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儿童急性呼吸道感染病原学特征分析 被引量：38
1
作者 于新芬 寇宇 +4 位作者 周银燕 李钧 钱昕 杨旭辉 潘劲草 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2018年第2期160-165,共6页
目的了解门诊和住院儿童急性呼吸道感染病例中呼吸道病毒和肺炎支原体、衣原体的流行特征，为防控急性呼吸道感染、指导临床用药奠定基础。方法采集2011—2013年杭州某儿童医院呼吸道门诊病例咽拭子、住院病例气管吸取物。采用实时荧光... 目的了解门诊和住院儿童急性呼吸道感染病例中呼吸道病毒和肺炎支原体、衣原体的流行特征，为防控急性呼吸道感染、指导临床用药奠定基础。方法采集2011—2013年杭州某儿童医院呼吸道门诊病例咽拭子、住院病例气管吸取物。采用实时荧光PCR方法，对收集到的样本进行呼吸道病毒和肺炎支原体、衣原体的核酸检测。结果本研究908例病例中，610例检出至少1种病原体，总的病原体检出率为67.2%（610/908），住院患儿检出率（76.7%）显著高于门诊患儿（43.0%）（χ^2＝94.79，P〈0.001）。206例检出2种或2种以上病原体，住院患儿合并感染率（29.0%）高于门诊患儿（6.6%）（χ2＝52.34，P〈0.001）。呼吸道合胞病毒、副流感病毒、鼻病毒、流感病毒、博卡病毒、腺病毒、saffold心肌炎病毒及肺炎支原体、衣原体在两组病例间检出率的差异均有统计学意义。住院病例中，检出率最高的是呼吸道合胞病毒（34.5%），其次是肺炎支原体（15.0%）、鼻病毒（14.6%）；门诊病例中，检出率最高的是腺病毒（15.2%），其次是流感病毒（11.7%）、副流感病毒（7.8%）。住院病例中除了呼吸道合胞病毒和流感病毒外，其他病原合并感染率均大于其单一感染率。腺病毒在门诊和住院病例中的合并感染率差异具有统计学意义（χ^2＝18.90，P〈0.001）。未发现住院病例单一感染与合并感染临床特征的显著性差异。结论住院病例呼吸道病原体的检出率较门诊病例高，多种病原体合并感染在住院病例中较常见，提示合并感染和疾病的严重程度有一定相关性。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 门诊病例 住院病例 合并感染
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2013年杭州市人感染H7N9禽流感病例分布特征及暴露来源分析 被引量：28
2
作者 谢立 丁华 +14 位作者 孙昼 考庆君 黄仁杰 温圆圆 杨旭辉 黄春萍 于新芬 李钧 濮小英 潘劲草 金涛 周晓红 郑琳 李剑 汪芬娟 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期944-945,共2页
2013年3月在我国上海和安徽两地首先发现人感染H7N9禽流感病例，疫情迅速波及到杭州地区，共报告30例人感染H7N9禽流感确诊病例。为此对30例确诊病例的分布、暴露史及其传播来源进行探讨。1．资料与方法：（1）病例及其定义：参照国家... 2013年3月在我国上海和安徽两地首先发现人感染H7N9禽流感病例，疫情迅速波及到杭州地区，共报告30例人感染H7N9禽流感确诊病例。为此对30例确诊病例的分布、暴露史及其传播来源进行探讨。1．资料与方法：（1）病例及其定义：参照国家卫生和计划生育委员会《人感染H7N9禽流感诊疗方案（2013年第1版）》和《人感染H7N9禽流感诊疗方案（2013年第2版）》中的标准分为监测病例、疑似病例和确诊病例，并按照《人感染H7N9禽流感疫情防控方案（第1版）》对病例进行个案调查，获得病例临床及流行病学资料，同时采集病例及密切接触者的咽拭子标本进行病原学检测。 展开更多
关键词 人禽流感 H7N9亚型 暴露
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麦冬总黄酮提取的响应面法优化及抗氧化性研究 被引量：22
3
作者 夏道宗 于新芬 +2 位作者 王慧铭 蒋立勤 夏明 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1629-1632,共4页
目的:探讨麦冬总黄酮(TFOJ)的提取工艺及其体内外抗氧化作用。方法:采用响应面法优化TFOJ的提取工艺;体外试验测定TFOJ、TFOJE和TFOJB清除自由基的能力;采用D-半乳糖建立小鼠氧化损伤模型,研究TFOJE和TFOJB对其的保护作用。结果:TFOJ的... 目的:探讨麦冬总黄酮(TFOJ)的提取工艺及其体内外抗氧化作用。方法:采用响应面法优化TFOJ的提取工艺;体外试验测定TFOJ、TFOJE和TFOJB清除自由基的能力;采用D-半乳糖建立小鼠氧化损伤模型,研究TFOJE和TFOJB对其的保护作用。结果:TFOJ的最佳提取条件:提取时间188min,乙醇浓度73%,温度72℃,料液比1∶29,最高得率0.886%。TFOJ、TFOJE和TFOJB均可有效清除DPPH、ABTS+自由基。TFOJB的抗氧化效果较优,可使氧化损伤小鼠血清和肝脏中MDA含量分别下降17.2%、15.7%,GSH-Px、SOD活性分别增高36.5%、17.2%和34.2%、13.5%。结论:麦冬中黄酮类化合物具有良好的自由基清除能力,可显著改善小鼠氧化损伤。 展开更多
关键词 麦冬 黄酮类化合物 响应面方法 抗氧化
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二次回归通用旋转设计优化土茯苓总黄酮的提取工艺 被引量：21
4
作者 夏道宗 于新芬 马志杰 《中华中医药学刊》 CAS 2009年第7期1460-1463,共4页
目的:采用二次回归通用旋转试验设计优化土茯苓总黄酮(TFSG)的提取工艺。方法:根据Box-Be-hnken的中心组合试验设计原理,在单因素试验的基础上采用四因素三水平的响应曲面分析法,依据回归分析确定各工艺条件的影响因子,以TFSG得率(%)为... 目的:采用二次回归通用旋转试验设计优化土茯苓总黄酮(TFSG)的提取工艺。方法:根据Box-Be-hnken的中心组合试验设计原理,在单因素试验的基础上采用四因素三水平的响应曲面分析法,依据回归分析确定各工艺条件的影响因子,以TFSG得率(%)为响应值作响应面和等高线图。结果:TFSG超声波辅助提取效果的影响因素由大到小顺序为:乙醇浓度>超声功率>超声时间>料液比。优化后的工艺参数为:乙醇浓度57%,超声功率500W,超声时间34min,料液比1:21,响应值达到2.32%。结论:本文所建立的数学模型极其显著(P<0.01),可用来对TFSG的提取工艺进行分析和预测。 展开更多
关键词 二次回归通用旋转设计 土茯苓 总黄酮 提取工艺
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多重实时PCR检测产毒素性霍乱弧菌和副溶血弧菌 被引量：20
5
作者 张蔚 潘劲草 +3 位作者 孟冬梅 于新芬 汪皓秋 郑伟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期950-954,共5页
设计引物和探针,优化多重实时PCR条件,以同时检测霍乱弧菌霍乱毒素基因ctxA、副溶血弧菌种特异性基因gyrB和耐热肠毒素基因tdh。该多重实时PCR方法检测产毒素性的O1群(3株)和O139群(44株)霍乱弧菌菌株、不产毒素的O1群(12株)和O139群(6... 设计引物和探针,优化多重实时PCR条件,以同时检测霍乱弧菌霍乱毒素基因ctxA、副溶血弧菌种特异性基因gyrB和耐热肠毒素基因tdh。该多重实时PCR方法检测产毒素性的O1群(3株)和O139群(44株)霍乱弧菌菌株、不产毒素的O1群(12株)和O139群(6株)及非O1非O139群(7株)霍乱弧菌菌株的ctxA,阳性和阴性结果与普通PCR检测结果100%符合;检测副溶血弧菌种特异性gyrB,116株副溶血弧菌均阳性,而9株其它细菌和72株霍乱弧菌均阴性;检测tdh的阳性和阴性结果也与普通PCR结果完全一致。另外还建立了检测副溶血弧菌菌株trh1和trh2的单重实时PCR方法。 展开更多
关键词 多重实时PCR 毒力基因 霍乱弧菌 副溶血弧菌
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杭州市急性呼吸道感染婴幼儿中副流感病毒3型遗传进化及其感染特征研究 被引量：15
6
作者 钱昕 于新芬 +3 位作者 赵敏 寇宇 李钧 周银燕 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期255-260,共6页
目的分析杭州市婴幼儿中副流感病毒3型（HPIV-3）的遗传进化及其感染与合并感染情况。方法收集2009年12月至2013年3月杭州地区医院0—11岁婴幼儿急性呼吸道感染病例咽拭子或呼吸道吸出物样本，共856份（男性553例，女性303例）。采用逆... 目的分析杭州市婴幼儿中副流感病毒3型（HPIV-3）的遗传进化及其感染与合并感染情况。方法收集2009年12月至2013年3月杭州地区医院0—11岁婴幼儿急性呼吸道感染病例咽拭子或呼吸道吸出物样本，共856份（男性553例，女性303例）。采用逆转录荧光定量PCR（qRT．PER）法检测HPIV-3，阳性样本用特异性引物扩增HN基因进行基因测序，将测序所得序列用ClustalX2．0软件进行比对，然后使用MEGA6．0软件，采用邻接法建立系统进化树。同时，用qRT-PCR法检测与其他呼吸道病原体的合并感染情况。采用x2检验比较不同特征患儿单一感染与合并感染情况。结果856例患儿中，HPIV-3阳性84例（9．6％）。男性患儿HPIV-3感染阳性率为10．0％（55／553），女性患儿阳性率为9．6％（29／303）（x2=0．03，P=0．860）。84例HPIV．3阳性病例的合并感染率为49％（41例），其中与鼻病毒合并感染检出率较高，为41％（17例）；1岁以下患儿的合并感染率为54％（36／67），高于单一感染率【46％（31／67）]（X2=4．78，P=0．029）；单一感染患儿伴有肺炎症状占93％（37／40），高于合并感染组【76％（29／38）]（x2=3．92，P=0．048）。同源性分析结果显示，56例患儿HPIV．3的HN基因编码区核苷酸和氨基酸序列一致性均较高，一致性分别为96．9％～100．0％和98．6％．100％。基于HN基因的进化树分析表明，杭州株均归属于c3亚群。结论杭州市婴幼儿的急性呼吸道感染与HPIV-3有关；HPIV-3HN基因型变异较小，但进化具有一定地域特征；与其他呼吸道病毒的合并感染率较高。 展开更多
关键词 副流感病毒3型 人 感染 遗传
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杭州市O139群霍乱弧菌耐药变迁及毒力基因携带 被引量：14
7
作者 汪皓秋 孟冬梅 +2 位作者 于新芬 张蔚 施世锋 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期321-322,共2页
目的 研究杭州市1994～2003年分离的O139群霍乱弧菌耐药性变迁以及携带ctxA、tcpA毒力基因的情况。方法 运用K—B法和PCR，检测90株O139群霍乱弧菌对抗生索的敏感性以及是否携带ctxA、tcpA毒力基因。结果 90株O139群霍乱弧菌中无丁胺卡... 目的 研究杭州市1994～2003年分离的O139群霍乱弧菌耐药性变迁以及携带ctxA、tcpA毒力基因的情况。方法 运用K—B法和PCR，检测90株O139群霍乱弧菌对抗生索的敏感性以及是否携带ctxA、tcpA毒力基因。结果 90株O139群霍乱弧菌中无丁胺卡那耐药的菌株，13株对诺氟沙星和环丙沙星耐药；对氨苄青霉索、复方新诺明分别有5年和6年的耐药率为100％；2002、2003年耐药谱增加到7种。87．87％的O139群霍乱弧菌同时携带ctxA、tepA毒力基因。结论10年来分离自杭州的O139群霍乱弧菌的耐药情况日益严重；O139群霍乱弧菌是否携带ctxA、tcpA毒力基因在对抗生素敏感性方面差异有统计学意义。 展开更多
关键词 O139群霍乱弧菌 耐药性分析 毒力基因 聚合酶链反应
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杭白菊总黄酮对铅诱导小鼠氧化损伤的拮抗效应研究 被引量：11
8
作者 夏道宗 吕圭源 +2 位作者 于新芬 王慧铭 杨晴 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第23期2803-2808,共6页
目的:探讨杭白菊总黄酮(total flavonoids from Chrysanthemum morifolium,TFCM)对铅诱导小鼠脑、肝脏和肾脏氧化损伤的拮抗效应。方法:将90只雄性小鼠分为9组:正常组,模型组,阳性药组,TFCM低、中、高(150,300,500 mg.kg-1)剂量组,TFCM... 目的:探讨杭白菊总黄酮(total flavonoids from Chrysanthemum morifolium,TFCM)对铅诱导小鼠脑、肝脏和肾脏氧化损伤的拮抗效应。方法:将90只雄性小鼠分为9组:正常组,模型组,阳性药组,TFCM低、中、高(150,300,500 mg.kg-1)剂量组,TFCM低、中、高剂量+二巯基丁二酸(DMSA,70 mg.kg-1)组。前20 d,除正常组外,其余小鼠隔天腹腔注射醋酸铅建立铅中毒模型;接下来的10 d,各组小鼠灌胃给予受试物。实验结束后,摘眼球取血及各脏器,测定全血、脑、肝脏、肾脏中铅、锌和铜的含量,计算脏体比重系数,并对抗氧化酶活性及脂质过氧化水平进行检测和分析。结果:TFCM可拮抗铅中毒小鼠体重的下降和脏体比重的升高。单独使用TFCM对小鼠血液及组织中铅浓度并无显著影响,但与DMSA联合使用时排铅效果显著(P<0.01),且未造成锌、铜的流失。中、高剂量TFCM在增加小鼠脑GSH含量,GSH-Px,SOD,CAT活性及降低MDA含量方面,效果明显优于DMSA;高剂量TFCM在增加小鼠肝脏和肾脏GSH-Px,CAT活性及降低MDA含量方面,效果也明显优于DMSA。TFCM与DMSA联合使用时,也可显著改善小鼠脑、肝脏和肾脏脂质过氧化,增加GSH,GSH-Px,SOD和CAT的活性,效果优于单独使用DMSA。结论:TFCM可显著提高铅中毒小鼠组织中抗氧化酶的活性,改善脂质过氧化,从而明显拮抗铅诱导的脑、肝脏和肾脏氧化损伤。 展开更多
关键词 杭白菊 总黄酮 铅中毒 氧化损伤 药物拮抗效应
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罐头食品中微量重金属的快速测定 被引量：11
9
作者 夏道宗 于新芬 《现代食品科技》 EI CAS 2005年第2期163-165,160,共4页
本文对罐头食品中微量重金属测定的样品消化进行了研究,提出以酸提取和HNO3-HCl顺序消化这两种消化技术处理样品。据此,建立了铜、锌、铅、镉、锡的原子吸收光谱快速测定方法,对不同添加量水平的回收率为79.0-126.0%,变异系数为2.1-20.8... 本文对罐头食品中微量重金属测定的样品消化进行了研究,提出以酸提取和HNO3-HCl顺序消化这两种消化技术处理样品。据此,建立了铜、锌、铅、镉、锡的原子吸收光谱快速测定方法,对不同添加量水平的回收率为79.0-126.0%,变异系数为2.1-20.8%。两种消化技术均具有操作简便、省时、准确度高和精密度好的优点,适合于作为食品分析的例行方法。 展开更多
关键词 罐头食品 微量重金属 快速测定
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多重实时PCR检测沙门菌、志贺菌和致泻性大肠埃希菌 被引量：10
10
作者 于新芬 潘劲草 +3 位作者 孟冬梅 汪皓秋 张蔚 郑伟 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期461-465,共5页
目的 建立多重实时荧光PCR检测沙门菌侵袭蛋白A基因（invA）、肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）不耐热肠毒素基因（elt）、志贺菌和肠侵袭性大肠埃希菌侵袭力基因（ipaH）的方法。方法 优化多重实时荧光PCR的反应条件，检测系列10倍稀释的阳... 目的 建立多重实时荧光PCR检测沙门菌侵袭蛋白A基因（invA）、肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）不耐热肠毒素基因（elt）、志贺菌和肠侵袭性大肠埃希菌侵袭力基因（ipaH）的方法。方法 优化多重实时荧光PCR的反应条件，检测系列10倍稀释的阳性菌DNA提取物。90份腹泻患者粪便样品经缓冲蛋白胨水（buffered peptone water，BP）增菌6h后进行多重实时荧光PCR检测，并对阳性标本进行菌株分离和鉴定。结果 多重实时PCR方法最低可以检测到10CFU／μl的福氏2aF301株、10。CFU／μl的鼠伤寒沙门菌和ETEC44815株。检测腹泻患者粪便样品，elt基因阳性率为14．4％（13／90），ipaH基因阳性率为5．6％（5／90）；并从阳性样品中分离到3株elt基因阳性大肠埃希菌和4株ipaH基因阳性大肠埃希菌。整个检测过程可在10h内完成，其中包括BP增菌6h。结论 建立了同时检测invA、elt、ipaH毒力基因的多重实时荧光PCR方法，具有高度的特异性，可用于沙门菌、肠产毒性大肠埃希菌、志贺菌和肠侵袭性大肠埃希菌菌株的毒力基因鉴定及临床腹泻粪便标本的快速筛检。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 基因 沙门氏菌属 志贺氏菌属 大肠杆菌
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猪源致病性沙门氏菌四环素耐药基因tetC的PCR扩增及序列分析 被引量：7
11
作者 代敏 王红宁 +2 位作者 吴琦 李春 于新芬 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第7期415-417,434,共4页
本研究对 16株猪致病性沙门氏菌的四环素耐药性进行了检测 ,结果表明 ,沙门氏菌对四环素类抗生素产生了广泛的耐药性 ,耐药率达 10 0 %。对四环素耐药基因 tet C进行 PCR扩增 ,结果在 12株沙门氏菌的质粒上扩增出特异性产物 ,与药敏试... 本研究对 16株猪致病性沙门氏菌的四环素耐药性进行了检测 ,结果表明 ,沙门氏菌对四环素类抗生素产生了广泛的耐药性 ,耐药率达 10 0 %。对四环素耐药基因 tet C进行 PCR扩增 ,结果在 12株沙门氏菌的质粒上扩增出特异性产物 ,与药敏试验结果阳性符合率 75 % ,具有较高的检出率 ;序列分析结果表明 tet C的核苷酸同源率较高 ,达 97.7%～ 98.7% ,建立 tet C基因的 PCR检测技术 ,为沙门氏菌对四环素耐药性的分子流行病学监测提供了有效的途径。 展开更多
关键词 沙门氏菌 四环素耐药基因 TETC PCR 序列分析
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过氧化凯氏定氮法在食品蛋白质分析中的应用 被引量：7
12
作者 夏道宗 陈明之 于新芬 《食品与药品》 CAS 2005年第04A期54-56,共3页
主要研究了过氧化凯氏定氮法在食品蛋白质分析中的应用,此法较常规或改良凯氏定氮法具有快速简便、精确精密、准确、灵敏度高等优点,且所用的消化设备简单易推广。
关键词 食品 蛋白质 过氧化凯氏定氮法 过氧化氢
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杭州地区2014—2019年乙型流感病毒HA和NA基因遗传进化分析 被引量：8
13
作者 钱昕 于新芬 +2 位作者 李钧 周银燕 文艳苹 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期523-529,共7页
目的研究2014—2019年杭州地区乙型流感病毒的流行情况以及血凝素基因(HA)和神经氨酸酶基因(NA)的遗传进化特征。方法收集2014年10月—2019年9月间杭州地区流感样病例10481例,用实时RT-PCR法检测乙型流感病毒,同时选取部分乙型流感病毒... 目的研究2014—2019年杭州地区乙型流感病毒的流行情况以及血凝素基因(HA)和神经氨酸酶基因(NA)的遗传进化特征。方法收集2014年10月—2019年9月间杭州地区流感样病例10481例,用实时RT-PCR法检测乙型流感病毒,同时选取部分乙型流感病毒阳性样本,用特异性引物扩增HA和NA基因,进行基因测序并分析其遗传进化特征。结果发现自2014年以来,杭州地区每年都有乙型流感病毒的流行。其中5~14岁年龄段人群发病率最高。2014—2019年,杭州地区流行的Victoria系乙型流感病毒都属于V1A进化簇,而Yamagata系乙型流感病毒都属于Y3进化簇。HA和NA基因的序列一致性分别为94.67%~100.00%和97.13%~100.00%,并在多个抗原位点发生了改变,同时出现了重排株。结论乙型流感病毒在杭州地区流感流行中影响显著。2014—2019年,杭州地区乙型流感病毒出现了抗原变异和基因重排,流行株和疫苗株之间存在不匹配的情况,但目前并未发现耐药株的出现和流行。 展开更多
关键词 乙型流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 遗传进化
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2016-2018年杭州市健康人群风疹IgG抗体水平调查 被引量：8
14
作者 刘艳 许玉洋 +5 位作者 张学潮 袁寒艳 孙向珏 陈俊 于新芬 张小平 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2020年第5期517-520,共4页
目的评估2016-2018年杭州市健康人群风疹抗体水平。方法采用分层随机抽样方法选择杭州市11个年龄组健康人群,采用酶联免疫吸附试验检测血清风疹IgG抗体,分析抗体阳性率和几何平均浓度(GMC)。结果杭州市健康人群风疹IgG抗体总阳性率为80.... 目的评估2016-2018年杭州市健康人群风疹抗体水平。方法采用分层随机抽样方法选择杭州市11个年龄组健康人群,采用酶联免疫吸附试验检测血清风疹IgG抗体,分析抗体阳性率和几何平均浓度(GMC)。结果杭州市健康人群风疹IgG抗体总阳性率为80.42%(801/996),GMC为101.87IU/mL。各年龄组人群风疹IgG抗体阳性率在35.56%(<1岁组)-97.62%(2岁组)之间(χ^2=165.38,P<0.001),GMC在59.52IU/mL(15-19岁组)-210.92IU/mL(1岁组)之间(F=5.75,P<0.001)。在有含风疹成分疫苗(RCV)免疫史人群中,风疹IgG抗体阳性率、GMC分别从免疫后<1年的95.97%、203.42IU/mL下降到免疫后≥10年的85.71%、50.03IU/mL(χ^2=32.11,P<0.001;F=12.77,P<0.001)。结论杭州市健康人群总体风疹抗体水平较高,但随着随年龄增长或RCV免疫后时间延长而下降,需探讨成人风疹免疫策略。 展开更多
关键词 风疹 IGG抗体 健康人群
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浙江省首株产志贺毒素大肠埃希菌O157:H7的分子生物学特性研究 被引量：7
15
作者 孟冬梅 潘劲草 +3 位作者 张蔚 汪皓秋 于新芬 施世锋 《中国卫生检验杂志》 CAS 2006年第4期407-409,共3页
目的:了解自浙江省杭州市腹泻婴儿中分离的1株大肠埃希菌O157:H7(HZ1-11株)的分子生物学特性。方法:应用ATB1525细菌半动化生化鉴定系统鉴定菌种。应用O157特异性抗血清玻片凝集试验、H7特异性抗血清试管凝集试验、以及PCR检测O抗原特异... 目的:了解自浙江省杭州市腹泻婴儿中分离的1株大肠埃希菌O157:H7(HZ1-11株)的分子生物学特性。方法:应用ATB1525细菌半动化生化鉴定系统鉴定菌种。应用O157特异性抗血清玻片凝集试验、H7特异性抗血清试管凝集试验、以及PCR检测O抗原特异性rfbE基因和H7特异性fliC基因,进行菌株血清型的鉴定。应用多重Real-tim ePCR和常规PCR检测stx1、stx2、hly和eae毒力基因。对菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,并与国内代表菌株进行比较。ATB1525药敏检测仪和纸片法检测菌株的抗药性。结果:细菌生化鉴定为大肠埃希菌,山梨醇阴性。血清型为O157:H7。毒力基因stx2、hly和eae均阳性,stx1阴性。PFGE谱带同江苏分离O157:H7菌株几乎完全相同,带型的相似度为97%。结论:该菌株为浙江省首株产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)O157:H7,与国内近年在江苏等地流行的STECO157:H7菌株密切相关。STEC O157:H7已开始对浙江地区的人民健康构成了威胁。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 O157:H7 志贺毒素 PFGE
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PCR法快速鉴定啤酒中分离的乳酸杆菌 被引量：5
16
作者 赵敏 潘劲草 +3 位作者 于新芬 叶榕 孙培龙 叶青 《中国卫生检验杂志》 CAS 2006年第5期534-535,共2页
目的:建立一种灵敏、快速的PCR法检测啤酒中的乳酸杆菌。方法:设计一对属特异性引物扩增乳酸杆菌的16Sr DNA基因,对7株乳酸杆菌进行检测,扩增片断长度为223 bp,金黄色葡萄球菌、蜡样芽孢杆菌、李斯特菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、铜绿假单孢菌... 目的:建立一种灵敏、快速的PCR法检测啤酒中的乳酸杆菌。方法:设计一对属特异性引物扩增乳酸杆菌的16Sr DNA基因,对7株乳酸杆菌进行检测,扩增片断长度为223 bp,金黄色葡萄球菌、蜡样芽孢杆菌、李斯特菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、铜绿假单孢菌5种菌作为阴性对照菌。结果:该引物能扩增7株乳酸杆菌,结果为阳性;阴性对照菌结果为阴性。结论:该方法快速、灵敏、特异,为啤酒中乳酸杆菌的快速检测提供了有效的途径。 展开更多
关键词 PCR 检测 啤酒 乳酸杆菌
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杭州市首例新型冠状病毒肺炎病例病毒全基因组序列测定及分析 被引量：7
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作者 俞骅 王旭初 +7 位作者 李钧 钱昕 于新芬 孙昼 陈珺芳 考庆君 汪皓秋 潘劲草 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期486-490,共5页
目的:分析杭州市首例感染新型冠状病毒(2019-nCoV)病例病毒全基因组序列特征。方法:采集杭州市首例新型冠状病毒肺炎病例咽拭子和深咳痰液呼吸道标本,对标本进行病毒核酸提取和实时逆转录PCR检测,对病毒进行高通量基因组测序;从美国国... 目的:分析杭州市首例感染新型冠状病毒(2019-nCoV)病例病毒全基因组序列特征。方法:采集杭州市首例新型冠状病毒肺炎病例咽拭子和深咳痰液呼吸道标本,对标本进行病毒核酸提取和实时逆转录PCR检测,对病毒进行高通量基因组测序;从美国国立生物技术信息中心GenBank数据库中获取29条(分别来自武汉、深圳、日本、美国、澳大利亚和芬兰)2019-nCoV基因组序列和其他物种来源的30条β冠状病毒基因组进行系统发育分析。对15株武汉地区毒株基因组以突变位点进行分组,鉴定其他地区相同和特异性突变位点。结果:获得29833 bp长度的杭州首例感染2019-nCoV病例病毒的基因组序列,覆盖病毒编码区全长。系统发育分析表明,该病毒与云南蝙蝠中分离到的严重急性呼吸综合征样冠状病毒RaTG13株最为接近,相似性为96.11%;相较其他基因,E基因间相似性最高(99.56%),而编码病毒表面刺突蛋白的S基因间相似性最低(92.87%)。与来自武汉、深圳、日本、美国、澳大利亚和芬兰的29株2019-nCoV基因组序列进行比对,相似性均大于99.9%,但在一些毒株中也发现了一些单位点核苷酸多态性。结论:杭州首例感染2019-nCoV病例病毒基因组序列和来自国内外疫情早期病毒基因组高度近源。 展开更多
关键词 基因组 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎
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2021-2022年杭州新型冠状病毒阳性病例中人鼻病毒的共感染特征分析
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作者 程实 于新芬 +2 位作者 曹飞飞 周银燕 潘劲草 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2024年第3期299-303,共5页
目的了解新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)阳性病例中人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)的共感染特征及系统进化特征。方法使用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR)对7... 目的了解新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)阳性病例中人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)的共感染特征及系统进化特征。方法使用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR)对7213份2019-nCoV核酸阳性样本进行了包括HRV在内的10种常见呼吸道病毒检测,分析其共感染特征;对HRV核酸阳性样本进行了VP4/VP2基因片段测序并构建进化树,分析其系统进化特征。结果2019-nCoV核酸阳性样本中合并HRV感染最多,为97例,阳性率1.34%;其次是普通冠状病毒(coronavirus,CoV),为36例,阳性率0.50%。HRV共感染率与其他病毒相比,差异具有统计学意义(χ^(2)=318.09,P<0.001)。18岁以下组HRV共感染率最高,差异具有统计学意义(χ^(2)=36.77,P<0.001)。共感染HRV未呈现明显季节性。其中39株HRV基因片段测序成功(39/97,40.21%),进化树分析表明,10株被划分到HRV-A组,9株被划分到HRV-B组,20株被划分到HRV-C组。39份样本共检测到17个血清型,其中B6和C15为优势血清型,分别为6株(HRV-B中占比66.67%)和14株(HRV-C中占比70%),其他血清型呈散在分布。结论HRV是2019-nCoV核酸阳性病例中共感染率最高的病毒类呼吸道病原体,共感染率在18岁以下组最高。杭州地区2019-nCoV阳性病例中共感染的HRV-A组、HRV-B组和HRV-C组均有发现,血清型呈现多样性。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 人鼻病毒 共感染
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杭州市儿童腺病毒感染的流行病学与病原学特征 被引量：6
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作者 谢立 杨旭辉 +2 位作者 王婧 孙昼 于新芬 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2019年第4期436-439,476,共5页
目的了解杭州市儿童腺病毒(Adenovirus,Adv)感染流行病学和病原学特征。方法收集2011年6月-2014年5月杭州市儿童急性上呼吸道感染哨点监测病例和暴发疫情信息,采集病例标本进行Adv检测和基因型鉴定,描述性分析Adv感染特征。结果儿童急... 目的了解杭州市儿童腺病毒(Adenovirus,Adv)感染流行病学和病原学特征。方法收集2011年6月-2014年5月杭州市儿童急性上呼吸道感染哨点监测病例和暴发疫情信息,采集病例标本进行Adv检测和基因型鉴定,描述性分析Adv感染特征。结果儿童急性上呼吸道感染监测病例的Adv检出阳性率为8.53%(32/375),其中城区、农村分别为11.02%、3.85%(χ^2=5.60,P=0.02),男、女性分别为7.17%、9.87%(χ^2=0.71,P=0.40),0-3、4-7、8-11、12-14岁分别为6.54%、13.56%、15.62%、11.11%(χ^2=4.43,P=0.22)。Adv感染临床表现包括急性咽喉炎、咽结膜热、急性呼吸道感染、肺炎等。共报告6起Adv感染暴发疫情,包括Adv-Ⅱ型5起、Adv-Ⅱ型1起;其中2起Adv-III型暴发中20株毒株与GenBank中Adv-III型毒株hexcon基因的核苷酸同源性为98.7%-100%。结论Adv为杭州市儿童急性上呼吸道感染的重要致病原,以Adv-III型为主。建议加强儿童Adv感染流行病学和病原学监测、暴发疫情控制以及Adv疫苗的研发。 展开更多
关键词 腺病毒 哨点监测 暴发 基因型
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多重实时PCR检测致泻性大肠埃希菌志贺毒素和紧密素基因 被引量：6
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作者 于新芬 潘劲草 +4 位作者 孟冬梅 叶榕 汪皓秋 张蔚 谢立 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期529-532,共4页
目的 建立多重实时PCR检测志贺毒素（stx1、stx2）基因和紧密素基因（eae）的方法。方法 优化多重实时PCR反应条件，检测系列稀释的阳性菌DNA提取物及纯化阳性质粒。检测42株携带已知毒力基因的大肠埃希菌株，并比较其阳性和阴性符合率... 目的 建立多重实时PCR检测志贺毒素（stx1、stx2）基因和紧密素基因（eae）的方法。方法 优化多重实时PCR反应条件，检测系列稀释的阳性菌DNA提取物及纯化阳性质粒。检测42株携带已知毒力基因的大肠埃希菌株，并比较其阳性和阴性符合率。对比3种粪便样品处理和DNA提取方法，选出最适方法。同时用该方法对36份腹泻患者粪便标本进行直接检测且对阳性标本进行菌株分离和鉴定。结果 多重实时PCR方法最低可以检测到10^1拷贝／pJ的毒力基因和10。CFU／p．1的DEL933大肠埃希菌。检测42株携带已知毒力基因的大肠埃希菌的阳性和阴性符合率均为100％。粪便样品的DNA提取以BP肉汤增菌6h后煮沸提取效果最好。36份腹泻患者粪便中2份eae阳性，均鉴定为大肠埃希菌。结论 建立的同时检测stx1、stx2、eae基因的多重实时PCR方法，具有较高的敏感性，可用于产志贺毒素大肠埃希菌（STEC）和肠致病性大肠埃希菌（EPEC）毒力基因鉴定及临床腹泻粪便标本的快速筛检。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 毒力 基因 大肠杆菌
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