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中国的猪育种研究现状与发展趋势 被引量：35
1
作者 陈瑶生 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第S1期1-11,共11页
在简要阐述国际猪育种发展趋势和分析国内猪育种现状的基础上,重点讨论了我国的全国性及区域性种猪遗传评估工作,以及场间遗传联系的建立,提出了我国未来猪育种的基本策略和工作重点.
关键词 猪 遗传评估 联合育种
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中国生猪产业新趋势 被引量：33
2
作者 陈瑶生 王健 +2 位作者 刘小红 郭惠武 王晨 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2015年第2期8-14,19,共8页
2014年中国生猪养殖持续低迷,生猪产业逐渐步入微利时代。新《环境保护法》的实施倒逼生猪养殖业进行转型、升级。面对各种资源要素的约束压力和产、销区的分离,生猪产业布局进入再调整时期,企业兼并与整合提速。随着生猪产业的发展,对... 2014年中国生猪养殖持续低迷,生猪产业逐渐步入微利时代。新《环境保护法》的实施倒逼生猪养殖业进行转型、升级。面对各种资源要素的约束压力和产、销区的分离,生猪产业布局进入再调整时期,企业兼并与整合提速。随着生猪产业的发展,对人力资源职业化与专业化需求更加迫切,技术服务的托管模式快速发展。大数据与电商对传统生猪产业的影响日益凸显,并快速渗透到产业发展的各个方面。 展开更多
关键词 生猪养殖 微利 环保 布局调整 托管 大数据
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采用微卫星标记分析13个中外牛品种的遗传变异和品种间的遗传关系 被引量：27
3
作者 罗永发 王志刚 +6 位作者 李加琪 张桂香 陈瑶生 梁勇 于福清 宋卫涛 张自富 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期498-507,共10页
本研究应用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的10对微卫星引物,结合荧光–多重PCR技术,检测了10个中国地方黄牛品种和3个外来牛品种的基因型。通过计算基因频率、多态信息含量和遗传杂合度,以Nei’s遗传距离和Nei’s标... 本研究应用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的10对微卫星引物,结合荧光–多重PCR技术,检测了10个中国地方黄牛品种和3个外来牛品种的基因型。通过计算基因频率、多态信息含量和遗传杂合度,以Nei’s遗传距离和Nei’s标准遗传距离为基础,采用非加权组对算术平均聚类法构建了聚类图,分析了13个牛品种的群体内遗传变异和群体间遗传关系。并以聚类分析和群体结构分析为基础,将13个中外黄牛品种分为三类:Ⅰ类属于普通黄牛品种,包括延边牛、沿江牛、长白地方牛、蒙古牛、阿勒泰白头牛、哈萨克牛、复州牛和西藏牛;Ⅱ类属于含有瘤牛血统的黄牛品种,包括日喀则驼峰牛和阿沛甲咂牛;Ⅲ类属于外来牛品种,包括德国黄牛、西门塔尔牛和夏洛来牛。研究结果为加强我国地方黄牛品种种质特性研究以及地方牛品种资源的保护与利用提供了科学的依据。 展开更多
关键词 地方黄牛品种 微卫星 遗传变异 遗传关系
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IGF1基因对长白×蓝塘猪资源群生产性能的遗传效应分析(英文) 被引量：24
4
作者 李加琪 陈赞谋 +5 位作者 刘德武 刘小红 孙宝丽 凌飞 张豪 陈瑶生 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第9期835-839,共5页
利用F2 代设计建立了由 2 16头F2 代个体组成的长白×蓝塘猪资源群 ,应用PCR RFLP方法检测F2 代个体IGF 1基因的多态性 ;通过固定模型方法估计了IGF 1不同基因型的最小二乘均值 ,同时采用混合模型方法分析不同性状IGF 1基因型的遗... 利用F2 代设计建立了由 2 16头F2 代个体组成的长白×蓝塘猪资源群 ,应用PCR RFLP方法检测F2 代个体IGF 1基因的多态性 ;通过固定模型方法估计了IGF 1不同基因型的最小二乘均值 ,同时采用混合模型方法分析不同性状IGF 1基因型的遗传效应 ,并由此计算IGF 1基因的加性和显性效应。固定模型和混合模型方法的分析结果都表明 ,IGF 1不同基因型对猪断奶后日增重有显著影响 ,AA型的遗传效应显著比AB型高 2 0 5 8g(P =0 0 347) ,IGF 1基因对该性状的加性和显性效应分别为 1 78g和 - 18 81g ;对胴体组成性状也有影响 ,AA型和AB型对骨率的遗传效应分别极显著低于BB型 5 2 2 % (P =0 0 0 0 8)和 5 19% (P =0 0 0 0 7) ,IGF 1基因对该性状的加性和显性效应分别为 - 2 6 1%和 - 2 5 8% ;AA型胴体瘦肉量的遗传效应显著比AB型少 0 4 5kg(P =0 0 2 6 4 ) ,IGF 1基因对该性状的加性和显效应分别为 0 16kg和 0 6 1kg ;AA型和AB型皮脂率的遗传效应比BB型分别高 8 81%(P =0 0 2 0 6 )和 7 6 4 % (P =0 0 4 31) ,对该性状的加性和显性效应分别为 4 4 1%和 3 2 4 %。因此 ,IGF 1基因的遗传效应分析说明该基因对断奶后日增重、骨率、胴体瘦肉量和皮脂率等 4个性状有显著的遗传影响 ;而加性和显性效应估计值的大? 展开更多
关键词 IFG-1基因 长白×蓝塘猪 资源群 生产性能 遗传效应
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种猪遗传评估技术研发与评估系统应用 被引量：29
5
作者 张勤 丁向东 陈瑶生 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2015年第8期61-65,84,共6页
种猪遗传评估是猪育种的中心和常规工作,是决定育种成效的关键。自2007年以来,在全国生猪产业技术体系建设项目和全国生猪遗传改良计划的推动和支持下,我国的种猪遗传评估工作得到持续稳步的推进,研发建立了我国种猪遗传评估技术体系,... 种猪遗传评估是猪育种的中心和常规工作,是决定育种成效的关键。自2007年以来,在全国生猪产业技术体系建设项目和全国生猪遗传改良计划的推动和支持下,我国的种猪遗传评估工作得到持续稳步的推进,研发建立了我国种猪遗传评估技术体系,包括育种值估计模型、综合选择指数、场间关联性估计和全国种猪遗传评估中心。基于动物模型BLUP的遗传评估技术已在种猪场(尤其是国家核心种猪场)广泛应用。截止到2014年底,全国种猪遗传评估中心已积累了226.1万头种猪的生长性能测定数据和94.5万头母猪的繁殖记录,每年所收集数据量、数据的质量和场间关联率均逐年提高,利用这些数据每周为全国核心种猪场进行一次遗传评估。今后需在增强场间遗传联系、增加遗传评估性状、有效利用中心测定站数据和加强技术服务等方面进一步完善我国种猪遗传评估体系。 展开更多
关键词 全国生猪产业技术体系 全国生猪遗传改良计划 遗传评估 全国种猪遗传评估中心
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微卫星DNA标记与猪肉质性状的相关分析 被引量：17
6
作者 侯建国 李加琪 +1 位作者 陈瑶生 王翀 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期63-66,共4页
测定了长蓝参考家系F2代个体的肉色、大理石纹、pH值和系水力4个肉质性状,同时测定了6号染色体的23个微卫星DNA标记,将不同基因型与4个肉质性状进行方差分析与多重比较.结果表明:肉色与大理石纹、pH值、系水力间的相关系数分别为-0 322... 测定了长蓝参考家系F2代个体的肉色、大理石纹、pH值和系水力4个肉质性状,同时测定了6号染色体的23个微卫星DNA标记,将不同基因型与4个肉质性状进行方差分析与多重比较.结果表明:肉色与大理石纹、pH值、系水力间的相关系数分别为-0 322、0 419、0 468,pH值和系水力间的相关系数最高,为0 737,差异极显著;MN006座位与影响pH值性状的QTL连锁,加性效应为0 108,MN004座位与影响大理石纹性状的QTL连锁,加性效应为0 125. 展开更多
关键词 微卫星DNA标记 猪肉 肉质性状 相关分析 基因型 QTL定位 标记辅助育种
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我国生猪标准化养殖模式和技术水平分析 被引量：26
7
作者 刘小红 王健 +9 位作者 刘长春 赵云翔 杨军香 梁菲菲 黄萌萌 何耀棋 胡斌 闻丽君 姚钟骁 陈瑶生 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期72-77,共6页
对全国28个省市区的241家生猪标准化示范场进行调研和分析,系统反映了我国生猪标准化规模养殖现状,对养殖营销模式、繁育体系、饲料质量监测、疫病综合防控及猪舍设计与环境控制等主要因素进行了分析。结果表明,我国生猪养殖模式多元并... 对全国28个省市区的241家生猪标准化示范场进行调研和分析,系统反映了我国生猪标准化规模养殖现状,对养殖营销模式、繁育体系、饲料质量监测、疫病综合防控及猪舍设计与环境控制等主要因素进行了分析。结果表明,我国生猪养殖模式多元并存,标准化格局逐步形成,一体化养殖模式是我国主要的标准化养殖模式。此外,通过总结参与调查者对生猪规模化发展、标准化技术创新和养殖模式等方面的需求,提出了一些建议,供相关的政策制定、产业技术研发和推广等相关部门参考。 展开更多
关键词 生猪养殖模式 标准化养殖 技术水平 调查研究
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猪脂肪前体细胞分化过程中聚脂相关基因的表达模式 被引量：22
8
作者 张罕星 朱晓彤 +5 位作者 束刚 高萍 高淑静 张常明 江青艳 陈瑶生 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第1期143-150,共8页
本实验采用胶原酶消化法分离猪皮下脂肪前体细胞,用含850nmol/L胰岛素和50nmol/L地塞米松的诱导培养液进行诱导,采用油红O提取法测定了细胞中的甘油三酯含量,同时采用实时定量RT-PCR方法检测了细胞分化过程中聚脂相关基因的表达。结果显... 本实验采用胶原酶消化法分离猪皮下脂肪前体细胞,用含850nmol/L胰岛素和50nmol/L地塞米松的诱导培养液进行诱导,采用油红O提取法测定了细胞中的甘油三酯含量,同时采用实时定量RT-PCR方法检测了细胞分化过程中聚脂相关基因的表达。结果显示:转录因子PPARγ和C/EBPβ在诱导后12h即迅速表达,SREBP-1mRNA表达水平在诱导后12h出现显著下调,随后逐渐升高,96h达到最高水平;脂肪合成相关酶基因GPDH、FAS、ACC和LPL呈现出与SREBP-1相似的表达模式;脂肪酸转运相关基因aP2、FAT、FATP1与VLDLR的表达量随着细胞分化过程的延长而不断增加,并且与细胞内甘油三酯的含量变化高度相关。本实验结果表明,PPARγ、C/EBPβ和SREBP-1可能是调控猪脂肪前体细胞分化的关键转录因子。猪皮下脂肪组织在聚脂过程中,在分化早期可能以脂肪细胞自身合成脂肪酸为主,而后期则主要依赖细胞外脂肪酸的跨膜转运。这些结果可能有助于揭示脂肪细胞的分化调控规律。 展开更多
关键词 脂肪生成 脂肪前体细胞 基因表达 猪
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全基因组选择在猪育种中的应用 被引量：23
9
作者 王晨 秦珂 +3 位作者 薛明 莫德林 陈瑶生 刘小红 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期1-9,共9页
全基因组选择(Genomic selection,GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能够更加准确地早期预测估计育种值,降低近交系数,大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪... 全基因组选择(Genomic selection,GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能够更加准确地早期预测估计育种值,降低近交系数,大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪60kSNP芯片的商业化,全基因组选择已经成为猪育种研究领域的新热点。本文综述了全基因组选择的分析方法、计算方法和影响因素,并阐述了全基因组选择在猪育种中的应用情况和发展趋势。 展开更多
关键词 全基因组选择 猪 育种 SNP芯片
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猪肌内脂肪前体细胞与皮下脂肪前体细胞分化过程中基因差异表达分析 被引量：23
10
作者 张罕星 朱晓彤 +6 位作者 束刚 周桂炫 高萍 高淑静 张常明 江青艳 陈瑶生 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期3760-3768,共9页
【目的】探讨猪肌内脂肪细胞与皮下脂肪细胞的基因表达差异。【方法】通过改进的胶原酶消化法,分别从猪(大×长二元杂)皮下脂肪组织和背最长肌肌肉组织中分离脂肪前体细胞,用850nmol·L-1胰岛素和50nmol·L-1地塞米松诱导... 【目的】探讨猪肌内脂肪细胞与皮下脂肪细胞的基因表达差异。【方法】通过改进的胶原酶消化法,分别从猪(大×长二元杂)皮下脂肪组织和背最长肌肌肉组织中分离脂肪前体细胞,用850nmol·L-1胰岛素和50nmol·L-1地塞米松诱导细胞分化,采用油红O提取法测定细胞分化过程中的聚酯水平。同时采用实时荧光定量PCR方法检测细胞分化过程中的转录调控因子基因(PPARγ、C/EBPβ与SREBP-1)、脂肪合成酶相关基因(GPDH、ACC和SCD-1)、脂肪酸转运相关基因(LPL、FAT与AP2)以及肌肉旁分泌因子受体基因(ACVR2B、IL-6R和IGF-1R)的表达模式。【结果】猪肌内脂肪前体细胞诱导后聚酯的速度快于皮下脂肪前体细胞。与此相似,肌内脂肪前体细胞中PPARγ、SREBP-1、SCD-1、LPL、AP2和FAT的mRNA表达在分化后期均显著高于皮下脂肪细胞。肌肉旁分泌因子受体基因ACVR2B、IGF-IR和IL-6RmRNA在皮下脂肪前体细胞随分化程度的增加其表达水平逐渐降低,但肌内脂肪前体细胞ACVR2B却在诱导后不断上调。【结论】建立了猪肌内和皮下脂肪前体细胞的原代培养模型,发现在离体培养条件下猪肌内脂肪前体细胞比皮下脂肪前体细胞具有更强的分化聚酯能力。从在体情况下肌内脂肪的沉积量少,沉积时间晚等现象可以推测肌内脂肪前体细胞的分化有可能受到肌肉旁分泌因子的局部抑制。 展开更多
关键词 猪 脂肪前体细胞 离体培养 肌内脂肪 基因表达
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母猪品种、胎次、活仔数和分娩月份对窝产仔均匀度等性状的影响 被引量：22
11
作者 赵云翔 刘小红 +4 位作者 陈清森 朱琳 黄志强 张从林 陈瑶生 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2017年第2期24-29,共6页
母猪窝产仔均匀度相关性状是影响哺乳仔猪死亡率的因素之一。本研究对9 458头长白猪和13 317头大白母猪分娩数据进行分析发现,长白和大白猪初生窝内平均重变异度分别为17.9%和18.0%,初生窝内平均重标准差分别为262.6、257.6 g。研究表明... 母猪窝产仔均匀度相关性状是影响哺乳仔猪死亡率的因素之一。本研究对9 458头长白猪和13 317头大白母猪分娩数据进行分析发现,长白和大白猪初生窝内平均重变异度分别为17.9%和18.0%,初生窝内平均重标准差分别为262.6、257.6 g。研究表明,母猪品种、配种组合、母猪产活仔数、胎次、季节及母猪妊娠天数影响母猪窝产仔均匀度。初生窝内平均重标准差依次为大长杂繁(YL)>长大杂繁(LY)>长白纯繁(LL)>大白纯繁(YY)(P<0.05);随着产活仔数的增加,初生窝内平均重变异度和标准差显著升高(P<0.05);初生窝内平均重标准差和初生窝内平均重变异度均是第1胎最低,随着胎龄而增加。本研究提示通过选择合适的品种、规范胎龄分布和有效的季节性管理措施可以改善猪群窝产仔均匀度。 展开更多
关键词 均匀度 母猪 品种 胎次
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2020年生猪产业发展状况、未来发展趋势与建议 被引量：22
12
作者 刘小红 陈瑶生 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第3期196-200,共5页
2020年是我国生猪产业高速发展的一年,本文总结了国内外生猪产业生产与贸易概况,分析了2020年我国生猪产业发展现状及存在的主要问题,展望了2021年生猪产业发展趋势,并对未来生猪产业发展提出建议。
关键词 生猪 产业 趋势 建议
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2019年生猪产业发展状况、未来发展趋势与建议 被引量：21
13
作者 刘小红 陈瑶生 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第3期126-130,共5页
本文首先总结了国内外生猪产业生产与贸易概况,进而分析了2019年我国生猪产业的发展现状及存在的主要问题,并对2020年生猪产业发展趋势进行展望,最后对未来生猪产业发展提出相关建议。
关键词 生猪 产业 趋势 建议
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猪的骨骼肌生长发育研究进展 被引量：19
14
作者 赵晓 莫德林 +3 位作者 张悦 龚雯 李安宁 陈瑶生 《生命科学》 CSCD 北大核心 2011年第1期37-44,共8页
瘦肉率对生猪产业来说是一个极其重要的经济指标,而这一指标完全取决于骨骼肌的生长发育。因此,猪骨骼肌生长发育机理的研究是十分必要的。然而,在早期由于各种因素的限制,猪骨骼肌单个基因的研究一直进展缓慢;相反,以小鼠为模型,其骨... 瘦肉率对生猪产业来说是一个极其重要的经济指标,而这一指标完全取决于骨骼肌的生长发育。因此,猪骨骼肌生长发育机理的研究是十分必要的。然而,在早期由于各种因素的限制,猪骨骼肌单个基因的研究一直进展缓慢;相反,以小鼠为模型,其骨骼肌单基因的功能研究却取得了较大进展。在这一时期,影响肌决定和肌分化的基因,如MRFs家族和MEF2家族相继被发现,这些基因在猪的肌肉发育中也发挥着同样的作用。然而,这些结果并不能很好地揭示骨骼肌发育过程中复杂的基因间互作关系。随着近年来芯片和测序技术的不断发展,更多人试图从整个转录谱的水平来阐述猪肌肉发育的分子机理,并且也取得了较大的进展。为了对猪骨骼肌生长发育有一个更为清晰的认识,该文将以目前猪骨骼肌生长发育研究结果为基础,同时结合模式动物小鼠骨骼肌单基因的研究成果,对猪的骨骼肌生长发育分子调控机理进行详细的阐述。 展开更多
关键词 骨骼肌 猪 生长发育 成肌 调节因子
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全国生猪遗传改良计划(2009-2020)给我国生猪种业带来的变化和未来工作建议 被引量：19
15
作者 丁向东 邱小田 +3 位作者 王志刚 杨红杰 陈瑶生 张勤 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第6期169-174,共6页
我国生猪遗传改良计划经过10年实施取得了显著成效,已成为我国生猪育种的压舱石。本文总结了我国生猪遗传改良计划给我国生猪种业带来的巨大变化,并对存在的问题提出下一步工作建议。
关键词 遗传改良 全国生猪遗传改良计划 显著成效 生猪
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2021年生猪产业发展状况、未来发展趋势与建议 被引量：18
16
作者 刘小红 陈瑶生 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第3期204-209,共6页
2021年是我国生猪产业遭遇最强烈"猪周期"影响的一年,也标志着规模化生猪养殖进入激烈竞争的新时期。本文总结了本年度国内外生猪产业生产与贸易概况,分析了我国生猪产业的发展现状及当前存在的主要问题,展望了2022年生猪产... 2021年是我国生猪产业遭遇最强烈"猪周期"影响的一年,也标志着规模化生猪养殖进入激烈竞争的新时期。本文总结了本年度国内外生猪产业生产与贸易概况,分析了我国生猪产业的发展现状及当前存在的主要问题,展望了2022年生猪产业发展趋势,对未来生猪产业发展提出一些看法和建议。 展开更多
关键词 生猪 产业 趋势 建议
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应用SSA报告载体提高ZFN和CRISPR/Cas9对猪IGF2基因的打靶效率 被引量：19
17
作者 吴金青 梅瑰 +3 位作者 刘志国 陈瑶生 丛佩清 何祖勇 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期55-62,共8页
IGF2(Insulin-like growth factor 2)基因作为最复杂多样的生长因子之一,对猪胎儿发育以及出生后生长发育和肌肉生成起着非常重要的作用。通过基因组编辑技术对我国本地猪种的IGF2基因作精确的遗传修饰,对于提高本地猪种的瘦肉率具有重... IGF2(Insulin-like growth factor 2)基因作为最复杂多样的生长因子之一,对猪胎儿发育以及出生后生长发育和肌肉生成起着非常重要的作用。通过基因组编辑技术对我国本地猪种的IGF2基因作精确的遗传修饰,对于提高本地猪种的瘦肉率具有重要的育种意义。文章在蓝塘猪胎儿成纤维细胞(Porcine fetal fibroblasts,PEF)中检测了锌指核酸酶(Zinc finger nucleases,ZFN)和CRISPR/Cas9对IGF2基因的打靶效率,结果表明CRISPR/Cas9对IGF2基因的切割效率最高可达9.2%,显著高于ZFN的切割效率(<1%),但两者均未达到作为体细胞核移植(Somatic nuclear transfer,SCNT)供体细胞所需的打靶效率。应用SSA(Single-strand annealing)报告载体筛选技术来富集IGF2基因被ZFN和CRISPR/Cas9修饰过的PEF细胞,结果表明,该技术可使CRISPR/Cas9的打靶效率提高5倍左右,对ZFN的打靶效率具有更大的增强作用。 展开更多
关键词 IGF2基因 CRISPR/Cas9 SSA报告系统 CRISPR/Cas9
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DHPLC系统工作原理及其应用 被引量：15
18
作者 李莉 王翀 陈瑶生 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第C00期120-124,共5页
变性高效液相色谱(DHPLC)是一种高通量筛选DNA序列变异的新技术,从该仪器设备的组成、工作原理、基本操作方法、主要技术特点等作一综述,并对其在基因组领域的应用如SNP分析、双链DNA片段分析、微卫星分析、mRNA定量分析、引物纯度检测... 变性高效液相色谱(DHPLC)是一种高通量筛选DNA序列变异的新技术,从该仪器设备的组成、工作原理、基本操作方法、主要技术特点等作一综述,并对其在基因组领域的应用如SNP分析、双链DNA片段分析、微卫星分析、mRNA定量分析、引物纯度检测等方面及在医学、遗传学方面的应用作了较详细的综述。 展开更多
关键词 DHPLC 原理 应用 变性高效液相色谱
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动物遗传学综合性实验教学模式和效果 被引量：18
19
作者 王翀 陈瑶生 +1 位作者 张细权 杨关福 《华南农业大学学报（社会科学版）》 2006年第2期148-152,共5页
在动物科学专业本科生“动物遗传学”课程中,开设综合性实验,通过对实验设计的基本思路、教学方式、教学效果反馈信息、问题及对策等方面进行综合讨论和分析。实施效果表明,这种实验课教学模式得到了学生的普遍认同,认为通过综合性实验... 在动物科学专业本科生“动物遗传学”课程中,开设综合性实验,通过对实验设计的基本思路、教学方式、教学效果反馈信息、问题及对策等方面进行综合讨论和分析。实施效果表明,这种实验课教学模式得到了学生的普遍认同,认为通过综合性实验扩大了知识面,对遗传学知识有了直观的感性认识,巩固了理论课学习的基本知识,提高了综合实验技能和动手能力,为学生今后从事相应的专业研究奠定基础。 展开更多
关键词 动物遗传学 实验教学 综合性实验
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基于SNP芯片分析的蓝塘猪遗传群体结构 被引量：18
20
作者 王晨 马宁 +6 位作者 郭春和 袁仁强 曾检华 宋德清 张惠文 陈瑶生 刘小红 《广东农业科学》 CAS 2018年第6期110-115,174,共7页
为了保护和利用蓝塘猪种质资源,采用Illumina CAUPorince 50K SNP芯片对139头蓝塘猪进行遗传群体结构分析。结果显示,SNP芯片基因型分型的平均检出率高达98.24%,表明该芯片适合应用于中国地方猪。蓝塘猪的平均遗传距离值为0.3326±0... 为了保护和利用蓝塘猪种质资源,采用Illumina CAUPorince 50K SNP芯片对139头蓝塘猪进行遗传群体结构分析。结果显示,SNP芯片基因型分型的平均检出率高达98.24%,表明该芯片适合应用于中国地方猪。蓝塘猪的平均遗传距离值为0.3326±0.0339,主成分分析和G矩阵结果表明部分种猪之间亲缘关系较近。139头蓝塘猪种猪可以分成5个家系,分别为家系A、B、C、D和E,其中家系A、B、C和D均有种公猪。蓝塘猪的Y染色体共有两种单倍型,其中家系A和B属于单倍型A,家系C和D属于单倍型B。在蓝塘猪中共检测到1 680个ROH片段,10~20 Mb长度的ROH数量最多、占44.52%,平均每个蓝塘猪的ROH数量为12.09(±5.90)个,平均总长度为246.90(±170.93)Mb。通过SNP芯片,从遗传水平反映了一个蓝塘猪种群的群体结构,为地方猪种的保种、开发与利用提供了有力工具。 展开更多
关键词 蓝塘猪 SNP芯片 群体结构 ROH 近交
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