C57BL/6小鼠微小三毛滴虫的观察与种系发育分析

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作者 温福利 《福建畜牧兽医》 2024年第4期10-12,18,共4页

为鉴定从某外单位引进的C57BL/6小鼠粪样检测中发现的虫体种类,本试验对虫体进行形态学观察,并进行种系发育分析。取C57BL/6小鼠粪样涂片和瑞士染色后进行显微镜观察,提取粪样总DNA,根据三毛滴虫的16S rRNA进行PCR扩增后测序,运用MEGA1... 为鉴定从某外单位引进的C57BL/6小鼠粪样检测中发现的虫体种类,本试验对虫体进行形态学观察,并进行种系发育分析。取C57BL/6小鼠粪样涂片和瑞士染色后进行显微镜观察,提取粪样总DNA,根据三毛滴虫的16S rRNA进行PCR扩增后测序,运用MEGA11进行种系发育分析。显微镜观察发现,虫体符合微小三毛滴虫的形态学特征,测序发现微小三毛滴虫的基因序列与鼠三毛滴虫高度同源。 展开更多

关键词 C57BL/6小鼠 微小三毛滴虫 16S rRNA 种系发育分析

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四川省骆驼源隐孢子虫的分离与虫种鉴定 被引量：4

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作者 谢娜 钟志军 +11 位作者 刘学涵 陈维刚 李威 刘俊卿 李魏 邓家波 孙鸿雁 谢瑶 庄妤冰 徐晓阳 苏怀益 彭广能 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期414-418,共5页

为调查四川省骆驼的隐孢子虫感染情况,采用蔗糖溶液漂浮法检测了成都动物园和雅安市碧峰峡野生动物园共6匹成年骆驼的新鲜粪便,通过巢式PCR扩增了阳性分离株的18SrRNA位点基因,并采用MLST方法测定了该分离株在MS1、MS2、MS3和MS16基因... 为调查四川省骆驼的隐孢子虫感染情况,采用蔗糖溶液漂浮法检测了成都动物园和雅安市碧峰峡野生动物园共6匹成年骆驼的新鲜粪便,通过巢式PCR扩增了阳性分离株的18SrRNA位点基因,并采用MLST方法测定了该分离株在MS1、MS2、MS3和MS16基因位点单元型;同时构建了系统发育树,鉴定了感染的隐孢子虫虫种及亚型类别。结果显示,2匹骆驼(CDBC01、SCBCO2)感染了隐孢子虫,18SrRNA序列与安氏隐孢子虫人源分离株(GenBank登录号KF271478)的相似率均为100%;经MLST分析,该2株亚型分别为A6、A5、A2、A1和A4、A4、A4、A1,与先前在骆驼与牛上的报道一致。本试验首次在四川省骆驼体内发现安氏隐孢子虫,并确定为2种隐孢子虫亚型。 展开更多

关键词 隐孢子虫 骆驼 安氏隐孢子虫 18S RRNA MLST 种系发育分析

原文传递

林芝地区羊蜱蝇的形态学及分子鉴定

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作者 钟浪 杨飞 +3 位作者 董海龙 张浩杰 陈杰 廖成斌 《四川畜牧兽医》 2024年第8期25-27,29,共4页

为了鉴定西藏林芝地区绵羊外寄生虫的种属类型,采集林芝地区羊蜱蝇成虫30只、蛹5只,通过形态学作初步鉴定,同时基于18S rRNA序列的PCR方法进行分子鉴定,获得18S rRNA基因序列进行Blast相似性搜索,应用MegAlign和MEGA 7.0软件完成同源性... 为了鉴定西藏林芝地区绵羊外寄生虫的种属类型,采集林芝地区羊蜱蝇成虫30只、蛹5只,通过形态学作初步鉴定,同时基于18S rRNA序列的PCR方法进行分子鉴定,获得18S rRNA基因序列进行Blast相似性搜索,应用MegAlign和MEGA 7.0软件完成同源性分析及种系发育分析。结果显示:虫体18S rRNA序列与中国新疆2016年上传的羊蜱蝇序列同源性达99.5%~99.9%,差异性在0.1%~0.5%之间;进化树显示与蜱蝇属、羊蜱蝇18S rRNA基因序列聚类。研究表明林芝地区绵羊感染的外寄生虫是羊蜱蝇。 展开更多

关键词 羊蜱蝇 18S rRNA 同源性 种系发育分析

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湖南省野猪杜氏颚口线虫线粒体cytb基因序列种系发育分析 被引量：4

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作者 王欣茹 尹代杰 +3 位作者 杨逸豪 李萌 刘思齐 刘伟 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期643-645,649,共4页

为阐明野猪杜氏颚口线虫分离株线粒体细胞色素b(cytb)基因的遗传变异情况,并利用该基因探究杜氏颚口线虫与其它线虫的种群遗传关系。本研究利用PCR扩增从野猪体内分离出的杜氏颚口线虫cytb基因,并对该基因序列进行分析。结果显示,8株杜... 为阐明野猪杜氏颚口线虫分离株线粒体细胞色素b(cytb)基因的遗传变异情况,并利用该基因探究杜氏颚口线虫与其它线虫的种群遗传关系。本研究利用PCR扩增从野猪体内分离出的杜氏颚口线虫cytb基因,并对该基因序列进行分析。结果显示,8株杜氏颚口线虫分离株线粒体cytb基因序列长度均为1 067 bp,与Genbank中登录的杜氏颚口线虫分离株同源性均大于98.3%,与其它线虫的同源性均小于72.0%;通过该基因建立的系统发育树分析显示,所有的杜氏颚口线虫分离株均与已知杜氏颚口线虫属于同一大分支。表明,线粒体cytb基因序列种内相对保守,种间差异明显,可以作为分子标记应用于杜氏颚口线虫的种间遗传变异研究。本研究为杜氏颚口线虫的分子流行病学和群体遗传学奠定基础。 展开更多

关键词 野猪 杜氏颚口线虫 线粒体DNA CYTB基因 种系发育分析

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渝西地区奶牛隐孢子虫的分离和基因型鉴定 被引量：3

5

作者 林洁 周荣琼 +3 位作者 谭燕财 马光旭 敖冯虎 胡志刚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期495-500,共6页

为鉴定渝西地区奶牛隐孢子虫分离株的种类和基因型,本研究利用巢氏PCR(Nested PCR)扩增18S rRNA基因,PCR产物进行限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism analysis,RFLP);将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体... 为鉴定渝西地区奶牛隐孢子虫分离株的种类和基因型,本研究利用巢氏PCR(Nested PCR)扩增18S rRNA基因,PCR产物进行限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism analysis,RFLP);将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体,对阳性克隆进行测序,序列用BLAST和MEGA 4.0进行同源性和种系发育分析。结果表明阳性样品均成功扩增出约830bp的目的基因片段,PCR产物分别经SspⅠ和MboⅡ酶切后进行RFLP分析,显示渝西地区存在3种隐孢子虫,即C.andersoni、C.bovis、C.ryanae。其中C.andersoni为优势虫种。鉴定结果为进一步开展奶牛隐孢子虫的病原生物学研究及该地区隐孢子虫病的监测奠定了基础。 展开更多

关键词 隐孢子虫 18S RRNA PCR-RFLP 种系发育分析

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贵州省安顺地区蛇源裂头蚴分离株的分子鉴定及种系发育关系分析 被引量：3

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作者 李金福 刘艳丹 +1 位作者 陈艳 裘学丽 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期376-382,共7页

目的对贵州省安顺地区蛇源裂头蚴分离株进行分子鉴定及种系发育关系的分析。方法采集贵州安顺地区4种常见野生蛇（王锦蛇、乌梢蛇、黑眉锦蛇、灰鼠蛇）来源的裂头蚴,分别提取各裂头蚴基因组DNA,PCR扩增ITS1和cox1基因,所得PCR扩增产物... 目的对贵州省安顺地区蛇源裂头蚴分离株进行分子鉴定及种系发育关系的分析。方法采集贵州安顺地区4种常见野生蛇（王锦蛇、乌梢蛇、黑眉锦蛇、灰鼠蛇）来源的裂头蚴,分别提取各裂头蚴基因组DNA,PCR扩增ITS1和cox1基因,所得PCR扩增产物经纯化并T-A克隆后测序。运用ClustalX1.81生物分析软件,将所得序列与GenBank所录迭宫属绦虫和其它属绦虫基因序列进行多重序列比对分析,并应用软件MEGA 6.0构建系统发育树（邻位连接法）。结果成功扩增出8株裂头蚴的ITS1和cox1基因序列,ITS1大小为822～863bp,cox1大小为404～415bp,与预期的基因片段大小一致。基于ITS1和cox1基因序列构建的种系发育树与所有的猬迭宫绦虫均构成同一亚群,总分支的自展值高于50%,二者在不同的分离株之间呈现基因多态性。对8株裂头蚴ITS1和cox1序列的同源性进行比较,ITS1的同源性为70.27%～82.84%,而cox1的同源性为95.63%～99.50%,显示cox1的同源性高于ITS1。已向GenBank提交ITS1和cox1新序列各一条,登录号分别为KF990161和KJ418421。结论贵州安顺地区不同蛇源裂头蚴分离株之间存在基因多态性。从总分支的自展值来看,cox1比ITS1更适合用于种内遗传多态性研究,ITS1适合做定种的分子标记。 展开更多

关键词 裂头蚴 第一内转录间隔区 细胞色素C氧化酶第一基因 种系发育分析

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钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫ITS2序列测定及其种系发育分析 被引量：2

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作者 梅雪芳 李树清 +3 位作者 胡长红 黄腾飞 陈志飞 黄维义 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第8期1943-1949,共7页

本试验将从犬猫肠道中分离的钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫用盐酸卡红染色后观察其形态学特征;PCR扩增其ITS2基因序列并测序,并将测序结果与GenBank同属异形科的多棘单睾吸虫和横川后殖吸虫序列进行比对;应用Mega 6.05软件采用邻位相连法... 本试验将从犬猫肠道中分离的钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫用盐酸卡红染色后观察其形态学特征;PCR扩增其ITS2基因序列并测序,并将测序结果与GenBank同属异形科的多棘单睾吸虫和横川后殖吸虫序列进行比对;应用Mega 6.05软件采用邻位相连法构建种系发育树进行分析。盐酸卡红染色后显示,钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫各形态学特征符合经典的分类学描述。PCR测序后获得钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫ITS2序列长度分别为295和297bp,G＋C含量分别为49.5%（146/295）和54.2%（161/297）。提交至GenBank后获得登录号分别为钩棘单睾吸虫KJ137221-KJ137223,KP165437-KP165439;扇棘单睾吸虫KP165440。序列比对结果显示,钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫种内差异性为0,4种异形吸虫种间差异为15.2%-28.9%。基于ITS2序列建立的种系发育树显示钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫构成自展值为78%的拓扑分支。 展开更多

关键词 钩棘单睾吸虫 扇棘单睾吸虫 ITS2基因 种系发育分析

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绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫线粒体nad5基因和cytb基因的序列分析 被引量：2

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作者 赵雷 江海海 +5 位作者 刘国华 赵光辉 蔡进忠 周东辉 朱兴全 钱爱东 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期21-26,共6页

本研究的目的是通过对绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫线粒体细胞色素b基因（cytb）部分序列（pcytb）和烟酰胺嘌呤二核苷酸（NADH）脱氢酶亚单位5基因（nad5）部分序列（pnad5）的克隆和遗传变异分析，首次为在分子水平上区分绵羊夏柏... 本研究的目的是通过对绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫线粒体细胞色素b基因（cytb）部分序列（pcytb）和烟酰胺嘌呤二核苷酸（NADH）脱氢酶亚单位5基因（nad5）部分序列（pnad5）的克隆和遗传变异分析，首次为在分子水平上区分绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫提供理论依据。采用PCR方法分别克隆了6条绵羊夏柏特线虫陕西分离株和9条叶氏夏柏特线虫青海分离株的pcytb和pnad5。将测序结果应用ClustalX1．81程序进行比对，然后用PAUP4．0程序中的MP法将pcytb和pnad5串联后构建系统发育树。结果显示，获得的pnad5和pcytb序列的长度分别为388bp和659bp，其变异率在绵羊夏柏特线虫分离株中分别为0．3％～1．3％和0．2％～2．6％，在叶氏夏柏特线虫分离株中分别为0～1．8％和0．2％～1．2％，较为保守。但pnad5和pcytb序列在两种间差异率较大，分别为14．7％～16．0％和15．0％～17．39／6。用pcytb和pnad5串联后的序列进行的种系发育分析表明，绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫分别位于2个分支，支持叶氏夏柏特线虫为独立种；pcytb和pnad5序列可作为夏柏特线虫种间鉴定的遗传标记。 展开更多

关键词 绵羊夏柏特线虫 叶氏夏柏特线虫 线粒体DNA nad5基因 CYTB基因 种系发育分析

原文传递

食蟹猴源食道口线虫和缩小特尼登线虫的形态学鉴定及基于其ITS2基因的分子种系发育分析 被引量：2

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作者 李健 杨磊 +2 位作者 石云良 周庆安 黄维义 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期258-263,共6页

对采集自食蟹猴肠道血结节中的3种线虫进行形态观察后鉴定,并用PCR扩增其ITS2基因后进行序列测定分析。结果显示,3种线虫分别为尖形食道口线虫、双叉食道口线虫及缩小特尼登线虫。测序结果表明,3种虫体ITS2基因序列的大小均为216bp。邻... 对采集自食蟹猴肠道血结节中的3种线虫进行形态观察后鉴定,并用PCR扩增其ITS2基因后进行序列测定分析。结果显示,3种线虫分别为尖形食道口线虫、双叉食道口线虫及缩小特尼登线虫。测序结果表明,3种虫体ITS2基因序列的大小均为216bp。邻位连接法构建的种系发育树显示,本研究中测定的尖形食道口线虫、双叉食道口线虫和缩小特尼登线虫序列在进化树上自成独立的拓扑分支。以上结果为人类食道口线虫病及缩小特尼登线虫病建立分子鉴别诊断方法提供了分子标记。 展开更多

关键词 尖形食道口线虫 双叉食道口线虫 缩小特尼登线虫 食蟹猴 ITS2基因 种系发育分析

原文传递

2株禽源鲍曼不动杆菌recA及16S rRNA基因的序列分析 被引量：1

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作者 马文昭 迪力拜尔.阿木提 +3 位作者 姚惠霞 王川庆 王新卫 刘慧敏 《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 CAS 北大核心 2018年第3期46-49,57,共5页

为了解禽源鲍曼不动杆菌与已知同种异源菌株的差异性,基于管家基因recA (同源重组因子A基因)并结合16SrRNA基因对2株禽源鲍曼不动杆菌分离株进行系统发育分析。结果表明:分离株序列同源性与鲍曼不动杆菌的同源性最高,高达92.0%～99.9%,... 为了解禽源鲍曼不动杆菌与已知同种异源菌株的差异性,基于管家基因recA (同源重组因子A基因)并结合16SrRNA基因对2株禽源鲍曼不动杆菌分离株进行系统发育分析。结果表明:分离株序列同源性与鲍曼不动杆菌的同源性最高,高达92.0%～99.9%,且与人源鲍曼不动杆菌遗传距离最近,证实了recA基因与16SrRNA基因在鉴定鲍曼不动杆菌属菌种上的正确性。这一研究提示,分离自禽的鲍曼不动杆菌在基因演化上可能源自于人类。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 RECA基因 16S RRNA 种系发育分析

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猴源贾第虫新亚型B11的基因鉴定

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作者 李威 钟志军 +7 位作者 屈羽 刘学涵 谢娜 邓家波 周紫峣 刘俊卿 程云 彭广能 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期156-160,共5页

运用饱和蔗糖溶液漂浮法收集了26份雅安市碧峰峡野生动物园不同野生动物的粪便寄生虫卵囊,提取DNA,经巢式PCR扩增β-giardin和tpi基因,扩增产物经测序后进行同源性和系统发育分析。结果显示,环尾狐猴(YARTL01)和猕猴(YARM01)感染贾第虫... 运用饱和蔗糖溶液漂浮法收集了26份雅安市碧峰峡野生动物园不同野生动物的粪便寄生虫卵囊,提取DNA,经巢式PCR扩增β-giardin和tpi基因,扩增产物经测序后进行同源性和系统发育分析。结果显示,环尾狐猴(YARTL01)和猕猴(YARM01)感染贾第虫,其中YARTL01分离株为一个新基因亚型,被命名为B11;YARM01分离株为蓝氏贾第虫B1亚型。YARTL01分离株的β-giardin基因序列与环尾狐猴分离株6LC(GenBank登录号HQ616629)的相似率为99.4%,tpi基因序列与猕猴分离株34538(GenBank登录号JX000563)的相似率为98.6%。种系发育分析显示,YARTL01在β-giardin基因位点与聚集体B处于同一分支,而在tpi基因位点,此分离株单独成一分支。YARM01的β-giardin基因序列和tpi基因序列分别与河狸分离株Be1(GenBank登录号EU014382)、猕猴分离株36395(GenBank登录号KC441076)的相似率达到100%;在进化树中,YARM01分离株在β-giardin基因位点与聚集体B处于同一分支,在tpi基因位点此分离株与聚集体B1处于同一个进化分支。本研究是首次报道四川省猴感染贾第虫,其中YARTL01分离株为一个新基因亚型。 展开更多

关键词 贾第虫 巢式PCR β-giardin基因 tpi基因 种系发育分析 亚型 猴

原文传递

基于16S rRNA基因的鼠Mycoplasma haemomuris的分子鉴定和种系发育分析

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作者 白挨泉 李高强 +5 位作者 郭建超 李欣 蒲文珺 李国清 陈志伟 张浩吉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1471-1476,共6页

为了从分子水平揭示野生鼠类血原体的种类特征和系统发生关系,无菌采集32份野生白腹巨鼠血样,抽提全血基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16SrRNA基因的扩增,对扩增产物进行克隆和测序。结果从其中21只血样中成功地扩增出目的片段大小... 为了从分子水平揭示野生鼠类血原体的种类特征和系统发生关系,无菌采集32份野生白腹巨鼠血样,抽提全血基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16SrRNA基因的扩增,对扩增产物进行克隆和测序。结果从其中21只血样中成功地扩增出目的片段大小的核苷酸序列。对阳性产物进行克隆、测序,获得了两条代表性序列(GenBank登录号HQ183731和HQ183732)。序列分析显示,获得的两条序列与GenBank中收录的鼠Mycoplasma haemomuris 16SrRNA基因(AB758435)相似性最高,分别为95%和97%。两个样本间16SrRNA基因序列相似性达98.3%。种系发育分析表明,获得白腹巨鼠血原体的两条序列形成了独立的进化分支,并与来自野鼠的Haemobartonella muris(HMU82963)和来自家鼠M.haemomuris(AB758435)所形成的进化分枝为姊妹枝。上述研究证明,白腹巨鼠具有较普遍的M.haemomuris感染,并与已报道的啮齿动物M.haemomuris有一定的遗传差异,是一种新基因型的血原体。对进一步研究人和动物的亲血性支原体的流行病学、种群生物学等研究具有一定价值。 展开更多

关键词 鼠 MYCOPLASMA haemomuris 16SRRNA基因 分子鉴定 种系发育分析

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基因工程小鼠肠道鞭毛虫的调查研究

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作者 李雯雯 苏乔 +4 位作者 付强 赵广银 李武国 黄浩机 李文英 《动物医学进展》 北大核心 2018年第2期55-60,共6页

为调查中山大学附属第一医院动物实验中心基因工程小鼠肠道感染鞭毛虫的情况,并进一步鉴定虫种,分析其对小鼠健康状况的影响。随机抽取不同来源、不同品系的基因工程小鼠的哨兵鼠采血进行血清生化分析;取盲肠组织固定于中性甲醛,进行组... 为调查中山大学附属第一医院动物实验中心基因工程小鼠肠道感染鞭毛虫的情况,并进一步鉴定虫种,分析其对小鼠健康状况的影响。随机抽取不同来源、不同品系的基因工程小鼠的哨兵鼠采血进行血清生化分析;取盲肠组织固定于中性甲醛,进行组织切片后HE染色,比较分析鞭毛虫感染小鼠的肠道病理变化;取盲肠内容物涂片镜检,确定为阳性的样品通过ITS基因片段的PCR扩增测序,并运用MEGA 6.0软件进行种系发育分析。结果发现,抽检的小鼠全部呈鞭毛虫感染阳性;感染组的雌性和雄性小鼠血清总蛋白(TP)的含量极显著高于正常小鼠的含量(P<0.01);感染鞭毛虫的小鼠盲肠病理切片与正常小鼠盲肠相比,无明显的病理变化;获得的ITS序列与GenBank上的鼠三毛滴虫(Tritrichomonas muris)ITS序列(登录号为AY886843)同源性为84%,在种系发育树中该研究的三毛滴虫(Tritrichomonas sp.)在三毛滴虫科(Tritrichomonadidae)拓扑结构中独立形成一个自展值为86%的分支。结果表明本次分离到的三毛滴虫可能是三毛滴虫属的一个新种,并且对小鼠的基本健康无明显危害。 展开更多

关键词 鞭毛虫 三毛滴虫 种系发育分析 生化 组织病理学 基因工程小鼠

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鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITS rDNA序列测定及种系发育关系分析 被引量：4

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作者 张媛 林瑞庆 +3 位作者 赵光辉 袁子国 宋慧群 朱兴全 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期298-302,共5页

以鲁道夫对盲囊线虫C种为研究对象,对其rDNA的内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增、测序和序列分析,以ClustalⅩ1.81程序对序列进行比对,然后用MEGA4.0程序的MP法和NJ法及PUZ-ZLE4.1程序的ML法构建鲁道夫对盲囊线虫A、B、C种以及北方对... 以鲁道夫对盲囊线虫C种为研究对象,对其rDNA的内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增、测序和序列分析,以ClustalⅩ1.81程序对序列进行比对,然后用MEGA4.0程序的MP法和NJ法及PUZ-ZLE4.1程序的ML法构建鲁道夫对盲囊线虫A、B、C种以及北方对盲囊线虫的种系发育关系。结果显示,鲁道夫对盲囊线虫C种的ITS-1,5.8 S,ITS-2序列大小分别为451 bp、127 bp和277 bp,鲁道夫对盲囊线虫3个种与北方对盲囊线虫ITS序列种内差异小,种间差异明显。种系发育关系分析发现,这3种方法(NJ法、MP法和ML法)构建的种系发育树的拓扑结构基本一致,其中C种和A种聚在一起,构成一支,再和B种聚在一起;北方对盲囊线虫单独成一支。研究结果证明鲁道夫对盲囊线虫C种确为一新种。 展开更多

关键词 鲁道夫对盲囊线虫C种 内转录间隔区 RDNA 种系发育关系分析

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