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PCR引物设计及软件使用技巧 被引量:102
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作者 张新宇 高燕宁 《生物信息学》 2004年第4期15-18,46,共5页
介绍了使用软件设计PCR引物的技巧。在PCR引物设计原则的基础上 ,详细介绍了两种常用引物设计软件的基本使用方法 ,并对其各自的优缺点进行了比较。一般性引物自动搜索可采用“PremierPrimer 5”软件 ,而引物的评价分析则可采用“Oli go... 介绍了使用软件设计PCR引物的技巧。在PCR引物设计原则的基础上 ,详细介绍了两种常用引物设计软件的基本使用方法 ,并对其各自的优缺点进行了比较。一般性引物自动搜索可采用“PremierPrimer 5”软件 ,而引物的评价分析则可采用“Oli go6”软件。 展开更多
关键词 PCR 引物设计 软件
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冲击力模型中ATP浓度和负载力对分子马达运动的影响
2
作者 李晨璞 胡金江 +2 位作者 李建宽 沈文梅 马丽红 《河北建筑工程学院学报》 CAS 2013年第3期86-90,97,共6页
根据已建立满足朗之万方程的冲击力模型,重点分析了ATP浓度和负载力对分子马达定向动力学的影响.研究发现:在合适的冲击力和噪声强度的共同作用下,分子马达可以进行稳定的梯跳运动;另外,分子马达平均速度随ATP浓度的增加而增大,随负载... 根据已建立满足朗之万方程的冲击力模型,重点分析了ATP浓度和负载力对分子马达定向动力学的影响.研究发现:在合适的冲击力和噪声强度的共同作用下,分子马达可以进行稳定的梯跳运动;另外,分子马达平均速度随ATP浓度的增加而增大,随负载力的增加而减小;而驻留时间及其分布的峰值随ATP浓度的增加而减小,随负载力的增加而增大. 展开更多
关键词 分子马达 冲击力 负载力 噪声强度
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Assembly and structure of neurofllaments isolated from bovine spinal cord
3
作者 佟向军 陈建国 +2 位作者 刘洁 庞世瑾 翟中和 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 1999年第3期233-239,共7页
Neurofilaments (NFs) are neuron-specific intermediate filaments. The NFs were isolated from bovine spinal cord by differential centrifugation. The NFs were detected with electron microscopy and scanning tunneling micr... Neurofilaments (NFs) are neuron-specific intermediate filaments. The NFs were isolated from bovine spinal cord by differential centrifugation. The NFs were detected with electron microscopy and scanning tunneling microscopy (STM) . Under STM, two kinds of sidearm of NFs were revealed: one was short, the other was long. They were arrayed along the 10-nm width core filaments one by one. The intervals between two adjacent long sidearms or two short sidearms were 20-22 nm, while those between two adjacent long and short sidearms were 10-ll nm. It was proposed that the rod domain of NF triplet proteins was 3/4-staggered. The assembly properties of NT triplet proteins were also studied. Immuno-colloidal-gold labeling assay showed that NF-M and NF-H are able to co-assemble into long filaments with NF-L. NF-M and NF-H can also co-constitute into winding filaments. 展开更多
关键词 NEUROFILAMENTS (NFs) STM sidearm STRUCTURE ASSEMBLY immunogold.
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用环糊精葡聚糖转移酶合成葡糖基甘油
4
作者 乃用 《工业微生物》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期57-57,共1页
关键词 葡糖基甘油 甜度 环糊精葡聚糖转移酶 淀粉 甘油
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细胞内RNA的原位杂交
5
作者 王敦瑞 陈季 +2 位作者 汪肖钢 于丽莉 陈诗书 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1989年第4期284-286,共3页
本文介绍用原位杂交方法测定细胞内的RNA。该方法特异性较高,能保持细胞曲完整性。我们测定了不同细胞的rRNA基因的转录和原癌基因c-myc,c-H-rgs的转录,取得了较满意的结果。RNase处理细胞或质粒pBR322作探针,细胞中显影颗粒很少。本文... 本文介绍用原位杂交方法测定细胞内的RNA。该方法特异性较高,能保持细胞曲完整性。我们测定了不同细胞的rRNA基因的转录和原癌基因c-myc,c-H-rgs的转录,取得了较满意的结果。RNase处理细胞或质粒pBR322作探针,细胞中显影颗粒很少。本文对原位杂交方法学进行了初步的讨论。 展开更多
关键词 RNA 细胞原位杂交
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叶酸对高同型半胱氨酸血症大鼠单核细胞趋化蛋白-1和白细胞介素-8释放的影响 被引量:4
6
作者 陈健 黎明 +1 位作者 舒砚文 廖玉华 《临床心血管病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期338-340,共3页
目的:探讨叶酸(FA)对高同型半胱氨酸(Hhcy)血症大鼠释放单核细胞趋化蛋白1(MCP1)和白细胞介素8(IL8)的影响。方法:SD大鼠30只随机分3组:Hhcy组、FA组、正常对照组,每组10只,分别给予普通饲料加1.7%蛋氨酸、普通饲料加1.7%蛋氨酸和0.006%... 目的:探讨叶酸(FA)对高同型半胱氨酸(Hhcy)血症大鼠释放单核细胞趋化蛋白1(MCP1)和白细胞介素8(IL8)的影响。方法:SD大鼠30只随机分3组:Hhcy组、FA组、正常对照组,每组10只,分别给予普通饲料加1.7%蛋氨酸、普通饲料加1.7%蛋氨酸和0.006%的FA、普通饲料,饲养45d,采用高效液相色谱法测定血浆总同型半胱氨酸(thcy)水平,双抗体夹心ELISA法测定大鼠血浆和oxLDL诱导的外周血单核细胞(PBMCs)释放MCP1和IL8的含量。结果:①大鼠喂高蛋氨酸饲料45d可诱导Hhcy,同时补充FA可显著降低血浆thcy水平(P<0.01);②与正常对照组相比,Hhcy组大鼠血浆thcy升高的同时,血浆和oxLDL诱导PBMCs释放的MCP1水平均明显升高(P<0.05;P<0.01),PBMCs释放的IL8水平亦明显升高(P<0.05),而血浆IL8的水平无明显变化(P>0.05);③FA组大鼠较Hhcy组大鼠血浆thcy水平降低,同时血浆和oxLDL诱导PBMCs释放MCP1的水平均显著降低(P<0.05;P<0.01),PBMCs释放的IL8水平亦明显降低(P<0.05),而血浆IL8的水平无明显变化(P>0.05)。结论:FA治疗显著降低血浆thcy和Hhcy血症大鼠体内MCP1和IL8的释放,FA可能通过下调趋化因子介导的炎症反应来阻止Hhcy诱导的早期动脉粥样硬化的发生。 展开更多
关键词 高同型半胱氨酸 叶酸 单核细胞趋化蛋白-1 白细胞介素-8
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手机辐射损害DNA添新证
7
《时事资料手册》 2005年第3期108-108,共1页
欧洲7国科学家发现了手机电磁辐射会破坏实验室中人体细胞的遗传物质DNA的新证据。这些科学家发现,当人体细胞受到辐射强度在每千克0.3瓦特~2瓦特的电磁波干扰时,单个DNA片断就会断裂。辐射越强,接触辐射时间越长,人体细胞DNA的... 欧洲7国科学家发现了手机电磁辐射会破坏实验室中人体细胞的遗传物质DNA的新证据。这些科学家发现,当人体细胞受到辐射强度在每千克0.3瓦特~2瓦特的电磁波干扰时,单个DNA片断就会断裂。辐射越强,接触辐射时间越长,人体细胞DNA的损伤程度就越大。研究人员指出,这种DNA损害可能会导致癌症。现有手机的辐射强度为每千克0.5瓦特~1瓦特,与上述这个区域有很大的重叠。 展开更多
关键词 DNA 手机 损害 辐射强度 体细胞 遗传物质 电磁辐射 损伤程度 研究人员 科学家 瓦特 新证据 实验室 电磁波 发现
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常减压蒸馏装置循环水样中铁含量的测定
8
作者 艾宏承 豆祥辉 祁良才 《甘肃科技》 2005年第10期113-114,共2页
介绍一种采用分光光度法测定常减压蒸馏装置循环水样中铁含量的方法,并对该方法的最佳条件进行了探讨。结果表明该方法准确度高、操作简便快速,可用于监测循环水样中的铁含量,从而监控常减压蒸馏装置中设备的腐蚀情况。
关键词 循环水样 分光光度法 测定
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全反式维甲酸对SHI-1细胞株糖基转移酶表达的影响 被引量:1
9
作者 赵凝 杨静 +2 位作者 郭向红 吴艳 吴士良 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2005年第6期465-469,共5页
目的:探讨全反式维甲酸对SH I-1细胞株中糖基转移酶表达的影响。方法:采用半定量RT-PCR和Real-Tim e PCR方法,比较在不同浓度ATRA作用下,SH I-1细胞中不同糖基转移酶家族(多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶家族、β3N-乙酰氨基葡萄糖基转移... 目的:探讨全反式维甲酸对SH I-1细胞株中糖基转移酶表达的影响。方法:采用半定量RT-PCR和Real-Tim e PCR方法,比较在不同浓度ATRA作用下,SH I-1细胞中不同糖基转移酶家族(多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶家族、β3N-乙酰氨基葡萄糖基转移酶家族和O-连接N-乙酰氨基葡萄糖转移酶家族)的表达情况。结果:在SH I-1细胞株中ppGalNAcT1、T2、T3、T4,β3GnT1、β3GnT5,O-GnT有不同程度的表达,加入全反式维甲酸后β3GnT5表达量下降,pp-GalNAcT2、T4、β3GnT1、O-GnT表达量升高。结论:加入诱导分化剂全反式维甲酸后,SHI-1细胞中的糖基化作用升高。 展开更多
关键词 全反式维甲酸 SHI-1细胞株 糖基转移酶 诱导分化
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Analysis of Single Nucleotide Polymorphism in Human Paraoxonase 1 Gene(Q192R) with Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry 被引量:1
10
作者 SUN Ya-dong SUN Shu-chen +2 位作者 WANG Zhi YANG Yang ZHANG Jin 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2006年第3期394-396,共3页
Introduction Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the most abundant DNA markers in the human genome occurring at a frequency of one in every 500--1000 nucleotides. A variety of methods have been used for the ... Introduction Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the most abundant DNA markers in the human genome occurring at a frequency of one in every 500--1000 nucleotides. A variety of methods have been used for the analysis of single nucleotide polymorphisms, including restriction fragment length polymorphism (RFLP), direct sequencing by using laser-induced fluorescence detectionTM, fluorescence energy transfer, MALDI-TOF MS combined with primer extension or invasive cleavage, and fluorescence polarization. During the past two decades, mass spectrometry has become a very popular tool in the analysis of biomolecules and is perfectly suited to the analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) due to its speed, low cost, and accuracy. In this work, we used MALDI TOF mass spectrometry to detect the fragments of restriction endonuclease hydrolysis of PCR products flanking a SNP located at paraoxonase 1(Q192R). Compared with electrophoresis, this method requires less time of analysis and possess a higher accuracy. 展开更多
关键词 Single nucleotide polymorphism Human paraoxonase 1 gene Matrix-assisted laser desorption/ionizationtime-of-flight mass spectrometry
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新型DNA逻辑门
11
作者 方德声 《科学》 北大核心 2006年第3期40-40,共1页
据国家自然科学基金委员会2006年4月4日报道,中科院上海应用物理研究所樊春海研究员与上海交通大学Bio-X中心贺林院士、张治洲教授通过合作,应用DNA核酶研制成功一类新型的“DNA逻辑门”。
关键词 DNA 逻辑门 国家自然科学基金委员会 上海交通大学 BIO-X 物理研究所 研制成功 研究员 中科院 应用
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鲨鱼皮胶原蛋白肽成分分析 被引量:14
12
作者 蒋哲 王勤 +2 位作者 邱凌 陈晋安 陈清西 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第B05期169-171,共3页
应用植物蛋白酶和动物蛋白酶来处理酶解鲨鱼皮,通过现代生物化学方法分离制备鲨鱼胶原蛋白肽,并对其组成成分进行分析,测定了它们的粗蛋白、粗脂肪、灰分、氨基酸及Cu、Zn、Fe、Ca、Na、K、Pb等金属元素的含量.应用MALDI-TOF分析两... 应用植物蛋白酶和动物蛋白酶来处理酶解鲨鱼皮,通过现代生物化学方法分离制备鲨鱼胶原蛋白肽,并对其组成成分进行分析,测定了它们的粗蛋白、粗脂肪、灰分、氨基酸及Cu、Zn、Fe、Ca、Na、K、Pb等金属元素的含量.应用MALDI-TOF分析两种胶原蛋白肽分子量的分布范围.结果表明,植物蛋白酶酶解方法研制的胶原蛋白肽分子量分布范围在2~3ku区间,而用动物蛋白酶酶解方法研制的胶原蛋白肽分子量分布范围在2~7ku区间. 展开更多
关键词 胶原蛋白肽 成分分析 质谱
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单不饱和脂肪酸对心血管的保护作用 被引量:40
13
作者 刘跟生 徐贵发 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期357-359,共3页
单不饱和脂肪酸(MUFA)是脂肪酸的一种,其碳链上只有一个双键。研究发现MUFA能够正向调节血脂代谢,降低低密度脂蛋白胆固醇(LDL)的氧化敏感性,保护血管内皮和降低血液高凝状态。本文将从以上几个方面介绍MUFA对心血管的保护作用。
关键词 单不饱和脂肪酸 血脂 内皮 心血管
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肺表面活性物质相关蛋白的特性研究
14
作者 谢尔凡 《生命的化学》 CAS CSCD 1996年第2期22-23,共2页
肺表面活性物质相关蛋白的特性研究谢尔凡(第三军医大学烧伤研究所,重庆630038)关键词肺表面活性物质,表面活性物质相关蛋白肺表面活性物质是由脂质和蛋白质组成的复合物,其主要生理功能是降低肺泡表面张力,维持肺泡结构相... 肺表面活性物质相关蛋白的特性研究谢尔凡(第三军医大学烧伤研究所,重庆630038)关键词肺表面活性物质,表面活性物质相关蛋白肺表面活性物质是由脂质和蛋白质组成的复合物,其主要生理功能是降低肺泡表面张力,维持肺泡结构相对稳定。近年来,特异性的肺表面活性... 展开更多
关键词 肺表面活性物质 表面活性物质 相关蛋白
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血管活性肠肽对人脐血CD34^+细胞增殖分化的影响
15
作者 王利 王春晖 +1 位作者 黄明慧 唐承薇 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第22期2219-2222,共4页
目的探索血管活性肠肽(vasoactiveintestinalpolypeptide,VIP)对造血干细胞(hematopoieticstemcells,HSC)增殖分化的影响及其可能机制。方法采用免疫磁珠分选技术纯化人脐血CD34+细胞;VIP孵育人CD34+细胞后,通过体外集落形成、扩增培养... 目的探索血管活性肠肽(vasoactiveintestinalpolypeptide,VIP)对造血干细胞(hematopoieticstemcells,HSC)增殖分化的影响及其可能机制。方法采用免疫磁珠分选技术纯化人脐血CD34+细胞;VIP孵育人CD34+细胞后,通过体外集落形成、扩增培养了解细胞增殖;ELISA测定细胞内外TNF-α、TGF-β水平;流式细胞术检测细胞表面CD13、CD14、CD71、CD41、CD19、CD4/CD8、CD33、CD34等抗原;生物分子相互作用系统检测人CD34+细胞VIP受体;RT-PCR分析其受体亚型。结果在1×10-7~1×10-12mol/L浓度范围内,VIP抑制人CD34+细胞集落形成及扩增倍数,其细胞集落形成抑制与VIP浓度呈正相关(r=0·925,P<0·01)。VIP(1×10-8mol/L)作用于人CD34+细胞14d后,粒系(CD13+蓝色)及单核系(CD14+)细胞百分比均明显下降(P<0·05)。VIP增加人CD34+细胞的CD34抗原表达(P<0·05)。VIP作用后CD34+细胞内、外TNF-α及TGF-β1浓度显著增加(P<0·05);人脐血CD34+细胞表达VIPI型受体。结论VIP通过人脐血CD34+细胞上VIPI型受体介导,提高造血抑制因子TNF-α、TGF-β水平,抑制人CD34+细胞的增殖、维持其干细胞特性,阻止其向粒、单系细胞分化。 展开更多
关键词 造血干细胞 血管活性肠肽 造血抑制
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控制人类寿命的时钟——核糖核酸
16
《中学科技》 2006年第11期30-31,共2页
人类对遗传基因的研究已有百年的历史,但是一直以来,科学家们的目光都聚集在脱氧核糖核酸(DNA)的研究领域,而将核糖核酸(RNA)看作“信使”和蛋白质全盛的“模板”。近年来,随着对核糖核酸的不断深入研究,核糖核酸的这种“身份... 人类对遗传基因的研究已有百年的历史,但是一直以来,科学家们的目光都聚集在脱氧核糖核酸(DNA)的研究领域,而将核糖核酸(RNA)看作“信使”和蛋白质全盛的“模板”。近年来,随着对核糖核酸的不断深入研究,核糖核酸的这种“身份”正在发生变化。那么,这到底是一种怎样的变化呢? 展开更多
关键词 脱氧核糖核酸 人类寿命 时钟 控制 遗传基因 发生变化 DNA 科学家
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用近红外光谱分析转基因抗虫棉根际全氮和有机质含量 被引量:7
17
作者 芮玉奎 黄昆仑 +2 位作者 田慧琴 郭晶 罗云波 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期35-37,共3页
随着转基因植物的普及推广,人们越来越关心其生态安全性。以转基因棉花及其对照为实验材料,借助于近红外光谱仪对转基因棉花及其对照根际土壤和非根际土壤中的全氮和有机质进行了分析测定,扫描区间为12000~ 4000cm^-1,分辨率为4cm... 随着转基因植物的普及推广,人们越来越关心其生态安全性。以转基因棉花及其对照为实验材料,借助于近红外光谱仪对转基因棉花及其对照根际土壤和非根际土壤中的全氮和有机质进行了分析测定,扫描区间为12000~ 4000cm^-1,分辨率为4cm^-1,扫描次数为64次;同时用标准方法进行对比测定。结果显示近红外检测样品的结果与标准方法结果无明显差别,说明通过扫描光谱加上数学和计算机软件分析,非常准确、方便地测定了转基因作物根际土壤中的全氮和有机质。结果显示,转基因棉花根际土壤中的全氮和有机质含量显著高于对照中的含量,分析原因主要可能与转基因抗虫棉向根际土壤分泌毒蛋白所致,毒蛋白会结合在土壤颗粒上,降解较慢,增加了全氮和有机质的含量,有机质又会增加土壤微生物的繁殖,进一步增加了土壤有机质含量。 展开更多
关键词 近红外光谱 转基因棉花 生态安全 全氮 有机质
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H^+—ATPase单位点水解过程中Fo构象的变化 被引量:1
18
作者 乐加昌 李生广 +2 位作者 祝雄伟 黄有国 林治焕 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第4期585-592,共8页
利用H+-ATP酶复合体(也称ATP合成酶)中的Fo的色氨酸荧光,观察了复合体中F1结合ATP或ADP(酶蛋白与底物分子比为1:1)时,Fo的荧光猝灭常数的变化(用竹红菌乙作为膜区蛋白荧光的猝灭剂)结果表明F1结合A... 利用H+-ATP酶复合体(也称ATP合成酶)中的Fo的色氨酸荧光,观察了复合体中F1结合ATP或ADP(酶蛋白与底物分子比为1:1)时,Fo的荧光猝灭常数的变化(用竹红菌乙作为膜区蛋白荧光的猝灭剂)结果表明F1结合ATP或ADP时Fo可得到不同的猝灭常数(Ksv),也就是Fo会产生不同的构象变化。加入二价金属离子起动ATP水解反应结束后:ATP+H2O→ADP+Pi,这时可以在Fo观察到与ADP加Mg2+时相同猝灭常数Ksv;用荧光强度随时间进程变化的实验可观察到F1水解过程中导致Fo构象变化的动力学过程。这些结果说明了H+-ATP酶复合体ATP合成的过程中F1与Fo之间存在着构象之间的通信与传递。 展开更多
关键词 腺苷三磷酸酶 氢离子 构象 水解
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分光光度计有效测量范围的生化实验验证
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作者 何正平 陆红 +1 位作者 吴忠良 江培翃 《实验室研究与探索》 CAS 2007年第2期33-34,共2页
为了在生物化学实验讲解中更直观地说明使用分光光度计时的有效测量范围,分别测定了不同浓度的苯丙氨酸和pSK质粒的光吸收值,与相应的标准浓度对照,计算出不同光吸收值的偏差,得到光吸收值与测量偏差的曲线。实验结果表明,当光吸... 为了在生物化学实验讲解中更直观地说明使用分光光度计时的有效测量范围,分别测定了不同浓度的苯丙氨酸和pSK质粒的光吸收值,与相应的标准浓度对照,计算出不同光吸收值的偏差,得到光吸收值与测量偏差的曲线。实验结果表明,当光吸收值小于0.1和大于1.0时,测量偏差超过10%,而当光吸收值在0.1~1.0之间时,测量偏差小于100k(当光吸收值在0.3~0.7之间时,测量偏差小于4%),测量值有效可信。本实验以氨基酸和核酸两种物质为例,验证了分光光度计的有效测量范围为0.1~1.0。 展开更多
关键词 有效测量范围 光吸收值 偏差
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燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ基因3′端cDNA的克隆及分析 被引量:3
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作者 何江峰 韩冰 +2 位作者 郭慧琴 张占雄 赵雅丽 《生物技术》 CAS CSCD 2007年第1期5-8,共4页
实验利用3'-RACE技术进行燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ(Oglc13Ⅱ)3'末端cDNA的快速扩增并进行序列分析.将0.01%的HgCl2诱导处理24h之后的燕麦(Avena Sativa)幼叶作为材料,利用RT-PCR技术得到Oglc13Ⅱ的部分cDNA片段,根据此片 段设计一... 实验利用3'-RACE技术进行燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ(Oglc13Ⅱ)3'末端cDNA的快速扩增并进行序列分析.将0.01%的HgCl2诱导处理24h之后的燕麦(Avena Sativa)幼叶作为材料,利用RT-PCR技术得到Oglc13Ⅱ的部分cDNA片段,根据此片 段设计一条特异性上游引物,反转录引物中的部分序列即3'sites Adaptor Primer作为下游引物,按3'RACE试剂盒(Takara)操作流程进行Oglc13Ⅱ3'末端cDN A的快速扩增,成功获取837bp的3'-RACE反应产物,通过BLAST技术,发现该片段与 许多植物β-1,3-葡聚糖酶基因具有较高的相似性(50.0%~72.0%).因此认为成功 克隆了Oglc13ⅡcDNA的3'末端序列. 展开更多
关键词 β-1 3-葡聚糖酶Ⅱ基因 RT-PCR 3'RACE CDNA
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