假丝酵母属疑难菌株大亚基rDNA D1/D2区域序列分析及其分类学意义 被引量：75

1

作者 白逢彦 贾建华 梁慧燕 《菌物系统》 CSCD 北大核心 2002年第1期27-32,共6页

对根据常规形态和生理生化性状难以确定分类学地位的8株假丝酵母菌，进行了以大亚基（26S）rDNA中D1/D2区域（均500-600bp)的碱基序列分析为依据的分子分类学研究。根据系统树上所显示的供试菌株与假丝酵母属及相关子囊菌酵母已知种的... 对根据常规形态和生理生化性状难以确定分类学地位的8株假丝酵母菌，进行了以大亚基（26S）rDNA中D1/D2区域（均500-600bp)的碱基序列分析为依据的分子分类学研究。根据系统树上所显示的供试菌株与假丝酵母属及相关子囊菌酵母已知种的亲缘关系，以及与最近缘种模式菌株D1/D2区域序列的相似性比较，确定了各个菌株的归属，本研究也显示了DNA序列分析在假丝酵母菌快速鉴定中的优越性。 展开更多

关键词 酵母菌 rrna基因序列分析 分子分类 假丝酵母属

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西伯利亚鲟(Acipenser baerii)致病性维氏气单胞菌的分离鉴定 被引量：73

2

作者 马志宏 杨慧 +2 位作者 李铁梁 罗琳 高俊莲 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1289-1294,共6页

【目的】本研究旨在寻找引起养殖西伯利亚鲟鱼(Acipenser baerii)病害的致病因子。【方法】从北京地区自然患病的西伯利亚鲟鱼体内分离到致病菌株X-1-06909,采用生理生化鉴定结合16SrRNA基因序列的系统发育学分析确定该菌株的系统发育... 【目的】本研究旨在寻找引起养殖西伯利亚鲟鱼(Acipenser baerii)病害的致病因子。【方法】从北京地区自然患病的西伯利亚鲟鱼体内分离到致病菌株X-1-06909,采用生理生化鉴定结合16SrRNA基因序列的系统发育学分析确定该菌株的系统发育地位。同时采用琼脂扩散法对抗菌类药物的敏感性进行测定。【结果】菌株X-1-06909与Aeromonas veroniiATCC35624T的16SrRNA基因序列相似性达99.6%;结合形态特征与生理生化测定结果,革兰氏阴性杆菌,具极生单鞭毛。发酵葡萄糖产酸,甲基红试验和乙酰甲基甲醇试验阳性,精氨酸双水解阴性,3%氯化钠生长,明胶水解阳性、七叶灵水解阳性等。在21种抗菌类药物对该菌的抑菌试验中,其中,头孢羟氨苄、新霉素等11种药物的抑菌效果较好。【结论】确定该菌株在分类上属于维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)。为进一步防治鲟鱼养殖病害提供依据。 展开更多

关键词 鲟鱼 维氏气单胞菌 生理生化 分离鉴定 16S rrna基因序列分析 药敏试验

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内蒙古呼伦贝尔地区传统发酵乳中乳酸菌的多样性分析 被引量：26

3

作者 呼斯楞 刘红新 +2 位作者 于洁 刘文俊 孙天松 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期984-990,共7页

【目的】对内蒙古呼伦贝尔地区传统发酵乳制品中乳酸菌资源的生物多样性进行研究。【方法】采用纯培养和16S rRNA基因序列分析法对内蒙古呼伦贝尔地区传统发酵乳中的乳酸菌进行多样性分析。【结果】从8份传统发酵乳制品(6份酸牛奶和2份... 【目的】对内蒙古呼伦贝尔地区传统发酵乳制品中乳酸菌资源的生物多样性进行研究。【方法】采用纯培养和16S rRNA基因序列分析法对内蒙古呼伦贝尔地区传统发酵乳中的乳酸菌进行多样性分析。【结果】从8份传统发酵乳制品(6份酸牛奶和2份酸马奶)样品中分离到24株乳酸菌,通过16S rRNA基因序列分析和系统进化关系分析将24株乳酸菌鉴定为2株Lactobacillus kefiranofaciens、2株Lactobacillus kefiri、5株Lactobacillus paracasei、3株Lactobacillus plantarum、1株Lactobacillus rhamnosus、6株Lactococcus lactis subsp.lactis、2株Leuconostoc mesenteroides subsp.dextranicum、2株Streptococcus thermophilus和1株Enterococcus faecium。【结论】Lactococcus lactis subsp.lactis为内蒙古呼伦贝尔地区传统发酵乳制品的优势菌种,占总分离株的25%,其次为Lactobacillus paracasei,占总分离株的20.83%。 展开更多

关键词 乳酸菌 多样性分析 16S rrna基因序列分析 系统发育树

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斑点叉尾鮰烂鳃病病原柱状黄杆菌的分离及鉴定 被引量：20

4

作者 刘礼辉 李宁求 +3 位作者 石存斌 潘厚军 付小哲 吴淑勤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第17期7124-7126,共3页

[目的]对从斑点叉尾鮰烂鳃病中分离的病原菌进行分类学地位鉴定。[方法]采用人工感染确定其病原性,常规生理生化鉴定和16SrRNA基因序列分析方法进行分析。[结果]该菌株为革兰氏阴性杆菌,滑行运动,无鞭毛,菌体大小为(0.3～0.5)μm×(... [目的]对从斑点叉尾鮰烂鳃病中分离的病原菌进行分类学地位鉴定。[方法]采用人工感染确定其病原性,常规生理生化鉴定和16SrRNA基因序列分析方法进行分析。[结果]该菌株为革兰氏阴性杆菌,滑行运动,无鞭毛,菌体大小为(0.3～0.5)μm×(5～10)μm,过氧化氢酶反应阳性,不能发酵和利用葡萄糖等多糖,不水解酪氨酸,不产生吲哚。所测16SrRNA基因序列经BLAST分析表明,与GeneBank上登录的柱状黄杆菌的16SrRNA序列同源性最高,其相似性达98.2%。基于16SrRNA基因序列构建的系统进化树表明,菌株GHS061212与柱状黄杆菌(AY841899)聚为1个分支,且置信度较高,为71.0%。[结论]菌株GHS061212被鉴定为柱状黄杆菌,这是国内首次报道斑点叉尾鮰烂鳃病病原为柱状黄杆菌。 展开更多

关键词 斑点叉尾鲴 烂鳃病 柱状黄杆菌 生理生化鉴定 16S rrna基因序列分析

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16S rRNA基因序列方法分析传统发酵菜中乳酸菌多样性 被引量：9

5

作者 燕平梅 张慧 +1 位作者 薛文通 畅晓晖 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 2007年第2期119-123,共5页

以发酵甘蓝卤水中微生物的总DNA为模板,用扩增革兰氏阳性菌16S rRNA基因的方法研究中国发酵甘蓝菜卤中乳酸菌的多样性。获得了42种含有1.5kb的16S rRNA基因插入核苷酸片段的克隆菌。利用克隆菌落核苷酸的部分序列和NCBI数据库中搜索到... 以发酵甘蓝卤水中微生物的总DNA为模板,用扩增革兰氏阳性菌16S rRNA基因的方法研究中国发酵甘蓝菜卤中乳酸菌的多样性。获得了42种含有1.5kb的16S rRNA基因插入核苷酸片段的克隆菌。利用克隆菌落核苷酸的部分序列和NCBI数据库中搜索到的相似序列进行对比后作出鉴定,结果得出4种独特的菌落,鉴定为Lactobacillus acidifarinae、植物乳杆菌(Lactobacillus Plantarum)、融合乳杆菌(Weissella confusa)和足球菌属(Pediococcus sp.)。此外,还发现两种非核糖体序列。用这种分子方法发现了常规分离培养技术未鉴定的乳酸菌,如Lactobacillus acidifarinae。 展开更多

关键词 乳酸菌多样性 16S rrna基因序列分析 中国泡菜 传统发酵

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43株甘肃临床分离非结核分枝杆菌分类鉴定 被引量：17

6

作者 张鑫 蔡静 +3 位作者 姜元 魏黛珏 李凯 同重湘 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期173-177,共5页

目的了解甘肃当前临床流行的非结核分枝杆菌(NTM)的病原谱特点及其主要NTM种类,为指导临床诊疗、有效防治NTM肺病提供参考依据。方法收集2012年~2014年来源于甘肃省不同地区的875株临床分离分枝杆菌菌株,经PNB/TCH方法初步鉴定为疑似NT... 目的了解甘肃当前临床流行的非结核分枝杆菌(NTM)的病原谱特点及其主要NTM种类,为指导临床诊疗、有效防治NTM肺病提供参考依据。方法收集2012年~2014年来源于甘肃省不同地区的875株临床分离分枝杆菌菌株,经PNB/TCH方法初步鉴定为疑似NTM菌株,采用16SrRNA基因测序技术进行菌种鉴定。结果 875株分枝杆菌临床分离菌株中分离出疑似NTM菌株46株。经16SrRNA基因序列分析鉴定,43株为NTM,3株为诺卡氏菌。43株NTM菌株分别为胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、塞内加尔分枝杆菌、鸟分枝杆菌、戈登氏分枝杆菌、楚尔盖分枝杆菌、罕见分枝杆菌、偶然分枝杆菌和脓肿分枝杆菌。其中,胞内分枝杆菌有31株,占总NTM菌株数的72.09%。结论甘肃省非结核分枝杆菌群以胞内分枝杆菌为主,应用16SrRNA基因序列分析鉴定方法能准确鉴定出NTM菌种,为临床诊治提供依据。 展开更多

关键词 非结核分枝杆菌 PNB/TCH鉴别培养 16S rrna基因序列分析

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VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对牛乳中葡萄球菌的鉴定效果评价 被引量：16

7

作者 林杰 张景艳 +7 位作者 王磊 王海瑞 邹璐 朱永刚 边亚彬 李建喜 杨志强 王旭荣 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2514-2520,共7页

【目的】评价VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对牛乳中葡萄球菌属细菌鉴定效果。【方法】对从西宁、白银、西安三地乳样中分离的52株葡萄球菌通过VITEK2 Compact全自动微生物分析系统进行鉴定,并与革兰氏染色、触酶试验、血浆凝固... 【目的】评价VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对牛乳中葡萄球菌属细菌鉴定效果。【方法】对从西宁、白银、西安三地乳样中分离的52株葡萄球菌通过VITEK2 Compact全自动微生物分析系统进行鉴定,并与革兰氏染色、触酶试验、血浆凝固酶试验以及16S r RNA基因序列分析结果进行比对;通过对凝固酶阴性葡萄球菌和凝固酶阳性葡萄球菌在不同麦氏浓度的鉴定,评价该系统的稳定性。【结果】VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对葡萄球菌在"属"水平的鉴定结果符合率达96.15%,与血浆凝固酶结果对比,凝固酶阴性葡萄球菌属细菌鉴定结果符合率为92.86%,对凝固酶阳性葡萄球菌属细菌鉴定结果符合率为50%,但对具体种鉴定时,结果符合率仅为44.23%。在稳定性检测的试验中,鉴定符合率为100%,鉴定结果可靠性不随菌液浓度变化而变化。【结论】该系统可用于牛乳中葡萄球菌在"属"水平的鉴定。 展开更多

关键词 VITEK2 Compact全自动微生物分析系统 葡萄球菌 16S rrna基因序列分析 准确性 稳定性

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传统奶酪样品中乳酸菌的分离鉴定 被引量：14

8

作者 杨彦荣 任艳 +4 位作者 德亮亮 陈红霞 张冬蕾 刘文俊 张和平 《中国乳品工业》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期19-22,共4页

通过实验室纯培养的方法对采集自俄罗斯卡尔梅克共和国不同地区的7份奶酪样品进行乳酸菌的分离,对分离株运用16S r RNA基因序列和系统发育关系研究进行种属鉴定。分离到的37株乳酸菌被鉴定为3个属10个种,其中2株Enterococcus durans,6株... 通过实验室纯培养的方法对采集自俄罗斯卡尔梅克共和国不同地区的7份奶酪样品进行乳酸菌的分离,对分离株运用16S r RNA基因序列和系统发育关系研究进行种属鉴定。分离到的37株乳酸菌被鉴定为3个属10个种,其中2株Enterococcus durans,6株Enterococcus faecium,2株Lactobacillus brevis,1株Lactobacillus graminis,6株Lactobacillus helveticus,1株Lactobacillus kefiri,6株Lactobacillus paracasei,11株Lactobacillus plantarum,1株Leuconostoc citreum和1株Leuconostoc pseudomesenteroides。 展开更多

关键词 乳酸菌 16S rrna基因序列分析 奶酪

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黄颡鱼红头病病原研究 被引量：13

9

作者 郑善坚 《水产科学》 CAS 北大核心 2009年第12期757-759,共3页

从患红头病的黄颡鱼的肝脏中分离获得HS807菌株,经人工感染试验为该病的致病菌,结合形态观察、培养特性及16S rRNA基因序列分析,HS807菌为鲇鱼爱德华氏菌。药敏试验表明,对复方新诺明、环丙沙星、先锋Ⅳ、强力霉素、青霉素、依诺沙星、... 从患红头病的黄颡鱼的肝脏中分离获得HS807菌株,经人工感染试验为该病的致病菌,结合形态观察、培养特性及16S rRNA基因序列分析,HS807菌为鲇鱼爱德华氏菌。药敏试验表明,对复方新诺明、环丙沙星、先锋Ⅳ、强力霉素、青霉素、依诺沙星、菌必治、新霉素、呋喃唑酮等药物敏感。 展开更多

关键词 黄颡鱼 红头病 鲇鱼爱德华氏菌 16S rrna基因序列分析

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一株高抗汞细菌的分离鉴定及其抗性基因的克隆与表达 被引量：9

10

作者 曾艳 陈强 +2 位作者 王敏 孙建光 高俊莲 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1628-1633,共6页

【目的】本研究旨在从重金属汞抗性细菌中分离鉴定汞抗性基因【方法】从北京凉水河河床底泥中分离抗汞细菌,采用16SrRNA基因序列分析结合生理生化特征对菌株进行鉴定。根据GenBank中已发表的多种抗汞细菌的merA基因序列设计引物,以抗性... 【目的】本研究旨在从重金属汞抗性细菌中分离鉴定汞抗性基因【方法】从北京凉水河河床底泥中分离抗汞细菌,采用16SrRNA基因序列分析结合生理生化特征对菌株进行鉴定。根据GenBank中已发表的多种抗汞细菌的merA基因序列设计引物,以抗性细菌基因组DNA为模板,扩增merA基因,并在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)表达。同时对表达菌株的重金属汞抗性进行测定。【结果】分离得到一株能在含HgCl2为70mg/L的平板上生长良好的高抗汞细菌,编号为KHg2。16S rRNA基因序列分析结果表明,菌株KHg2与Bacillus silvestris的模式菌株DSM12223T有96%的同源性,其形态特征及生理生化特性与文献报道的Bacillus silvestris一致。从菌株KHg2中扩增得到1687bp DNA片断,其序列与Pseudomonas putida的merA基因序列同源性达到99%,将该DNA片断克隆于pET-30a(+)得到重组质粒pZY2,转化宿主菌获得表达菌株E.coliBL21(DE3).pZY2,经IPTG诱导后产生相对分子量约为33KD的蛋白。重金属汞抗性测定结果表明,表达菌株E.coliBL21(DE3).pZY2可以在含HgCl2为20mg/L的培养基中生长,而转入空载体pET-30a(+)的阴性对照菌株E.coliBL21(DE3)pET-30a(+)则不能在含HgCl2为20mg/L的培养基中生长。【结论】分离的抗汞菌株KHg2与Bacillus silvestris关系密切;从菌株KHg2中克隆到汞抗性基因merA,并在大肠杆菌中得到了成功表达;表达merA基因的大肠杆菌具有抗重金属汞的特性。 展开更多

关键词 重金属污染土壤 抗汞细菌 分离鉴定 16S rrna基因序列分析 merA基因克隆与表达

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阑尾炎并阑尾周围脓肿置管引流术后迟缓埃格特菌血流感染的诊断及治疗(附1例报告) 被引量：9

11

作者 蒋舒明 王登朝 +1 位作者 鄂建飞 陈宗耀 《山东医药》 CAS 2021年第21期88-90,共3页

目的总结阑尾炎并阑尾周围脓肿置管引流术后迟缓埃格特菌血流感染的有效诊断及治疗方法。方法对1例阑尾炎并阑尾周围脓肿置管引流术后迟缓埃格特菌血流感染患者的诊治经过作回顾性分析。结果患者80岁,以右下腹疼痛伴发热入院,经实验室... 目的总结阑尾炎并阑尾周围脓肿置管引流术后迟缓埃格特菌血流感染的有效诊断及治疗方法。方法对1例阑尾炎并阑尾周围脓肿置管引流术后迟缓埃格特菌血流感染患者的诊治经过作回顾性分析。结果患者80岁,以右下腹疼痛伴发热入院,经实验室检查、腹部超声检查、腹部CT检查诊断为阑尾炎并阑尾周围脓肿,接受经皮穿刺阑尾周围脓肿造影及置管引流术治疗,术后以头孢唑肟进行抗感染治疗。术后4 h患者突发持续性寒战、体温升高、降钙素原升高,判断患者有血流感染表现,更换抗菌药物为头孢哌酮/舒巴坦经验性抗感染治疗。血培养结果提示患者为革兰阳性杆菌,血培养分离菌株经基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析仪和16S rRNA基因序列分析均鉴定为迟缓埃格特菌。患者经头孢哌酮/舒巴坦抗感染治疗9 d后康复出院。结论阑尾炎并阑尾周围脓肿置管引流术后迟缓埃格特菌血流感染的主要临床症状是发热,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析和16S rRNA基因序列分析均可用于迟缓埃格特菌菌种鉴定,但鉴定时间较长,提前进行经验性抗感染治疗十分必要,头孢哌酮/舒巴坦是治疗阑尾炎并阑尾周围脓肿置管引流术后迟缓埃格特菌血流感染的有效抗菌药物之一。 展开更多

关键词 迟缓埃格特菌 血流感染 阑尾炎 阑尾周围脓肿 置管引流术 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析 16S rrna基因序列分析

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海南传统发酵蔬菜中微生物多样性分析 被引量：7

12

作者 谷懿寰 彭倩楠 +2 位作者 姜帅铭 马臣臣 霍冬雪 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第3期282-290,共9页

为研究海南发酵蔬菜中微生物的多样性,以采自海南白沙、昌江、临高、琼中、文昌、万宁和五指山7个地区的30份不同种类的发酵竹笋、小西瓜、白菜和豆角样品为研究对象,通过传统分离培养方法、16S rRNA基因序列分析和荧光定量PCR技术对样... 为研究海南发酵蔬菜中微生物的多样性,以采自海南白沙、昌江、临高、琼中、文昌、万宁和五指山7个地区的30份不同种类的发酵竹笋、小西瓜、白菜和豆角样品为研究对象,通过传统分离培养方法、16S rRNA基因序列分析和荧光定量PCR技术对样品中的微生物进行多样性分析。共获得了172株乳酸菌,分属于3个属,16个种,其中乳杆菌属数量最多,占菌株总数的84.30%,肠球菌属和片球菌属分别占15.12%和0.58%,测得每份样品中乳杆菌的平均含量为5.22×10^7 CFU/g,片球菌的平均含量为9.42×10^5 CFU/g,肠球菌的平均含量为1.07×10^4 CFU/g。乳杆菌属是海南发酵蔬菜中的优势菌属,植物乳杆菌是海南发酵蔬菜中的优势菌种。研究表明不同地区、不同种类的发酵蔬菜中微生物多样性存在差异。本研究初步揭示了海南发酵蔬菜中微生物的多样性,为海南微生物资源的深入研究和开发利用打下基础。 展开更多

关键词 海南 发酵蔬菜 微生物多样性 16S rrna基因序列分析 荧光定量PCR

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池塘养殖中华绒螯蟹细菌性疾病病原的分离与鉴定 被引量：7

13

作者 郑世雄 祖国掌 《水产养殖》 CAS 2013年第1期45-48,共4页

从安徽省当涂县和芜湖县池塘养殖患病中华绒螯蟹的肝脏和肌肉组织中分离到35株细菌,经人工感染试验证实DT9和WH21菌株为病原菌。细菌形态特征检查2菌株均为革兰氏阴性杆菌。细菌16S rRNA基因序列分析结果:2条扩增的基因序列长度均为1443... 从安徽省当涂县和芜湖县池塘养殖患病中华绒螯蟹的肝脏和肌肉组织中分离到35株细菌,经人工感染试验证实DT9和WH21菌株为病原菌。细菌形态特征检查2菌株均为革兰氏阴性杆菌。细菌16S rRNA基因序列分析结果:2条扩增的基因序列长度均为1443bp,DT9菌株与维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,FJ490063)的亲缘关系最近,同源性为99.2%。WH21菌株与嗜水气单胞菌(A.hydrophila,AB680307)的亲缘关系最近,同源性为99.9%。 展开更多

关键词 池塘 中华绒螯蟹 病原 分离鉴定 16S rrna基因序列分析

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哈萨克斯坦传统发酵乳制品中乳酸菌的多样性 被引量：7

14

作者 刘红新 呼斯楞 +1 位作者 刘文俊 孙天松 《中国乳品工业》 CSCD 北大核心 2017年第7期9-12,共4页

为了阐明哈萨克斯坦传统发酵乳制品中乳酸菌生物多样性,采用传统纯培养方法对采集的5份传统发酵乳制品中的乳酸菌进行分离纯化,运用16S rRNA基因序列分析方法和系统发育树研究进行属种鉴定。结果表明,从5份传统乳制品中分离鉴定了49株... 为了阐明哈萨克斯坦传统发酵乳制品中乳酸菌生物多样性,采用传统纯培养方法对采集的5份传统发酵乳制品中的乳酸菌进行分离纯化,运用16S rRNA基因序列分析方法和系统发育树研究进行属种鉴定。结果表明,从5份传统乳制品中分离鉴定了49株乳酸菌分属于4个属8个种或亚种,乳杆菌属(Lactobacillus)44株,片球菌属(Pediococcus)1株、肠球菌属(Enterococcus)3株,链球菌属(Streptococcus)1株。其中乳杆菌属、片球菌属、肠球菌属、链球菌属是哈萨克斯坦地区传统发酵乳制品中的主要乳酸菌,其中Pediococcus pentosaceus为优势菌种,占总分离株的22%。 展开更多

关键词 乳酸菌 传统发酵乳制品 16S rrna基因序列分析

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纹带棒状杆菌引起肺部感染1例 被引量：6

15

作者 单琨 张丽杰 +4 位作者 黄印启 赵连春 左惠芬 赵振军 陈东科 《中国热带医学》 CAS 2018年第12期1276-1278,共3页

目的痰培养经传统生化鉴定及16S rRNA基因序列分析明确导致肺部感染的病原菌,据此建立相应抗感染的有效治疗方案。方法对痰液培养中分离得到的菌株进行16S rRNA基因序列分析鉴定以及传统的革兰染色、生化反应鉴定。采用纸片扩散法(K-B法... 目的痰培养经传统生化鉴定及16S rRNA基因序列分析明确导致肺部感染的病原菌,据此建立相应抗感染的有效治疗方案。方法对痰液培养中分离得到的菌株进行16S rRNA基因序列分析鉴定以及传统的革兰染色、生化反应鉴定。采用纸片扩散法(K-B法)进行药敏试验。结果16S rRNA基因序列分析鉴定结果显示分离株与纹带棒状杆菌有99%同源(GenBank编号:JF342700.1),使用VITEK 2-Compact全自动细菌鉴定仪及与其相匹配的VITEK 2ANC棒状杆菌鉴定(产品代码21348)卡鉴定结果也符合纹带棒状杆菌的特征(鉴定率:99.9%),正式报告致病菌为纹带棒状杆菌。药敏结果显示该菌对利奈唑胺、阿米卡星、万古霉素敏感。明确病原菌为纹带棒状杆菌后,迅速调整抗生素治疗方案为静点利奈唑胺,8d后患者肺部感染情况逐渐好转,各项实验室检查结果大部分在正常范围,且炎症指标也降落至参考范围之内,遂出院回家休养。结论临床微生物工作者以及临床医生应该重视纹带棒状杆菌引起的感染,及早为患者建立有效的抗感染治疗方案。 展开更多

关键词 纹带棒状杆菌 肺部感染 16S rrna基因序列分析

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一起空肠弯曲菌引起食源性疾病事件的病原学研究及溯源分析 被引量：6

16

作者 刘绮明 吴灿权 +1 位作者 仇绮琳 袁展红 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2022年第5期1063-1070,共8页

目的 对一起食源性疾病事件进行病原菌检测,了解病原菌毒力基因携带情况并进行溯源分析。方法 对事件采集的样本经FilmArray多重PCR系统进行快速初筛,同时进行细菌分离培养鉴定。使用PCR检测技术对分离菌株进行毒力基因检测,采用16S rRN... 目的 对一起食源性疾病事件进行病原菌检测,了解病原菌毒力基因携带情况并进行溯源分析。方法 对事件采集的样本经FilmArray多重PCR系统进行快速初筛,同时进行细菌分离培养鉴定。使用PCR检测技术对分离菌株进行毒力基因检测,采用16S rRNA基因序列分析与PFGE分型方法对分离菌株进行同源性分析。结果 2份患者肛拭子样本和4份食堂厨工肛拭子样本检出空肠弯曲菌,检出菌株均携带flaA、cadF、imaA、cdtA、cdtB、cdtC等毒力基因。16S rRNA基因序列分析表明6株分离菌株均为空肠弯曲菌,1株菌株与其他5株菌株分子发育距离稍远。6株菌株经PFGE分型可分为3种带型,3株菌和2株菌分别呈现同一带型,2种带型相似性为52.2%;另1株菌为另一带型,与其他菌株带型相似性仅为26.7%。结论 实验室结果表明这是一起由不同克隆株的空肠弯曲菌感染引起的食源性疾病事件。 展开更多

关键词 空肠弯曲菌 16S rrna基因序列分析 PFGE 毒力基因

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内蒙古赤峰地区传统发酵乳制品中乳酸菌的分离与鉴定 被引量：5

17

作者 刘逸群 党娜 +3 位作者 武岳 丛琳 刘文俊 孟和毕力格 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2021年第6期23-26,32,共5页

通过探索内蒙古赤峰地区传统发酵乳制品中乳酸菌的多样性,为当地人们制作传统发酵乳制品提供理论依据与菌种资源是具有重要意义的。通过采用传统纯培养方法对15份采集来自内蒙古赤峰地区的传统发酵乳制品(6份酸奶油样品、5份酸牛奶样品... 通过探索内蒙古赤峰地区传统发酵乳制品中乳酸菌的多样性,为当地人们制作传统发酵乳制品提供理论依据与菌种资源是具有重要意义的。通过采用传统纯培养方法对15份采集来自内蒙古赤峰地区的传统发酵乳制品(6份酸奶油样品、5份酸牛奶样品、4份奶豆腐样品)进行乳酸菌的分离纯化,运用16S rRNA序列分析和系统发育进化关系对其种属进行鉴定。结果表明:经16S rRNA基因序列分析,将分离到的116株乳酸菌鉴定为7个属,13个种。其中Lactococcus lactis占总分离株的56%,是内蒙古赤峰地区发酵乳制品中的优势菌种。 展开更多

关键词 乳酸菌 多样性 16S rrna基因序列分析 发酵乳制品

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离子型稀土矿植物根际促生芽孢杆菌的筛选与鉴定 被引量：4

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作者 何森 谢东 +2 位作者 宋美玲 潘涛 董伟 《江西理工大学学报》 CAS 2021年第1期52-58,共7页

以离子型稀土废弃矿修复植物的根际土壤为研究对象,采用稀释涂布法从土壤样品中筛选出具有植物根际促生作用,以及能够在高浓度稀土离子条件下生长的芽孢杆菌菌株,并对菌株的促生能力和稀土离子耐受性进行测试。试验结果表明,筛选得到的... 以离子型稀土废弃矿修复植物的根际土壤为研究对象,采用稀释涂布法从土壤样品中筛选出具有植物根际促生作用,以及能够在高浓度稀土离子条件下生长的芽孢杆菌菌株,并对菌株的促生能力和稀土离子耐受性进行测试。试验结果表明,筛选得到的芽孢杆菌菌株中具有产吲哚乙酸(IAA)能力的有14株,其中同时具有产铁载体和NH3能力的共有5株。菌株Y18-3不仅具有较好的促生特性,而且对稀土离子铥和铽表现出较强的耐受性,半抑制浓度(IC50)分别为2.22和2.29 mmol/L,经16S rRNA基因序列分析法鉴定菌属为纺锤形赖氨酸芽孢杆菌(Lysinibacillus)。 展开更多

关键词 离子型稀土废弃矿 植物根际促生菌 芽孢杆菌 吲哚乙酸 16S rrna基因序列分析

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注射剂科氏葡萄球菌污染的鉴定和同源性分析方法研究 被引量：3

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作者 孙雪奇 肖剑 +5 位作者 秦力 陈婕 柴海毅 刘程智 杨小蓉 毛新武 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1764-1774,共11页

目的:采用多种常用微生物鉴定方法和同源性分析方法,对某制药企业注射剂无菌检查试验中分离的微生物污染菌A1进行来源分析,为药品生产企业完善微生物监控体系,实现生产和检验过程的微生物控制提供技术参考。方法:使用VITEK 2微生物生化... 目的:采用多种常用微生物鉴定方法和同源性分析方法,对某制药企业注射剂无菌检查试验中分离的微生物污染菌A1进行来源分析,为药品生产企业完善微生物监控体系,实现生产和检验过程的微生物控制提供技术参考。方法:使用VITEK 2微生物生化鉴定仪对A1和本次污染调查采集的78株菌进行初步鉴定,选择与A1同属的菌,分别采用傅里叶变换红外光谱(FTIR)、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、16S rRNA基因序列分析、核糖体分型(Ribotyping)、全基因组测序(WGS)等方法进行鉴定和同源性分析,同源性分析结果用PFGE进行了验证。结果:除MALDI-TOF MS法的部分鉴定结果外,几种方法的微生物鉴定结果完全相同;上述方法的同源性分析结果均为A1溯源自无菌检验使用的无菌隔离器内部仪器表面采集菌株A2(16S rRNA基因序列分析本次仅溯源至亚种),该结果得到了PFGE证实;不同方法在种的集群之间的亲缘关系划分有所不同。结论:微生物污染溯源的流程一般包括以下3步:首先采用生化鉴定法初步确定污染菌的种;其次从污染调查采集菌株和环境菌库中选择与污染菌同种的微生物;然后,使用16S rRNA基因序列分析、核糖体分型、全基因组测序等方法进行微生物鉴定和同源性分析。采用16S rRNA基因序列分析时,必须进行多相鉴定以便准确溯源,才能有效实施纠正与预防措施。 展开更多

关键词 微生物污染 鉴定 同源性分析 葡萄球菌 傅里叶变换红外光谱(FTIR) 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS) 16S rrna基因序列分析 核糖体分型 全基因组测序(WGS) 脉冲场凝胶电泳(PFGE) 微生物污染溯源流程

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优良动物源抗汞益生乳酸菌的筛选及其抗性基因的克隆 被引量：3

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作者 陈金泰 谷珊珊 +4 位作者 翟羽飞 马斯琪 夏琦琦 崔文 葛俊伟 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第2期138-141,共4页

为了分离具有重金属汞抗性的优良益生乳酸菌,并挖掘细菌汞抗性的基因,应用于动物机体重金属中毒的解毒治疗,试验从健康狐狸和貉子粪便中筛选出耐酸、耐胰酶、耐胆汁、抗菌并具有较高汞抗性的乳酸菌,采用16S rRNA基因序列分析鉴定,并用PC... 为了分离具有重金属汞抗性的优良益生乳酸菌,并挖掘细菌汞抗性的基因,应用于动物机体重金属中毒的解毒治疗,试验从健康狐狸和貉子粪便中筛选出耐酸、耐胰酶、耐胆汁、抗菌并具有较高汞抗性的乳酸菌,采用16S rRNA基因序列分析鉴定,并用PCR方法扩增mer A基因,从72株优良益生菌中逐级筛选出耐酸、耐胰酶、耐胆盐、抗菌性能好并能耐受500 mg/L HgCl_2的高浓度重金属汞的一株细菌,命名为CJT-KHg1,测定了其益生特性指标。结果表明:经过16S rRNA序列分析,该菌株为乳酸片球菌;该菌株的mer A基因序列与克雷伯氏菌、阴沟肠杆菌、希瓦氏菌mer A基因序列的同源性达到99%,证明为乳酸片球菌;从该菌株中克隆到的汞抗性基因为汞还原酶基因(Mercury reductase)。 展开更多

关键词 汞 乳酸菌 重金属中毒 分离鉴定 高抗汞细菌 16S rrna基因序列分析 挖掘 merA克隆

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