目的:基于网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure, CRF)的作用机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP...目的:基于网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure, CRF)的作用机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索柴胡、黄芩的活性成分及其相关靶点。通过在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)和GeneCards数据库检索CRF相关靶点。应用Draw Venn Diagram在线工具将柴胡、黄芩活性成分相关靶点与CRF相关靶点取交集并绘制韦恩图,得到的交集靶点即柴胡-黄芩治疗CRF的潜在靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“活性成分-潜在靶点”网络图。采用STRING11.0数据库构建潜在靶点蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,并筛选柴胡-黄芩治疗CRF的核心靶点。将潜在靶点导入Metascape平台进行基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析中的生物学过程(biological process, BP)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析,并采用Cytoscape 3.8.0软件构建“潜在靶点-信号通路”网络图。结果:基于TCMSP得到柴胡活性成分13种、黄芩活性成分32种及216个相关靶点。从GeneCards数据库及OMIM数据库获得CRF相关靶点2 607个,活性成分相关靶点与CRF相关靶点进行映射,得到137个柴胡-黄芩治疗CRF的潜在作用靶点。PPI网络分析得到6个核心靶点。GO功能富集分析共得到5 437个BP条目,KEGG信号通路富集分析筛选得到434条信号通路。结论:柴胡-黄芩可通过多成分、多靶点、多通路治疗CRF。展开更多
文摘目的:基于网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure, CRF)的作用机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索柴胡、黄芩的活性成分及其相关靶点。通过在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)和GeneCards数据库检索CRF相关靶点。应用Draw Venn Diagram在线工具将柴胡、黄芩活性成分相关靶点与CRF相关靶点取交集并绘制韦恩图,得到的交集靶点即柴胡-黄芩治疗CRF的潜在靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“活性成分-潜在靶点”网络图。采用STRING11.0数据库构建潜在靶点蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,并筛选柴胡-黄芩治疗CRF的核心靶点。将潜在靶点导入Metascape平台进行基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析中的生物学过程(biological process, BP)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析,并采用Cytoscape 3.8.0软件构建“潜在靶点-信号通路”网络图。结果:基于TCMSP得到柴胡活性成分13种、黄芩活性成分32种及216个相关靶点。从GeneCards数据库及OMIM数据库获得CRF相关靶点2 607个,活性成分相关靶点与CRF相关靶点进行映射,得到137个柴胡-黄芩治疗CRF的潜在作用靶点。PPI网络分析得到6个核心靶点。GO功能富集分析共得到5 437个BP条目,KEGG信号通路富集分析筛选得到434条信号通路。结论:柴胡-黄芩可通过多成分、多靶点、多通路治疗CRF。
