利用高通量测序技术对衡阳和韶关地区的自然发酵辣椒微生物多样性进行解析,并结合基于标记基因序列来预测功能丰度(phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states 2,PICRUSt2)软件预测菌群功能差...利用高通量测序技术对衡阳和韶关地区的自然发酵辣椒微生物多样性进行解析,并结合基于标记基因序列来预测功能丰度(phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states 2,PICRUSt2)软件预测菌群功能差异。结果表明,相比韶关地区,衡阳地区自然发酵辣椒具有更多的OTUs数目和更高的多样性。在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)是衡阳和韶关地区自然发酵辣椒的优势菌门,其两者相对丰度之和大于94%。在属水平上,Rosenbergiella(42.59%~48.77%)、假单胞菌属(Pseudomonas,7.36%~10.24%)和泛菌属(Pantoea,4.94%~6.99%)是衡阳地区自然发酵辣椒的优势菌属;韶关地区自然发酵辣椒中葡萄球菌属的相对丰度最高,可达76.15%~81.67%。PICRUSt2预测结果表明,衡阳和韶关地区自然发酵辣椒在20条二级代谢通路上存在显著差异(P<0.05),包括碳水化合物代谢、脂质代谢、核苷酸代谢和氨基酸代谢等。本研究扩大了对自然发酵辣椒微生物多样性的了解,同时为适合辣椒发酵微生物的筛选提供理论基础。展开更多
文摘利用高通量测序技术对衡阳和韶关地区的自然发酵辣椒微生物多样性进行解析,并结合基于标记基因序列来预测功能丰度(phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states 2,PICRUSt2)软件预测菌群功能差异。结果表明,相比韶关地区,衡阳地区自然发酵辣椒具有更多的OTUs数目和更高的多样性。在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)是衡阳和韶关地区自然发酵辣椒的优势菌门,其两者相对丰度之和大于94%。在属水平上,Rosenbergiella(42.59%~48.77%)、假单胞菌属(Pseudomonas,7.36%~10.24%)和泛菌属(Pantoea,4.94%~6.99%)是衡阳地区自然发酵辣椒的优势菌属;韶关地区自然发酵辣椒中葡萄球菌属的相对丰度最高,可达76.15%~81.67%。PICRUSt2预测结果表明,衡阳和韶关地区自然发酵辣椒在20条二级代谢通路上存在显著差异(P<0.05),包括碳水化合物代谢、脂质代谢、核苷酸代谢和氨基酸代谢等。本研究扩大了对自然发酵辣椒微生物多样性的了解,同时为适合辣椒发酵微生物的筛选提供理论基础。
