梓木草抗炎的作用机制。方法2023年1—3月,首先利用网络药理学研究方法在文献中检索梓木草成分,并通过TCMSP数据库、PubChem数据库获取成分结构式及3D结构,同时将成分结构导入Swiss Target Prediction数据库中获取相应靶点。其次,在DisGeNET数据库、GeneCards数据库获取炎症的相关靶点,并利用微生信平台获取梓木草成分与炎症的共同基因靶点,采用Cytoscape3.9.0软件构建“梓木草-成分-潜在作用靶点-炎症”网络。再次,利用STRING数据库获取梓木草抗炎蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,DAVID平台进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组数据库(KEGG)信号通路富集分析,再采用Cytoscape3.9.0软件中的CytoHubba功能筛选出前十基因靶点。最后,通过Uniprot数据库、PDB数据库获取受体3D结构,通过AutoDock Vina 1.1.2进行分子对接,并用PyMOL 2.5软件将结果进行可视化呈现。结果从文献检索中获得梓木草β-谷甾醇、柯伊利素、木犀草素等9个成分,与炎症共有STAT3、ESR1、EGFR等51个共同靶点。GO富集分析和KEGG富集分析结果显示梓木草主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子初始微RNA(pri-miRNA)转录的正向调节、炎症反应的负调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的负调节等生物过程和调控癌症的通路、化学致癌-受体活化、胰岛素抵抗等信号通路有关。分子对接结果显示有7个成分可与6NJS、1M17、2Q70等多个炎症蛋白结合。结论梓木草的抗炎作用可能通过多成分与多个炎症蛋白结合、多靶点调控多通路影响炎症反应。 展开更多
关键词 紫草科 网络药理学 梓木草 分子对接 炎症 Β-谷甾醇
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新媒体语境下的文化焦虑研究
5
作者 伍敏瑞 徐鸿 《科技传播》 2023年第21期43-46,共4页
阐述新媒体语境下文化焦虑的三个主要维度,即民族文化焦虑、精英文化焦虑、传统文化焦虑,这三者统一于文化焦虑的命题之下,并在新媒体语境当中呈现出不同状态。理性地审视外来文化、坚守自身文化的核心,使自身文化在新媒体语境下焕发新... 阐述新媒体语境下文化焦虑的三个主要维度,即民族文化焦虑、精英文化焦虑、传统文化焦虑,这三者统一于文化焦虑的命题之下,并在新媒体语境当中呈现出不同状态。理性地审视外来文化、坚守自身文化的核心,使自身文化在新媒体语境下焕发新的活力,才是当下对抗文化焦虑的重要命题。 展开更多
关键词 文化焦虑 新媒体语境 新媒体技术 现代化
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