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大豆叶绿素含量QTL定位及候选基因预测
被引量:
16
1
作者
李伟
潘校成
+8 位作者
于
洪
潇
齐慧冬
毛新瑞
黄仕钰
王新宇
尹振功
倪忠秋
齐照明
陈庆山
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期1793-1799,共7页
叶绿素是调节光合作用的关键色素,对籽粒形成有着重要作用。本研究以美国半矮秆大豆Charleston为母本,东北地区主栽品种东农594为父本杂交衍生的147个重组自交系群体为材料,基于经SLAF测序获得的大豆高密度遗传图谱,利用复合区间作图法(...
叶绿素是调节光合作用的关键色素,对籽粒形成有着重要作用。本研究以美国半矮秆大豆Charleston为母本,东北地区主栽品种东农594为父本杂交衍生的147个重组自交系群体为材料,基于经SLAF测序获得的大豆高密度遗传图谱,利用复合区间作图法(CIM)、多重区间作图法(MIM)和完备区间作图法(ICIM)对大豆叶绿素含量进行QTL联合定位分析,并结合大豆基因组基因注释信息对QTL区段内的候选基因进行预测。利用CIM算法定位出2个QTL,表型遗传贡献率分别为6%和9.3%。利用MIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为8.1%。利用ICIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为7.76%。其中qchl-G-1被CIM和MIM两种算法同时检测到。在上述3个QTL区段内共含有151个基因,根据大豆基因组基因注释信息,筛选到了3个与叶绿素相关的候选基因,这些结果为叶绿素含量的遗传剖析和标记辅助育种提供理论基础,有利于分子辅助育种的发展。
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关键词
大豆
叶绿素含量
高密度图谱
QTL定位
原文传递
持续性心房颤动经导管射频消融术后复发的临床分析
被引量:
15
2
作者
于
洪
潇
于
波
+2 位作者
马春燕
朱小龙
侯士元
《中国心血管病研究》
CAS
2019年第3期227-230,共4页
目的探讨持续性心房颤动患者经导管射频消融术后复发的相关因素.方法纳入2011年4月至2017年10月期间于中国医科大学附属第一医院行房颤导管消融的持续性房颤患者100例.术前收集患者一般临床资料、检验结果及超声心动图指标,术后对所有...
目的探讨持续性心房颤动患者经导管射频消融术后复发的相关因素.方法纳入2011年4月至2017年10月期间于中国医科大学附属第一医院行房颤导管消融的持续性房颤患者100例.术前收集患者一般临床资料、检验结果及超声心动图指标,术后对所有患者进行随访,根据术后3个月后是否复发,将患者分为复发组与未复发组,对两组各项临床资料进行统计学分析,以明确影响术后复发的临床因素.结果 100例房颤术后患者47例复发,多因素Logistic回归分析显示,血小板计数水平(OR=1.617,95%CI1.005~2.029,P=0.017)、左心耳自发显影(OR=3.980,95%CI 1.279~12.390,P=0.007)、左心房直径(OR=5.556,95%CI 1.791~17.289,P=0.004)是持续性房颤患者消融术后房颤复发的独立危险因素(P<0.05).结论血小板计数水平、左心耳自发显影、左心房直径为预测持续性房颤患者消融术后复发的重要指标.
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关键词
持续性心房颤动
导管消融
复发
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职称材料
司美格鲁肽联合二甲双胍治疗2型糖尿病合并肥胖患者改善代谢指标的价值研究
被引量:
5
3
作者
夏燕华
于
洪
潇
陈丹
《中华糖尿病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第S02期40-43,共4页
选取2021年10月至2022年10月在厦门市海沧医院明确诊断的2型糖尿病合并肥胖患者共60例作为研究对象。按照随机数字表法将纳入患者分为对照组和试验组,每组30例。其中对照组患者常规接受二甲双胍治疗,试验组患者实施司美格鲁肽联合二甲...
选取2021年10月至2022年10月在厦门市海沧医院明确诊断的2型糖尿病合并肥胖患者共60例作为研究对象。按照随机数字表法将纳入患者分为对照组和试验组,每组30例。其中对照组患者常规接受二甲双胍治疗,试验组患者实施司美格鲁肽联合二甲双胍治疗。观察对比治疗前后两组患者空腹血糖(FPG)、餐后2 h血糖(2hPG)、体重指数(BMI)、胰岛β细胞功能以及血脂水平改善情况。组间比较采用t检验。结果显示,治疗后,两组BMI、FPG、2hPG、低密度脂蛋白胆固醇与该组治疗前相比均下降,差异具有统计学意义(P<0.05);治疗后,两组间上述指标差异均具有统计学意义(P<0.05)。治疗后,两组患者稳态模型评估胰岛β细胞功能指数、稳态模型评估胰岛素抵抗指数、C肽水平与该组治疗前相比均出现改善趋势(P<0.05)。2型糖尿病合并肥胖患者接受司美格鲁肽联合二甲双胍治疗,可明显降低血糖、血脂水平,进一步减少体重,促进胰岛β细胞功能改善,患者可有多方面获益。
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关键词
肥胖症
糖尿病
2型
司美格鲁肽
二甲双胍
原文传递
大豆冠层参数的QTL定位及上位性互作分析
被引量:
4
4
作者
李永亮
王新宇
+8 位作者
黄仕钰
陈琳
倪忠秋
王雅楠
于
洪
潇
齐照明
蒋
洪
蔚
陈庆山
武小霞
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期3414-3429,共16页
本研究采用主基因+多基因混合遗传模型分离分析法对大豆冠层的叶面积指数(leaf area index,LAI)、无截取散射(diffuse none-interceptance,DIFN)、平均叶倾角(mean leaf angle,MTA)3个参数进行遗传分析,并利用Win QTL Cartographer Vers...
本研究采用主基因+多基因混合遗传模型分离分析法对大豆冠层的叶面积指数(leaf area index,LAI)、无截取散射(diffuse none-interceptance,DIFN)、平均叶倾角(mean leaf angle,MTA)3个参数进行遗传分析,并利用Win QTL Cartographer Version 2.5程序的复合区间作图法(CIM)及完备区间作图法QTL Ic IMapping软件进行QTL定位和上位性互作分析。染色体片段置换系(chromosome segment substitution lines,CSSL)群体冠层参数中,LAI最适模型为4MG-AI,DIFN最适模型为4MG-A,MTA两个最适模型为2MG-Duplicate和2MG-Inhibiting,重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体冠层中LAI最适模型为4MG-EEEA,DIFN最适模型为4MG-A,MTA两个最适模型为2MG-Duplicate和2MG-Inhibiting。两套群体共检测到2个LAI相关的QTL位点,分别位于A1、I连锁群上。检测到22个与DIFN相关的QTL位点,分别位于A1、D1b、F、J、L、N、M、A2、K、B2、I、D1a连锁群上。检测到7个MTA相关的QTL位点,分别位于C2、E、I、A1、D1a连锁群上。CSSL群体冠层参数数据分析中发现,q LAI-A1-1和q DIF,N-A1-1同时在A1连锁群上的3 691~34 163 kb处检测到,q DIFN-A1-2和q MTA-A1-1同时在A1连锁群上的38 669~40 501 kb处检测到,两个位点可能为一因多效位点。仅在RIL群体冠层参数中发现6对QTL间存在着互作效应,在J、A1、B1、F、B2、E、D2连锁群上,在J连锁群上的q DIFN-J-1与A1连锁群上的q DIFN-A1-1和B1连锁群上的q DIFN-B1-1同时发生互作。
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关键词
大豆
冠层参数
叶面积指数(LAI)
无截取散射(DIFN)
平均叶倾角(MTA)
遗传分析
QTL定位
原文传递
三种评分对心房颤动导管消融术后复发的预测价值比较
被引量:
4
5
作者
刘希平
于
波
+3 位作者
马春燕
朱小龙
李美岑
于
洪
潇
《中国心血管病研究》
CAS
2018年第11期1014-1018,共5页
目的探讨CAAP-AF评分、APPLE评分和CHA2DS2.VASc评分对房颤导管消融术后复发的预测价值。方法纳入2014年1月至2017年6月在中国医科大学附属第一医院行房颤消融术的251例患者并进行术后随访,根据术后3个月后是否再次发生任何持续至少30S...
目的探讨CAAP-AF评分、APPLE评分和CHA2DS2.VASc评分对房颤导管消融术后复发的预测价值。方法纳入2014年1月至2017年6月在中国医科大学附属第一医院行房颤消融术的251例患者并进行术后随访,根据术后3个月后是否再次发生任何持续至少30S的房性心律失常,将患者分为复发组和未复发组。分别计算每位患者CAAP-AF评分、APPLE评分及CHA2DS2-VASc评分分值,并对评分及一般资料等结果进行统计学分析。结果三种评分对房颤导管消融术后复发均有一定预测价值,其ROC曲线下面积(Auc)均>O.5(P<0.05),随着评分的增高,复发率逐渐增高(趋势P值均<0.05);两两比较表明,CAAP-AF评分的预测价值最佳(P<0.05),其最佳截断点为≥5分,灵敏度为65.1%,特异度为65.5%。其余评分预测价值之间无统计学差异(P>0.05)。Logistic回归分析表明,CAAP-AF评分(OR=1.356,P<0.001)及CHA2DS2-VASc评分(OR=1.241,P=0.049)为房颤消融术后复发的独立危险因素。结论三种评分对房颤消融术后复发均有一定预测价值,其中CAAP-AF评分预测价值最佳。
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关键词
心房颤动
导管消融术
复发
CAAP-AF评分
APPLE评分
CHA2DS2-VASc评分
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职称材料
VIGS技术在大豆功能基因组学研究中的应用进展
被引量:
1
6
作者
项薇
贾世炎
+2 位作者
于
洪
潇
胡振帮
陈庆山
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期2036-2043,共8页
病毒诱导基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)是一种基于植物天然防御病毒保卫机制的转录后基因沉默现象。携带目的基因的重组病毒载体侵染植株引发内源基因沉默,已成为快速、高效、高通量地鉴定未知基因功能的新技术。近年,V...
病毒诱导基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)是一种基于植物天然防御病毒保卫机制的转录后基因沉默现象。携带目的基因的重组病毒载体侵染植株引发内源基因沉默,已成为快速、高效、高通量地鉴定未知基因功能的新技术。近年,VIGS技术在研究植物抗虫抗病、代谢调控、非生物胁迫等方面取得进展。本研究介绍了大豆VIGS技术的分子机制和构建病毒载体,并对该技术在大豆功能基因组学研究中的应用进行综述,对其发展前景进行展望。
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关键词
大豆
VIGS
功能基因组
病毒载体
原文传递
题名
大豆叶绿素含量QTL定位及候选基因预测
被引量:
16
1
作者
李伟
潘校成
于
洪
潇
齐慧冬
毛新瑞
黄仕钰
王新宇
尹振功
倪忠秋
齐照明
陈庆山
机构
大豆生物学教育部重点实验室东北农业大学农学院
中国
黑龙江省农科院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期1793-1799,共7页
基金
黑龙江省新世纪优秀人才项目(1252-NCET-004)
教育部新世纪优秀人才支持计划(NECT-1207-01)
+2 种基金
黑龙江省高校长江学者后备支持计划项目(2014CJHB004)
创新训练项目(201610224146)
创新训练项目(201510224016)共同资助
文摘
叶绿素是调节光合作用的关键色素,对籽粒形成有着重要作用。本研究以美国半矮秆大豆Charleston为母本,东北地区主栽品种东农594为父本杂交衍生的147个重组自交系群体为材料,基于经SLAF测序获得的大豆高密度遗传图谱,利用复合区间作图法(CIM)、多重区间作图法(MIM)和完备区间作图法(ICIM)对大豆叶绿素含量进行QTL联合定位分析,并结合大豆基因组基因注释信息对QTL区段内的候选基因进行预测。利用CIM算法定位出2个QTL,表型遗传贡献率分别为6%和9.3%。利用MIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为8.1%。利用ICIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为7.76%。其中qchl-G-1被CIM和MIM两种算法同时检测到。在上述3个QTL区段内共含有151个基因,根据大豆基因组基因注释信息,筛选到了3个与叶绿素相关的候选基因,这些结果为叶绿素含量的遗传剖析和标记辅助育种提供理论基础,有利于分子辅助育种的发展。
关键词
大豆
叶绿素含量
高密度图谱
QTL定位
Keywords
Soybean
Chlorophyll content
High-density genetic map
QTL mapping
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
持续性心房颤动经导管射频消融术后复发的临床分析
被引量:
15
2
作者
于
洪
潇
于
波
马春燕
朱小龙
侯士元
机构
中国医科大学附属第一医院心内科
出处
《中国心血管病研究》
CAS
2019年第3期227-230,共4页
文摘
目的探讨持续性心房颤动患者经导管射频消融术后复发的相关因素.方法纳入2011年4月至2017年10月期间于中国医科大学附属第一医院行房颤导管消融的持续性房颤患者100例.术前收集患者一般临床资料、检验结果及超声心动图指标,术后对所有患者进行随访,根据术后3个月后是否复发,将患者分为复发组与未复发组,对两组各项临床资料进行统计学分析,以明确影响术后复发的临床因素.结果 100例房颤术后患者47例复发,多因素Logistic回归分析显示,血小板计数水平(OR=1.617,95%CI1.005~2.029,P=0.017)、左心耳自发显影(OR=3.980,95%CI 1.279~12.390,P=0.007)、左心房直径(OR=5.556,95%CI 1.791~17.289,P=0.004)是持续性房颤患者消融术后房颤复发的独立危险因素(P<0.05).结论血小板计数水平、左心耳自发显影、左心房直径为预测持续性房颤患者消融术后复发的重要指标.
关键词
持续性心房颤动
导管消融
复发
Keywords
Persistant atrial fibrillation
Catheter ablation
Recurrence
分类号
R541.7 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
司美格鲁肽联合二甲双胍治疗2型糖尿病合并肥胖患者改善代谢指标的价值研究
被引量:
5
3
作者
夏燕华
于
洪
潇
陈丹
机构
厦门市海沧医院内分泌科
厦门市海沧医院心血管内科
厦门市海沧医院神经内科
出处
《中华糖尿病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第S02期40-43,共4页
文摘
选取2021年10月至2022年10月在厦门市海沧医院明确诊断的2型糖尿病合并肥胖患者共60例作为研究对象。按照随机数字表法将纳入患者分为对照组和试验组,每组30例。其中对照组患者常规接受二甲双胍治疗,试验组患者实施司美格鲁肽联合二甲双胍治疗。观察对比治疗前后两组患者空腹血糖(FPG)、餐后2 h血糖(2hPG)、体重指数(BMI)、胰岛β细胞功能以及血脂水平改善情况。组间比较采用t检验。结果显示,治疗后,两组BMI、FPG、2hPG、低密度脂蛋白胆固醇与该组治疗前相比均下降,差异具有统计学意义(P<0.05);治疗后,两组间上述指标差异均具有统计学意义(P<0.05)。治疗后,两组患者稳态模型评估胰岛β细胞功能指数、稳态模型评估胰岛素抵抗指数、C肽水平与该组治疗前相比均出现改善趋势(P<0.05)。2型糖尿病合并肥胖患者接受司美格鲁肽联合二甲双胍治疗,可明显降低血糖、血脂水平,进一步减少体重,促进胰岛β细胞功能改善,患者可有多方面获益。
关键词
肥胖症
糖尿病
2型
司美格鲁肽
二甲双胍
分类号
R587.2 [医药卫生—内分泌]
R589.2 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
大豆冠层参数的QTL定位及上位性互作分析
被引量:
4
4
作者
李永亮
王新宇
黄仕钰
陈琳
倪忠秋
王雅楠
于
洪
潇
齐照明
蒋
洪
蔚
陈庆山
武小霞
机构
东北农业大学农学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期3414-3429,共16页
基金
科技部重点项目(2016YFD0100500)
第58批中国博士后科学基金
+5 种基金
国家自然科学基金项目(31471516
31271747
31401465
31400074
31501332)
东北农业大学SIPT项目(201610224146)共同资助
文摘
本研究采用主基因+多基因混合遗传模型分离分析法对大豆冠层的叶面积指数(leaf area index,LAI)、无截取散射(diffuse none-interceptance,DIFN)、平均叶倾角(mean leaf angle,MTA)3个参数进行遗传分析,并利用Win QTL Cartographer Version 2.5程序的复合区间作图法(CIM)及完备区间作图法QTL Ic IMapping软件进行QTL定位和上位性互作分析。染色体片段置换系(chromosome segment substitution lines,CSSL)群体冠层参数中,LAI最适模型为4MG-AI,DIFN最适模型为4MG-A,MTA两个最适模型为2MG-Duplicate和2MG-Inhibiting,重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体冠层中LAI最适模型为4MG-EEEA,DIFN最适模型为4MG-A,MTA两个最适模型为2MG-Duplicate和2MG-Inhibiting。两套群体共检测到2个LAI相关的QTL位点,分别位于A1、I连锁群上。检测到22个与DIFN相关的QTL位点,分别位于A1、D1b、F、J、L、N、M、A2、K、B2、I、D1a连锁群上。检测到7个MTA相关的QTL位点,分别位于C2、E、I、A1、D1a连锁群上。CSSL群体冠层参数数据分析中发现,q LAI-A1-1和q DIF,N-A1-1同时在A1连锁群上的3 691~34 163 kb处检测到,q DIFN-A1-2和q MTA-A1-1同时在A1连锁群上的38 669~40 501 kb处检测到,两个位点可能为一因多效位点。仅在RIL群体冠层参数中发现6对QTL间存在着互作效应,在J、A1、B1、F、B2、E、D2连锁群上,在J连锁群上的q DIFN-J-1与A1连锁群上的q DIFN-A1-1和B1连锁群上的q DIFN-B1-1同时发生互作。
关键词
大豆
冠层参数
叶面积指数(LAI)
无截取散射(DIFN)
平均叶倾角(MTA)
遗传分析
QTL定位
Keywords
Soybean
Canopy parameters
Leaf area index(LAI)
Diffuse none-interceptance(DIFN)
Mean tiltangle(MTA)
Genetic analysis
QTL mapping
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
三种评分对心房颤动导管消融术后复发的预测价值比较
被引量:
4
5
作者
刘希平
于
波
马春燕
朱小龙
李美岑
于
洪
潇
机构
中国医科大学附属第一医院心内科
出处
《中国心血管病研究》
CAS
2018年第11期1014-1018,共5页
基金
沈阳市科技计划(项目编号:17-230-9-59)
文摘
目的探讨CAAP-AF评分、APPLE评分和CHA2DS2.VASc评分对房颤导管消融术后复发的预测价值。方法纳入2014年1月至2017年6月在中国医科大学附属第一医院行房颤消融术的251例患者并进行术后随访,根据术后3个月后是否再次发生任何持续至少30S的房性心律失常,将患者分为复发组和未复发组。分别计算每位患者CAAP-AF评分、APPLE评分及CHA2DS2-VASc评分分值,并对评分及一般资料等结果进行统计学分析。结果三种评分对房颤导管消融术后复发均有一定预测价值,其ROC曲线下面积(Auc)均>O.5(P<0.05),随着评分的增高,复发率逐渐增高(趋势P值均<0.05);两两比较表明,CAAP-AF评分的预测价值最佳(P<0.05),其最佳截断点为≥5分,灵敏度为65.1%,特异度为65.5%。其余评分预测价值之间无统计学差异(P>0.05)。Logistic回归分析表明,CAAP-AF评分(OR=1.356,P<0.001)及CHA2DS2-VASc评分(OR=1.241,P=0.049)为房颤消融术后复发的独立危险因素。结论三种评分对房颤消融术后复发均有一定预测价值,其中CAAP-AF评分预测价值最佳。
关键词
心房颤动
导管消融术
复发
CAAP-AF评分
APPLE评分
CHA2DS2-VASc评分
Keywords
Atrial fibrillation
Catheter ablation
Recurrence
CAAP-AF score
APPLE score
CHA2DS2-VASc score
分类号
R541.7 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
VIGS技术在大豆功能基因组学研究中的应用进展
被引量:
1
6
作者
项薇
贾世炎
于
洪
潇
胡振帮
陈庆山
机构
东北农业大学农学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期2036-2043,共8页
基金
国家自然科学基金(31471516
31271747)
黑龙江省高校长江后备支持计划项目(2014CJHB004)共同资助
文摘
病毒诱导基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)是一种基于植物天然防御病毒保卫机制的转录后基因沉默现象。携带目的基因的重组病毒载体侵染植株引发内源基因沉默,已成为快速、高效、高通量地鉴定未知基因功能的新技术。近年,VIGS技术在研究植物抗虫抗病、代谢调控、非生物胁迫等方面取得进展。本研究介绍了大豆VIGS技术的分子机制和构建病毒载体,并对该技术在大豆功能基因组学研究中的应用进行综述,对其发展前景进行展望。
关键词
大豆
VIGS
功能基因组
病毒载体
Keywords
Soybean
VIGS
Functional genomics
Virus vector
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆叶绿素含量QTL定位及候选基因预测
李伟
潘校成
于
洪
潇
齐慧冬
毛新瑞
黄仕钰
王新宇
尹振功
倪忠秋
齐照明
陈庆山
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
16
原文传递
2
持续性心房颤动经导管射频消融术后复发的临床分析
于
洪
潇
于
波
马春燕
朱小龙
侯士元
《中国心血管病研究》
CAS
2019
15
下载PDF
职称材料
3
司美格鲁肽联合二甲双胍治疗2型糖尿病合并肥胖患者改善代谢指标的价值研究
夏燕华
于
洪
潇
陈丹
《中华糖尿病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
原文传递
4
大豆冠层参数的QTL定位及上位性互作分析
李永亮
王新宇
黄仕钰
陈琳
倪忠秋
王雅楠
于
洪
潇
齐照明
蒋
洪
蔚
陈庆山
武小霞
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016
4
原文传递
5
三种评分对心房颤动导管消融术后复发的预测价值比较
刘希平
于
波
马春燕
朱小龙
李美岑
于
洪
潇
《中国心血管病研究》
CAS
2018
4
下载PDF
职称材料
6
VIGS技术在大豆功能基因组学研究中的应用进展
项薇
贾世炎
于
洪
潇
胡振帮
陈庆山
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016
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