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Expression and significance of PAX8 gene in ovarian cancer based on Oncomine database Meta-analysis 被引量:1
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作者 Kun Yan Hua Yan +3 位作者 Qin Zhou Min Wan Yanyan Ge Jin Lu 《Oncology and Translational Medicine》 2019年第4期175-181,共7页
Objective Although great progress has been made in the diagnosis and treatment of ovarian cancer, this disease is still the leading cause of death due to female reproductive system tumors. It has been reported that th... Objective Although great progress has been made in the diagnosis and treatment of ovarian cancer, this disease is still the leading cause of death due to female reproductive system tumors. It has been reported that the paired box 8 (PAX8) gene is involved in the occurrence and development of a variety of human tumors. However, few researchers have investigated this phenomenon in detail. Methods Here, the BioGPS database was used to analyze the expression of the PAX8 gene in normal tissues. The Oncomine database was used to search for PAX8 gene information, and the findings were analyzed via a meta-analysis with regard to the significance of this gene in ovarian cancer. The Kaplan- Meier Plotter database was used to analyze the prognosis of patients with ovarian cancer. The Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) was used only for obtaining cell line analysis data regarding the PAX8 gene. Results The relevant results of the BioGPS database analysis showed that PAX8 is not expressed or under-expressed in normal ovarian tissues. Oncomine data showed 454 different results;there were 417 study samples in total, with 9 results showing a significant statistical difference in PAX8 expression, 5 of which were related to high expression of PAX8 and 4 of which were related to low PAX8 expression. Cell line analysis data of the PAX8 gene obtained from CCLE showed high expression in ovarian cancer, which is consistent with the high expression of PAX8 in ovarian cancer research found using the Oncomine database. The Kaplan-Meier Plotter database showed that the expression level of PAX8 had a significant effect on the overall survival time of patients (P = 0.042). Compared with the low expression group, the overall survival time of ovarian cancer patients in the high expression group of PAX8 was significantly low (P < 0.05). Conclusion Through an in-depth study of the gene information of ovarian cancer-related genes using the gene chip data in the Oncomine database, it was concluded that PAX8 is highly expressed in ovarian cancer 展开更多
关键词 OVARIAN cancer GENE paired BOX 8 cancer cell line encyclopedia
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基于多种基因数据库分析乳清酸性蛋白4-二硫键核心结构域2(WFDC2)在卵巢癌中表达及意义 被引量:1
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作者 陆进 杨月 +2 位作者 闫坤 邓竹琴 张浩轩 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期528-534,共7页
目的研究乳清酸性蛋白4-二硫键核心结构域2(WFDC2)在卵巢癌中的表达及临床意义。方法分别利用Bio GPS数据库、Oncomine数据库以及癌症细胞系百科全书(CCLE)和Kaplan-Meier Plotter数据库分析WFDC2基因在正常人体组织中的表达、卵巢癌组... 目的研究乳清酸性蛋白4-二硫键核心结构域2(WFDC2)在卵巢癌中的表达及临床意义。方法分别利用Bio GPS数据库、Oncomine数据库以及癌症细胞系百科全书(CCLE)和Kaplan-Meier Plotter数据库分析WFDC2基因在正常人体组织中的表达、卵巢癌组织中表达以及卵巢癌细胞系中的表达和卵巢癌患者预后生存分析。结果 Bio GPS数据库分析结果显示WFDC2在正常卵巢组织不表达; Oncomine数据库检索出417例样本,WFDC2表达水平有差异意义的结果 34项,其中WFDC2表达增高19项,WFDC2表达降低15项;对符合设定条件的7项研究进行Meta分析发现,WFDC2在卵巢癌组织中呈高表达状态; CCLE分析结果显示WFDC2在卵巢癌细胞系中也呈高表达状态; Kaplan-Meier Plotter数据库结果显示WFDC2高表达组的卵巢癌患者总生存时间较低表达组显著延长。结论 WFDC2在卵巢癌组织高表达,且与卵巢癌患者预后生存显著相关。 展开更多
关键词 卵巢癌 基因 荟萃分析 癌症细胞系百科全书
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基于ONCOMINE数据库荟萃分析BRCA1基因在肺癌中的表达及意义 被引量:1
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作者 陆进 陈传好 张浩轩 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期2387-2393,共7页
为探讨BRCA1基因在肺癌中的表达及对肺癌患者预后生存意义,本研究利用(BioGPS,Oncomine,Kaplan-Meier Plotter)基因数据库和癌症细胞系百科全书(CCLE),分析BRCA1基因在正常人体组织中的表达以及差异表达情况,并对符合条件的研究进行Met... 为探讨BRCA1基因在肺癌中的表达及对肺癌患者预后生存意义,本研究利用(BioGPS,Oncomine,Kaplan-Meier Plotter)基因数据库和癌症细胞系百科全书(CCLE),分析BRCA1基因在正常人体组织中的表达以及差异表达情况,并对符合条件的研究进行Meta分析,同时分析BRCA1基因在肺癌组织细胞系中的表达和对肺癌患者预后生存意义。研究发现,BioGPS数据库显示BRCA1在正常肺癌组织中低表达(3.65±0.035);同时Oncomine数据库检索BRCA1基因有453项不同种类结果,35项结果表达有统计学差异意义,其中28项显示表达增高,7项显示表达降低,共有研究样本量229例;并对符合条件的5项研究进行Meta分析,发现BRCA1基因差异表达中位数值排名为34.0,p=2.51×10^-5;与CCLE检索BRCA1基因在肺癌组织细胞系中高表达的结果一致;Kaplan-Meier Plotter数据库检索结果表明BRCA1表达水平与患者的总生存预后周期相关(p=9.5×10^-6);并且BRCA1高表达组相对于低表达组的肺癌患者总体生存周期明显降低(p<0.05)。因此,通过深入挖掘Oncomine等数据库中BRCA1基因芯片信息,证实BRCA1基因在肺癌组织中呈现高表达状态,且与肺癌患者预后生存周期相关,为临床肺癌的治疗及基因靶向药物的研制提供重要依据。 展开更多
关键词 肺癌 基因 癌症细胞系百科全书
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小细胞肺癌中EphA7表达及其临床意义
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作者 王佩 王婧雅 +2 位作者 范雪涵 张宇嘉 黄鼎智 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期558-567,共10页
目的:探讨酪氨酸蛋白激酶受体A7(Ephrin receptor A7,EphA7)在小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)患者中的表达情况及其临床意义。方法:分别利用CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia)和Oncomine数据库分析EphA7 mRNA在SCLC细胞系... 目的:探讨酪氨酸蛋白激酶受体A7(Ephrin receptor A7,EphA7)在小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)患者中的表达情况及其临床意义。方法:分别利用CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia)和Oncomine数据库分析EphA7 mRNA在SCLC细胞系和组织中的表达水平。收集2011年1月—2014年12月于天津医科大学肿瘤医院接受肺叶切除术或全肺切除术的SCLC患者的石蜡包埋肺癌组织标本73例和癌旁肺组织标本6例,采用免疫组织化学法检测EphA7蛋白表达情况。采用χ^2检验分析EphA7蛋白表达与其他临床病理特征的关系,并用Kaplan-Meier生存曲线及COX风险比例模型分析EphA7蛋白表达水平及其他临床病理学特征与SCLC患者预后的关系。结果:在CCLE数据库包含的1 457个细胞系中,SCLC细胞系的EphA7 mRNA表达水平最高。在Oncomine数据库检索到的3个SCLC组织EphA7 mRNA表达数据集中,无论与正常肺组织还是非小细胞肺癌相比,SCLC组织的EphA7 mRNA表达水平均相对升高。73例SCLC患者的EphA7蛋白表达阳性率为72.6%(53/73),EphA7蛋白表达与淋巴结转移及TNM分期有关(P值均<0.05)。调整其他因素的影响后,EphA7蛋白表达阳性是影响SCLC患者总生存期(overall survival,OS)的独立预后因素[风险比(hazard ratio,HR)=2.369,95%置信区间(condence interval,CI)为1.075~5.219,P<0.05],而TNM分期是影响SCLC患者OS和无进展生存期(progression-free survival,PFS)的独立预后因素(HR=2.273,95%CI为1.252~4.124,P<0.05;HR=1.898,95%CI为1.088~3.312,P<0.05)。结论:SCLC细胞和组织中EphA7 mRNA与蛋白高表达。EphA7蛋白表达及肿瘤TNM分期可能与SCLC患者的预后密切相关。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 预后 受体 EphA7 免疫组织化学 CCLE Oncomine数据库
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