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柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析 被引量:61
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作者 李琳琳 何雅晴 +4 位作者 朱俊萍 薛颖 朱雅芳 徐星晔 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期217-222,共6页
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′U... 对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 基因组 手足口病 同源性 序列分析 中国分离株 儿童
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呼吸机相关性肺炎感染途径分子流行病学研究 被引量:49
2
作者 郭伟 崔生辉 +2 位作者 李景云 马越 张杰 《国际呼吸杂志》 2011年第13期1010-1013,共4页
目的用分子流行病学方法研究呼吸机相关性肺炎(vcntilator associated pneumonia ,VAP)各种感染途径在其发病机制中的作用。方法采集ICU置入人工气道行机械通气的患者下呼吸道标本、口咽分泌物、气囊上滞留物、胃液、呼吸机机管路标... 目的用分子流行病学方法研究呼吸机相关性肺炎(vcntilator associated pneumonia ,VAP)各种感染途径在其发病机制中的作用。方法采集ICU置入人工气道行机械通气的患者下呼吸道标本、口咽分泌物、气囊上滞留物、胃液、呼吸机机管路标本、空气标书。从护理人员手上采集标本进行细菌培养和表型分析:再通过脉冲场凝胶电泳(pulse field gel electrophoresis,PFGE)办法分析所分离菌株是否具有同源性。结果48例患者中22例发生VAP,其下呼吸道标本细菌培养17例阳性,以G-性菌为主,其中铜绿假单胞菌居首位。且为多重耐药菌;对9例患者来源菌株行PFGE分析.6例气囊上滞留物分离菌株与相应下呼吸道分离菌株为同一PFGE型,5例胃液分离菌株与相应下呼吸道分离菌株为H—PFGE型,3例呼吸机管路样品分离菌株与相应下呼吸道分离菌株为同一PFGE型.2例口咽部分泌物分离菌株与相应下呼吸道分离菌株为同-PFGE型。结论VAP患者下呼吸道病原体与气囊上滞留物、胃液分离菌有很高的同源性.在感染源的防治上应列为重中之重。 展开更多
关键词 呼吸机 肺炎 分子流行病学 脉冲场凝胶电泳 同源性分析
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一株好氧反硝化菌的分离鉴定及其除氮特性 被引量:37
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作者 杨小龙 李文明 +1 位作者 陈燕 曹郁生 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1062-1070,共9页
【目的】生物除氮中反硝化菌具有重要的作用,需氧反硝化菌研究较少,有着很好的应用潜力,本研究主要从环境样品中分离具有高效去除铵氮和亚硝酸盐氮活性的好氧反硝化菌,并对其分类及除氮特性进行研究。【方法】以高效去除铵氮、除亚硝酸... 【目的】生物除氮中反硝化菌具有重要的作用,需氧反硝化菌研究较少,有着很好的应用潜力,本研究主要从环境样品中分离具有高效去除铵氮和亚硝酸盐氮活性的好氧反硝化菌,并对其分类及除氮特性进行研究。【方法】以高效去除铵氮、除亚硝酸盐氮和好氧反硝化能力为主要指标,从富营养化的池塘淤泥水和工厂污泥样品中进行菌株分离筛选。通过生理生化特点以及16S rRNA序列分析对活性最好的菌株进行初步鉴定。在好氧条件下,分别以NO-3-N、NH+4-N和NO-2-N作为唯一氮源,考察菌株的好氧反硝化特性、去除铵氮和亚硝酸盐氮特性,以及不同初始pH值、温度、碳源、摇床转速对该菌去除铵氮和亚硝酸盐氮特性的影响。【结果】得到的细菌中,以菌株C-4的活性最好,其16S rRNA序列与不动杆菌的同源性达99%,结合生理生化特点,初步确定菌株C-4属于不动杆菌属(Acinetobacter sp.)。以柠檬酸钠作为碳源,30℃、120 r/min振荡培养,种龄为18 h,用初始pH为8.5的200 mg/L NH +4-N培养基和初始pH为7.5的100 mg/L NO -2-N培养基进行测定,分别培养15 h与12 h,净除氮率分别达到65.8%和47.8%。【结论】从鱼塘水样中分离到一株好氧反硝化菌C-4,初步鉴定为不动杆菌属的一个种(Acinetobacter sp.),具有较高的反硝化特性和高效去除铵氮与亚硝酸盐氮的能力,在处理实际池塘污水时中,净除氮率可达73.04%以上。 展开更多
关键词 好氧反硝化细菌 铵氮和亚硝酸盐氮 分离鉴定 同源分析
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医务人员手与医院环境物体表面分离多重耐药菌的同源性分析 被引量:32
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作者 李秀华 小林寅喆 +4 位作者 陈炜 许春娟 刘丽平 施丽莎 五岛瑳智子 《中华护理杂志》 CSCD 北大核心 2015年第11期1285-1290,共6页
目的调查医务人员的手及医院环境物体表面多重耐药菌的分布情况,并探讨多重耐药菌在医务人员的手与医院环境物体表面的同源性。方法应用琼脂直接接触培养法。对来自4个科室的112名医务人员的手和120例医院环境物体表面采样,采用脉冲场... 目的调查医务人员的手及医院环境物体表面多重耐药菌的分布情况,并探讨多重耐药菌在医务人员的手与医院环境物体表面的同源性。方法应用琼脂直接接触培养法。对来自4个科室的112名医务人员的手和120例医院环境物体表面采样,采用脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型技术对分离出的耐药菌进行同源性分析。结果所有送检标本中,分离出耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(meticillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)、高水平庆大霉素耐药肠球菌(high-level gentamicin resistant Enterococcus,HLGR)和多重耐药鲍曼不动杆菌(multidrug—resistant Acinetobacter baumannii,MDRA)等多重耐药菌菌株。对MRSA和MDRA进行脉冲场凝胶电泳(pulse-field gel electrophoresis,PFGE)检测,发现多重耐药菌在医务人员手和医院环境物体表面存在同源性。同时,对MDRA进行多位点序列分型.发现其分型ST92同全球其他地区一致。结论多重耐药菌在医务人员手和医院环境物体表面污染较严重,存在两者之间的交叉传播,应加强医务人员手卫生并提高医院环境物体表面的清洁。 展开更多
关键词 医务人员 医院 环境 多重耐药菌 同源性分析
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一种中国发生的真菌传小麦花叶病毒RNA-13'末端核苷酸序列分析 被引量:22
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作者 于嘉林 晏立英 +3 位作者 冯继东 李大伟 蔡祝南 刘仪 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第3期248-254,共7页
以采自河南的真菌传小麦花叶病毒(FWMV-C)为材料,抽提病毒RNA,合成互补DNA(cDNA)。对杂交筛选所得cDNA克隆进行亚克隆及序列分析,结果表明,亚克隆pGSI含有一个长度为891个核苷酸的不完整开放阅读框... 以采自河南的真菌传小麦花叶病毒(FWMV-C)为材料,抽提病毒RNA,合成互补DNA(cDNA)。对杂交筛选所得cDNA克隆进行亚克隆及序列分析,结果表明,亚克隆pGSI含有一个长度为891个核苷酸的不完整开放阅读框架(ORF)和长度为258个核苷酸的3'末端非编码区(NTR),并带有Poly(A)尾序。此段序列与大麦黄花叶病毒(BaYMV)及法国报道的一种小麦梭条花叶病毒(WSSMV-F)的RNA-13'末端分别具有67.6%和69.9%的同源性。由所测序列编码区(1-891nt)可推导产生296个氢基酸,并与WSSMV-F及BaYMV外壳蛋白氨基酸序列分别具有75.9%和71%的同源性。此结果表明,FWMV-C为另外一种不同于WSSMV-F的大麦黄花叶病毒组(Baymovirus)病毒,所测基因组片段应为RNA-13'末端序列,其中可能包括了病毒全长外壳蛋白编码区域。 展开更多
关键词 真菌传小麦病毒 小麦花叶病毒 RNA 核苷酸
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新疆细粒棘球蚴95基因的克隆及同源性分析 被引量:21
6
作者 林仁勇 丁剑冰 +1 位作者 温浩 卢晓梅 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 2002年第5期288-290,共3页
目的 分析新疆地区细粒棘球蚴 95 (EG95 )基因结构特点。 方法 从新疆地区细粒棘球蚴原头节中提取基因组 DNA,以细粒棘球蚴原头节 DNA为模板进行 PCR扩增 ,获得 EG95基因 ,将其克隆至 p UCm- T载体 ,利用 DNAman软件及 Gene Bank/BL ... 目的 分析新疆地区细粒棘球蚴 95 (EG95 )基因结构特点。 方法 从新疆地区细粒棘球蚴原头节中提取基因组 DNA,以细粒棘球蚴原头节 DNA为模板进行 PCR扩增 ,获得 EG95基因 ,将其克隆至 p UCm- T载体 ,利用 DNAman软件及 Gene Bank/BL AST功能测序并对其进行基因全序列分析。 结果 测序显示新疆株 EG95 (EG95 - XJ)基因片段为 1191bp。 BL AST比对分析表明 EG95 - XJ基因与新西兰株 EG95基因家族成员同源性达 86 %~ 97% ,所有的碱基差异均发生于内含子区域。 结论 中国新疆地区的 EG95基因为 EG95基因家族成员之一 ,但其序列与新西兰株 EG95基因之间存在一定的差异。 展开更多
关键词 新疆 细粒棘球蚴 95基因 克隆 同源性分析
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耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌的耐药性及分子流行病学研究 被引量:20
7
作者 袁莉莉 丁百兴 +3 位作者 沈震 吴湜 徐晓刚 李光辉 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期289-292,共4页
目的了解耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)对抗菌药物的耐药性及分子生物学特征。方法收集2013年1-12月复旦大学附属华山医院住院患者临床分离的CRPA 104株,采用琼脂稀释法对菌株行药敏测定;脉冲场凝胶电泳(PFGE)行同源性分析。结果 104... 目的了解耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)对抗菌药物的耐药性及分子生物学特征。方法收集2013年1-12月复旦大学附属华山医院住院患者临床分离的CRPA 104株,采用琼脂稀释法对菌株行药敏测定;脉冲场凝胶电泳(PFGE)行同源性分析。结果 104株CRPA对美罗培南、亚胺培南的耐药率分别为85.6%、98.1%,对阿米卡星、庆大霉素的耐药率分别为18.3%、40.4%,对头孢他啶和头孢吡肟的耐药率分别为26.9%和21.2%,对环丙沙星和左氧氟沙星的耐药率分别为44.2%和50.0%,对哌拉西林-他唑巴坦、头孢哌酮-舒巴坦和替卡西林-克拉维酸的耐药率分别为19.2%、26.9%和52.9%,对氨曲南耐药率为26.9%,对黏菌素耐药率最低,仅为5.8%。PFGE分析存在48个型别(3株未能分型),9个克隆。克隆A是主要流行株,占41.6%(42/101),科室主要集中在神经外科、老年科及综合病房,其次为克隆B,占5.9%(6/101)。结论医院内存在耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌的多个克隆,应采取有效的感染控制手段,加强抗菌药物临床应用管理,延缓细菌耐药性产生并阻止耐药菌进一步播散。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 碳青霉烯类耐药 耐药性 同源性分析
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运用生物信息学方法快速获取与肿瘤基因同源的EST及其新基因克隆的策略 被引量:7
8
作者 田芳 陈主初 《生命科学》 CSCD 2000年第2期72-75,共4页
如何更多更快地克隆肿瘤基因,探索肿瘤发病机制是研究工作者努力的方向。利用人类基因组研究的现存数据,从EST即cDNA的部分序列入手,通过同源筛选;直接搜寻新基因不失为一种在“基因抢夺战”中获胜的捷径。本文通过实例综述... 如何更多更快地克隆肿瘤基因,探索肿瘤发病机制是研究工作者努力的方向。利用人类基因组研究的现存数据,从EST即cDNA的部分序列入手,通过同源筛选;直接搜寻新基因不失为一种在“基因抢夺战”中获胜的捷径。本文通过实例综述了怎样运用生物信息资源进行EST筛选及其新基因克隆的策略。 展开更多
关键词 生物信息学 EST 同源性分析 肿瘤基因 基因克隆
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辣白菜中乳酸菌的分离鉴定 被引量:19
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作者 孟令帅 张颖 +3 位作者 邹婷婷 乌日娜 岳喜庆 武俊瑞 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第11期130-133,共4页
从沈阳市7个区25份朝鲜族家庭制作的传统发酵辣白菜中分离出81株乳酸菌疑似菌株,初步鉴定34株为杆菌,47株为球菌。进一步采用16S r DNA序列分析对81株菌进行分子鉴定,通过序列分析进行属种鉴定。结果表明:81株菌均为乳酸菌,分别来自2个... 从沈阳市7个区25份朝鲜族家庭制作的传统发酵辣白菜中分离出81株乳酸菌疑似菌株,初步鉴定34株为杆菌,47株为球菌。进一步采用16S r DNA序列分析对81株菌进行分子鉴定,通过序列分析进行属种鉴定。结果表明:81株菌均为乳酸菌,分别来自2个属6个种,45株为屎肠球菌,25株为植物乳杆菌,4株为干酪乳杆菌,3株为戊糖乳杆菌,2株为短乳杆菌,2株为坚强肠球菌。研究结果为我国东北辣白菜中乳酸菌作进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 辣白菜 乳酸菌 16S r DNA 同源性分析
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酱香型高温大曲中高产蛋白酶细菌的分离及鉴定 被引量:18
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作者 曾德勇 方镒 +1 位作者 刘涛 曹文涛 《酿酒科技》 2015年第3期27-30,共4页
用检测蛋白酶透明圈和蛋白酶活性测定相结合的方法,从酱香型高温大曲中筛选出1株高产蛋白酶细菌,并通过生理生化特征实验及16S r DNA序列同源性分析,鉴定该高产蛋白酶菌株为解淀粉芽孢杆菌。
关键词 解淀粉芽孢杆菌 高产蛋白酶 高温大曲 同源性分析
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云南蚊虫中阿卡斑病毒的分离和鉴定 被引量:18
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作者 冯云 何彪 +5 位作者 付士红 杨卫红 章域震 涂长春 梁国栋 张海林 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期51-57,共7页
为掌握云南省德宏州芒市和瑞丽市蚊媒病毒分布状况,2010年8月用诱蚊灯采集蚊虫17种2 149只,用金黄地鼠肾细胞(Baby hamster kidney cell,BHK-21)培养法分离病毒,阳性分离物用阿卡斑病毒(Akabane virus,AKV)S和M片段特异性引物的RT-PCR... 为掌握云南省德宏州芒市和瑞丽市蚊媒病毒分布状况,2010年8月用诱蚊灯采集蚊虫17种2 149只,用金黄地鼠肾细胞(Baby hamster kidney cell,BHK-21)培养法分离病毒,阳性分离物用阿卡斑病毒(Akabane virus,AKV)S和M片段特异性引物的RT-PCR法鉴定。从采集蚊虫中分离到能引起BHK-21细胞病变和致乳小白鼠发病死亡的2株病毒,其中DHL10M110株分离自瑞丽市迷糊按蚊(Anopheles vagas),DHL10M117株分离自芒市三带喙库蚊(Culex tritaeniorhynchus)。RT-PCR扩增获得S片段的702bp序列和M片段的456bp序列,系统进化树分析表明DHL10M110和DHL10M117株与肯尼亚和澳大利亚AKV分离株进化关系较远;与日本、韩国和中国台湾的AKV分离株亲缘关系较近,但云南株形成一个独立的小分支。2株新分离病毒的S片段与中国台湾CY-77株的核苷酸(96.6%和96.7%)和氨基酸(99.6%和100%)同源性最高;M片段与日本Iriki株的核苷酸同源性最高(93.2%和93.6%),与中国台湾CY-77株氨基酸同源性最高(99.6%和100%);与肯尼亚MP496株核苷酸(69.7%和70.0%)和氨基酸(91.0%)同源性最低。本研究证实云南省德宏州存在AKV的流行,与亚洲流行株具有较近的亲缘关系。三带喙库蚊和迷糊按蚊可传播该病毒。 展开更多
关键词 蚊虫 阿卡斑病毒 系统进化树 同源性分析
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脑膜败血金黄杆菌产金属β-内酰胺酶的检测及基因型的研究 被引量:15
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作者 张嵘 周宏伟 陈功祥 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期734-738,共5页
目的了解杭州市脑膜败血金黄杆菌的流行及产金属β-内酰胺酶的情况并对其基因型进行研究。方法对100株分离自4所综合性医院的多重耐药脑膜败血金黄杆菌,用三维试验、改良三维试验和2-巯基丙酸抑制试验检测金属β-内酰胺酶,用blaB和GOB... 目的了解杭州市脑膜败血金黄杆菌的流行及产金属β-内酰胺酶的情况并对其基因型进行研究。方法对100株分离自4所综合性医院的多重耐药脑膜败血金黄杆菌,用三维试验、改良三维试验和2-巯基丙酸抑制试验检测金属β-内酰胺酶,用blaB和GOB的通用引物对表型试验阳性的菌株进行聚合酶链反应(PCR)和测序分析金属β-内酰胺酶的基因型。并用脉冲场凝胶电泳对其中的菌株进行同源性分析。结果用三维试验、改良三维试验和2-巯基丙酸抑制试验检测到61株菌株产金属β-内酰胺酶,用blaB和GOB通用引物进行扩增和测序,有60株菌株扩增到金属β-内酰胺酶,其中有51株检测到blaB基因型,有36株检测到GOB基因型。检测到的blaB基因型主要为blaB-1、2、3、5和blaB-11这5种类型;检测到的GOB基因型主要为GOB-1、2、4、6和GOB-8这5种类型。其中产生一种金属β-内酰胺酶的有33株,产两种金属β-内酰胺酶的有27株。浙江大学医学院附属第一医院和附属第二医院主要是blaB-3和blaB-11型为主,邵逸夫医院主要是GOB-4和GOB-8为主,杭州市中医院主要是GOB-8基因型。其中1菌株表型试验检测阳性而未能检测到基因型,可能为一种新的基因型,有待以后进一步研究。菌株经同源性分析,杭州市中医院的菌株具有很好的一致性,而与其他医院的结果完全不同。结论杭州市多重耐药的脑膜败血金黄杆菌的耐药机制证实携带的金属β-内酰胺酶基因型主要为blaB和GOB型,4所医院流行的基因型均不相同。而从PFGE结果分析中医院的脑膜败血金黄杆菌具有一定的同源性,有别于其他3所医院,可能为院内感染菌。 展开更多
关键词 脑膜败血金黄杆菌 金属Β-内酰胺酶 基因型 同源性分析
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鸡含锰超氧化物歧化酶cDNA克隆及序列分析 被引量:14
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作者 卜友泉 罗绪刚 +6 位作者 李素芬 鲁成 李英文 邝霞 刘彬 李建凡 余顺祥 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期463-467,共5页
为弄清鸡含锰超氧化物歧化酶 (manganese containingsuperoxidedismutase ,MnSOD)的cDNA序列 ,以开展动物锰营养学的深入研究 ,根据已知鸡MnSOD的N端氨基酸序列设计简并引物 ,应用 3′RACE(rapidamplificationofcDNAends)技术 ,扩增克... 为弄清鸡含锰超氧化物歧化酶 (manganese containingsuperoxidedismutase ,MnSOD)的cDNA序列 ,以开展动物锰营养学的深入研究 ,根据已知鸡MnSOD的N端氨基酸序列设计简并引物 ,应用 3′RACE(rapidamplificationofcDNAends)技术 ,扩增克隆了鸡心肌MnSOD 990bp的 3′cDNA片段 .再根据 3′RACE片段测序结果设计引物进行 5′RACE ,结果获取了一个与 3′RACE片段相互重叠的鸡心肌MnSOD 52 1bp的 5′RACE片段 ,并对其进行了克隆测序 .最后根据 3′RACE片段和 5′RACE片段序列信息进行拼接 ,从而获取鸡MnSODcDNA的全序列信息 .研究结果表明 :鸡MnSODcDNA全长为 110 8个核苷酸 ,其中 5′非翻译区 2 5个核苷酸 ,编码区 675个核苷酸 ,3′非翻译区 4 0 8个核苷酸 ,编码一个长 2 2 4个氨基酸残基的蛋白质前体 .其中信号肽长 2 6个氨基酸残基 ,成熟肽长 198个氨基酸残基 ,分子量为 2 2kD .与人、大鼠、线虫、果蝇等真核生物MnSOD氨基酸序列的同源性分别为82 4 %、84 .7%、62 .4 %、59.3% . 展开更多
关键词 MNSOD CDNA RACE 序列分析 同源性分析
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耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的耐药机制研究和同源性分析 被引量:16
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作者 谭坪海 陈利达 +4 位作者 郭鹏豪 廖康 伍众文 叶大柠 黄彬 《分子诊断与治疗杂志》 2019年第3期182-188,共7页
目的研究鲍曼不动杆菌耐药性的变迁及耐亚胺培南鲍曼不动杆菌(IRAB)的耐药机制及同源性,为临床抗感染治疗及医院感染控制提供依据。方法采用Vitek 2 Compact全自动微生物鉴定仪进行菌株鉴定和药敏实验。收集2011至2014年间1 761株鲍曼... 目的研究鲍曼不动杆菌耐药性的变迁及耐亚胺培南鲍曼不动杆菌(IRAB)的耐药机制及同源性,为临床抗感染治疗及医院感染控制提供依据。方法采用Vitek 2 Compact全自动微生物鉴定仪进行菌株鉴定和药敏实验。收集2011至2014年间1 761株鲍曼不动杆菌,其中IRAB 1360株。随机选取对亚胺培南耐药和敏感的鲍曼不动杆菌,分为耐药组(66株)及对照(敏感)组(14株),用PCR方法进行A^D类β-内酰胺酶、外膜孔通道蛋白和主动外排泵基因检测,采用脉冲场凝胶电泳对菌株进行分子分型,用BioNumeric软件进行聚类分析。结果1761株鲍曼不动杆菌对亚胺培南的耐药率逐年下降,由84.0%降至71.8%。同时,鲍曼不动杆菌对多种抗生素的耐药率也逐年下降。耐药组耐药基因TEM、AMPC、OXA-51的阳性率分别为95.45%、98.48%、96.97%,对照组分别为35.71%、64.29%、71.43%,耐药组均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。OXA23、OXA58仅在耐药组中检出,阳性率分别为95.45%和1.52%。其余耐药基因在2组中均未检出。80株鲍曼不动杆菌分为A^W共23个型别,耐药组主要为P1型(16株),R1型(4株)和R2(12株)型,对照组分布分散,其中R4型同时存在于耐药组和对照组。2012年2次暴发流行,分别为P1型(9月-11月)(MICU、SICU),R2型(9月-11月)(MICU);2013年2次暴发流行,分别为P1型(4月-6月)(MICU、SICU、神经科),R1型(2013年12月-2014年2月)(MICU、神经科);2014年一次暴发流行,流行菌株为R2型(2月-4月)(MICU、SICU、神经科)。结论耐亚胺培南鲍曼不动杆菌对多种抗生素的耐药率较高。鲍曼不动杆菌对亚胺培南耐药的主要机制为携带OXA23基因,产生D类β-内酰胺酶水解亚胺培南。MICU、SICU和神经科是暴发流行监控的重点科室。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 院内感染 耐药性 同源性分析
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基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合菌鉴定及同源性分析中的应用 被引量:16
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作者 嵇金如 沈萍 +6 位作者 应超群 郭丽华 喻玮 张静 吕继芳 郑焙文 肖永红 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期134-138,共5页
目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对我院血流感染样本中醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合菌的鉴定及同源性分析中的应用。方法收集2011年4月—2015年4月我院非重复血流感染标本,对VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪初... 目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对我院血流感染样本中醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合菌的鉴定及同源性分析中的应用。方法收集2011年4月—2015年4月我院非重复血流感染标本,对VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪初步鉴定为醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合菌的菌株,开展基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定,用MALDIBiotyper软件和ERIC-PCR进行同源性分析,并用16S r RNA及rec A基因测序技术进行验证。结果基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对20株VITEK 2无法鉴定到种的醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合菌展开了有效的鉴定,其中9株为医院不动杆菌(Acinetobacter nosocominalis),11株为皮特不动杆菌(Acinetobacter pittii),两种细菌的质谱图中均含有特异性的峰图,能有效地将两类细菌进行区分。同源性分析结果将菌株分为2大簇(I型11株,II型9株),II型又分为3小簇(IIa4株,IIb3株,IIc2株)。I型、II型分布在我院4个病区。结论基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合菌鉴定方面具有精准、快速的优点,可以鉴别出皮特不动杆菌和医院不动杆菌,MALDI-Biotyper软件进行同源性分析十分便捷。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合菌 医院不动杆菌 皮特不动杆菌 同源性分析
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全长细粒棘球蚴95抗原基因的克隆及DNA疫苗的构建 被引量:12
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作者 林仁勇 丁剑冰 +2 位作者 温浩 王笑峰 魏晓丽 《新疆医科大学学报》 CAS 2002年第4期359-361,共3页
目的 :克隆分析新疆地区细粒棘球蚴 95 (Eg95 )抗原全长基因的结构特点 ,并构建 Eg95 DNA疫苗。方法 :根据细粒棘球蚴 95抗原基因序列设计 PCR引物 ,应用 PCR方法从新疆株细粒棘球蚴 c DNA文库中克隆获得Eg95全长抗原目的基因。利用定... 目的 :克隆分析新疆地区细粒棘球蚴 95 (Eg95 )抗原全长基因的结构特点 ,并构建 Eg95 DNA疫苗。方法 :根据细粒棘球蚴 95抗原基因序列设计 PCR引物 ,应用 PCR方法从新疆株细粒棘球蚴 c DNA文库中克隆获得Eg95全长抗原目的基因。利用定向克隆技术将全长 Eg95抗原基因片段克隆至真核表达质粒 pc DNA3上 ,构建DNA疫苗 pc DNA3 - Eg95 ,测序确定基因碱基序列。利用 DNAm an软件及 Gene Bank/ Blast功能 ,对其进行基因全序列分析及同源性比较。 结果 :从新疆株细粒棘球蚴 c DNA文库中克隆出全长 Eg95抗原基因。所克隆的全长Eg95抗原基因长度为 471bp,编码 15 6个氨基酸。pc DNA3 - Eg95阳性克隆均为正确连接全长 Eg95抗原基因的重组质粒 ,可作为 DNA疫苗作进一步的研究。新疆株全长 Eg95抗原基因与 Gene Bank中已登录的新西兰株 Eg95抗原基因序列一致。 结论:成功克隆并构建了新疆株全长细粒棘球蚴 95抗原基因 展开更多
关键词 全长细粒棘球蚴95 抗原基因 DNA疫苗 基因克隆
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物联网设备漏洞挖掘技术研究综述 被引量:14
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作者 郑尧文 文辉 +3 位作者 程凯 宋站威 朱红松 孙利民 《信息安全学报》 CSCD 2019年第5期61-75,共15页
随着物联网设备的迅速发展和广泛应用,物联网设备的安全也受到了严峻的考验。安全漏洞大量存在于物联网设备中,而通用漏洞挖掘技术不再完全适用于物联网设备。近几年,针对物联网设备漏洞的挖掘技术逐渐成为热点。本文将分析物联网设备... 随着物联网设备的迅速发展和广泛应用,物联网设备的安全也受到了严峻的考验。安全漏洞大量存在于物联网设备中,而通用漏洞挖掘技术不再完全适用于物联网设备。近几年,针对物联网设备漏洞的挖掘技术逐渐成为热点。本文将分析物联网设备漏洞挖掘技术面临的挑战与机遇,然后从静态分析,动态模糊测试,以及同源性分析三个方面来介绍物联网设备漏洞挖掘技术的研究进展。最后本文将对今后该领域的研究重点和方向进行讨论和展望。 展开更多
关键词 物联网设备 漏洞挖掘 静态分析 模糊测试 同源性分析
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波尔山羊生长激素(GH)基因克隆及序列分析 被引量:8
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作者 刘长国 罗军 +2 位作者 郑新民 杨公社 苟德明 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2004年第6期13-17,共5页
 比较生长激素(GH)基因在不同物种间的相似性,设计引物,用PCR方法从波尔山羊基因组中扩增出一条长约2.0kb的DNA片段,然后用PMD-18T载体在感受态DH5α株大肠杆菌中获得GH基因克隆子。DNA测序结果表明,波尔山羊GH基因DNA序列全长1951bp(...  比较生长激素(GH)基因在不同物种间的相似性,设计引物,用PCR方法从波尔山羊基因组中扩增出一条长约2.0kb的DNA片段,然后用PMD-18T载体在感受态DH5α株大肠杆菌中获得GH基因克隆子。DNA测序结果表明,波尔山羊GH基因DNA序列全长1951bp(不含引物序列),含完整的5个外显子编码区。应用ClustalW软件进行同源性分析,结果表明,波尔山羊GH基因与Tokara山羊、澳洲美利奴羊和黄牛的GH基因的相似度分别为98.5%,97.0%和95.4%;内元比外元的变异程度高,在5个外元中,第一外元的保守性最高,其他区域的变异程度随物种亲缘关系的增大而升高,在分子水平上符合物种进化原理。 展开更多
关键词 波尔山羊 生长激素 基因克隆 序列分析 PCR GH基因
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MALDI-TOF MS技术在鲍曼不动杆菌鉴定及同源性分析中的应用 被引量:14
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作者 王亚南 高晶晶 +4 位作者 钟桥 陆文香 周颖 吴元健 徐卫东 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2015年第6期430-433,共4页
目的评价基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对我院鲍曼不动杆菌属的鉴定及同源性分析的能力。方法对2014年9月至2015年2月我院29株经PhoneixTM100全自动微生物鉴定仪鉴定为鲍曼不动杆菌属的菌株进行MALDI-TOF MS鉴定... 目的评价基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对我院鲍曼不动杆菌属的鉴定及同源性分析的能力。方法对2014年9月至2015年2月我院29株经PhoneixTM100全自动微生物鉴定仪鉴定为鲍曼不动杆菌属的菌株进行MALDI-TOF MS鉴定,用MALDI-Biotyper软件进行同源性分析,并用16S rRNA基因测序进行验证。结果 MALDI-TOF MS鉴定结果为鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)26株,院内不动杆菌(Acinetobacter nosocomialis)3株。MALDI-TOF MS鉴定为院内不动杆菌的3株菌株的16S rRNA基因测序结果显示,2株为院内不动杆菌,1株为鲍曼不动杆菌。26株质谱鉴定为鲍曼不动杆菌的菌株分为2大簇(Ⅰ型,Ⅱ型),Ⅱ型又分为2小簇(Ⅱa、Ⅱb)。Ⅰ型、Ⅱ型分布在我院4个病区。结论MALDI-TOF MS技术鉴定鲍曼不动杆菌精准,可以鉴别鲍曼不动杆菌和院内不动杆菌。MALDI-Biotyper数据库软件进行同源性分析十分快捷。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱 质谱 鲍曼不动杆菌 院内不动杆菌 同源性分析
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不同动物源性维氏气单胞菌气溶素基因的克隆及比较分析 被引量:14
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作者 曾范利 赵丹 +4 位作者 康元环 陈龙 王惠 单晓枫 钱爱东 《中国兽药杂志》 2014年第8期6-10,共5页
为系统研究维氏气单胞菌毒力因子气溶素,对不同动物源性的维氏气单胞菌气溶素基因(aerA)进行了克隆,获得了1500 bp左右的目的基因,并对其序列进行了分析比较。结果显示,不同动物源性维氏气单胞菌aerA基因的核苷酸序列均具有APT Superfam... 为系统研究维氏气单胞菌毒力因子气溶素,对不同动物源性的维氏气单胞菌气溶素基因(aerA)进行了克隆,获得了1500 bp左右的目的基因,并对其序列进行了分析比较。结果显示,不同动物源性维氏气单胞菌aerA基因的核苷酸序列均具有APT Superfamily与Aerolysin Superfamily保守结构域,其核苷酸序列的同源性在95.8%以上,编码的氨基酸序列同源性在89.8%以上,说明不同源性维氏气单胞菌气溶素具有一定的保守性。该研究结果可为维氏气单胞菌的检测及疫苗制备提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 维氏气单胞菌 不同动物源性 气溶素基因 同源性分析
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