葡萄果实硬度及影响硬度的主要因素 被引量：44

1

作者 彭永彬 李玉 +2 位作者 徐鹏程 王晨 上官凌飞 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期1227-1234,共8页

葡萄果实硬度是葡萄果实商品性的重要衡量指标,越来越受到果树生产者和育种者的重视。为了使人们对相关研究成果有更好的了解,促进对葡萄果实硬度的进一步深入研究,文章就葡萄果实硬度及影响硬度的主要因素的研究进展进行了总结归纳和梳... 葡萄果实硬度是葡萄果实商品性的重要衡量指标,越来越受到果树生产者和育种者的重视。为了使人们对相关研究成果有更好的了解,促进对葡萄果实硬度的进一步深入研究,文章就葡萄果实硬度及影响硬度的主要因素的研究进展进行了总结归纳和梳理,阐述了葡萄果实硬度及测量方法,生长发育过程中和采后贮藏期葡萄果实硬度的变化规律,以及影响葡萄果实硬度的内外因素,内部因素即果实细胞自身结构和所含有的特殊离子成分,外部因素为外源激素以及外界环境条件。 展开更多

关键词 葡萄 硬度 发育阶段 影响因素 生长调节剂

下载PDF 职称材料

梨EST-SSR标记的开发及其在梨品种遗传多样性分析中的应用评价 被引量：40

2

作者 王西成 姜淑苓 +4 位作者 上官凌飞 曹玉芬 乔玉山 章镇 房经贵 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第24期5079-5087,共9页

【目的】分析梨EST中SSR位点分布规律,开发梨EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于梨品种遗传差异研究的可行性。【方法】从NCBI公共数据库中下载梨表达序列标签(expressed sequence tag,EST)1293条,利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条... 【目的】分析梨EST中SSR位点分布规律,开发梨EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于梨品种遗传差异研究的可行性。【方法】从NCBI公共数据库中下载梨表达序列标签(expressed sequence tag,EST)1293条,利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条件的序列选出,利用Primer3.0Plus软件设计48对引物,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增特点,并对部分扩增产物克隆与测序,以验证其真实性。【结果】1293条梨的EST序列中含有SSR位点的序列为82条,SSR位点92个。二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是最主要的SSR类型,分别占48.91%、17.39%和17.39%。48对引物中有31对引物能扩增出理想的PCR产物,其中27对引物扩增条带具有多态性。同时发现11对引物中,有83.87%的片段具有相应的SSR位点。聚类结果表明,梨被明显地区分成东方梨和西方梨两大群,分类效果明显。【结论】梨EST-SSR标记开发效率较高,是梨SSR标记开发的重要措施,对于梨品种的鉴定与遗传多样性分析具有重要应用价值。 展开更多

关键词 梨 EST SSR 遗传多样性

下载PDF 职称材料

葡萄浆果着色分子机理的重要研究进展 被引量：28

3

作者 孙欣 韩键 +4 位作者 房经贵 上官凌飞 王西成 宋长年 李晓颖 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期333-342,共10页

葡萄浆果的颜色主要是由花色苷的量决定的,花色苷的生物合成受结构基因和调节基因的控制。葡萄浆果着色是一个非常复杂的过程,不同种葡萄乃至同品种群不同品种的着色机制特性不同。近些年来,Myb调控葡萄花色苷生物合成机理的发现使人们... 葡萄浆果的颜色主要是由花色苷的量决定的,花色苷的生物合成受结构基因和调节基因的控制。葡萄浆果着色是一个非常复杂的过程,不同种葡萄乃至同品种群不同品种的着色机制特性不同。近些年来,Myb调控葡萄花色苷生物合成机理的发现使人们对花色苷生物合成有了更进一步的了解。 展开更多

关键词 葡萄 着色 花色苷

原文传递

杏EST-SSR标记的开发 被引量：29

4

作者 上官凌飞 李晓颖 +3 位作者 宁宁 王玉柱 章镇 房经贵 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期43-54,共12页

利用MISA软件对NCBI上杏的15387条EST序列进行SSR位点查找,发掘出含有SSR位点的序列1073条,共有1353个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为8.79%。二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占23.50%、38.80%和23.43%。设计... 利用MISA软件对NCBI上杏的15387条EST序列进行SSR位点查找,发掘出含有SSR位点的序列1073条,共有1353个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为8.79%。二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占23.50%、38.80%和23.43%。设计了50对EST-SSR引物并进行PCR扩增,发现40对引物能扩增出理想的PCR产物,其中有25对引物能够扩增出多态性带。随机对7对引物的部分杏扩增片段进行了测序分析,发现有57.1%的片段具有相应的SSR位点,对梅DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明是杏扩增出的相应的SSR位点。根据推算,从杏EST中开发SSR标记的开发效率为3.98%。进一步选用20对扩增效果最好的引物对24个杏品种,16个花梅品种以及8个果梅品种进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果表明,来源于杏的EST-SSR引物在梅中有很高的通用性,杏和梅是遗传差异明显的两种植物,果梅与花梅在遗传上是不能分为两类的同种植物。 展开更多

关键词 杏 梅 EST-SSR 遗传差异分析

原文传递

葡萄NAC转录因子家族生物信息学分析 被引量：27

5

作者 孙欣 上官凌飞 +3 位作者 房经贵 宋长年 王晨 慕茜 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期229-242,共14页

NAC基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及器官建成、逆境胁迫应答等反应。目前,基因组信息的挖掘和分析已经成为葡萄功能基因组学研究的重要组成部分。本文利用生物信息学方法对葡萄143条NAC蛋白序列的... NAC基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及器官建成、逆境胁迫应答等反应。目前,基因组信息的挖掘和分析已经成为葡萄功能基因组学研究的重要组成部分。本文利用生物信息学方法对葡萄143条NAC蛋白序列的系统发生和NAC基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的NAC基因家族之间的联系。结果显示这143条蛋白序列与拟南芥94个NAC基因蛋白序列一起分成了16个亚族,说明拟南芥与葡萄NAC基因间具有较高的保守性。基因组定位结果发现143条NAC基因分布在17条染色体上。研究还发现不同亚家族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;而它们的二级结构都主要以随机卷曲为组成部分,且143条氨基酸序列三维结构十分相似。本文试验结果将为葡萄NAC基因家族的进一步功能分析提供重要研究基础。 展开更多

关键词 葡萄 拟南芥 NAC转录因子 生物信息学

下载PDF 职称材料

葡萄SBP基因家族生物信息学分析 被引量：21

6

作者 曹雪 上官凌飞 +4 位作者 于华平 杨光 王晨 谭洪花 房经贵 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期791-798,共8页

SBP(squamosa promoter binding protein,SBP)基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导。葡萄是继拟南芥、水稻和杨树之后完成全基因组测序的第四种开花植物,因此葡萄逐渐成为分... SBP(squamosa promoter binding protein,SBP)基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导。葡萄是继拟南芥、水稻和杨树之后完成全基因组测序的第四种开花植物,因此葡萄逐渐成为分子生物学研究的重点对象,进行葡萄基因组信息挖掘与分析对于葡萄功能基因组学的发展具有重要意义。本文利用生物信息学方法对葡萄家族45条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的SBP基因家族之间的联系。结果显示这45条蛋白序列与拟南芥16个SBP基因蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与葡萄SBP基因间具有较高的保守性;进一步的基因组定位结果发现其分布在14条染色体上,较拟南芥在染色体上的分布更为分散。研究还发现不同亚家族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;而二级结构预测结果发现,41条氨基酸序列以随机卷曲为主要组成部分,这与拟南芥相似,且45条氨基酸序列三维结构十分相似。本文实验结果均为葡萄SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础。 展开更多

关键词 葡萄 拟南芥 SBP基因家族 生物信息学

下载PDF 职称材料

葡萄品种资源裂果性状调查与分析 被引量：17

7

作者 王旭旭 樊秀彩 +4 位作者 李傲 张超博 房经贵 刘崇怀 上官凌飞 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2099-2108,共10页

选取252个鲜食葡萄品种(111个欧美杂种,141个欧亚种),分别在转色期、成熟期、过熟期采集果实,通过清水浸泡试验,了解比较其裂果情况。结果表明,葡萄裂果症状有环裂、纵裂、纵环裂和龟裂等,龟裂只在欧亚种葡萄出现;欧亚种葡萄比欧美杂种... 选取252个鲜食葡萄品种(111个欧美杂种,141个欧亚种),分别在转色期、成熟期、过熟期采集果实,通过清水浸泡试验,了解比较其裂果情况。结果表明,葡萄裂果症状有环裂、纵裂、纵环裂和龟裂等,龟裂只在欧亚种葡萄出现;欧亚种葡萄比欧美杂种葡萄裂果严重;成熟期裂果最严重;欧美杂种小果粒葡萄品种更容易裂果;果皮厚、果肉质地软的葡萄不易裂果。不同葡萄品种的裂果倾向性存在较大差异,通过研究清水浸泡后葡萄发生裂果的情况,对葡萄裂果有了初步认识,为葡萄品种选择及葡萄育种亲本选择提供一定理论支撑。 展开更多

关键词 葡萄 品种资源 裂果 性状

原文传递

不同葡萄品种的VvmybA1基因型及其特征性DNA片段的序列分析 被引量：16

8

作者 慕茜 吴伟民 +3 位作者 房经贵 孙欣 上官凌飞 赵密珍 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2075-2084,共10页

对59个葡萄品种的VvmybA1基因型进行了研究,发现在所有果皮为红色或紫黑色的葡萄品种中,除了‘黑奇’为VvmybA1c的纯合型外,其它都是VvmybA1a与VvmybA1b或VvmybA1a与VvmybA1c的基因位点的杂合状态。大部分果皮为白色的品种为VvmybA1a纯... 对59个葡萄品种的VvmybA1基因型进行了研究,发现在所有果皮为红色或紫黑色的葡萄品种中,除了‘黑奇’为VvmybA1c的纯合型外,其它都是VvmybA1a与VvmybA1b或VvmybA1a与VvmybA1c的基因位点的杂合状态。大部分果皮为白色的品种为VvmybA1a纯合型,但有7个果皮呈白色的品种基因位点为VvmybA1a与VvmybA1b或VvmybA1a与VvmybA1c杂合型。相关特征性DNA片段序列分析发现葡萄品种间存在个别碱基的差异。 展开更多

关键词 葡萄 果皮 颜色 花色素苷 VvmybA1

原文传递

巨峰葡萄系谱的SSR与RAPD分析 被引量：16

9

作者 冷翔鹏 刘崇怀 +2 位作者 房经贵 谭洪花 上官凌飞 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1560-1566,共7页

利用RAPD和SSR 2种标记分别对系谱关系明确的22个巨峰系葡萄品种进行聚类分析,以验证2种标记方法的正确性与可靠性。结果显示,11条RAPD引物和12对SSR引物,分别扩增了82和43个清晰的条带。RAPD与SSR引物扩增的条带中分别有58和31条多态性... 利用RAPD和SSR 2种标记分别对系谱关系明确的22个巨峰系葡萄品种进行聚类分析,以验证2种标记方法的正确性与可靠性。结果显示,11条RAPD引物和12对SSR引物,分别扩增了82和43个清晰的条带。RAPD与SSR引物扩增的条带中分别有58和31条多态性带,其多态性比率分别为70.7%和72.1%。2种分子标记聚类结果基本一致,并且都能有效地将品种区分开来以及正确反映22个葡萄品种的亲缘关系。研究结果说明RAPD和SSR 2种分子标记均适合于巨峰系葡萄的系谱分析和种质遗传多样性研究。 展开更多

关键词 SSR RAPD 葡萄 系谱分析

下载PDF 职称材料

桃NAC基因家族生物信息学分析 被引量：14

10

作者 张春华 上官凌飞 +2 位作者 俞明亮 张彦苹 马瑞娟 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期406-414,共9页

NAC基因家族是最大的植物特有的转录因子家族之一,因在植物发育和逆境应答过程中起着多样的作用而被广泛关注。为进一步进行桃NAC家族基因鉴定、功能分析等研究提供基础信息,采用生物信息学方法预测了桃NAC基因家族成员数目、在基因组... NAC基因家族是最大的植物特有的转录因子家族之一,因在植物发育和逆境应答过程中起着多样的作用而被广泛关注。为进一步进行桃NAC家族基因鉴定、功能分析等研究提供基础信息,采用生物信息学方法预测了桃NAC基因家族成员数目、在基因组骨架上分布、表达模式、假定蛋白质结构和亚族分类。预测结果显示桃NAC基因家族包含115个假定NAC蛋白质,被分为17个亚族,且与拟南芥中NAC家族基因具有一定的相似性;1个NAC基因分布在11号骨架上,其余分布在1～8号基因组骨架上;对一级结构的分析结果显示桃NAC家族蛋白质分子量和氨基酸数目成正相关,绝大多数是亲水氨基酸,各亚族间等电点没有规律;115个蛋白质的二级结构全部以无规则卷曲为主要构成元件,且它们的三级结构大部分相似。在果皮中表达的NAC家族基因数最多,达到75%;在花芽中表达的NAC家族基因数较少,为1%。 展开更多

关键词 桃 NAC基因家族 生物信息学

下载PDF 职称材料

基于EST库的枳APETALA2基因cDNA克隆及其表达分析 被引量：12

11

作者 宋长年 房经贵 +2 位作者 王晨 上官凌飞 章镇 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期799-806,共8页

根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法以拟南芥APETALA2 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,克隆了柑橘APETALA2基因的cDNA序列,并以枳[Ponci-rustri foliata(L.)Raf.]花cDNA为模板,根据以上cDNA序列... 根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法以拟南芥APETALA2 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,克隆了柑橘APETALA2基因的cDNA序列,并以枳[Ponci-rustri foliata(L.)Raf.]花cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计特异引物,利用RACE技术分别获得该基因的5′和3′末端,序列拼接后获得枳的APETALA2 cDNA全长。该cDNA全长为1980bp,命名为Pt-AP2。Pt-AP2核苷酸序列有一个1539bp完整的开放读码框(ORF),5′末端起始密码子ATG其始于290bp,3′末端非翻译区为152bp,其中含有27bp的Ploy+(A)。该基因已在GenBank基因数据库注册,注册号为EU883665。推导该cDNA编码512个氨基酸,与苹果、矮牵牛和拟南芥中相应序列同源性分别为59.1%、59.7%和63.8%。序列分析表明,Pt-AP2除了具备完全保守的核定位信号序列(KKSR)外,还具有两个高度保守的重复序列即AP2结构域。分别采用半定量RT-PCR和SYBR GreenI实时定量RT-PCR方法分析Pt-AP2在枳叶、茎、根、花和果等不同器官中的表达水平,结果一致表明Pt-AP2在各个器官中的表达水平不同,花中的表达量最高,果实中的表达量最低。 展开更多

关键词 柑橘 枳 花器官发育 基因 表达分析

原文传递

核桃RAPD引物筛选及品种间亲缘关系研究 被引量：11

12

作者 张美勇 上官凌飞 +2 位作者 徐颖 相昆 房经贵 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2010年第2期84-90,共7页

以30个核桃品种为试验材料,首次建立了11 nt引物长度的优化核桃RAPD技术体系。从40个11 bp碱基中共筛选出适用于核桃遗传多样性分析18个11 nt引物。这些引物在30个核桃品种中共扩增出111个DNA片段,片段大小在5003050之间,其中77个DNA片... 以30个核桃品种为试验材料,首次建立了11 nt引物长度的优化核桃RAPD技术体系。从40个11 bp碱基中共筛选出适用于核桃遗传多样性分析18个11 nt引物。这些引物在30个核桃品种中共扩增出111个DNA片段,片段大小在5003050之间,其中77个DNA片段表现出多态性,占总扩增片段的69.4%。根据RAPD指纹信息对核桃品种资源的遗传距离进行了分析,并据此构建了聚类树状图。从聚类结果看,30个核桃品种可以划分成遗传差异较明显的10组。 展开更多

关键词 核桃 RAPD 遗传关系 引物筛选

下载PDF 职称材料

文心兰类原球茎液体增殖过程中秋水仙素化学诱变 被引量：12

13

作者 崔广荣 上官凌飞 +3 位作者 张子学 胡能兵 张从宇 侯喜林 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1385-1389,共5页

采用秋水仙素对液体增殖培养中的文心兰类原球茎进行多倍体诱变,获得了大量的文心兰多倍体试管苗。结果表明,秋水仙素浓度越高,处理时间越长,类原球茎受伤害程度越严重,再生苗多倍体比例越大,最高诱变率可达46.7%;低浓度,短时间秋水仙... 采用秋水仙素对液体增殖培养中的文心兰类原球茎进行多倍体诱变,获得了大量的文心兰多倍体试管苗。结果表明,秋水仙素浓度越高,处理时间越长,类原球茎受伤害程度越严重,再生苗多倍体比例越大,最高诱变率可达46.7%;低浓度,短时间秋水仙素处理易产生嵌合体;四倍体试管苗植株粗短,健壮,叶片宽厚,叶片下表皮气孔张度较大,下表皮细胞核较大且靠近细胞壁边缘;根尖细胞染色体数加倍。 展开更多

关键词 文心兰 类原球茎 多倍体 秋水仙素 液体培养 化学诱变

原文传递

葡萄EST-SSR标记的开发及其应用 被引量：11

14

作者 郭磊 上官凌飞 +2 位作者 房经贵 刘崇怀 于华平 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期23-30,共8页

从NCBI公共数据库中随机下载葡萄表达序列标签(expressed sequence tag,EST)8 925条,利用Phrap软件对这些序列进行拼接后形成5 642条序列,利用MISA软件共发掘出含有SSR位点的序列336条,共含有367个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为6.50... 从NCBI公共数据库中随机下载葡萄表达序列标签(expressed sequence tag,EST)8 925条,利用Phrap软件对这些序列进行拼接后形成5 642条序列,利用MISA软件共发掘出含有SSR位点的序列336条,共含有367个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为6.50%。二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复单元的SSR数目分别为79(21.53%)、83(22.62%)、29(7.9%)、60(16.35%)和116(31.61%)。利用Primer 3.0 Plus软件随机设计50对引物进行PCR扩增,用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析这些SSR引物的PCR扩增产物多态性。50对引物中有36对引物能在20个葡萄品种中扩增出理想的PCR产物,占总引物的72%。其中,26对引物扩增条带具有多态性。利用16对经过验证的EST-SSR引物对20个葡萄品种亲缘关系的分析获得了理想的研究结果。 展开更多

关键词 葡萄 EST SSR 遗传多样性

下载PDF 职称材料

DNA标记在植物品种鉴定上的应用现状 被引量：11

15

作者 朱旭东 上官凌飞 +2 位作者 孙欣 王晨 房经贵 《中国农学通报》 CSCD 2014年第30期234-240,共7页

为了全面地了解DNA指纹在品种鉴定上的利用现状,更重要的是促进DNA指纹技术切实有效的应用于植物品种鉴定,本研究归纳了目前开发出的可用于植物品种鉴定的DNA指纹技术,指出已有的DNA指纹品种鉴定技术的优势与不足,总结了DNA指纹应用于... 为了全面地了解DNA指纹在品种鉴定上的利用现状,更重要的是促进DNA指纹技术切实有效的应用于植物品种鉴定,本研究归纳了目前开发出的可用于植物品种鉴定的DNA指纹技术,指出已有的DNA指纹品种鉴定技术的优势与不足,总结了DNA指纹应用于品种鉴定的分析措施,并认为受限于缺乏可以将DNA指纹转化为植物鉴定信息的理想措施,所以DNA标记还未真正有效地应用于生产实践中,因此提出一种基于DNA指纹的人工绘制品种鉴定简图(MCID)法是很重要的,本研究也重点阐述了MCID法的实施过程。 展开更多

关键词 品种鉴定 分子标记 人工绘制植物品种鉴别图

下载PDF 职称材料

植物激素对果树单性结实调控的研究进展 被引量：10

16

作者 王西成 王晨 +3 位作者 房经贵 上官凌飞 刘洪 韩键 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期629-636,共8页

尽管种子与果实的发育过程密切相关,但由于无籽果实提高了果实的品质并延长了货架期,因此无籽果实受到生产者和消费者的广泛青睐。果实的生长受激素调控,而相关研究也初步揭示了激素在单性结实果实形成过程中的作用。本文对单性结实的... 尽管种子与果实的发育过程密切相关,但由于无籽果实提高了果实的品质并延长了货架期,因此无籽果实受到生产者和消费者的广泛青睐。果实的生长受激素调控,而相关研究也初步揭示了激素在单性结实果实形成过程中的作用。本文对单性结实的概念、诱导单性结实的激素种类及功能、诱导机理,以及转基因技术在单性结实果实生产中的应用概况进行了综述,以期为果树单性结实的研究提供参考。 展开更多

关键词 激素 果树 单性结实 无籽果实

原文传递

利用GenBank中大量葡萄EST序列分离有效基因的电子表达分析平台 被引量：10

17

作者 上官凌飞 王晨 +3 位作者 房经贵 李晓颖 王西成 宋长年 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第13期2748-2759,共12页

【目的】充分利用GenBank上的大量葡萄EST序列,建立本地化基因电子表达分析平台,实现基因表达模式的大规模快速分析。【方法】利用生物信息学方法对GenBank上的362 193条葡萄EST序列进行本地化及后续处理,建立电子分析平台,并通过RT-PC... 【目的】充分利用GenBank上的大量葡萄EST序列,建立本地化基因电子表达分析平台,实现基因表达模式的大规模快速分析。【方法】利用生物信息学方法对GenBank上的362 193条葡萄EST序列进行本地化及后续处理,建立电子分析平台,并通过RT-PCR技术对其电子分析准确性进行验证。【结果】建立了包含叶、花等11个组织类别和GA3等5个胁迫类型的基因电子表达分析平台。通过VvAG、VvCHS、VvF3H、VvLDOX等4个葡萄基因的RT-PCR和电子表达分析结果比较发现,平台预测效率较高,在预测EST来源数较多的果实、花序、花组织的表达效果较好,而对叶等EST来源较少的组织的预测效果需结合试验判断。随着dbEST库中源于葡萄各组织EST序列数量的大量增加,平台的预测效果将更加符合基因表达的实际情况。【结论】葡萄基因电子表达分析平台预测效率较高,为葡萄基因大规模快速表达分析以及重要相关信息的挖掘提供了很好的分析工具。 展开更多

关键词 葡萄 电子表达分析 表达序列标签(EST) 生物信息学

下载PDF 职称材料

梅EST-SSR标记的开发及利用 被引量：9

18

作者 上官凌飞 李晓颖 +4 位作者 宋长年 王西成 王玉柱 章镇 房经贵 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1766-1772,共7页

利用MISA软件对10 123条梅EST序列进行SSR位点查找,得到含SSR位点的序列935条,SSR位点1 233个,平均每100条EST序列中含有12.18个SSR位点。2核苷酸、3核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占35.52%和41.36%。设计了40对EST-SSR引物并进行扩... 利用MISA软件对10 123条梅EST序列进行SSR位点查找,得到含SSR位点的序列935条,SSR位点1 233个,平均每100条EST序列中含有12.18个SSR位点。2核苷酸、3核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占35.52%和41.36%。设计了40对EST-SSR引物并进行扩增,有24对引物能扩增出理想的PCR产物,其中17对引物具有较好的扩增多态性。测序后发现13对引物中有73.08%的片段具有相应的SSR位点,对杏DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明了是梅扩增出的相应的SSR位点。根据本研究含有SSR位点的测序结果推算,从梅EST中开发真实SSR位点的数目为901。随机选择13对引物对杏和梅进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果发现,来源于梅的EST-SSR引物在杏中有很高的通用性,这些引物把梅和杏分成了两大群体,说明他们是遗传差异明显的两种植物。 展开更多

关键词 梅 杏 EST-SSR 遗传差异分析

下载PDF 职称材料

‘金星无核’葡萄短节间突变体的遗传变异和内源激素水平分析 被引量：9

19

作者 吴伟民 王庆莲 +5 位作者 房经贵 钱亚明 上官凌飞 赵密珍 王静 于红梅 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期2486-2491,共6页

以秋水仙素处理‘金星无核’葡萄获得的短节间突变体植株‘3-2D-05’和‘金星无核’植株新抽枝梢嫩叶、梢尖和茎段为材料,利用高效液相色谱(HPLC)法测定了新抽枝梢不同部位内源GA3、IAA及ABA的含量及比值差异;采用细胞流式仪分析两种材... 以秋水仙素处理‘金星无核’葡萄获得的短节间突变体植株‘3-2D-05’和‘金星无核’植株新抽枝梢嫩叶、梢尖和茎段为材料,利用高效液相色谱(HPLC)法测定了新抽枝梢不同部位内源GA3、IAA及ABA的含量及比值差异;采用细胞流式仪分析两种材料叶细胞染色体倍性,并通过RAPD和SSR两种标记对两种植株进行分子鉴定,以明确两者的遗传差异。结果显示:(1)与‘金星无核’相比,突变体‘3-2D-05’植株嫩叶、梢尖和茎段中的内源GA3、IAA和ABA含量均降低;‘3-2D-05’植株嫩叶、梢尖和茎段中的内源GA3、IAA和ABA含量总和分别为‘金星无核’的29.58%、20.04%和20.03%,GA3/IAA值分别为‘金星无核’的1.30倍、0.97倍和0.89倍。(2)两种材料叶片细胞的染色体倍性一致,DNA序列差异不大,其遗传背景表现出高度一致性。研究表明,秋水仙素处理‘金星无核’获得的染色体倍性未发生变化的葡萄短节间变异与调控内源激素的基因有关,秋水仙素诱发了基因突变,产生了节间变短的葡萄新种质。 展开更多

关键词 葡萄 秋水仙素 短节间突变体 内源激素 遗传差异

下载PDF 职称材料

葡萄种质资源花序的调查与分析 被引量：9

20

作者 许瀛之 张文颖 +3 位作者 上官凌飞 樊秀彩 刘崇怀 房经贵 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期488-497,共10页

葡萄产量与品质和花序数量、特点、结构等密切相关。葡萄品种资源众多,不同品种结实系数、花序着生节位以及花序的结构等存在差异,花芽分化的高低与修剪有关。为对葡萄花序有更好的认识,以及为更好地利用葡萄种质资源、葡萄育种亲本选... 葡萄产量与品质和花序数量、特点、结构等密切相关。葡萄品种资源众多,不同品种结实系数、花序着生节位以及花序的结构等存在差异,花芽分化的高低与修剪有关。为对葡萄花序有更好的认识,以及为更好地利用葡萄种质资源、葡萄育种亲本选择以及栽培管理措施的实施提供一定理论参考,本研究对205份葡萄种质资源的花序特点进行了调查分析。研究发现:葡萄花序类型有花序紧凑型、花序松散型、无卷须型、卷须紧靠花序型、卷须非紧靠花序型等,欧美杂种花序着生初节位分布在3和4,其结实系数为1或2。欧亚种初节位分布在4和5,其结实系数主要为1。抽生花序节位的芽比非抽生花序节位的芽大。花序增长速度在开花前7d时最大。 展开更多

关键词 葡萄 种质资源 花序

下载PDF 职称材料