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基于网络药理学及体外实验探究温下方正丁醇部位联合吉非替尼治疗非小细胞肺癌的作用机制
被引量:
2
1
作者
陈瑞杰
毕倩宇
+3 位作者
施杰民
钟婧
韩晋涛
季旭明
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期471-486,共16页
运用网络药理学、分子对接和体外实验探究温下方正丁醇部位(n-butanol fraction of Wenxia Formula,NWXF)联合吉非替尼(gefitinib,GEF)治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。超高效液相色谱-四极杆-静电...
运用网络药理学、分子对接和体外实验探究温下方正丁醇部位(n-butanol fraction of Wenxia Formula,NWXF)联合吉非替尼(gefitinib,GEF)治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱法(UPLC-Q-Orbitrap MS)检测NWXF的主要化学成分,利用SwissADME数据库筛选NWXF的活性成分,SwissTargetPrediction数据库获取NWXF活性成分的潜在作用靶点,OMIM和GeneCards数据库搜集NSCLC相关疾病靶点。运用Cytoscape 3.9.0软件和STRING数据库对共同靶点进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络构建和关键靶点筛选,利用DAVID数据库进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,预测其可能的作用机制。运用SYBYL-X 2.0软件对核心成分与关键靶点进行分子对接验证。MTT法检测NWXF和GEF单用及联用对人非小细胞肺癌细胞(A549、PC-9)增殖的抑制作用以及NWXF对人胚肺成纤维细胞MRC-5的作用,运用Q值评价两药联用的效果,TUNEL法检测NWXF和GEF单用及联用对A549、PC-9细胞凋亡的影响,实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)法检测NWXF和GEF单用及联用对A549、PC-9细胞EGFR、JNK、Bax mRNA表达的影响,蛋白印迹(Western blot,WB)法检测NWXF和GEF单用及联用对A549和PC-9细胞EGFR、p-EGFR、JNK、p-JNK、Bax蛋白表达的影响。结果共获取NWXF治疗NSCLC的77种活性成分、488个潜在靶点及49个关键靶点。GO富集分析结果显示,NWXF干预NSCLC可能与调控细胞增殖、凋亡过程及蛋白质磷酸化等生物学过程相关,KEGG富集分析结果显示,NWXF干预NSCLC可能与调控MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路、HIF-1信号通路及肿瘤中的microRNA等信号通路相关。NWXF中核心成分与关键靶点分子对接结果显示,91.9%的对接分值>5,表明核心成分与关键靶点有较好的结合能力。�
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关键词
温
下方
正丁醇
部位
吉非替尼
非小细胞肺癌
凋亡
网络药理学
分子对接
机制
原文传递
题名
基于网络药理学及体外实验探究温下方正丁醇部位联合吉非替尼治疗非小细胞肺癌的作用机制
被引量:
2
1
作者
陈瑞杰
毕倩宇
施杰民
钟婧
韩晋涛
季旭明
机构
湖州市中心医院
浙江中医药大学基础医学院
浙江省神经药理学与转化研究重点实验室
浙江中医药大学中医药科学院
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期471-486,共16页
基金
国家自然科学基金项目(81774198,82274406)。
文摘
运用网络药理学、分子对接和体外实验探究温下方正丁醇部位(n-butanol fraction of Wenxia Formula,NWXF)联合吉非替尼(gefitinib,GEF)治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱法(UPLC-Q-Orbitrap MS)检测NWXF的主要化学成分,利用SwissADME数据库筛选NWXF的活性成分,SwissTargetPrediction数据库获取NWXF活性成分的潜在作用靶点,OMIM和GeneCards数据库搜集NSCLC相关疾病靶点。运用Cytoscape 3.9.0软件和STRING数据库对共同靶点进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络构建和关键靶点筛选,利用DAVID数据库进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,预测其可能的作用机制。运用SYBYL-X 2.0软件对核心成分与关键靶点进行分子对接验证。MTT法检测NWXF和GEF单用及联用对人非小细胞肺癌细胞(A549、PC-9)增殖的抑制作用以及NWXF对人胚肺成纤维细胞MRC-5的作用,运用Q值评价两药联用的效果,TUNEL法检测NWXF和GEF单用及联用对A549、PC-9细胞凋亡的影响,实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)法检测NWXF和GEF单用及联用对A549、PC-9细胞EGFR、JNK、Bax mRNA表达的影响,蛋白印迹(Western blot,WB)法检测NWXF和GEF单用及联用对A549和PC-9细胞EGFR、p-EGFR、JNK、p-JNK、Bax蛋白表达的影响。结果共获取NWXF治疗NSCLC的77种活性成分、488个潜在靶点及49个关键靶点。GO富集分析结果显示,NWXF干预NSCLC可能与调控细胞增殖、凋亡过程及蛋白质磷酸化等生物学过程相关,KEGG富集分析结果显示,NWXF干预NSCLC可能与调控MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路、HIF-1信号通路及肿瘤中的microRNA等信号通路相关。NWXF中核心成分与关键靶点分子对接结果显示,91.9%的对接分值>5,表明核心成分与关键靶点有较好的结合能力。�
关键词
温
下方
正丁醇
部位
吉非替尼
非小细胞肺癌
凋亡
网络药理学
分子对接
机制
Keywords
n-butanol fraction of Wenxia Formula
gefitinib
non-small cell lung cancer
apoptosis
network pharmacology
mole-cular docking
mechanism
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学及体外实验探究温下方正丁醇部位联合吉非替尼治疗非小细胞肺癌的作用机制
陈瑞杰
毕倩宇
施杰民
钟婧
韩晋涛
季旭明
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
原文传递
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